Cycles de replication virale Flashcards
Nomme ce que les virus peuvent infecter
animaux, plantes, levures, champignons, arthropodes, protozoaires, bactéries, virus
classification des virus en fonction de…
genome, ARN ou ADN, enveloppe ou non, + ou -
synthèse de ARN dépend de …. ou ….
ARN ou reverse transcription
est-ce que les ARN pol ont une activité proof reading?
NON
quelles sont les conséquences pour les virus ARN (ARN pol n’a pas d’activité proof reading)?
limite taille du génome
bcp de particules non infectieuses (coût élevé)
évolution rapide (compense pour particules non infectieuses)
pas de clone homogène
majorité des virus ARN répliquent leur matériel génétique dans le ….
donc les …. y sont présents
cytoplasme
ribosomes
cmt les virus ARN (petit genome) font pour avoir bcp de prots? (3)
fragmentation au niveau du précurseur protéique
fragmentation ARNm
fragmentation du genome
pourquoi la majorité des virus ARN ont un genome simple brin?
pcq double brin enclencherait immunité (plus facilement détectable) pcq plus difficile pour ribosomes
nommer les familles de virus ARN qui se répliquent au noyau (4)
Arteriviridae
Filoviridae
Orthomyxoviridae
Delta virus
nommer la différence entre les génomes ARN + et - au niveau de la capside
ARN + se détache de la capside au début de l’infection
ARN - reste liée à la capside tout au long du cycle de replication
chez les virus ARN +, la synthèse de ARN pol virale dépend de ….
ARN (RdRp)
Quel est le rôle de RdRp chez les virus ARN+?
réplique le génome ARN (avec aide de d’autres prots non structurales)
chez les virus ARN+, après la replication du genome ARN, les prots structurales sont assemblées en …
virions
chez les virus ARN-, le genome ARN- est transcrit en … par …
ARN+
RdRp virale (amenée par le virus)
chez les virus ARN double brin, le génome parental demeure associé à des …
prots structurales
chez virus ARN double brin, que font les ARN+ après la replication virale?
ils quittent le complexe pour être traduits
quel est un problème des virus à génome linéaire?
“end problem”
perte des extrémités du génome a chaque cycle de replication
cmt les virus à genome linéaire se protègent du “end problem”? (6)
circularise génome
lie prots cellulaires aux extrémités
lie prots virales aux extrémités
3’polyA
ARN px adopter des structures secondaires (ex: ARNt)
complémentarité des extrémités du génome
pourquoi les virus ARN- veulent produire un ARNm?
pour se rendre à ARN+
cmt les virus ARN- et double brin synthétisent un ARNm?
avec RdRp
est-ce que les virus ARN+ doivent synthétiser un ARNm comme les ARN-?
non car le ARN+ agit comme ARNm
donner les caractéristiques des Picornavirus
non enveloppe
ARN
simple brin
+
décrire les principales étapes du cycle de réplication d’un virus ARN sb+
1) interaction avec récepteur cellulaire
2) décapsidation
3) traduction et clivage du précurseur protéique (donne prots non structurales et structurales)
4) replication du génome grâce à sa propre ARN pol virale, donne lieu à ARN-
5) ARN- sert de matrice pour faire plus de ARN+ (plus de traduction)
6) traduction des ARN+
7) encapsidation du genome viral ARN+
8) relâche des particules virales (bourgeonnement ou lyse cellulaire)
nommer les caractéristiques des Flavivirus
enveloppes
ARN
simple brin
+
nommer une particularité du cycle de réplication des Picorna et des Flavivirus
la replication se fait dans des vésicules (PAS DANS LE CYTOPLASME)
nommer les caractéristiques des Bunyavirus
enveloppes
ARN
simple brin
-
3 fragments (L, S, M)
expliquer les étapes principales du cycle de replication des virus ARN-
1) interaction avec récepteur cellulaire
2) entree via endocytose
3) decapsidation
4) transcription de ARN- en ARNm et en ARN+ par ARN pol virale
5) traduction de ARN+ pour faire prots structurales et non structurales
6) transcription des ARNm pour redevenir ARN-
7) assemblage
8) bourgeonnement (relâche virale)
expliquer le cycle de réplication des coronavirus
1) S interagit avec ACE2
2) entrée du virus à la membrane plasmique ou par endocytose
3) ARN+ sert de matrice pour synthétiser une ARN pol ARN-dep
4) ARN pol synthétisée assemble le brin - (en utilisant brin + comme matrice)
5) ARN- sert de matrice pour transcrire de petits ARNs sous génomiques
6) ARNs sous génomiques sont utilisées pour fabriquer les prots
7) ARN- sert de matrice pour créer ARN+, ARN+ s’associe à prot N
8) assemblage
9 relâchement par exocytose
donner les caractéristiques des coronavirus
ARN
enveloppes
simple brin
+
donner les caractéristiques des rétrovirus (comme VIH)
ARN
enveloppes
simple brin
+
expliquer le cycle de réplication du VIH
1) interaction Env avec CD4, changement de conformation Env, interaction avec co récepteurs, changement de conformation Env, peptide de fusion
2) decapsidation dans cytoplasme
3) reverse transcription (ARN -> ADN double brin)
4) import nucléaire du complexe de pré intégration
5) insertion du provirus dans génome cellulaire
6) transcription à partir du promoteur viral LTR par transactivator Tat
7) export des ARNm vers cytoplasme (besoin de Rev)
8) traduction prots accessoires et structurales
9) transport de Gag vers membrane plasmique
10) bourgeonnement
qu’est-ce que les virus ADN doivent faire que les virus ARN n’ont pas besoin?
- transport de ADN au noyau
- initier transcription à partir de ADN
- preparer cellule pour replication ADN
- encapsidation de ADN viral
- sortir matériel génétique du noyau
cmt les virus ADN font pour utiliser la machinerie cellulaire juste pour eux? (8 techniques)
1) initiation de la transcription (enhancer et prots virales qui facilitent transcription)
2) stimulation de l’expression des gènes (competition avec promoteurs cell)
3) effets sur cycle cellulaire (inhibe p53 et Rb, stimulation cellulaire via facteurs de croissance)
4) provision de nucleotides pour répliquer ADN (inactivation de Rb et relâche de facteurs E2F, capacité de coder pour leur propre enzymes)
5) initiation de réplication virale
6) recrutement de prots cellulaires nécessaires à la fourche de réplication
7) complétion du génome ADN (end réplication problem)
8) évasion des défenses de l’hôte (latence, apoptosis)
nommer les caractéristiques du HSV
virus ADN
nommer les caractéristiques de Hepadnavirus
virus ADN
nommer caractéristiques de adenovirus
virus ADN
expliquer les grandes étapes du cycle de réplication d’un virus ADN
1) attachement et entrée virale (membrane plasmique ou endocytose)
2) decapsidation
3) transport des particules virales au noyau de cellule
4) relâche de ADN viral dans le noyau (px se circulariser)
5) transcription de ADN par ARN pol II pour synthétiser protéines, peut bloquer certains mécanismes cellulaires pour augmenter transcription
6) assemblage de la capside
7) relâche des particules virales (lyse cellulaire ou bourgeonnement)
