Latence et persistance Flashcards
définir ce qu’est la latence virale
virus entre dans un état non replicatif persistant (“sommeil viral”), mais qui peut être reverté
la latence virale est une caractéristique de tous les …. et certains ….
herpesvirus
retrovirus
définir ce qu’est un réservoir viral
type cellulaire (ou site anatomique) dans lequel une forme de virus compétent pour la réplication persiste de manière plus stable que les cellules dans lesquelles le virus se multiplie de façon active
définir ce qu’est la phase de latence clinique
phase asymptomatique d’une infection persistante (ex: entre 2 résurgences herpétiques, phase asymptomatique du VIH…)
définir ce qu’est une infection virale persistante
infection chronique, pas d’élimination du pathogène, contraire d’une infection virale aiguë
(tout les herpes virus, parfois HCV, HIV)
définir ce qu’est une infection aiguë
virus infectieux et les symptômes disparaissent rapidement et définitivement
ex: influenza, adenovirus…
définir ce qu’est une infection aiguë avec complications tardives
virus infectieux disparaît mais certaines prots virales persistantes peuvent causer des complications tardives
ex: rougeole
définir ce qu’est une infection latente
après infection aiguë, virus persiste à l’état latent dans certaines cellules et peut être réactivé des années plus tard
ex: varicelle-zona
définir ce qu’est une infection chronique
après infection aiguë (symptomatique ou non), virus est produit en permanence et en absence de symptômes
ex: hépatites B et C
définir ce qu’est une infection lente
virus se réplique continuellement, sans causer de symptômes pendant plusieurs années jusqu’à une conséquence fatale
ex: VIH
nommer 3 types d’infections virales persistantes
infection latente
infection chronique
infection lente
nommer 2 types d’infection non persistantes
infection aiguë
infection aiguë avec complications tardives
les herpesvirus se répliquent dans les …. mais font la latence dans les ….
cellules épithéliales
neurones
l’établissement d’un programme de latence ou d’un programme lytique est parfois dépendant du …
type de cellules infectées par le virus
le type cellulaire dicte le choix entre …. et ….
replication active
latence
EBV se réplique activement dans les … mais est plutôt latent dans les ….
plasmocytes
cellules B mémoires
il existe plusieurs états de latence chez EBV et chacun sont caractérisés par un …
programme transcriptionnel propre
le VIH infecte les … de manière persistante
cellules T quiescentes
dans le cas des herpès virus, à quoi est associé la latence ?
production de prots virales spécifiques
différentes de celles produites lors de la phase lyrique
nommer une caractéristique de la latence
modulation (inhibition) de l’expression des gènes viraux
ex: conformation de la chromatine, miRNA produits par l’hôte ou le virus…)
pourquoi certains virus persistants veulent induire un programme anti-apoptotique?
pour assurer la survie de la cellule infectée et faire infection persistante
si des traces de SARS-COV-2 ont été trouvé dans les intestins d’un patient guéri, est-ce un signe de réservoir du virus?
non, car pour que ça soit un réservoir il faudrait montrer que le virus est capable de se réactiver
décrire l’immunité mise en place suite à une infection aiguë
réponse adaptative
décrire l’immunité mise en place lors d’une infection chronique avec production virale persistante
échappement à la réponse adaptative (pression de sélection immunitaire)
décrire l’immunité mise en place lors d’une infection chronique avec latence et réactivation
absence de reponse (silence immunologique) ou nouvelle réponse adaptée à l’expression de prots associées à la latence
décrire le lien entre la latence et le développement d’un vaccin
la latence est un obstacle majeur à la mise au point d’un vaccin
nommer un autre obstacle au vaccin VIH mis à part la latence
la grande diversite génétique du VIH
quelles sont les phases d’infection par le VIH
phase aiguë
phase chronique
sida
l’infection par le VIH est une infection … (…)
chronique (persistante)
comment la latence du VIH est-elle caractérisée?
par la présence d’un provirus intégré qui ne produit que peu ou pas de transcrits viraux et de prots virales
la latence du VIH est …, et le provirus est …. lorsque la cellule …. est activée
reversible
reactive
activée
la latence du VIH est une évènement très ….
rare
quel est le problème avec les cellules latentes du VIH
la grande majorité des cellules infectées par le VIH produisent activement des particules virales
une petite partie pourrait être infectée de manière latente mais sont difficiles à trouver
est-ce qu’il existe plusieurs familles d’antiretroviraux
oui en fonction de leurs modes d’action
définir les trithérapies
combinaison de 3 molécules contre le VIH
augmente espérance de vie
expliquer le mode d’action des trithérapies
n’éradiquent pas le VIH
permettent d’inhiber la réplication du VIH et donc la charge virale
comment sait on que le virus persiste à bas bruit dans les réservoirs au cours des trithérapies?
rebond viral après arrête des traitements
les trithérapies ont révélé le petit nombre de …
cellules infectées de manière latente qui persistent dans le temps
nommer les 2 types de réservoirs lors de la persistance du VIH
réservoir actif et latent
nommer les 3 mécanismes de la persistance
1) réplication virale résiduelle
2) maintien des cellules T mémoires infectées de façon latente par leur survie intrinsèque
3) maintien des cellules T mémoires infectées de façon latente par prolifération homéostatique ou induite par l’ag
est-ce que le VIH continue de se répliquer à bas bruit lors de la trithérapie
oui, aucun antiretroviral n’empêche la production d’ARN viraux, de prots virales ou de particules virale si le génome viral intégré persiste
la PCR ultrasensible + reverse transcription permet …
d’amplifier un faible nombre d’ARN avec une sensibilité accrue
la PCR en temps réel permet…
de déterminer le nombre initial de copies d’un acide nucléique dans un échantillon
est-il possible de mesurer une virémie résiduelle pendant les trithérapies
oui chez la majorité des personnes sous traitement efficace
pk la réplication résiduelle à bas niveau est possible durant la trithérapie?
pcq souvent certains antiretroviraux ne pénètrent pas de façon optimale dans les tissus
est-ce que intensifier le traitement antiretroviral a un impact sur la viremie residuelle
non, donc la viremie résiduelle n’est pas due à des cycles de réplication complets mais plus à la production continue depuis des réservoirs stables
si la réplication résiduelle du VIH au cours des trithérapies reste controversée, …
l’existence d’un réservoir latent ne fait aucun doute
nommer une différence entre la latence du VIH et celle des herpès virus
les herpes virus codent pour des prots qui induisent ou maintiennent un programme de latence virale, pas le VIH
la latence du VIH est un …
accident immunologique
nommer le lien entre la latence du VIH et la conformation de la chromatine
la latence du VIH est caractérisé par un état de acétyle des histones qui contribue à l’absence de production virale
l’absence de certains facteurs de transcription et d’élongation pourrait contribuer à la latence du VIH (ex: 3)
NFAT et NF-kB
PTEFb (élongation)
nommer 4 types de latence du VIH
latence complète = réservoir silencieux
réservoir compétent pour la transcription
réservoir compétent pour la traduction
réservoir compétent pour la réplication
il est possible de mesure l’ADN du VIH total et intégré dans le génome de la cellule par …
PCR
l’ADN viral intégré du VIH persiste au cours du …
traitement antiretroviral
le VIH persiste surtout dans les cellules ..
de la memoire centrale (Tcm)
longue durée de vie
quelle caractéristique des cellules de la mémoire centrale pourrait contribuer à la persistance du réservoir?
leur stabilité intrinsèque
les ARN … sont rares chez les patients sous traitement efficace, mais on trouve fréquemment des ARN …
multi-épisses
non épisses
définir le réservoir inductible
la fréquence de cellules ayant la capacité de produire des ARN viraux quand on les stimule in vitro
quelle est la méthode de référence ce pour la quantification du réservoir latent?
test de co-culture (quantitative viral outgrowth assay ou QVOA)
le QVOA est la seule méthode qui permet de mesurer quoi
une fréquence de cellules portant du virus compétent pour la réplication
nommer les étapes du QVOA
1) isoler les cellules T CD4 (quiescente ou non)
2) stimuler pendant 48h avec PHA (morigène) et IL-2 + PBMCs allogeniques
3) ajouter des cellules “cibles”
4) poursuivre la culture 2-3 semaines en changeant le milieu tous les 3 jours
5) mesurer la production virale par ELISA p24 ou par RT-PCR (ARN viral)
6) compter le nombre de puits positifa a chaque dilution et estimer les unités infectieuses par million de cellule
le sequencage complet du provirus permet d’identifier les virus … et les virus …
défectifs et intacts
la taille réelle du reservoir est … par le QVOA et … par PCR
sous estimée
surestimée
quels sont les 2 types de guérison du VIH
eradication
remission
