Kreuger 2 Flashcards
När kan proteintranslokation över ER-membran ske?
Samtidigt som translatation - ER-bundna ribosomer
Efter translationen - fria ribosomer
Vad står SRP för?
Signal recognition particle
Vad gör SRP med ribosomen när den binder?
Blockar proteinsyntesen genom att genomgå konformationsändring
Varför är det viktigt att signalsekvenser i protein känns igen av specifika receptorer?
Möjliggör sortering och specifik transportväg - vart proteinet ska hamna
Vad gör SRP när den har bundit signalsekvens och blockat translationen?
Binder till SRP-receptor på ER
När SRP bundit sin receptor, vad händer med proteinet då? (ER)
Proteintranslokator associerad med SRP-receptorn binder speciell sekvens på proteinet och matar igenom det.
Vad är en translokator?
En kanal där proteinet kan matas in. Efter färdigmatning dissocierar de.
Vad för signalsekvenser behövs för translokation av membranprotein? (ER)
Start och stop. Vid stop slutar den mata. Stopsekvensen är lipofil (?) så den förankras i membranet.
Vad händer med start-sekvensen när proteinet matas igenom (singelpass-protein)?
Klyvs bort av signalpeptidas
Hur sker translokation för ytprotein som ska vara loop, passera membranet 2ggr?
Starttransfersekvensen sitter lite längre in på proteinet, klyvs ej bort. Sen finns det ju en stopsekvens med. Därmed kommer det vara 2 utskott på cytosolsidan och en loop på insidan.
Vad krävs för att ett protein ska bli multimembranpasserande?
Många start- och stopsekvenser
Vad är det som styr om C- eller N-terminus hamnar inne i ER?
Förekomst av positiva AS vid ER-signalsekvensen
Vilka bindningar påverkar proteinveckning allmänt?
Elektrostatiska interaktioner
Vätebindningar
VdW-interaktioner
Vad är PDI?
Proteindisulfidisomeras - Veckning i ER. Bygger disulfidbryggor
Vad gör glykosylering generellt med proteiner?
Ökar lösligheten
Vad har N-glykosylering för huvudsaklig funktion i ER?
Veckningskontroll av protein
Hur är glykosylering med och reglerar veckningskontroll?
Genom en cykel som görs om och om igen tills proteinet är rättveckat.
- Calnexin
- Glucosidas
- Glucosyltransferas
Vad är Calnexin?
ER-membranbundet chaperon
Vad gör calnexin?
Binder felveckade protein
Vad gör glucosidas?
Plockar bort glukos från calnexin-bundet protein så att proteinet släpps fritt
Vad gör glucosyltransferas?
Verkar om proteinet fortfarande är felveckat: Isf så glykosylerar den proteinet igen.
Vad händer när proteinet har rättveckats efter calnexin-processen?
Kan lämna ER
Vad kallas export och nedbrytning av felveckade protein i ER?
Retrotranslokation
ER->cytosol
När sker retrotranslokation?
När inga rättveckningsåtgärder har funkat.
Vad händer när det trasiga proteinet har transporterats från ER till cytosolen?
Ubiquitineras av Ubiquitinligas och bryts ned av proteasom.
Vad innebär det oveckade proteinsvaret?
IRE1
PERK
ATF6
-aktiveras och stimulerar aktivering av gener som ökar proteinveckningsförmågan
Vad kan man säga att IRE1, PERK och ATF6 är?
Sensorer för oveckade protein
