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H19 Bactériologie 1 MCB2979 > Lecture #4 > Flashcards

Lecture #4 Flashcards

1
Q

Quels-sont les 4 types de réplication de plasmides vus?

Les deux derniers sont pour le même type de plasmide mais différents selon deux espèces bactérienne.

A
  1. Thêta (unidirectionnelle et bidirectionnelle)
  2. Réplication à cercle roulant
  3. Réplication de plasmide linéaires pour Borrelia burgdorferi
  4. Modèle de raquette pour plasmide linéaire de Streptomyces
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Q

Quelle-est a protéine impliquée dans la réplication à cercle roulant qui est essentielle tout au long du processus?

A

RepA

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3
Q

Que fait Rep (4 étapes)?

A

Lie l’origine, clive un brin puis reste attaché sur l’extrémité 5’ via une liaison via une phosphotyrosine.

Finalement, clive le dernier lien entre la molécule bicaténaire et la molécule monocaténaire protégée par les SSB.

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4
Q

Dans la réplication des plasmides linéaires chez Borrelia, quelle enzyme fait le clivage des extrémités pour reformer les plasmides linéaires?

A

Résolvase

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5
Q

Pourquoi y a-t-il un modèle particulier pour Streptomyces?

A

Les extrémités ne sont pas continues.

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6
Q

Quelle protéine est essentielle à la conservation et la réplication des plasmides monocaténaires chez Streptomyces?

A

Protéines terminales liant les extrémités 5’. Protège le brin de la dégradation et essentielle pour la réplication des extrémités.

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7
Q

Combien de plasmides peut-on retrouver dans une cellule pour les types suivants?

  1. Plasmide F, P1
  2. Plasmide colicine (ColEI)
  3. Plasmide R
A
  1. Plasmide F, P1: faible, 1 à 2/cellule
  2. Plasmide colicine (ColEI): multicopies, >30/cellule
  3. Plasmide R: Moyen, 5 à 30/cellule
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8
Q

Comment s’appelle…

  1. Un plasmide à faible nombre de copies, demandant une régulation précise.
  2. Un plasmide à multicopies, avec régulation plus simple
A
  1. Plasmides stringents

2. Plasmides relaxed

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9
Q

Complétez la phrase.
Dans la régulation de la réplication du plasmide CoIE1, __________ est important pour initier la traduction. Ce dernier se lie à l’ADN au niveau de l’origine de réplication et ________ vient cliver l’hybride ADN-ARN.
Les extrémités 3’OH produites sont __________________ pour la réplication.

Finalement, la régulation s’opère par_________ qui vient former un complexe avec ___________ (kissing complexe) et ainsi empêche le clivage.

A

Dans la régulation de la réplication du plasmide CoIE1, l’ARN II est important pour initier la traduction. Ce dernier se lie à l’ADN au niveau de l’origine de réplication et LA RNASE H vient cliver l’hybride ADN-ARN.
Les extrémités 3’OH produites sont DES AMORCES pour la réplication.

Finalement, la régulation s’opère par L’ARN I qui vient former un complexe avec L’ARN II (kissing complexe) et ainsi empêche le clivage.

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10
Q

Quelle protéine aide à l’interaction ARN-ARN dans la régulation de la réplication du plasmide ColE1?

A

Rop

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11
Q

Comment se fait la régulation (contrôle des niveaux de ARN I) dans la régulation de la transcription de ColE1?

A

Par polyadénylation de l’ARN I ou par sa dégradation via RNase E. Bref, si on veut que ça réplique, on déstabilise ARN I

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12
Q

Pour l’interaction ADN-protéines & ARN-ARN vu pour le plasmide R1, quelles-sont les deux grandes étapes?

A
  1. Répression de la transcription de RepA par CopB (protéine-ADN)
  2. Arrêt de la traduction par hybridation ARN-ARN avec CopA et clivage par RNase III
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13
Q

Mettre les étapes dans l’ordre.

  1. RepA est transcrite à partir de son promoteur PrepA pour un nombre de copies spécifique.
  2. La transcription de RepA ne se fait que par le promoteur CopB = transcrit polycistronique
  3. CopB est transcrit et traduit, réprime le promoteur de RepA
  4. Clivage par la RNase III pour empêcher la traduction
  5. Transcription de CopA qui vient s’hybrider sous sa forme ARN avec le transcrit ARNm CopB-RepA.
A

Mettre les étapes dans l’ordre.

  1. RepA est transcrite à partir de son promoteur PrepA pour un nombre de copies spécifique.
  2. CopB est transcrit et traduit, réprime le promoteur de RepA
  3. La transcription de RepA ne se fait que par le promoteur CopB = transcrit polycistronique
  4. Transcription de CopA qui vient s’hybrider sous sa forme ARN avec le transcrit ARNm CopB-RepA.
  5. Clivage par la RNase III pour empêcher la traduction
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14
Q

Vrai ou faux, RepA est essentielle pour la réplication, si on réprime sa transcription/traduction, on réprime la réplication.

A

Vrai

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15
Q

Dans le cas des plasmide avec un faible nombre de copies, quelle-est la méthode de régulation de la réplication?

A

ADN-protéine, basée sur la concentration en RepA et en plasmides dans la cellule.

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16
Q

Récapitulons, associez les bons éléments:

  1. ADN-Protéine
  2. Plasmide R1
  3. ADN-protéine, ARN-ARN
  4. ARN-ARN
  5. Plasmide ColE1
  6. Plasmide F, R6K, P1, pSC101
  7. Faible (1-2)
  8. Moyen (5-30)
  9. Polycopies (>30)
A
  1. ADN-Protéine,
  2. Faible (1-2),
  3. Plasmide F, R6K, P1, pSC101
  4. ADN-protéine, ARN-ARN
  5. Plasmide R1
  6. Moyen (5-30)
  7. ARN-ARN
  8. Plasmide ColE1
  9. Polycopies (>30)
17
Q

Vrai ou faux, dans toutes les méthodes de réplication que nous avons vu, c’est RepA qui est la cible pour la répression de la réplication.

A

Faux, c’est ARN II qui est important pour commencer pour les polycopies, s’hybride en chevauchant l’origine.

18
Q

Quel-est le fonctionnement de la régulation pour les plasmides qui doivent rester en nombre faible de copies dans la cellule?

A

Les plasmides ont des itérons (courtes séquences répétées) près des OriV. RepA lie ces itérons, en présence de trop de plasmide il y a une interaction polymoléculaire et des plasmides sont agrégés ensemble (hancuffed) et RepA ne peut commencer la réplication.

19
Q

Quelles-sont les protéines recombinases chez ColE1 dans le système de monomérisation? Où sont-elles codées?
Quel est le site de monomérisation?

A

Site: Cer
Les protéines sont codées par le chromosome bactérien.
XerC, XerD, PepA, ArgR

20
Q

Faites les bonnes associations:

  1. Plasmide Col
  2. Plasmide F
  3. Plasmide R1
  4. Protéine Hok et ARN antisens sok inhibant la traduction de Hok
  5. Colicine et protéine d’immunité
  6. CcdB qui inhibe l’ADN gyrase et CcdA qui empêche son action
A
  1. Plasmide Col –> 5. Colicine et protéine d’immunité
  2. Plasmide F –> 6. CcdB qui inhibe l’ADN gyrase et CcdA qui empêche son action
  3. Plasmide R1 –> 4. Protéine Hok et ARN antisens sok inhibant la traduction de Hok

H19 Bactériologie 1 MCB2979 (4 decks)

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