La virologie Flashcards
Qu’est-ce qu’un virus ?
Un agent infectieux qui affectent tous les organismes, impliqué dans de nombreuses pathologies et crée de nouveaux virus
Les virus sont-ils vivants ?
◦ Extracellulaire: molécules organiques
Inerte, absence de métabolisme
◦ Intracellulaire: réactions et molécules
caractéristiques des organismes vivants
Réplication d’acides nucléiques,
composition protéique…
Un parasite intracellulaire est-il obligatoire ?
Oui, il monopolise les activités cellulaires ce qui crée des particules virales.
La structure acellulaire s’appelle le virion
Tous les virus n’ont aucun gène commun
Quels sont les constituants de base des virus ?
Acide nucléique
Capside
Enveloppe (fréquente)
Quels sont les acides nucléiques présentes chez les virus ?
De l’ADN ou de l’ARN
ADN monocaténaire (COVID)
ADN pluricaténaire
ARN monocaténaire
ARN pluricaténaire
La molécule est absente de la cellule infectée et se réplique avec des enzymes viraux
Taille: 4-1200 kilobases (kb) ◦ 1 gène ≈ 1 kb ◦ E. coli : 4 x 103 kb ◦ Homo sapiens : 106 kb Haploïde (quelques diploïdes) Génome fragmenté
Rôle: porter l'information génétique ◦ Protéines de structures, enzymes, reprogrammation cellulaire Présents chez tous les virus
Qu’est-ce que la capside ? Les types de symétrie ? Les types des capsomères ? Le rôle de la capside ?
Structure protéique externe à l’acide nucléique
Les capsomères sont un assemblage de protomères et les capsides sont un assemblage de capside ce qui donne la forme du virion
Types de symétrie:
◦ Polyèdrale
◦ Hélicoïdale.
◦ Binaire (mixte, complexe).
Polyèdrale: ◦ Rapport surface/volume ⇑ ◦ Virus de tailles variées ex. virus de la poliomyélite, fièvre aphteuse ◦ icosaèdre: 20 côtés ◦ assemblage de triangles
Hélicoidale. ◦ 1 type de capsomère ◦ Assemblage hélicoïdal autour de l’acide nucléique ◦ Bâtonnet creux ◦ Virus de la mosaïque du tabac, rage, oreillons, rougeole, bactériophage M13
Binaire: 2 types de symétries ◦ Exclusive au bactériophages ◦ Tête polyèdrale, queue hélicoïdale ◦ Assemblage complexe. ex. T paires (2,4,6...) d’E. coli, DT1 de Streptococcus thermophilus
3 types de capsomères:
◦ faces, arêtes, sommets
Rôle de la capside: ◦ protection de l'acide nucléique. ◦ attachement à la cellule cible via les protéines de capside, fibres/spicules ou queue
Elle est présente chez tous les virus
Qu’est-ce que l’enveloppe ?
Sa provenance, sa composition, son rôle
L’enveloppe des virus est une structure fréquente située à l’extérieure de la capside. Elle provient de la membrane cytoplasmique ou nucléaire de la cellule infectée
Elle est composée de phospholipides + protéines cellulaires + glycoprotéines virales
Ex: le virus de l’influenza possède de l’hémagglutinine (H) qui agglutines les hématies et la neuraminidase (N) qui digère l’acide neuraminique. Ce virus s’identifier selon le nombre de N et de H qu’il possède
Le rôle de l’enveloppe est de protéger l’hémagglutinine, Reconnaissance des récepteurs spécifiques sur la cellule hôte et pénétration/sortie de la celllule hôte (neuraminidase)
À quoi servent les protéines internes de la capside ?
Présentes chez plusieurs virus
◦ Nucléoprotéines:origine virale
empaquetage de l’acide nucléique viral
réplication et la lecture de l’acide nucléique viral
Absentes de la cellule infectée
Présente pour le covid
En résumé, quelles sont les structures du virion ?
Acide nucléique, capside, nucléoprotéines qui eux font partie du nucléocapside et l’enveloppe.
Qu’est-ce que la réplication virale comme moyen de proliférer les virus ?
Réplication ≠ reproduction
◦ Pas de croissance (⇑ de taille)
◦ Production de répliques (copies)
Assemblages de constituants viraux
Quelles sont les étapes de la réplication virale ?
Adsorption à la surface de la cellule.
Pénétration de la cellule infectée.
Réplication des constituants viraux.
Assemblages des constituants viraux.
Sortie des virus.
(A,P,R,A,S)
Expliquer l’étape d’adsorption à la surface de la cellule. Son exception
Reconnaissance: réversible
◦ Collision au hasard
◦ Forces électrostatiques
Attachement: irréversible ◦ Complémentarité virus-récepteurs ◦ Récepteurs ⇒ spécificité/tropisme λ: LamB, VIH:CD4/CCR5, Rage: récepteur d’acétylcholine
Exception: ◦ Virus des plantes absence de récepteurs connus piqûre d'insecte ou abrasion mécanique
Expliquer l’étape de la pénétration de la cellule infectée
Pour les bactériophages, c’est l’acide nucléique qui fait la pénétration, la capside reste à l’extérieur
Pour les virus animaux,
La fusion directe qui est un virus enveloppés
enveloppe/membrane cytoplasmique
L’endocytose qui est comme la phagocytose (virus enveloppés ou nus)
Après pénétration il va y avoir libération de la nucléocapside qui elle va faire la décapsidation qui se caractérise par la libération de l’acide nucléique
C’est le début de la phase d’éclipse
Expliquer l’étape de la réplication des constituants viraux
Dans les évènements précoces, les enzymes de réplication ou de lecture de l’acide nucléique augmentent la quantité d’acides nucléiques
Dans les évènements tardifs, il y a augmentation des protéines de structure. (capsomère, glycoprotéine d’enveloppe, protéines de queue et enzymes de lyse)
Expliquer l’étape de l’assemblage des constituants viraux.
Encapsidation
De manière polyèdrale:
Interaction capsomères-acide nucléique qui cause la fermeture de la capside
De manière hélicoidale:
Interaction capsomères-acide nucléique sous forme d’empilement hélicoïdal
De manière binaire:
Queue et tête qui se fait par un assemblage indépendant
La phase d’éclipse se fait en 1 à 10 heures pour les virus animaux et en quelques minutes pour les phages.
