Kreuger 1 Flashcards
Hur mycket av cellvolymen utgörs av cytoplasma?
Ca 1/2
Vad kännetäcknar rough ER?
Har massa ribosomer på sin cytosoliska yta
Hur sitter ribosomerna INTE i förhållande till ER?
Sitter inte i membranet
Var produceras cellens flesta lipider?
ER
Vart sänder ER de flesta av sina proteiner och lipider?
Till golgi
Vad är golgi cisternae?
Diskliknande compartments som golgiapparaten består av. Välorganiserade.
Vad händer i golgi?
Tar emot lipider och proteiner från ER och skickar vidare dem, modifierar dem lite på vägen. Tar upp på bakändan och skickar till framsidan
Vad är peroxisomer?
Små vesikulära compartments som har enzymer, viktiga i oxidativa reaktioner
Hur tänker man sig att kärnmembranet uppkom?
Arkéer var promiskuösa, fagocyterade aerob bakterie (med DNA). Genutbyte skedde mellan arké och bakterie när bakterien bröts ned. Invagination gav upphov till primitiva kärnmembranet.
Hur tänker man sig att mitokondrien uppkom?
Vissa av de fagocyterade aeroba bakterierna började leva i arkéen -> promitokondrie. Därför har vi mito-DNA kvar
Vilka ändhållplatser har endosomer?
Lysosom
Golgi
Återviningsendosom -> exocytos
Hur tömmer sig en vesikel i exocytos?
Genom fusion med cellmembran
Ge exempel på modifiering som sker i golgi
Glykosylering
När är “compartments” topologiskt ekvivalenta?
När de kan kommunicera med varandra - utan att behlva passera ett membran. Fusion ok, så en endosom är topologiskt ekvivalent med extracellulärt
Vad är en vesikel från ER topologiskt ekvivalent med?
Golgi, lysosom och ECM.
Vad är det som är knottrigt och omger cellkärnan?
Rough ER
Vad innebär att mitokondrier är associerade med mikrotubuli?
Mitokondrier är väldigt dynamiska. Ser sällan ut som man ritar dem. Elongeras till långa rör och klyvs i bitar. Kan även fusera med varandra
Vilken sorts molekyler sysslar peroxisomen med?
Lipider
Vart startar proteinsyntesen?
Vid fria ribosomer i cytosolen
Vad är N-terminalsignalsekvensen?
Den del som först kommer ut från ribosomen
När försvinner N-terminala signalsekvensen?
Klyvs bort av signalpeptidas och finns inte kvar i färdigt protein efter transmemb-translokation
Är C-terminalsignalsekvensen med i färdigt protein?
Ja
På vilka 3 sätt kan proteintransport ske in i olika organeller?
- gated - kärnporskomplexet
- Transmembrantransport
- vesikulär transport
Vilken proteintransport går från cytosol till mitokondrier eller ER?
Transmembrantransport
Vad är mitofagi?
Autofagi av utbrukade eller skadade mitokondrier
Vad är PINK1?
Ett kinas som normalt tas upp i mitokondrier och där bryts ned av proteasom.
När tas PINK1 inte upp?
Skadad mitokondrie.
Vad händer när PINK1 inte tas upp och bryts ned?
Kvar på mitoytan och rekryterar parkin = ubiquitinligas. Markerar mitokondrien för destruktion.
Vad kallas ubiquitinligaset som aktiveras av PINK1?
Parkin
Vad står TOM och TIM för?
Transporter Outer/Inner Membrane
Hur transporteras protein in till mitomatrix?
Har en signalsekvens som känns igen av TOM som matar in vidare till TIM23 som translokerar in proteinet till matrix.
Vad händer med signalsekvensen för mitotranslokation väl inne i matrix?
Klyvs bort av signalpeptidas
Vad har mitokondriellt hsp70 att göra med mitotransport?
Drar igenom proteinet igenom TIM genom hydrolys av ATP
Vad gör cytosoliskt hsp70 för mitotransport?
Håller proteinet uppveckat och uträtat så att det kan ta sig igenom TOM
Vilka molekyler är viktiga för proteinveckning?
Chaperoner
Vad kan felaktiv veckning leda till?
Dålig funktion och proteinaggregation (stress) -> toxicitet
Vart finns Hsp70?
Cytosol, mitokondrier, ER
Vart finns Hsp60?
Cytosol, mitokondrier
Vart finns Hsp90?
Cytosol
Vad gör HSP70?
Jobbar tidigt, veckar redan under translation - genom hydrolys av ATP
Positiv feedback Hsp70?
Ja. HSF1 tar sig igenom kärnporen och ökar gentranskription av Hsp70
Vad gör Hsp60?
Veckar om felveckade färdiga protein. Ser ut som tunna med 2 ställen där proteiner kan komma in. Lock sätts på och släpper sen ut dem när de har omveckats.
Vad i Hsp60 kostar ATP?
Att sätta på locket (cap)
Att ta av locket
Vilka 3 klasser av enzym är inblandade i ubiquitinering av protein?
E1: aktiverar ubiquitin
E2: Konjugerar ubiquitin
E3: Ubiquitinligas
Hur kan enzymer känna av att protein är felveckade?
De har klibbiga, hydrofoba sites blottade.
Märks för nedbrytning av proteasom
Hur aktiveras ubiquitinligas?
Fosforylering till exempel
Vart finns proteasom?
I cytosolen
Vad består proteasom av?
Proteinrör med 2 capar. I mitten finns en katalytisk cylinder. Där finns aktiva sites som klipper upp proteinet
Följer ubiquitinet med in i proteasomen?
Nope, de återanvänds
