Cycles de replication virale

Question 1

Nomme ce que les virus peuvent infecter

Answer 1

animaux, plantes, levures, champignons, arthropodes, protozoaires, bactéries, virus

Question 2

classification des virus en fonction de…

Answer 2

genome, ARN ou ADN, enveloppe ou non, + ou -

Question 3

synthèse de ARN dépend de …. ou ….

Answer 3

ARN ou reverse transcription

Question 4

est-ce que les ARN pol ont une activité proof reading?

Answer 4

NON

Question 5

quelles sont les conséquences pour les virus ARN (ARN pol n’a pas d’activité proof reading)?

Answer 5

limite taille du génome
bcp de particules non infectieuses (coût élevé)
évolution rapide (compense pour particules non infectieuses)
pas de clone homogène

Question 6

majorité des virus ARN répliquent leur matériel génétique dans le ….
donc les …. y sont présents

Answer 6

cytoplasme
ribosomes

Question 7

cmt les virus ARN (petit genome) font pour avoir bcp de prots? (3)

Answer 7

fragmentation au niveau du précurseur protéique
fragmentation ARNm
fragmentation du genome

Question 8

pourquoi la majorité des virus ARN ont un genome simple brin?

Answer 8

pcq double brin enclencherait immunité (plus facilement détectable) pcq plus difficile pour ribosomes

Question 9

nommer les familles de virus ARN qui se répliquent au noyau (4)

Answer 9

Arteriviridae
Filoviridae
Orthomyxoviridae
Delta virus

Question 10

nommer la différence entre les génomes ARN + et - au niveau de la capside

Answer 10

ARN + se détache de la capside au début de l’infection
ARN - reste liée à la capside tout au long du cycle de replication

Question 11

chez les virus ARN +, la synthèse de ARN pol virale dépend de ….

Answer 11

ARN (RdRp)

Question 12

Quel est le rôle de RdRp chez les virus ARN+?

Answer 12

réplique le génome ARN (avec aide de d’autres prots non structurales)

Question 13

chez les virus ARN+, après la replication du genome ARN, les prots structurales sont assemblées en …

Answer 13

virions

Question 14

chez les virus ARN-, le genome ARN- est transcrit en … par …

Answer 14

ARN+
RdRp virale (amenée par le virus)

Question 15

chez les virus ARN double brin, le génome parental demeure associé à des …

Answer 15

prots structurales

Question 16

chez virus ARN double brin, que font les ARN+ après la replication virale?

Answer 16

ils quittent le complexe pour être traduits

Question 17

quel est un problème des virus à génome linéaire?

Answer 17

“end problem”
perte des extrémités du génome a chaque cycle de replication

Question 18

cmt les virus à genome linéaire se protègent du “end problem”? (6)

Answer 18

circularise génome
lie prots cellulaires aux extrémités
lie prots virales aux extrémités
3’polyA
ARN px adopter des structures secondaires (ex: ARNt)
complémentarité des extrémités du génome

Question 19

pourquoi les virus ARN- veulent produire un ARNm?

Answer 19

pour se rendre à ARN+

Question 20

cmt les virus ARN- et double brin synthétisent un ARNm?

Answer 20

avec RdRp

Question 21

est-ce que les virus ARN+ doivent synthétiser un ARNm comme les ARN-?

Answer 21

non car le ARN+ agit comme ARNm

Question 22

donner les caractéristiques des Picornavirus

Answer 22

non enveloppe
ARN
simple brin
+

Question 23

décrire les principales étapes du cycle de réplication d’un virus ARN sb+

Answer 23

1) interaction avec récepteur cellulaire
2) décapsidation
3) traduction et clivage du précurseur protéique (donne prots non structurales et structurales)
4) replication du génome grâce à sa propre ARN pol virale, donne lieu à ARN-
5) ARN- sert de matrice pour faire plus de ARN+ (plus de traduction)
6) traduction des ARN+
7) encapsidation du genome viral ARN+
8) relâche des particules virales (bourgeonnement ou lyse cellulaire)

Question 24

nommer les caractéristiques des Flavivirus

Answer 24

enveloppes
ARN
simple brin
+

Question 25

nommer une particularité du cycle de réplication des Picorna et des Flavivirus

Answer 25

la replication se fait dans des vésicules (PAS DANS LE CYTOPLASME)

Question 26

nommer les caractéristiques des Bunyavirus

Answer 26

enveloppes
ARN
simple brin
-
3 fragments (L, S, M)

Question 27

expliquer les étapes principales du cycle de replication des virus ARN-

Answer 27

1) interaction avec récepteur cellulaire
2) entree via endocytose
3) decapsidation
4) transcription de ARN- en ARNm et en ARN+ par ARN pol virale
5) traduction de ARN+ pour faire prots structurales et non structurales
6) transcription des ARNm pour redevenir ARN-
7) assemblage
8) bourgeonnement (relâche virale)

Question 28

expliquer le cycle de réplication des coronavirus

Answer 28

1) S interagit avec ACE2
2) entrée du virus à la membrane plasmique ou par endocytose
3) ARN+ sert de matrice pour synthétiser une ARN pol ARN-dep
4) ARN pol synthétisée assemble le brin - (en utilisant brin + comme matrice)
5) ARN- sert de matrice pour transcrire de petits ARNs sous génomiques
6) ARNs sous génomiques sont utilisées pour fabriquer les prots
7) ARN- sert de matrice pour créer ARN+, ARN+ s’associe à prot N
8) assemblage
9 relâchement par exocytose

Question 29

donner les caractéristiques des coronavirus

Answer 29

ARN
enveloppes
simple brin
+

Question 30

donner les caractéristiques des rétrovirus (comme VIH)

Answer 30

ARN
enveloppes
simple brin
+

Question 31

expliquer le cycle de réplication du VIH

Answer 31

1) interaction Env avec CD4, changement de conformation Env, interaction avec co récepteurs, changement de conformation Env, peptide de fusion
2) decapsidation dans cytoplasme
3) reverse transcription (ARN -> ADN double brin)
4) import nucléaire du complexe de pré intégration
5) insertion du provirus dans génome cellulaire
6) transcription à partir du promoteur viral LTR par transactivator Tat
7) export des ARNm vers cytoplasme (besoin de Rev)
8) traduction prots accessoires et structurales
9) transport de Gag vers membrane plasmique
10) bourgeonnement

Question 32

qu’est-ce que les virus ADN doivent faire que les virus ARN n’ont pas besoin?

Answer 32

• transport de ADN au noyau
• initier transcription à partir de ADN
• preparer cellule pour replication ADN
• encapsidation de ADN viral
• sortir matériel génétique du noyau

Question 33

cmt les virus ADN font pour utiliser la machinerie cellulaire juste pour eux? (8 techniques)

Answer 33

1) initiation de la transcription (enhancer et prots virales qui facilitent transcription)
2) stimulation de l’expression des gènes (competition avec promoteurs cell)
3) effets sur cycle cellulaire (inhibe p53 et Rb, stimulation cellulaire via facteurs de croissance)
4) provision de nucleotides pour répliquer ADN (inactivation de Rb et relâche de facteurs E2F, capacité de coder pour leur propre enzymes)
5) initiation de réplication virale
6) recrutement de prots cellulaires nécessaires à la fourche de réplication
7) complétion du génome ADN (end réplication problem)
8) évasion des défenses de l’hôte (latence, apoptosis)

Question 34

nommer les caractéristiques du HSV

Answer 34

virus ADN

Question 35

nommer les caractéristiques de Hepadnavirus

Answer 35

virus ADN

Question 36

nommer caractéristiques de adenovirus

Answer 36

virus ADN

Question 37

expliquer les grandes étapes du cycle de réplication d’un virus ADN

Answer 37

1) attachement et entrée virale (membrane plasmique ou endocytose)
2) decapsidation
3) transport des particules virales au noyau de cellule
4) relâche de ADN viral dans le noyau (px se circulariser)
5) transcription de ADN par ARN pol II pour synthétiser protéines, peut bloquer certains mécanismes cellulaires pour augmenter transcription
6) assemblage de la capside
7) relâche des particules virales (lyse cellulaire ou bourgeonnement)