LE6 Fylogenier Flashcards
Fylogenetiskt träd
Ett evolutionärt träd (= fylogeni = kladogram) som visar hypoteser om hur utvecklingslinjer från en gemensam förfader modifierats och gett upphov till olika taxa.
En rekonstruktion av den evolutionära släktskapen mellan studerade taxa.
Ett diagram som visar den divergens och evolutionära förändring som lett från en gemensam tidigare utvecklingslinje till en uppsättning avkommetaxa.
En grupp organismers evolutionära släktskap såsom förväntas utifrån Darwins teori om härkomst med modifiering (”descentwithmodification”) från en gemensam förfader.
Hur man läser ett fylogentisk träd
Egenskaper nära trädets rot är längre tillbaka i tiden och egenskaper på gren-spetsarna representerar nutid.
Roten (eller den första förgreningspunkten) representerar den gemen-samma förfadern för alla taxa.
Förgreningar representerar separation av evolutionära linjer.
Den evolutionära släktskapen mellan arter i en fylogeni definieras av den tid som har gått sen de delade en gemensam förfader.
Utvecklingslinjer som delar en mer nylig gemensam förfader anses vara mer närbesläktade.
Evolutionära träd visar inte allt! Har ospecifikt datering. Ingen information om…
- ej inkluderad taxa
- ej inkluderade förändringar
Homologi
Morfologiska eller genetiska egenskaper hos olika organismer som liknar varandra och har samma evolutionära ursprung.
Analogi/Homoplasi
Morfologisk och/eller genetisk likhet mellan två taxa som inte uppkommit genom nedärvda karaktärer från en gemensam förfader, utan istället genom parallell evolution, konvergent evolution (framkallat av ett likartat levnadssätt) eller reversion (återgång till ett ursprungligare karaktärsstadium). Ex. vingarna hos fåglar och fladdermöss.
Konvergent evolution
När liknande genetiska eller morfologiska strukturer utvecklas oberoende av varandra hos olika icke närbesläktade organismer. Egenskaperna utvecklas inte likartat på grund av att de har en gemensam förfader, det är enbart framkallat genom ett likartat levnadssätt. Konvergenta karaktärer kallas analogier eller homoplasier.
Apomorfi & Synapomorfi
En egenskap närvarande hos en eller flera arter (taxa) i en klad som inte fanns vid den gemensamma förfadern. En evolutionär nyhet.
En synapomorfi är en delad apomorfi som skiljer en klad från andra organismer. Med andra ord är det en apomorfi som delas av medlemmar i en monofyletisk grupp och därmed antas vara närvarande i deras senaste gemensamma förfader. Utgör grunden i att bygga upp kladogram.
Klad
En gren på ett evolutionärt träd och alla dess kvistar. Samma som monofyletisk grupp.
Monofyletisk grupp
Gemensam förfader + alla ättlingar. En uppsättning av arter (eller populationer) som härstammar från en gemensam förfader. Samma som klad.
Parafyletisk grupp
En uppsättning av arter som inkluderar en gemensam förfader och en del, men inte alla, av sina ättlingar.
Polyfyletisk grupp
Gruppering utifrån likhet men ej släktskap. Behöver ej ha samma MRCA. En uppsättning av arter som är grupperade i likheter, men som inte härstammar från en gemensam förfader.
Plesiomorfi
En i nedärvd egenskap som uppstod hos en tidigare förfader. Homolog i kladen men inte unik för alla medlemmar.
En plesiomorf egenskap som finns hos flera organismer kallas symplesiomorfi. Parafyletiska grupper utmärks av symplesiomorfier (d.v.s. avsaknaden av en viss egenskap).[6]
Parsimonianalys
Används för konstruktionen av ett fylogeni.
Identifiera vilken fylogeni som antar lägst antal evolutionära förändringar
Utgrupp
En organism som inte anses ingå i gruppen i fråga, men som är nära besläktad med gruppen.
Utgruppsananlys
Används för konstruktionen av ett fylogeni.
Använd besläktad grupp för att identifiera utseende hos förfader.
Molekylära fylogenier
Baserat på molekylära data. Protein och framförallt DNA-sekvensdata är ofta bättre lämpade för fylogenetisk analys än morfologiska egenskaper.
- Mutationshändelser är sällsynta -> låg risken för konvergent evolution.
- Lämpar sig även bättre för statistisk analys.
- Om vi har en bra modell för hur ofta mutationer fixeras i olika utvecklingslinjer kan vi datera tiden tillbaka till separation -> molekylära klockor.
