L'ARN, Transcription et Maturation Flashcards
Quel type d’ARN est le plus présent en terme de masse?
ARNribosomal
Quelle est la différence entre l’uridine et la pseudouridine?
Dans une pseudouridine, le ribose est attaché via une liaison glycosidique C-C à la base azotée, tandis que la liaison glycosidique se fait entre un azote et un carbone pour l’uridine. Le ribose a donc ‘‘migré’’ pour changer la liaison de place.
La synthèse d’ARN est catalysée par quel enzyme?
L’ARN polymérase
À quel endroit démarre la transcription?
Aux promoteurs
Chez les bactéries, quel éléments est essentiel à la polymérase pour reconnaître le promoteur?
L’élément sigma
Comment appelle-t-on une séquence de gènes transcrit ensemble comme un tout chez les bactéries?
Un opéron
Vrai ou faux. Chez les eucaryotes, les gènes sont généralement organisés en opérons
FAUX. Chaque gène eucaryote possède son propre promoteur.
Chez les eucaryotes, les protéines auxiliaires qui reconnaissent le promoteur se nomment comment?
Les facteurs de transcription.
Vrai ou faux. Chez les eucaryotes, la boita TATA du promoteur est l’équivalent de la boite -10 chez E.Coli
Vrai
À quoi sert le remodelage de la chromatine avant la transcription?
Rendre les séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de la transcription.
Qui recrute les complexes de remodelage de la chromatine?
Les facteurs de transcription.
À quoi sert l’ATPase contenue dans les complexes de remodelage de la chromatine?
Ils utilisent l’énergie de l’ATP pour le remodelage. Ils catalysent le glissement ou le déroulement de nucléosomes.
Quelle partie des histones est modifiée lors du remodelage de la chromatine?
Les queues N-Terminales des histones.
L’acétylation des histones se fait sur quel acides aminé?
Lysine
Quel enzyme aide à décondenser la chromatine en faisant de l’acétylation? Quel enzyme fait la réaction inverse?
Histones acétyltransférases (HAT), et la réaction inverse se fait par les histones déacétylases (HDAC)
Quels sont les rôles du médiateur de la transcription, un important complexe multiprotéique.
- Recruter la polymérase II en réponse aux facteurs de transcription
- Assemblage des complexes pré-initiation.
Où se lie le bromodomaine?
Sur les histone acétylés.
Quel effet a TBP sur l’ADN? Quelle structure lui impose-t-il?
TBP, en forme de selle, induit une courbure à deux endroits dans l’ADN
Quel rôle possède TFIIH?
Il possède une activité hélicase, et forme la bulle de transcription.
À quoi sert le CTD de l’ARN polymérase?
Il sert de site de fixation pour un complexe médiateur.
Qu’arrive-t-il lorsque CTD est phosphorylé?
La conformation de l’ARN polymérase change vers un mode d’élongation de l’ARN.
Vrai ou faux. L’octamère d’histones se dissocie de l’ADN lors de la transcription
Faux. L’ADN forme une boucle lâche de sorte qu’il ne quitte jamais entièrement l’octamère d’histones.
La cellule peut utiliser le lactose comme source d’énergie grâce à quel enzyme?
La béta-galactosidase
Quelle action pose la béta galactosidase?
Convertir le lactose en glucose et galactose.
Elle peut aussi convertir le lactose en allolactose par isomérisation.
Qu’arrives-t-il lorsque l’allolactose se fixe sur le répresseur lac I?
Dissociation du répresseur de son site de liaison sur l’opérateur
Vrai ou faux. La liaison du répresseur lacI empêche la polymérase de s’attacher au promoteur
Faux. La polymérase peut se lier, mais elle est incapable de démarrer la transcription de l’opéron lac à cause du répresseur.
Que permet la liaison de CAP au site CAP sur l’ADN?
La liaison permet d’accélérer l’initiation de la transcription de l’opéron lac par le complexe de l’ARN polymérase.
Quelle molécule inhibe la formation d’AMPc?
Le glucose
En absence d’AMPc, quelle est l’affinité de CAP pour le site CAP sur l’ADN?
L’affinité est faible. Lorsqu’AMPc sera présente, CAP pourra se fixer au site CAP sur l’ADN.
S’il n’y a pas de glucose ni de lactose, la transcription de l’opéron pourra-t-elle se faire?
NON. L’absence de glucose fera en sorte que CAP sera présent. Cependant, l’absence de lactose fait en sorte que le répresseur est toujours présent, et la polymérase ne peut pas faire la transcription.
Pour une bonne transcription de l’opéron lac, le lactose et le glucose doivent-ils être présent
Le glucose doit être absent, et le lactose présent.
Que contrôlent les facteurs de transcription avec l’homéodomaine?
L’expression des gènes du développement (contrôle de la croissance des différentes parties du corps)
Qu’est ce que les éléments de réponse?
Ce sont des sites de fixation initiale des facteurs de transcription qui recrutent l’ARN polymérase
Qu’est ce qu’un amplificateur?
Séquence d’ADN qui augmente la transcription et peuvent agir à distance du promoteur, soit en amont ou en aval.
Vrai ou faux. Chaque facteur de transcription régule l’expression d’un seul gène.
Faux. Un facteur de transcription peut réguler l’expression de milliers de gènes.
Vrai ou faux.Les procaryotes et les eucaryotes ont une méthode de maturation de l’ADN très similaire.
FAUX. Chez les procaryotes, le transcrit primaire est traduit tel quel et la traduction commence avant même que la transcription soit terminée.
Par quel enzyme l’extrémité 5’ du transcrit primaire (ARNm non mature) est elle remaniée? Que fait-elle?
Par la phosphohydrolase, qui lui enlève un groupe phosphate terminal.
Quel enzyme ajoute une molécule de GTP à l’extrémité 5’ pour former la coiffe?
La guanylyltransférase
Par quel enzyme la coiffe 5’ est modifiée par méthylation de la nouvelle guanine?
La méthyltransférase
Où a lieu la transcription et la traduction chez les eucaryotes?
La transcription a lieu dans le noyau, et la transduction dans le cytoplasme
Quel sont les rôles de la coiffe 5’?
Protection contre les exonucléases 5’.
Elle peut aussi transformer le précurseur d’ARNm en substrat pour d’autres enzymes nucléaires de maturation, comme celles qui effectuent l’excision épissage.
Que fait l’enzyme poly(A) polymérase?
Elle ajoute environ 250 adénines à l’extrémité 3’ clivée de l’ARNm. La structure résultante s’appelle la queue poly-A.
Les queues poly-A des ARNm précurseurs et des ARNmatures s’associent fermement à quelle protéine pour se stabiliser d’une dégradation en 3’?
La protéine PABP.
Vrai ou faux. Le spliceosome a besoin d’ATP
Vrai
Le spliceosome est présent lors de quel mécanisme?
Excision-Épissage
Qu’est ce que l’épissage alternatif?
Du même ARNm, on peut faire plusieurs protéines différentes dépendant des exons choisis et combinés.
Qu’est ce que l’interférence d’ARN?
Inhibition de l’expression des ARNm par des petits ARN interférents (ARNi) et miARNs
Vrai ou faux, les brins ARN et ADN sont généralement de la même longueur?
Faux. Les brins ARN sont généralement beaucoup plus courts.
Pourquoi y a-t-il des bases modifiées dans l’ARN?
Enrichissement de la molécule d’ARN.
Quel est le but du remodelage de la chromatine?
Rendre des séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription. (moins condensé)
