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Zellbiologie II > Kapitel 8 > Flashcards

Kapitel 8 Flashcards

Kontrolle der Genexpression

1
Q

Weismann’s Determinantenlehre

A

Keimzellen mit “Vererbungssubstanz” aus “Determinanten”

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2
Q

Gurdon’s Klonierungsexperiment

A

1975 an Fröschen, somatische Zellen sind rückprogrammierbar

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3
Q

Menschliches Genom (Anz. Gene, aktive)

A

~25’000, ~10’000 aktiv

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4
Q

Haushaltungsgene

A

einige Tausend Gene, welche in allen Zellen aktiv sind

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5
Q

regulierte / zelltyp-spezifische Gene

A

mehr als 20’000 Gene, nur in bestimmten Zellen/Entwicklungsphasen aktiv, grösster Teil spez. Gene nur im ZNS

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6
Q

mRNA-Moleküle pro Zelle

A

~350’000 durch sehr unterschiedliche exprimierung (1-150’000 Kopien), unterschiede zw. Zelltypen mehr oder weniger (nicht alles/nichts)

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7
Q

Microarrays

A

mRNA hat bei 3’-Ende Poly-A-Schwanz, kann mittels Poly-T-Beads herausgefiltert werden, dann mittels Reverse Transkriptase von Retroviren in cDNA konvertieren

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8
Q

Stufen der Genregulation (6)

A

Im Zellkern:

  1. Transkriptionskontrolle
  2. RNA Prozessierungskontrolle

Im Cytosol:

  1. RNA Transport- & Lokalitätskontrolle
  2. mRNA Abbaukontrolle
  3. Translationskontrolle
  4. Proteinaktivitätskontrolle
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9
Q

Qualitätskontrolle (6)

A
  1. Nukleäres Zurückhalten
  2. RNA Verfall
  3. mRNA Umsatz
  4. nonsense-vermittelter mRNA Verfall
  5. Protein Umsatz
  6. Verfall von falsch gefalteten Proteinen
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10
Q

Wo binden Aktivatoren?

A

Binden vor Promotor

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11
Q

Repressoren

A

Binden an Operator

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12
Q

Operon

A

Gencluster, für die alle der gleiche Operator “zuständig” ist

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13
Q

Lac Operon

+ Glucose

+ Lactose

A

CAP nicht gebunden => Operon aus

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14
Q

Lac Operon

+Glucose

-Lactose

A

Lac Repressor gebunden => Operon aus

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15
Q

Lac Operon

  • Glucose
  • Lactose
A

Lac Repressor & CAP gebunden => Operon aus

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16
Q

Lac Operon

-Glucose

+Lactose

A

CAP gebunden => Operon an, RNA polymerase kann binden

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17
Q

Prinzip der Protein-DNA-Bindung

A

DNA wird in grosser Falte gelesen mit Hilfe von “Keys” (h-Brücken Akzeptor/Donator, H Atom, Mehtyl Gruppe)

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18
Q

Helix-Turn-Helix Motiv

A

essentiell für Bakterien

Aufklärung mittels Röntgenstrukturanalyse

10% der Gene sind Transkriptionsregulatoren/Genregulatoren

19
Q

Homeoboxproteine

A

wichtige Genregulation für Entwicklung

z.B. Drosophila bildet Beine statt Arme ohne bestimmte Homeoboxproteine

Helix-Turn-Helix Motiv

20
Q

Zn2+ Finger Motiv

A

wichtig für stereoid Rezeptoren

21
Q

Leucin Zipper Motiv

A

zwei “Stränge”: eines alpha-Helix anderes hat als jede 7. AS ein Leucin (sehr lange Hydrophobe Reste)

22
Q

Eukaryontische RNA:

mRNA

A

messenger RNA

~1-2% der Zell-RNA

kodieren für Proteine.
Sehr verschieden in Länge (300-14’000 nt) &Sequenz

23
Q

Eukaryontische RNA:

tRNA

A

transfer RNA

~10-12% der Zell-RNA

Adaptoren zwischen mRNA & AS bei der
Proteinsynthese

Ca. 75 nt lang, 20-30 verschiedene Arten.

24
Q

Eukaryontische RNA:

rRNA

A

ribosomale RNA

~70-75% der Zell-RNA

Grundstruktur (& katalytisches Zentrum) des Ribosoms

1 Art in kleiner Untereinheit, 2-3 Arten in grosser Untereinheit.

25
Eukaryotische RNA: verschiedene kurze RNAs
~2-5% der Zell-RNA 20-300 nt, viele verschiedene Arten Steuern RNAProcessing, RNA-Stabilität, Translation, Protein-Sekretion, Telomere, u.a.
26
Eukaryotische RNA: Vorläufer aller RNAs
~10-15% der Zell-RNA Im Zellkern Die meisten RNAs werden nach der Transkription irgendwie prozessiert.
27
RNA-Polymerase I
Für ribosomale RNA
28
RNA Polymerase II
Für mRNA & verschiedene kurze RNAs
29
RNA Polymerase III
Für tRNA & verschiedene kurze RNAs
30
Allgmeine Transkriptionsfaktoren
neben RNA-Polymerasen benötigt
31
TATA-Binding Protein
genereller Transkriptionsfaktor für Pol II Bindet an TATA Box eines Promotors z.B. TFIID sehr wichtig Phoshorylierung durch TFIIH löst Transkription aus
32
HMGI
High Mobility Group Protein 1 erleichtert Krümmung der DNA
33
Definition Gen
nach Buch: nur codierender Teil kann auch als gesamtes mit Regulatorregionen def werden
34
Mediatorkomplex
Aktivatoren kontaktieren darüber RNA-Polymerase sehr gross & kompliziert (über 30 Untereinheiten) wie er bindet noch nicht ganz klar
35
kombinatorische Genregulation
Gen wird in Expression durch mehrere Regulatorproteine reguliert Jedes Regulatorprotein kann das letzte sein, dass volle Aktivierung ermöglicht (Zahlenschlossprinzip) Kann mit verschiedenen Partnern zusammenarbeiten um verschiedene Gene zu steuern
36
Genregulation bei Eukaryonten (5)
mehrere RNA-Polymerasen zusätzliche "allgemeine Transkriptionsfaktoren" Aktivatoren & Repressoren wirken auf Distanz Kombinatorik vieler Aktivatoren & Repressoren Chromatinstruktur ist beteiligt
37
Methylierung
Des Cysteins am C5 Hemmt die Transkription, da sich durch Methylierung Histone wieder mehr einwickeln
38
Epigenetik
a) ATP-abhängiges Chromatin-Remodeling b) Histon-Modifikationen c) Einfügen von Histonvarianten d) DNA-Methylierung (CmpG)
39
Entstehung von Zell-/Gewebeidentität
Ein Regulatorprotein kann genügen zB. Muskelgewebe, Fliegenaugen
40
Zellgedächtnis
Regulatorprotein kann sein eigenes Gen aktivieren, Effekt wird auch in Tochterzellen noch vorhanden sein epigenetische Vererbung
41
epigenetische Vererbung
DNA-Methylierungsmuster & Chromationustände können über Zellgenerationen "vererbt" werden
42
Translationskontrolle in Bakterien
Translations-Repressor Proteine Thermoswitch Riboswitch (durch RNA Molekül) antisense RNA (Doppelsträngig hemmt besser)
43
Translations- & Stabilitätskontrolle
kurze, nicht-kodierende RNAs Doppelsträngige RNA wird aus Kern transportiert und von Dicer gespalten um als einsträngige RNA im RISC Protein platziert zu werden

Zellbiologie II (3 decks)

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