Laborationsteori Flashcards
Vad är mikrobiologi?
- Mikro = liten på grekiska
- Biologi = läran om levande varelser
- Mikrobiologi = läran om små organismer
Bakteriers funktion (allmänt)?
- De flesta orsakar inte sjukdom
- De flesta är saprofyter och bryter ned organiskt material, t.ex. döda växter
- Är viktiga i olika biologiska system
- Är nödvändiga för djur och människors liv
- Finns troligen 1 miljon arter, vi känner till minst 7000 arter
Olika typer av bakterier? (4 st)
- Apatogena bakterier
- Patogena bakterier (ex. salmonella)
- Opportunister (ex. streptokocker)
- Bakterier i livsmedelsindustrin
Faktorer som påverkar bakterietillväxt?
- Genetiska faktorer
- Tillgång till näringsämnen (kol, kväve, spårämnen, vitaminer)
- Tillgång till syre
- Fukt
- pH
- Temperatur
Vad är generationstid?
den tid det tar för en bakterie att dela sig i två dotterceller
Hur snabbt förökar sig bakterier?
Generationstiden varierar mellan olika bakteriearter, från 17 min under optimala förhållanden för Escherichia coli till 15 tim för mycobacterier som orsakar tuberkulos
Bakterier delas in i grupper? (4 st)
-Gram negativa/positiva (blåa eller röda)
Morfologi; Kocker, stavar och spiralformade
Förhållande till syre; Aeroba, Anaeroba och Fakultativt anaeroba
Nomenklaturen - namngivning följer Linnés system. Genusnamn (efternamn) och speciesnamn (förnamn)
Identifiering av bakterier? (utifrån utseende och tester)
- Familj, genus, art
- Fenotyp: bakteriens syn och märkbara egenskaper
- Mikro och makromorfologi; form och struktur
- Biokemiska tester
- Antigena egenskaper; förmåga att uppväcka antikroppssvar, serotypning
- Resistensmönster; känslighet för antibiotika
- Genotyp; En individs genetiska egenskaper, alltså dess genom (DNA)
- Molekylärbiologiska metoder såsom PCR
Vad är en bakteriekoloni?
- Bakterier som sprids på ett passande substrat och i en omgivning där den trivs, bildar kolonier
- En koloni motsvarar en colony forming unit (cfu), genetiskt identiska bakterier
- Bakterierna kan kännas igen på koloniutseendet
Vad är hemolys?
Kan ses på blodagar innebär att röda blodkroppar (erytrocyter) spricker sönder (hemolyserar) och släpper ut cellinnehållet (hemoglobin).
- Vissa bakterier producerar s.k. hemolysiner, som ger dem hemolytisk förmåga. De flesta hemolysiner är proteiner (enzymer eller poriner), men det finns även andra typer av hemolysiner som rhamnolipider och biologiska detergenter
Blå agar (indikator substrat) - användning?
Blå agar med laktos används ofta för detektion och typning av medlemmar av familjen Enterobacteriacaea, därför att det kan användas för att skilja på laktosfermenterare och icke-laktosfermenterare
- Laktosfermenterande bakterier sänker pH på mediet, som blir surt och det ändrar då färg från blå-lila till gult
MacConkey-agar (selektivt medium) - användning?
MacConkey-agar är ett selektivt odlingsmedium, som används för att odla gramnegativa bakterier och för att skilja på sådana som fermenterar och de som inte fermenterar laktos.
- Laktosfermenterande bakterier (Escherichia coli, Enterobacter spp. och Klebsiella spp.) bildar kolonier, som ser röda eller skära ut, därför att syra bildas när laktos fermenteras och odlingsmediet ändrar färg.
- Icke-laktosfermenterande bakterier (Proteus spp, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella spp och Shigella spp.) bildar kolonier, som ser gulaktiga, vita eller färglösa ut.
Selektiva substrat (2 st)?
XLD används för identifiering av Salmonella
CLED agar används för att förhindra Proteus spp. att svärma. Används t.ex. vid urinprover
Bakteriers (koloniers) storlek?
Nålstickstora kolonier (<1 mm i diameter)
Små kolonier (1-2 mm i diameter)
Medelstora kolonier (2-3 mm i diameter)
Stora kolonier (>3 mm i diameter)
Vad är gramfärgning?
Färgningsteknik med vilken man kan skilja på två stora grupper av bakterier, grampositiva och gramnegativa bakterier, som färgas mörklila respektive skära till röda
Bakteriers former? (3 st)
Stavar (baciller)
Kocker
Böjda/spiralformade
Många bakterier är rörliga och de kan förflytta sig genom att utnyttja principiellt skilda mekanismer, vilka?
Simmande förflyttning med hjälp av flageller
Ryckande rörelse med hjälp av typ IV pili (fimbrier)
Glidande rörelse på ytor
Rörelse genom användning av värdcellens cytoskelet
Vad är mastit?
Mastit betyder inflammation i juvret
Klinisk (=syn-/kännbara) symtom i mjölk och/eller juver. Kons allmäntillstånd kan också vara påverkat
Subklinisk = inga synbara symtom i mjölk och juver. Denna form av mastit upptäcks oftast genom att antalet celler i mjölken undersöks
Infektiös och icke infektiös mastit?
Infektiös mastit
- Bakterien via spenkanalen
- Från kon själv, andra kor eller från omgivningen
Icke infektiösa mastiter
- Trauma eller ev toxiner är utlösande faktor förekommer
- Vanligen uppträder mastit en juverfjärdedel, men ibland kan även flera drabbas samtidigt.
Mastit - akut och kronisk?
Akut = hastigt uppkommande (en eller ett par dagar), inga tecken (t.ex. förhöjda celltal eller kliniska symtom) på mastit har setts tidigare
Kronisk = långvarigt förlopp (har pågått under längre tid (veckor); tecken (t.ex. höga celltal eller kliniska symtom) på mastit har setts tidigare)
Mastit - Vanligast förekommande bakterier hos olika djurslag?
Nötkreatur, Staf. aureus, mastit streptokocker, E. coli
Får, get, Staf. aureus, E. coli
Svin, E. coli
Hund, Staph pseudintermedius (hundens streptokock)
Häst, beta-hemolyserande streptokocker
Vad händer vid mastit?
- Lokal produktion av inflammations markörer
- Ökad permeabilitet mjölk-blod
- Läckage av joner, proteiner och enzymer
- Celltal ökar (framförallt vita blodkroppar), friska kor ca 50 000 celler/ml
Vad är kaliumhydroxid (KOH) test?
- Syfter med KOH testet är att identifiera gramnegativa bakterier
- KOH löser upp det tunna peptidglykanlagret i cellväggen hos gramnegativa bakterier, men påverkar inte cellväggen hos grampositiva bakterier.
- Lyseringen av cellväggen hos gramnegativer innebär att innehållet inklusive DNA frigörs
- Frisläppt DNA gör lösningen viskös, fastnar på plastöglan och blir tråddragande
- Cellväggen hos grampositiva bakterier påverkas inte av KOH
Positivt resultat: Lösningen blir viskös (G-)
Negativt resultat: Lösningen blir inte viskös (G+)
Vad är oxidastest?
Oxidas-testet används för identifiering av gramnegativa bakterier. T.ex. för att identifiera medlemmar av familjen Enterobacteriaceae, som är oxidas-negativa
Positivt testresultat: Mörkt blålila färgomslag inom 10-30 sek
Negativt testresultat: Inget färgomslag eller färgomslag efter med än 30 sek
Vad är indoltest?
Användning: Konfirmering av framförallt av misstänkta E. coli-stammar.
Positivt testresultat: Blått färgomslag inom 10 sek
Negativt testresultat: Inget färgomslag
Vad är katalas test?
- Många bakterier producerar enzymet katalas, som ingår i bakteriernas enzymsystem för avgiftning av H2O2 (väteperoxid)
- H2O2 bildas från superoxidradikalen med hjälp av enzymet superoxiddismutas. Många syretoleranta bakterier har peroxidas i stället för katalas. Obligata anaerober saknar både superoxiddismutas och katalas.
- Katalas innehåller en hemgrupp vid den aktiva ytan och följande reaktion katalyseras med ett mycket högt omsättningstal (turnover number):
- 2 H2O2 → 2 H2O + O2
- Katalastestet används huvudsakligen för grampositiva bakterier och kan t.ex. utnyttjas för att skilja Staphylococcus spp. och Micrococcus spp., som är katalaspositiva från Streptococcus spp. respektive Enterococcus spp. som är katalasnegativa
En katalas positiv bakterie ger gasbildning (O2) i form av bubblor
En katalas negativ bakterie ger ingen gasbildning
Vad är Salmonella?
- Salmonella är en zoonotisk bakterie
- Vanlig i stora delar av världen hos många olika djurslag
- Utsöndras i avföringen - Sprids vidare via vatten, livsmedel eller kontakt med smittade djur
- Oftast akut insjuknande (inkubationstid ca 1-3 dygn)
- Buksmärtor, feber, diarréer och ibland kräkningar
- Ffa tarminfektioner på de flesta djurslag inklusive människa, vanlig är Salmonella Typhimurium
- Även infektioner i andra organ kan förekomma
- Symptomfria bärare
- Kräldjur har Salmonella i sin normalflora
- Salmonellabakterier överlever längre under rätt förhållanden i omgivningen
- Zoonos
- Hur infektionen avlöper beror på smittdos, virulens, immunstatus hos värden
Kolonimorfologi och andra karaktäristika?
Storlek
Form
Profil
Färg
Lukt
Svärmning
Hemolys
Kolonimorfologi och andra karaktäristika?
Storlek
Form
Profil
Färg
Lukt
Svärmning
Hemolys
Vad är hemolys? Vad är och gör hemolysiner?
Vid hemolys spränger bakterierna sönder de röda blodkropparna, för att komma åt järn
- Hemolysiner bildar en klar zon runt kolonin alternativt en ofullständig, grumlig hemolys runt kolonin
- Hemolysinerna är toxiner som verkar in vivo och orsakar skada på värdens celler
Vad är alfa-hemolys? + ex på bakterier
Alfa hemolys är ofullständig och kolonien omges av en grönaktig färg
Ex. på bakterier med alfa-hemolys: Erysipelothrix rhusiopathiae, Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae
Vad är beta-hemolys? + ex. på bakterier
Beta-hemolys eller fullständig hemolys ger en klar zon runt bakteriekolonin, en komplett lysis av erythrocyter.
Ex. på bakterier med Beta-hemolys: Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, Streptococcus equi subsp. equi, Trueperella pyogenes
Vad är dubbel hemolys? + ex. på bakterier
Dubbel hemolyszon på blodagar en klar (fullständig) och smal inre zon samt en grumlig (partiell) och bred yttre zon
- Har mer än en hemolysin
Ex. på bakterier med dubbel hemolys: Staphylococcus aureus subsp. aureus, Staphylococcus pseudintermedius
Grampositiva bakterier har en …. reaktion på KOH testet?
Negativ reaktion
Vad händer vid KOH test hos gram+ och gram- bakterier?
- Vid gramfärgning dehydreras bakterien av acetonsprit, färgen stannar kvar hos grampositiva bakterier. När gramnegativa bakterier behandlas med acetonsprit, så löses yttermembranet upp och KV-I-komplexet tvättas ut.
- KOH löser upp det tunna peptidoglykanlagret i cellväggen hos gramnegativa bakterier
- Cellväggen hos grampositiva bakterier påverkas inte av KOH, då de har ett tjockare peptidoglykanlager
Gramnegativa bakterier har en …. reaktion på KOH testet?
Positiv reaktion
Negativa stavar (gramnegativa) har en …. reaktion på oxidas test
Negativ reaktion
- Oxidas negativ
Positiva stavar (gramnegativa) har en …. reaktion på oxidas test
Positiv reaktion
- Oxidas positiv
Vad är Order Enterobacterales? (+ exempel)
- Finns i jord, vatten, utgör en viktig del av bakteriefloran hos djur och människor
- Tarmflorabakterier, hämmas inte av gallsalter
- Stor order med mer än 40 olika släkten, 180 olika arter, har nyligen blivit uppdelat i sju familjer
- Kallas ibland även för koliformer
- Gramnegativ stav
- Oxidas negativ
Ex. Escherichia, Klebsiella & Salmonella
Vad är E. coli (escherichia coli)? (+ infektioner)
- Tarmbakterie
- Tillhör normalfloran
- Vissa stammar patogena
- Rörlig (har flageller), orörliga stammar finns
- Vissa stammar hemolyserar
- Patogena E. coli orsakar tarminfektioner och septikemi framförallt hos unga djur
- Urinvägsinfektioner (flera djurslag)
- Livmoderinflammationer (fler djurslag)
- Mastit = juverinflammation, (framförallt nötkreatur)
Vad är Klebsiella pneumoniae? (makromorfologi, mikromorfologi, virulensfaktorer)
Makromorfologi
- Mukösa kolonier pga kapselbildning
- Ej hemolyserande
- Laktospositiv
Mikromorfologi
- Orörliga stavar
Virulensfaktorer
- Kraftig kapselbildning
- Adhesiner
- Siderophorer
- Endotoxin
Vad är Pseudomonas aeruginosa?
- Omgivningsbakterie jord, vatten, växter
- Kräver ej mycket näring
- Opportunist
- Infekterar många djurslag; öroninflammation hund, ofta efter antibiotikabehandling
- Naturlig antibiotikaresistent
- Gramnegativ stav
- Oxidas positiv
Vad är Genus Streptococcus?
- Grampositiv kock
- Ej sporbildare
- Orörlig
- Katalasnegativ
- Vanligen kommensaler på slemhinnor utom Streptococcus equi subsp equi. (kvarka hos häst)
- Vanligen patogen
- Pyogen
- Växer i kedjor
- Fakultativt anaeroba
- Grupperas i serologiska grupper (Lancefield) baserat på polysackarider i cellväggen. Parallellt används artnamnen
- Många arter av streptokocker är patogena
- Är ett stort problem - förekommer i rad olika sjukdomar hos djur och människor
- Vissa streptokocker hemolyserar
Vad är Genus Staphylococcus?
- Normalflorebakterie, slemhinnor, hud
- Grampositiv kock
- Relativt tålig mot uttorkning
- Bildar inte sporer
- Orörlig
- Katalaspositiv
- Viktig patogen
- Tål hög salthalt
Sjukdomar associerade med koagulaspositiva stafylokocker?
S. aureus orsakar infektioner i många olika organsystem samt sepsis
Vanliga:
- Opportunistiska infektioner i hud och öron
- Hund och katt: S. pseudintermedius
- Andra djurslag: S. aureus
- Sårinfektioner
Koagulasnegativa stafylokocker?
Ca. 20 tal arter, vissa är viktiga inom humanmedicin ex. Staphylococcus epidermidis
- Vanlig normalflorebakterie
- Kan bilda biofilm, virulensfaktor
- Tillhör normalfloran, anses skyddande
- Kan orsaka opportunistiska infektioner
- Hemolyserar inte
Vad växer på de olika agar plattorna - Dipslide, Uricult?
- Cledagar (B): det mesta växer där utom extremt krävande arter. Proteus spp. svärmar ej
- MacConkeyagar (A övre del) är en agar för Gramnegativa bakterier. Här växer inte Grampositiva bakterier.
- E. coli agar eller PGUA (A nedre del) - Skiljer mellan E. coli och Klebsiella
- E. coli bildar enzymet beta glukuronidas → E. coli brunsvarta kolonier, andra G- utan färgomslag.
Allmänt om bakterier som orsakar urinvägsinfektion (UVI)?
- I vagina och preputium finns en blandflora, med t.ex. koag neg. Staf., E. coli, Pasteurella spp., beta-hem Strept, alfa-hem Strept
- Bakterier som orsakar UVI kommer oftast från tarmen, t.ex. E.coli, Proteus spp.
- I distala (längst ned) urinröret (uretra) finns en normalflora; stafylokocker, streptokocker och E. coli
- Bakterierna kan komma via blodet eller vandra upp från uretra
- Bakterierna koloniserar lättare vid processer som skadat slemhinnan ex. efter förlossning, tumörer, urinsten, kateterisering
Vad kräver aeroba bakterier?
Syre
Vad kräver eller gynnas Mikroaerofil av?
Lägre O2
Vad kräver eller gynnas Kapnofil av?
Högre CO2
Fakultativt anaerob kan växa?
Med eller utan O2
Strikt/obligat anaerob växer?
Endast utan O2
Aerotolrant anaerob?
Anaerob metabolism, tål lite O2
Vad är anaeroba bakterier?
- Anaeroba bakterier saknar enzymer, som kan metabolisera väteperoxid och superoxidradikaler, de kan inte utnyttja syra i sin metabolism utan förgiftas och dör av syrgas
- Strikt anaeroba bakterier tål inte syre
- Syretoleranta anaeroba bakterier tål syre under kortare perioder
Sporbildande anarober?
- Genus - Clostridium
- Är sporbildare och bildar toxiner
Vad är Campylobacter spp.?
- Gramnegativ böjd staf
- Mikroaerofil
- Känslig för frysning inkl uttorkning
- Överlever vid låga temp.
- Thermotoletanta
- Vissa arter humanpatogena: C. jejuni (>90%) och C. coli
- Växer inte i rumstemperatur
- Reservoar: Djur ofta friska bärare. Framförallt fjäderfä, nöt, får och gris, hund och katt, vilda fåglar och vatten.
Vad är Capylobacter (kort)?
en zoonotisk bakterie som orsakar sjukdom hos människa
Fyra riskfaktorer associerade med Campylobacter?
- Allmän ordning
- Andra djur i närheten
- Delad slakt
- Byte av skodon
