la cellule Flashcards

1
Q

Nommez quelques caractéristiques de la cellule.

A

• Les cellules sont de petites entités physico-chimiques avec une membrane plasmique qui les entourent et qui contient une solution aqueuse concentré de produits chimiques. Elles ont la capacité de créer des copies d’elles-mêmes en grossissant et en se divisant par la suite, grâce à une ou plusieurs molécules d’ADN.

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2
Q

Quels sont les 2 théories cellulaires?

A
  • La cellule est l’unité de base du règne végétal et animal

* Toutes cellules proviennent d’une autre cellule

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3
Q

À quoi sert la membrane plasmique?

A

• La membrane plasmique permet de conserver ses nutriments a l’intérieur, d’excréter les déchets et de conserver les produit de synthèse.

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4
Q

Qu’est-ce qu’il y a sur la membrane plasmique?

A

Des protéines de transport

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5
Q

quel sont les trois types d’organismes?

A
  • Animaux, champignons et les bactéries: se nourrissent de d’autres vivants ou les produits chimiques qu’ils produisent (organotrophes)
  • Phototrophes : se nourrissent l’énergie lumineuse
  • Lithotrophes : les produits chimiques retrouver dans l’environnement (ex : sur une roche)
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6
Q

Quels sont les 3 divisions majeures du monde du vivant??

A
  • Bactéries : organisme unicellulaire  la plupart ne possédant pas de noyau et d’organites (procaryotes), possède un seule chromosome circulaire
  • Eucaryotes : organismes multicellulaires ou unicellulaire contenant un noyau et des organites
  • Archéobactéries : vivent dans des environnements extrêmes, ressemblent aux eucaryotes par leurs informations génétiques et ressemblent aux bactéries par leur apparence, leur métabolisme et leur conservation de l’énergie (procaryote  n’ont pas de noyau ni d’organites et unicellulaire)
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7
Q

quels est la différence entre le cytosol et le cytoplasme?

A

le cytoplasme contient les organites

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8
Q

Quels sont les différents organites de la cellule eucaryote?

A
  • On un noyau envelopper de la membrane nucléaire (double membrane constitué de pores)
  • Cytosquelette : système de protéines qui donne la forme et permet à la cellule de bouger
  • Vésicules
  • lysosomes
  • réticulum endoplasmique
  • mitochondrie
  • matrice extracellulaire
  • appareil de golgi
  • ribosome
  • peroxysomes
  • microtubules
  • centrosome avec une paire de centriole
  • membrane plasmique : entoure la cellule
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9
Q

Quel est la théorie symbiotique de l’apparition des cellules eucaryotes?

A

•Théorie endosymbiotique : À l’origine, certains organites des eucaryotes seraient des bactéries vivant à l’état libre qui se sont faites ingérées par des cellules plus grandes avec lesquelles elles ont établi une relation bénéfique mutuelle (symbiose).

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10
Q

quels sont les étapes pour isoler une cellule?

A

Défaire la matrice extracelullaire et les jonctions
Intercellulaires : Enzymes protéolytiques: V. g. trypsine, collagénase ET
EDTA: Calcium requis pour l’adhésion cellulaire
•Par contre, pour manipulation génétique ou une protéine rare →enrichissement supplémentaire d’un type cellulaire

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11
Q

quels sont les étapes pour faire une mise en culture?

A

• Étapes pour faire une mise en culture :
S’obtient par la dissociation de cellule de leur tissu
Nous obtenons une population plus homogène et cela est plus pratique
Cela requière une surface solide (gélose)

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12
Q

Qu’est-ce que le FACs?

A

• Le principe est basé sur un anticorps reconnaissant un antigène qui est couplé à un colorant fluorescent.
• Isolement :
1- De fines gouttes contenant une cellule passent à travers le faisceau d’un rayon laser
2- Les gouttes contenant des cellules fluorescentes sont chargées négativement et détecté
3- Celles-ci sont alors déviées par un champ électrique dans un contenant

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13
Q

Quel est la différence entre une culture primaire et une lignée cellulaire?

A
  • Une culture primaire est une culture prélevé directement des tissues et crée un passage pour devenir une culture secondaire
  • Lignée cellulaire : cellules qui sont immortelles
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14
Q

Quelle est la différence entre une cellule transformées et immortalisée?

A
  • Cellules transformées : Ce sont des cellules dérivé de tumeurs, qui sont déjà immortelles au départ. Celles-ci prolifère à haute densité et ne s’attachent pas = elles forment des tumeurs lorsqu’elles sont injectées.
  • Cellules immortalisées : cellules qui proviennent de tissus (ex) et qui ne sont pas immortelles au départ
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15
Q

Pourquoi la sénescence réplicative contribue à la mort des cellules dans une culture primaire?

A

• Sénescence réplicative : les télomères se raccourcirent, donc les chromosomes vont être touché, donc l’ADN = mort de la cellule.

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16
Q

Pourquoi le choc de culture contribue à la mort des cellules dans une culture primaire?

A

• Choc de culture : l’environnement qui change (pH) amène la mort des cellules qui ne peuvent vivre dans de telles conditions. Cela amène l’inhibition du cycle cellulaire.

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17
Q

Qu’est ce que la transfection?

A

• C’est la procédure par laquelle l’ADN est introduite dans les cellules. (différent de la transformation)

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18
Q

Qu’est-ce qu’on anticorps?

A

– Lesanticorps,ouimmunoglobulines(Ig),sontdes
protéinesproduitesparleslymphocytesBen
réponseàunemoléculeétrangèreouun
microorganisme(antigène)
– Ilslientfortementl’antigène
• Pourl’inactiver
• Lemarqueretenfaireunecibleàsadestruction
Chaquepopulationd’anticorpsestgénéréepar
unepopulationdistinctehomogènede
lymphocytesB

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19
Q

Qu’est-ce qu’un antigène?

A

unemoléculecontrelaquelleon

veutproduiredesanticorps

20
Q

qu’est-ce qu’un épitope?

A

unerégionsurl’antigènecontrelaquelleunanticorpss’est
développé

21
Q

Quelle est la différence entre les anticorps polyclonaux et monoclonaux?

A
  • Anticorps polyclonaux : c’est un mélange d’anticorps reconnaissant plusieurs épitopes d’un même antigène.
  • Anticorps monoclonaux : reconnaisse un seul épitope : sont hautement spécifique
22
Q

Décrire la fabrication d’hybridomes.

A
  • Dans une éprouvette, mettre un mélange de cellule normal de souris et une tumeur
  • Par la suite, les cellules vont se fusionner
  • Les cellules qui vont alors proliférer (les survivantes, après l’injection d’un poison) vont devenir des hybridomes
23
Q

À quoi peut servir les hybridomes?

A

À fabriquer des anticorps polyclonaux

24
Q

comment se réalise une immunobavardage?

A

1- Les protéines sont séparées par un gel 2D de polyacrylamide (horizontalement selon leur point isoélectrique et ensuite selon leur dimension)
2- Les protéines sont transférées sur une plaque de nitrocellulose et incubé en présence d’un anticorps qui reconnait les protéines phosphoryle sur thréonine pendant la mitose
3- La détection se fais avec un anticorps secondaire auquel il est fixé un produit coloré ou fluorescent

25
Q

Comment fait-on un immunoprécipitation?

A

1- Des anticorps sont couplés à des billes d’agarose
2- Ces billes sont couplées avec un extrait protéique qui est ensuite centrifugé
3- Les anticorps lient les protéines d’intérêt
4- Une deuxième centrifugation est exécuté pour récupérer seulement les protéines d’intérêt (les autres sont dans le surnageant)

26
Q

Comment fonctionnne une co-immunoprécipitation?

A

1- On mélange des anticorps couplé à des billes d’agarose avec des antigènes et des protéines qui interagissent avec l’antigène
2- Après centrifugation, l’antigène et la protéine sont ensemble et l’antigène réagit avec l’anticorps
3- Après une deuxième centrifugation on purifie et on garde les protéines et les antigènes, ce qui nous permet d’analyser la protéine d’intérêt.

27
Q

À quoi servent les systemes ZFN, TALEN et CRISPR?

A

LesZFN,lesTALENetlesystèmeCRISPRontété
utiliséspourgénérerdescellulesESetdes
cellulesiPS génétiquementmodifiées,etpour
générerdesKOdansdifférentsorganismes(C.
elegans,rat,souris,poissonzèbre)

28
Q

Comment fonctionne le CRISPR

A

1- Suite à une infection phagique, la bactérie excise un morceau de l’ADNdb du phage à proximité d’une séquence PAM
2- Cette excision lui permet de créé de petits ARN
3- L’endonucléase Cas9 est créé avec de petits ARN non codants qui agissent comme guide, ce qui permet de cliver le génome à l’ endroit désiré.
4- La petite séquence d’ADN est ensuite intégrée dans le locus CRISPR
5- Les cellules survivantes a l’infection et leurs descendants transcrive le locus CRISPR et produise les CRISPR ARN.
6- Lors d’une deuxième infection, ces petits ARN vont détruire l’ADN du virus grâce à la complémentarité avec l’ARN
**la cassette exprimant l’ARN guide (incl. la séquence cible) et la cassette exprimant la protéine Cas9 sont combinées dans un seul plasmide. Il n’y a donc qu’un seul plasmide à transfecter dans les cellules.

29
Q

A quoi sert CRISPR

A

-Utilisé pour faire du remplacement de gène avec un gène muté, en
fournissant l’ADN gabarit en trans
- Utilisation d’une protéine CAS9 mutante dépourvue d’activité
nucléase et fusionnée à des domaines protéique d’activation ou
d’inhibition de la transcription pour activer ou réprimer des gènes.

30
Q

Comment fonctionne un microscope optique?

A

Un microscope optique utilise des lentilles en verre pour converger la lumière sur ou au travers de l’échantillon pour former une image.

31
Q

Comment fonctionne un microscope électronique?

A

Le microscope électronique utilise des lentilles électrostatiques et électromagnétiques pour former l’image en contrôlant le faisceau d’électrons et le faire converger sur un plan particulier par rapport à l’échantillon

32
Q

Comment fonctionne la microscopie a fluorescence?

A

• Les molécules fluorescentes absorbent la lumière à une longueur d’onde (λ) spécifique et en émettre à
une λ différente
• Si on illumine une telle molécule à sa λ d’absorption
• puis la visualise à travers un filtre qui ne fait passer que la lumière de λ d’émission, elle rayonnera sur un fond noir!
• Permet de visualiser des molécules fluorescentes endogènes et exogènes

33
Q

Comment fonctionne la microscopie confocale?

A

• Un laser balaye le spécimen dans toute son épaisseur et sa largeur,
et concentre le faisceau lumineux sur un point à une profondeur
précise du spécimen
• Les données pour chaque point sont rassemblées séquentiellement et les images produites sont enregistrées par un ordinateur
• Forme une image composite de l’ensemble de la cellule ou un plan
très mince de la cellule

34
Q

Définir le mot résolution

A

en optique, le pouvoir de résolution d’un système optique désigne sa capacité à distinguer des détails fins

35
Q

Définir le mot détection

A

Le fait de déceler un corps à l’aide d’un appareil spécialisé

36
Q

Expliquer les différentes étapes de la préparation d’un échantillon pour la microscopie optique et électronique

A
  1. Fixation: Tue et préserve la structure de la cellule
    Fixateurs: glutaraldéhyde, formaldéhyde, méthanol, congélation
  2. Déshydratation: remplace l’eau avec du toluène
  3. Inclusion: milieu d’enrobage (cire ou epoxy), ou d’inclusion,
    solidifié par polymérisation.
  4. Coupe: microtome
  5. Coloration: augmente le contraste et rendent les
    membranes cellulaires et autres éléments de la cellule visibles.
37
Q

Qu’est-ce que l’hybridation in situ?

A

• Détection de séquences d’ADN ou d’ARN spécifiques
• Les sondes sont des ARN ou ADN complémentaires aux
séquences d’intérêt
• Repose sur les principes d’hybridation des acides nucléiques
• Appliquées sur les coupes de tissus, puis visualisées par :
1. radioautographie grâce aux nucléotides radioactifs présents dans la sonde
2. immunocytochimie grâce à la présence de nucléotides couplés à la digoxigénine,
alors détectée par un anticorps spécifique couplé à une
enzyme

38
Q

Qu’est-ce que l’immunocytochimie?

A

L’immunocytochimie permet de révéler et cibler une molécule biologique à l’échelle cellulaire depuis des anticorps spécifiques. Pour mettre en évidence ce complexe antigène-anticorps, on peut schématiser très simplement cette réaction, par :
• d’un côté, l’antigène que l’on veut localiser
• et l’anticorps primaire spécifique, qui va se fixer sur l’antigène (s’il le trouve).

39
Q

Définir la méthode FISH.

A

• Le FISH est une technique d’hybridation in situ utilisant des
sondes fluorescentes pour localiser une séquence spécifique d’ADN sur des chromosomes.
• Le FISH aussi utilisé pour localiser une séquence d’ADN sur
des chromosomes en métaphase

40
Q

Qu’elle est l’utilité des protéines fluorescentesdont celle avec la GFP?

A
  • Très utilisée comme molécule rapporteur poursuivre l’expression des gènes
  • Elles peuvent se lier avec un peptide de signal, une région codante pour une protéine
41
Q

Qu’est-ce que des gènes rapporteurs?

A

• Permet d’identifier les tissus et l’endroit dans la cellule où un gène est exprimé … ou comment sa localisation change en réponse à des
stimuli

42
Q

A quoi sert la technique FRET

A

• L’utilisation des protéines fluorescentes permet d’étudier les
propriétés cinétiques d’une protéine et de déterminer si elle interagit avec d’autres protéines

43
Q

Qu’elle est l’utilité FRAP et FLIP

A

Les données obtenues par FRAP ou FLIP permettent de
calculer de coefficient de diffusion des protéines
membranaires

Donne des informations sur la cinétique de la protéine

44
Q

à quoi servent les indicateurs émetteurs de lumière qui permettent de mesurer la concentration intracellulaire de plusieurs ions inorganique.

A
  • Utilisé pour mesurer la concentration intracellulaire du H+, Na+, K+, Cl- et Ca2+
  • Micro-électrode que l’on insère dans la cellule
  • Les changements de concentrations peuvent être analysés des ion-sensitive indicator ou une lumière d’émission révèle la concentration de l’ion.
45
Q

Qu’est-ce que la microscopie électronique a transmission?

A

• Les électrons non diffractés sont dirigés sur un écran par des lentilles objectifs et une lentille projecteur zone claire. Les électrons diffractés n’atteignent pas l’écran zone sombre

46
Q

Qu’est ce que la microscopie électronique à balayage?

A

1- Le spécimen est vaporisé avec un métal lourd
2- Le spécimen est balayé par un faisceau d’électrons
3- Émission d’électrons secondaires par le spécimen
4- Produit une vue 3D de la surface du spécimen
5- Résolution plus faible que TEM, soit ≅10 nm

47
Q

Qu’est-ce que immunomarquage?

A
  • Utilisation des anticorps en TEM
  • Incuber une coupe fine avec un Ac 1 aire, puis avec un Ac 2 aire fixé sur une particule d’or colloïdale opaque aux électrons → point noir
  • Des anticorps sont utilisés pour identifier chaque partie d’une particule. Chaque anticorps reconnait une protéine différente, ce qui permet de voir chaque protéine est placer ou sur la particule.