Les acides aminés Flashcards

1
Q

Quelle est la structure générale d’un acide aminé ?

A

A pH neutre = 7, la formule générale d’un acide aminé =

  • un carbone central simple = α lié à un H,
  • un groupement carboxylique acide COOH,
  • une fonction amine basique NH2 ou NH3+.
  • une chaine R +/- longue,complexe. Un acide cède un H+ alors qu’une base accepte un H+.
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2
Q

De quoi dépend la variabilité des acides aminés ?

A

De la nature de leur chaîne latérale R.

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3
Q

Quels sont les 3 grands rôles des acides aminés ?

A

Structure (+ important), métabolique et rôle de neuromédiateur.

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4
Q

Quels types de molécules peuvent former des acides aminés ? (rôle de structure)

A

Les acides aminés composent les protéines et d’autres molécules :
• La sérine forme l’éthanolamine (composant des phospholipides membranaires)
• La glycine participe à la synthèse de l’hème de l’hémoglobine

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5
Q

Quel est le rôle métabolique des acides aminés ?

A
Par leur fonction amine (NH2), les acides aminés sont des éléments de base du métabolisme azoté.
Les acides aminés sont capables d’échanger des molécules d’azote entre eux, ils ont un rôle de détoxification car l’ion ammonium NH4+ est toxique pour le système nerveux central et participe au cycle de l’urée qui est un des moyens d'éliminer l’azote toxique au sein de l’organisme.
Le catabolisme (destruction) de certains acides aminés alimente le cycle de Krebs et la néoglucogenèse : c’est un
intérêt pour le métabolisme énergétique
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6
Q

Quel est le rôle de neuromédiateur des acides aminés ?

A

Acide glutamique et acide aspartique = neuromédiateur excitateur
• Acide gamma amino-butyrique GABA = neuromédiateur inhibiteur

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7
Q

Qu’est ce qu’un neuromédiateur ?

A

Un neuromédiateur = molécule chimique transmettant l’information entre 2 neurones.

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8
Q

Comment sont formés les acides aminés chez les bactéries et les végétaux ?

A

Cette synthèse commence par la formation d’ammoniac NH3 car eux seuls ont la particularité de fixer l’azote
moléculaire N2 donc l’azote atmosphérique, grâce à la nitrogénase réductase

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9
Q

Comment sont formés les acides aminés chez l’homme ?

A

L’homme ne peut pas utiliser l’azote moléculaire ni atmosphérique, lui il assimile le NH4+, ce qui permet
une synthèse par assimilation NADH pour synthèse certains acides aminés.

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10
Q

Qu’elle est l’enzyme capable de transformer l’azote atmosphérique NH2 en ammoniac NH3 ?

A

La nitrogénase réductase.

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11
Q

Que sont les acides aminés essentiels ? (définition)

A

On parle alors d’acides aminés essentiel pour l’adulte = acides aminés nécessaire à l’organisme ne pouvant être synthétise par lui même, devant être apporté par l’alimentation

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12
Q

Il y a combien d’acides aminés essentiels pour l’homme ?

A

Il y a 8 acides aminés essentiels pour l’homme.

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13
Q

Quels sont les acides aminés essentiels ? (nom)

A
Il y a:
tryptophane, 
lysine, 
méthionine, 
phénylalanine, 
thréonine, 
valine,
leucine, 
isoleucine
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14
Q

Peut t-on synthétisé tout les autres acides aminés en quantité suffisante ?

A

Des acides aminés sont synthétisé par l’homme, mais le sont en trop petite quantité = déficit et doivent être apportés par l’alimentation ➔ ex : arginine et histidine pour l’enfant. Il y’a donc une dépendance
pour l’âge.

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15
Q

Qu’elle est la classification stricte des acides aminés ?

A

Il n’y en a pas, on ne peut pas classer les acides aminés de façon stricte.

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16
Q

Quels sont les acides aminés à chaîne latérale aliphatique hydrophobe ?

A

Glycine GLY, Alanine ALA, Valine VAL, Leucine LEU, Isoleucine ILE, Méthionine MET, Proline PRO

17
Q

Quelle est la structure de la glycine ?

A

Glycocolle = colle sucrée (obtenue par hydrolysat de gélatine en 1820),
Pas de carbone asymétrique α car le radical R = H
Flexible
Si on substitue un des H par CH3= ALA.

18
Q

Quelle est la structure de l’alanine ?

A

Présence d’un carbone asymétrique α,

Flexible car l’encombrement stérique de la chaine latérale est faible : R-CH3

19
Q

Quelle est la structure de la valine ?

A

On ajoute une fourche 3 carbones à 2 méthyles CH3.

20
Q

Quelle est la structure de la leucine ?

A

Fourche valine + Carbone supplémentaire entre la fourche .

21
Q

Quelle est la structure de l’isoleucine ?

A

Fourche valine + Carbone devient asymétrique β.
2 carbones asymétriques : β et α
Chaines latérales de + en + encombrantes et de + en + hydrophobes.
La nature de cette fourche 3C -> 1C central empêche le métabolisme de l’être humain de la synthétiser.

22
Q

Quelle est la structure de la méthionine ?

A

Acide aminé est très courant dans les protéines :
chaine aliphatique + atome de souffre coincé entre 2 molécules de carbone méthyle (CH3) et
éthyle (CH2) = groupe thioether qui est donneur de méthyle dans les réactions métaboliques.

23
Q

Quelle est la structure de la proline ?

A

chaîne latérale cyclique + fonction amine secondaire : pas de possibilité de rotation entre N et C α (car lié à 2 C), induisant la rigidité, la proline est impliquée pour cette raison dans la synthèse du coude pour changer la direction d’une chaîne peptidique.

24
Q

Quels sont les acides aminés aromatiques ?

A

Phénylalanine PHE, Tyrosine TYR, Tryptophane TRP

25
Q

Quelle est la structure de la phénylalanine ?

A

On ajoute un noyau aromatique à 6C 3 doubles liaisons + un CH2.
Le noyau phényle (= noyau aromatique) est particulièrement hydrophobe (aucun OH)
Précurseur de la tyrosine : Phe + OH = TYR par la phénylalanine (ou tyrisone) hydroxylase

26
Q

Quelle est la structure de la tyrosine ?

A

noyau phényle + radical hydroxyle OH = noyau phénol,
Plus polaire que PHE : l’hydroxylation de la PHE donne plus de polarité = TYR (= dérivé de PHE)
groupe hydroxyle OH polaire et un cycle aromatique hydrophobe.

27
Q

Quelle est la structure de la tryptophane ?

A

faiblement polaire grâce à son N du noyau indole acceptant ou libérant son proton H+.

28
Q

Quels sont les acides aminés à chaîne latérale non cyclique polaire non chargée.

A

Sérine SER, Thréonine THR, Asparagine ASN, Glutamine GLN, Cystéine CYS

29
Q

Quelle est la structure de la sérine ?

A

Le radical = CH2 + groupement hydroxyle (alcool primaire sur le 1er méthyl car lié à un carbone)

30
Q

Quelle est la structure de la thréonine ?

A

Le radical = carbone asymétrique β lié à un H, + CH3 + OH (alcool secondaire)

31
Q

Quelle est la structure de l’asparagine ?

A
fonction amide (CO-NH2), on peut avoir sur cette fonction amide un site de fixation post
traductionnelle de sucre (N glycosylation).
acide aspartique + fonction amide = ASN.
32
Q

Quelle est la structure de la glutamine ?

A

Fourche de ASN + CH2 dans le radical
AA le plus important en quantité dans le sang.
acide glutamique + fonction amide = glutamine.
ASN et GLN : rôle prépondérant dans le transport de l’azote sanguin.

33
Q

Quelle est la structure de la cystéine ?

A

Radical = CH2 + soufre SH, groupement thiol = SH
Il y a possibilité de synthétisé des ponts S-S (liaison covalente) avec une autre cystéine : confère la stabilité + structure secondaire des protéines.