Juan Felipe Gomez- Avsunviroidae Flashcards
Familia Avsunviroidae- Monocatenario
Es un viroideen el que el material genético está compuesto por ADN de cadena sencilla y se replica usando una ADN polimerasa dependiente del ADN no usando ARN como intermediario durante la replicación.
Familia Avsunviroidae- Cadena positiva y negativa
En un viroide de ARN monocatenario, una cadena positiva es aquella que tiene la misma polaridad que el ARNm viral y contiene secuencias de codones que pueden traducirse en proteína viral. Una cadena negativa es una cadena no codificante que debe ser copiada por una ARN polimerasa dependiente de ARN para producir un ARNm traducible.
Familia Avsunviroidae- Material Genetico
Es de tipo ARN con un genoma de alrededor de 246-375 nucleotidos. El ARN es monocatenario y circular. Al igual que esto
carecen de region conservada central. Su
replicacion se da a partir de fenomeno circulo rodante.
Microbiologia.net. (2018). “Virus Vegetales”. Caracteres Generales. https://microbiologia.net/virus/vegetales/
-Di Serio, F; Li, SF; Matoušek, J; Owens, RA; Pallás, V; Randles, JW; Sano, T; Verhoeven, JTJ; Vidalakis, G; Flores, R; Ictv Report, Consortium. (2018).”ICTV Virus Taxonomy Profile:
Avsunviroidae”.The Journal of General Virology.99(5): 611–612.doi:10.1099/jgv.0.001045.PMID29580320.
Familia Avsunviroidae- Morfologia
Tiene cuatro tramos de nucleótidos conservados (guuuc, uc, ucag, C.A) de 5 ‘a 3’.
Tiene amparejamientos Watson y Crick. Al igual que esto carecen de motivos CCH, TCR o TCH conservados, no poseen proteinas ni lipidos y es constituido por cadena corta de ARN
Daros, Jose Antonio. (2018). “Plant Virus Biotechnology, IBMCP (CSIC-Universitat Politècnica de València). https://www.ibmcp.upv.es/viroid-2018/
-MicrobiologyBytes: Viroids, (2007). “Viroidea.” Archived fromthe originalon 2007-02-24, retrieved2007-03-16.
Familia Avsunviroidae- Nicho Ecologico (hospederos)
Los hospederos donde se puede encontrar este viroide son Prunus persicala cual es una planta de durazno, Solanum melongena
la cual es una planta de berenjena, Asteraceae la cual es una planta que contiene una variedad de flores y Persea Americana
la cual es una planta de avocados
Su, T.; etal. (2016).”Peaches Preceded Humans: Fossil Evidence from SW China”.Scientific Reports. Nature Publishing Group. Bibcode:2015NatSR…516794S.doi:10.1038/srep16794.PMC4660870.PMID26610240.
Chisholm, Hugh, ed. (1911).”Chrysanthemum”.Encyclopædia Britannica(11thed.). Cambridge University Press.
Tsao and Lo in “Vegetables: Types and Biology”.Handbook of Food Science, Technology, and Engineeringby Yiu H. Hui (2006). CRC Press.ISBN1-57444-551-0
-kotze, Ryan.”The Shocking Environmental Effects of Avocado Farming”.Vox Nature. 17 May 2019. Retrieved26 April2022.
Familia Avsunviroidae- Enfermedades Asociadas
Las cuatro enfermedades asociadas a este viroide son todas relacionadas con plantas y sus frutos y son conocidas como PLMVd, CCHMVd, ELVd, ASBVd. Estas todas generando diferentes patrones en terminos de color, manchas e incluso afectaciones en el tallo y en las raices.
Flores, Ricardo; Hernández, Carmen; Alba, A. Emilio Martínez de; Daròs, José-Antonio; Serio, Francesco Di (2005). “Viroids and Viroid-Host Interactions”.Annual Review of Phytopathology.Annual Reviews.43(1): 117–139..
Familia Avsunviroidae- Datos Interesantes
Algunos datos interesantes son:
-Generalmente atacan vegetales como los citricos y cocos
-Tienen actividad ribozima debido a su estructura en “cabezas de martilo”
-En 2019 se reportaron infectando varioshongos
-Un estudio demetagenómica(2022) ha detectado muchos ARN viroides no descubiertos por lo que todavia falta mucho por descubrir
-Microbiologia.net. (2018). “Virus Vegetales”. Caracteres Generales. https://microbiologia.net/virus/vegetales/
-International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).Familia PospiviroidaeArchivadoel 22 de julio de 2012 enWayback Machine.
-Shuang Wei, Ruiling Bian, Ida Bagus Andika, Erbo Niu, Qian Liu, Hideki Kondo (2019).Symptomatic plant viroid infections in phytopathogenic fungiArchivadoel 25 de enero de 2022 enWayback Machine.. PNAS.
Pregunta - Santiago Torres Valero
Hola Juanfe, muy buena descripción de cada punto, solo tengo una duda. Tomando en cuenta que el virus afecta especies vegetales de consumo humano, es este un virus inocuo que no afecta a los humanos o se tiene alguna regulación cuando se presenta una infección de virus para que no tengamos contacto con este.
Respuesta - Juan Felipe Gomez
Muy buena pregunta Santiago! De lo que investigue la razón por la que este virus afecta a plantas y no humanos tiene que ver con la maquinaria celular normal de sus hospedantes para poder reproducirse. De este modo no solo en las plantas sabemos que los virus para propagarse necesitan atravesar la pared celular, por lo tanto pueden propagarse por heridas en las plantas, pero tambien sabemos que los seres humanos tienen anticuerpos contra los virus vegetales y es muy complicado que este virus pueda replicarse en el ser humano impidiendo la afectacion de este al consumir alimentos donde se pueda encontrar este virus.
¿Cómo se logró la infección del virus a los hongos reportados? ¿Cómo se pudo identificar?
Respuesta- Juan Felipe Gomez
Que buena pregunta! Esta infeccion del virus a los hongos reportados fue dada a la codificacion correcta del virus en el genoma de algunos hongos, infectando celulas y encontrandose en el nucleo de estas. Esto por medio de un proceso de autocatalisis de material genetico. Sin embargo hay todavia muy poca informacion de como estos pueden replicarse. Tambien se ha visto que a partir de silenciamiento del ARN esta infección ha sido mas facil de producirse. Finalmente este se pudo identificar despues de un proceso de un estudio de metagenomica donde evaluaban el genoma de varias especies de hongos donde en algunos aparecio el virus.
Hola Juan me gusto mucho la información y interesante como afectan a las plantas, pero me surge la siguente duda: ¿Hay algún uso potencial de los viroides de la familia Avsunviroidae en la investigación biológica o la biotecnología?
Sebastian Ortiz Gutierrez
Hola Sebastian, por supuesto que si hay! De lo que estuve leyendo que por medio de ribozimas derivadas del viroide latente en diferentes plantas (las cuales median el autocorte de los RNAs multiméricos
generados por un mecanismo de replicación de círculo rodante) ayudan en estudios basados en resistencia frente a virus de plantas. Así mismo generando ribozimas estructuralmente diferentes pero tambien mas resistentes. Esto ha ayudado a disminuir el numero de enfermedades que se pueden ocacionar e incluso ayudar economicamente ayudando a proteger cultivos que puedan padecer de la afectacion de este virus. Adjunto la referencia tambien a un estudio interesante sobre este mismo tema a continuación.
Carbonell, Alberto. (2008). “Resistencia a viroides inducida por ribozimas
de cabeza de martillo y RNAs interferentes”. Universidad Politecnica de Valencia. https://digital.csic.es/bitstream/10261/4546/1/Tesis%20Alberto%20Carbonell.pdf
