Lecture 1 Flashcards
Nommez les arrangements que les cocci et les bacilles peuvent prendre:
Cocci: diplocoques streptocoques tétrades sarcines staphylocoques
Bacilles:
Simple
Diplobacille
Streptobacille
Coccobacille
Nommez 5 autres formes que cocci et bacilles
Vibrion Spirille (flagelles) Spirochètes (filaments axiaux) Forme d'étoile Rectangulaire
À quoi servent les faussent couleurs?
Elle servent à mieux voir les bactéries quand on les observe et c’est aussi des couleurs proche de ce qu’on pense, mais pas exactement.
Donnez toutes les catégories de la hiérarchie taxinomique
Domaine Règne Embranchement ( ou phylum) Classe Ordre Famille Genre Espèce
Donnez un synonyme d’espèce
Épithète
V ou F
a) Les noms scientifiques sont composés du genre et de l’espèce d’un organisme?
b) Le genre est toujours en italique alors que l’espèce ne l’est pas?
c) Le genre ET l’espèce prennent une majuscule?
a) V
b) F. Le genre ET l’espèce sont en italique.
c) F. Le Genre prend une majuscule, mais pas l’espèce
Nommez
a) les 4 structures qui se retrouvent toujours chez une bactérie?
b) Une structure qui y est presque toujours
c) 6 structures facultatives
a) Membrane plasmique, ribosome, cytoplasme, nucléoide
b) paroi cellulaire
c) Pilus, capsule, plasmide, flagelle, inclusion, Fimbriae
Donnez les étapes de la coloration de Gram
1) Coloration primaire (toutes les bactéries sont colorées en violet)
2) Traitement à l’iode (mordant)
3) Lavage à l’alcool (slm les Gram + retiennent la coloration grâce à leur couche de peptidoglycane épaisse)
4) Coloration à la safranine pour visualiser les Gram -
Donnez la composition de la paroi bactérienne et sa fonction.
Peptidoglycanes: composés de NAM et NAG, deux sucres complexes.
Fonction:
Ce sont les a.a. et des sucres qui donnent une structure solide et une forme à la cellule ce qui la protège de l’environnement.
Donnez la différence entre NAM et NAG
NAM a un gr. acide lactique alors que NAG n’en a pas. Il n’a qu’un gr. alcool à la place.
Caractéristiques imp de la paroi bactérienne des gram+
- large couche de peptidoglycane à l’extérieur de la membrane
- Acide teichoïque sortent de la couche de peptidoglycanes
- Acide Lipoteichoïques qui servent à encrer couche de peptidoglycanes ds la membrane
Caractérisriques imp de la paroi bactérienne des gram-
A une membrane externe composée d’une partie lipidique et une partie polysaccharidique. Ce sont les lipopolysaccharides qui sont à l’extérieur de la couche de peptidoglycanes et qui ne sont pas présents chez les Gram+.
La couche de peptidoglycane est plus fine et il y a un espace périplasmique important chez les gram -
Décrivez les ponts interpeptidiques des Gram+ et des Gram-
gram+:
C’est un pont spl entre D-Ala(4e a.a de NAM) et DAP(3e a.a de l’autre NAM)
gram-:
C’est un pont de 5 Gly entre D-Ala(4e a.a de NAM) et L-Lys(3e a.a de l’autre NAM)
Décrivez la synthèse du peptidoglycane et donnez 3 antibiotique qui inhibe cette synthèse et où.
Synthèse commence dans la cellule
1) Les a.a sont ajoutés un par un au UDP-NAM
Dernière chose ajoutée, c’est 2 a.a Ala (Cette combinaison est synthétisée par un L-Ala qui est transformé en D-Ala par une enzyme)
Là, on a le premier précurseur du peptidoglycane.
Antibio: Cycloserine peut inhiber à 2 endroits: la transformation du L-Ala en D-Ala ou alors le lien entre les 2 D-Ala. Si on a pas D-Ala-D-Ala, on a pas de peptidoglycane.
2) On ajoute alors notre précuseur NAM-a.a(5) a Bactoprenol-P qui se trouve ds la membrane. Durant cette liaison, il y a hydrolyse de l’UDP. On a alors de l’UMP qui sera recyclé et retransformé en UDP
Là, on a besoin du NAG pcq sinon c’est pas un peptidoglycane.
3) NAG arrive, lié à UDP, et il se lie à NAM et libère UDP (pas d’hydrolyse, juste un déplacement)
4) Puis, l’enzyme flippase met la structure (Bactoprenol-P-P-NAM-Pentapeptide et NAG) de l’autre côté de la membrane (vers l’extérieur)
5) Peptidoglycane prend alors la place de BNactoprenol-P-P et on a Peptidoglycane-NAM(-pentapeptide)-NAG
Antibio: Vancomycin inhibe la liaison de la structure à un peptidoglycane. (contre les infections staphilo)
6)Pour libérer le bactoprenol, il y a un autre FLIP et il y a nécessité d’énergie. Un Pi est libéré et on retrouve notre Bactoprenol-P de l’étape 2
Antibio: La Bacitracine est un antibio qui bloque cette étape
Expliquez comment les peptidoglycanes s’assemblent une fois à l’extérieur de la cellule.
L’enzyme autolysine génère des ruptures dans les polymères de peptidoglycane déjà présent poour insérer les nouveaux couples NAM-NAG
La formation de nouveaux ponts entre chaines adjacentes est permise par l’enzyme transpeptidase et la réaction est appelée transpeptidation. Dans la réaction, le 5e a.a (D-Ala) est perdu.
Que fait la pénicilline pour tuer les bactéries
Elle empêche la formation de leur membrane en inhibant l’enzyme transpeptidase.
Que se passe-t-il si la transpeptidase ne fait pas bien son travail?
Les couches de peptidoglycanes sont beaucoup plus faibles et se brisent plus facilement.
Quel groupement similaire dans la pénicilline et le D-Ala-D-Ala permet à la pénicilline de prendre la place de D-Ala-D-Ala dans l’enzyme transpeptidase?
a) Bêta-Lactine
b) Alpha-Lactame
c) Bêta-Lactame
d) Alpha-Glutamane
c)Bêta-Lactame
Quels liens empêche la vancomycine? Quel effet cela a-t-il?
Les liaison croisées et les liaisons glycosidiques ce qui fait une parois beaucoup plus faible.
Quels sont les 3 sites possibles de synthèses du peptidoglycane chez les bactéries?
A) Cocci: pas d’élongation. Juste une division. La synthèse se fait dans le plan de la division.
B) Élongation se passe au milieu pour allonger la cellule.
C) bact qui peuvent faire de l’élongation et de la division séparemment, mais ce qui est différent, c’est que l’élongation se passe aux extrémité au lieu de se faire au milieu et qu’il y a une élongation dans le plan de division aussi.
V ou F
La membrane plasmique des eucaryotes est plus rigide que celle des bactéries
vrai
Les stérols rendent plus rigide les membranes des eucaryotes et les bactéries n’ont pas de stérol.
Qu’est-ce qu’une inclusion?
Un dépôts de réserve(nutriments à utiliser quand le milieu s’appauvrit)
Donnez des exemples d’inclusions
- Granules de polyssacharides
- Inclusions de lipides
- Carboxysomes (imp pour photosynthèse pcq fisent CO2)
- Granules de Soufre pour les bact qui utilisent le soufre dans leur métabolisme
- Vacuoles gazeuses pour bact aquatique qui doivent nager à une profondeur déterminée
- Magnétosomes pour se repérer dans un champs magnétique.
Donnez 5 structures externes à la paroi bactérienne
Glycocalyx Lypopolysaccaride Pili Fimbriae Flagelles
Qu’est-ce que le Glycocalyx et de quoi est-il composé?
C’est une substance qui enveloppe la cellule. Il est composé de polysaccarides et de protéines secrétées
Quels sont les 2 types de glycocalyx? Décrivez-les
Capsule: si la substance est organisée et fixée à la paroi(bactéries qui en ont une sont plus résistantes/pathogènes)
Couche visqueuse: Moins organisée
Donnez les 2 fonctions du glucocalyx.
1) Protection de la cellule (virulence augmentée)
2) Adhésion de la cellule à d’autres cellules et aux surfaces (composante du biofilm)
Où se trouvent les lipopolysaccharides?
Sur la membrane externe des bactéries Gram-
Que sont les polysaccharides O et les lipides A?
Polysaccharides O: portion antigénique
Lipide A= endotoxine
Quels sont les rôles des lipopolysaccharides?
- Stabiliser la membrane externe
- donner une charge négative à la bact (pcq composé de polysaccharides et de gr.P chargé négativement)
- Aide dans l’attachement aux surfaces
- Forme une barrière de perméabilité contre certains composés toxiques pour la bactérie
- Protège la bactérie du système de défense de l’hôte
- L’antigène O est imp pour la réponse du système immunitaire contre les Gram-
- Lipide A constitue l’endotoxine, très dangereuse pcq déclenche le choc septique.
Qu’est-ce qu’un pili?
Une structure filamenteuse utile pour le transfert d’ADN (conjugaison), le mouvement (twitching motility), etc.
Il y en a 1@4 par cellule
Qu’est-ce qu’un Fimbriae?
Une structure filamenteuse utile pour l’adhérence de la bactéries. Ils sont plus petits et plus nombreux que les Pili
Quelle est le rôle d’un flagelle?
La mobilité
Dites quelle phase a lieu quand les flagelles tournent dans le sens
a) horaire
b) anti-horaire
a) Horaire => tous les flagelles séparés => phase tumble
b) Anti-horaire => tous les flagelles ensembles => phase run
Le mouvement des flagelles est une ondulation ou une rotation?
Une rotation
Qu’est-ce qui maintient la forme des cellules
a) Eucaryotes
b) Procatyotes
a) Protéines structurales: Actine, tubuline et filaments intermédiaires
b) Il y a des protéines différentes, mais similaires aux eucaryotes.
Dites ce qui équivaut aux protéines eucaryotes suivantes, mais chez les procaryotes:
a) actine
b) tubuline
c) filaments intermédiaires
a) FtsZ
b) MreB
c) Crescentin
Qu’arrive-t-il si on diminue la quantité de MreB dans une cellule?
Elle perd sa forme et adopte une structure aberrante.
Qu’est-ce qu’un biofilm et à quoi sert-il?
C’est une communauté de microorganismes (bactéries,levures,algues ou protozoaires) qui forme un EPS (réseau de polysaccharides formant des chaines et créant un matériel visqueux)
Il permet l’adhérence aux surfaces et agit comme barrière qui protège les bactéries contre l’environnement
Donnez les étapes de formation d’un biofilm
1) bactéries nageuses (flottant dans le milieu)
2) attachement initial
3) attachement irréversible
4) expansion
5) différentiation
6) maturation + se détache pour aller former ailleurs.
**Voir cahier de note pour étapes complètes
où trouve-t-on des biofilms?
Environnement naturels: humides avec bcp d’éléments nutritifs
Environnement fabriqués: ex: tuyaux
Corps humain: ex: plaque dentaire, infection persistantes, instruments médicaux
Quel substance est la plus efficace pour se débarrasser d’un biofilm?
Les stérilisants sont parfois la seule option pour éliminer les bactéries ayant formé un biofilm puisque les antibiotiques et les désinfectants n’en sont pas capables