Latence et persistance Flashcards

1
Q

définir ce qu’est la latence virale

A

virus entre dans un état non replicatif persistant (“sommeil viral”), mais qui peut être reverté

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Q

la latence virale est une caractéristique de tous les …. et certains ….

A

herpesvirus
retrovirus

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3
Q

définir ce qu’est un réservoir viral

A

type cellulaire (ou site anatomique) dans lequel une forme de virus compétent pour la réplication persiste de manière plus stable que les cellules dans lesquelles le virus se multiplie de façon active

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4
Q

définir ce qu’est la phase de latence clinique

A

phase asymptomatique d’une infection persistante (ex: entre 2 résurgences herpétiques, phase asymptomatique du VIH…)

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5
Q

définir ce qu’est une infection virale persistante

A

infection chronique, pas d’élimination du pathogène, contraire d’une infection virale aiguë
(tout les herpes virus, parfois HCV, HIV)

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6
Q

définir ce qu’est une infection aiguë

A

virus infectieux et les symptômes disparaissent rapidement et définitivement
ex: influenza, adenovirus…

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7
Q

définir ce qu’est une infection aiguë avec complications tardives

A

virus infectieux disparaît mais certaines prots virales persistantes peuvent causer des complications tardives
ex: rougeole

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8
Q

définir ce qu’est une infection latente

A

après infection aiguë, virus persiste à l’état latent dans certaines cellules et peut être réactivé des années plus tard
ex: varicelle-zona

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9
Q

définir ce qu’est une infection chronique

A

après infection aiguë (symptomatique ou non), virus est produit en permanence et en absence de symptômes
ex: hépatites B et C

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10
Q

définir ce qu’est une infection lente

A

virus se réplique continuellement, sans causer de symptômes pendant plusieurs années jusqu’à une conséquence fatale
ex: VIH

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11
Q

nommer 3 types d’infections virales persistantes

A

infection latente
infection chronique
infection lente

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12
Q

nommer 2 types d’infection non persistantes

A

infection aiguë
infection aiguë avec complications tardives

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13
Q

les herpesvirus se répliquent dans les …. mais font la latence dans les ….

A

cellules épithéliales
neurones

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14
Q

l’établissement d’un programme de latence ou d’un programme lytique est parfois dépendant du …

A

type de cellules infectées par le virus

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15
Q

le type cellulaire dicte le choix entre …. et ….

A

replication active
latence

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16
Q

EBV se réplique activement dans les … mais est plutôt latent dans les ….

A

plasmocytes
cellules B mémoires

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17
Q

il existe plusieurs états de latence chez EBV et chacun sont caractérisés par un …

A

programme transcriptionnel propre

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18
Q

le VIH infecte les … de manière persistante

A

cellules T quiescentes

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19
Q

dans le cas des herpès virus, à quoi est associé la latence ?

A

production de prots virales spécifiques
différentes de celles produites lors de la phase lyrique

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20
Q

nommer une caractéristique de la latence

A

modulation (inhibition) de l’expression des gènes viraux
ex: conformation de la chromatine, miRNA produits par l’hôte ou le virus…)

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21
Q

pourquoi certains virus persistants veulent induire un programme anti-apoptotique?

A

pour assurer la survie de la cellule infectée et faire infection persistante

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22
Q

si des traces de SARS-COV-2 ont été trouvé dans les intestins d’un patient guéri, est-ce un signe de réservoir du virus?

A

non, car pour que ça soit un réservoir il faudrait montrer que le virus est capable de se réactiver

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23
Q

décrire l’immunité mise en place suite à une infection aiguë

A

réponse adaptative

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24
Q

décrire l’immunité mise en place lors d’une infection chronique avec production virale persistante

A

échappement à la réponse adaptative (pression de sélection immunitaire)

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25
Q

décrire l’immunité mise en place lors d’une infection chronique avec latence et réactivation

A

absence de reponse (silence immunologique) ou nouvelle réponse adaptée à l’expression de prots associées à la latence

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26
Q

décrire le lien entre la latence et le développement d’un vaccin

A

la latence est un obstacle majeur à la mise au point d’un vaccin

27
Q

nommer un autre obstacle au vaccin VIH mis à part la latence

A

la grande diversite génétique du VIH

28
Q

quelles sont les phases d’infection par le VIH

A

phase aiguë
phase chronique
sida

29
Q

l’infection par le VIH est une infection … (…)

A

chronique (persistante)

30
Q

comment la latence du VIH est-elle caractérisée?

A

par la présence d’un provirus intégré qui ne produit que peu ou pas de transcrits viraux et de prots virales

31
Q

la latence du VIH est …, et le provirus est …. lorsque la cellule …. est activée

A

reversible
reactive
activée

32
Q

la latence du VIH est une évènement très ….

A

rare

33
Q

quel est le problème avec les cellules latentes du VIH

A

la grande majorité des cellules infectées par le VIH produisent activement des particules virales
une petite partie pourrait être infectée de manière latente mais sont difficiles à trouver

34
Q

est-ce qu’il existe plusieurs familles d’antiretroviraux

A

oui en fonction de leurs modes d’action

35
Q

définir les trithérapies

A

combinaison de 3 molécules contre le VIH
augmente espérance de vie

36
Q

expliquer le mode d’action des trithérapies

A

n’éradiquent pas le VIH
permettent d’inhiber la réplication du VIH et donc la charge virale

37
Q

comment sait on que le virus persiste à bas bruit dans les réservoirs au cours des trithérapies?

A

rebond viral après arrête des traitements

38
Q

les trithérapies ont révélé le petit nombre de …

A

cellules infectées de manière latente qui persistent dans le temps

39
Q

nommer les 2 types de réservoirs lors de la persistance du VIH

A

réservoir actif et latent

40
Q

nommer les 3 mécanismes de la persistance

A

1) réplication virale résiduelle
2) maintien des cellules T mémoires infectées de façon latente par leur survie intrinsèque
3) maintien des cellules T mémoires infectées de façon latente par prolifération homéostatique ou induite par l’ag

41
Q

est-ce que le VIH continue de se répliquer à bas bruit lors de la trithérapie

A

oui, aucun antiretroviral n’empêche la production d’ARN viraux, de prots virales ou de particules virale si le génome viral intégré persiste

42
Q

la PCR ultrasensible + reverse transcription permet …

A

d’amplifier un faible nombre d’ARN avec une sensibilité accrue

43
Q

la PCR en temps réel permet…

A

de déterminer le nombre initial de copies d’un acide nucléique dans un échantillon

44
Q

est-il possible de mesurer une virémie résiduelle pendant les trithérapies

A

oui chez la majorité des personnes sous traitement efficace

45
Q

pk la réplication résiduelle à bas niveau est possible durant la trithérapie?

A

pcq souvent certains antiretroviraux ne pénètrent pas de façon optimale dans les tissus

46
Q

est-ce que intensifier le traitement antiretroviral a un impact sur la viremie residuelle

A

non, donc la viremie résiduelle n’est pas due à des cycles de réplication complets mais plus à la production continue depuis des réservoirs stables

47
Q

si la réplication résiduelle du VIH au cours des trithérapies reste controversée, …

A

l’existence d’un réservoir latent ne fait aucun doute

48
Q

nommer une différence entre la latence du VIH et celle des herpès virus

A

les herpes virus codent pour des prots qui induisent ou maintiennent un programme de latence virale, pas le VIH

49
Q

la latence du VIH est un …

A

accident immunologique

50
Q

nommer le lien entre la latence du VIH et la conformation de la chromatine

A

la latence du VIH est caractérisé par un état de acétyle des histones qui contribue à l’absence de production virale

51
Q

l’absence de certains facteurs de transcription et d’élongation pourrait contribuer à la latence du VIH (ex: 3)

A

NFAT et NF-kB
PTEFb (élongation)

52
Q

nommer 4 types de latence du VIH

A

latence complète = réservoir silencieux
réservoir compétent pour la transcription
réservoir compétent pour la traduction
réservoir compétent pour la réplication

53
Q

il est possible de mesure l’ADN du VIH total et intégré dans le génome de la cellule par …

A

PCR

54
Q

l’ADN viral intégré du VIH persiste au cours du …

A

traitement antiretroviral

55
Q

le VIH persiste surtout dans les cellules ..

A

de la memoire centrale (Tcm)
longue durée de vie

56
Q

quelle caractéristique des cellules de la mémoire centrale pourrait contribuer à la persistance du réservoir?

A

leur stabilité intrinsèque

57
Q

les ARN … sont rares chez les patients sous traitement efficace, mais on trouve fréquemment des ARN …

A

multi-épisses
non épisses

58
Q

définir le réservoir inductible

A

la fréquence de cellules ayant la capacité de produire des ARN viraux quand on les stimule in vitro

59
Q

quelle est la méthode de référence ce pour la quantification du réservoir latent?

A

test de co-culture (quantitative viral outgrowth assay ou QVOA)

60
Q

le QVOA est la seule méthode qui permet de mesurer quoi

A

une fréquence de cellules portant du virus compétent pour la réplication

61
Q

nommer les étapes du QVOA

A

1) isoler les cellules T CD4 (quiescente ou non)
2) stimuler pendant 48h avec PHA (morigène) et IL-2 + PBMCs allogeniques
3) ajouter des cellules “cibles”
4) poursuivre la culture 2-3 semaines en changeant le milieu tous les 3 jours
5) mesurer la production virale par ELISA p24 ou par RT-PCR (ARN viral)
6) compter le nombre de puits positifa a chaque dilution et estimer les unités infectieuses par million de cellule

62
Q

le sequencage complet du provirus permet d’identifier les virus … et les virus …

A

défectifs et intacts

63
Q

la taille réelle du reservoir est … par le QVOA et … par PCR

A

sous estimée
surestimée

64
Q

quels sont les 2 types de guérison du VIH

A

eradication
remission