Isolasi DNA Flashcards

1
Q

DNA yang merupakan material genetik terdiri dari molekul … berupa gula
…, basa nitrogen berupa … yang
dihubungkan oleh gugus … menjadi rantai …

A

nukleotida, pentosa (deoxyribose), adenin, timin, guanin dan sitosin, fosfat, polinukleotida

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Struktur DNA yang merupakan rangkaian
nukleotida memberikan implikasi pada sifat kimia DNA yang akan bermuatan … pada pH
netral seperti yang umumnya ada di dalam sel, sehingga dengan mudah dapat
… dari komponen sel yang lain

A

negatif, dipisahkan/diisolasi DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Prinsip dalam isolasi DNA adalah … DNA dari
bagian-bagian sel yang lain

A

memisahkan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Pada isolasi DNA Melisis sel dengan … bertujuan mengeluarkan material DNA dari sel

A

larutan buffer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pada isolasi DNA memisahkan molekul DNA dari … dengan …

A

debris sel, sentrifugasi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Teknik elektroforesis gel digunakan untuk …. Media yang digunakan untuk memisahkan umumnya adalah … Konsentrasi gel yang dipakai
biasanya kisaran …

A

memisahkan fragmen DNA berdasarkan
ukuran fragmen, gel agarosa, 0.8-1%.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Teknik elektroforesis didasarkan pada kemampuan molekul DNA untuk bergerak pada media agarose
bermedan listrik dari kutub … ke kutub ….

A

negatif, positif

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Fragmen yang berukuran kecil akan bergerak lebih … dan lebih … dari kutub …

A

awal, jauh, negatif

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Teknik PCR adalah suatu teknik yang digunakan untuk … secara …

A

memperbanyak fragmen DNA, in vitro

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Teknik ini ditemukan oleh … pada tahun 1983. Dalam teknik ini
digunakan beberapa tahapan yaitu …

A

Kary Mullis, Denaturasi, annealing, ekstension

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Pada praktikum isolasi DNA akan diisolasi DNA yang berasal dari …
dengan metode cepat, yaitu dengan memisahkan isi sel
berupa protein, DNA, RNA, lemak, ribosom dan molekul-molekul kecil lainnya.

A

bawang bombay

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Selanjutnya
DNA akan diendapkan dari larutan suspensi sel menggunakan …

A

alkohol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Fenomena sel mana yang ditiru oleh Teknik PCR

A

replikasi pada DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Utas DNA mana dari template DNA yang diamplifikasi

A

sequence DNA target

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Fungsi Primer pada PCR

A

awalan sintesis DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Apa fungsi enzim DNA polimerase

A

enzim yang melakukan katalisis reaksi
sintesis rantai DNA

17
Q

Pada suhu berapa utas DNA bisa terpisah, dan pada suhu berapa utas DNA bisa
disintesis

A

Denaturasi 95 C, Sintesis Ekstension 75 C

18
Q

Rumus molekul DNA yang terbentuk dari satu molekul DNA yang diamplifikasi
dengan PCR setelah n siklus

A

Y = (2^n – 2n)X

19
Q

Kondisi PCR seperti apa dari simulasi yang anda kerjakan yang menghasilkan produk
paling optimum

A

jumlah siklus 35, dengan suhu denaturasi 94oC, suhu annealing 56oC, suhu
ekstensi 72oC, jumlah plasmid 100 ng, dNTP 0,5 μL, jenis DNA polymerase taq,
polymerase 1 μL, serta dalam waktu (30, 30, 60).

20
Q

Proses PCR dilakukan dalam
suatu mesin … yang bisa diatur perubahan … secara bersiklus.

A

thermocycle, suhunya

21
Q

pemisahan utas DNA satu sama lain. Suhu yang tinggi menyebabkan ikatan
hidrogen terputus sehingga terjadi pemisahan utas ganda DNA menjadi dua utas tunggal.

A

Denaturasi

22
Q

penempelan primer oligonukleotida pada bagian DNA yang sekuennya
homolog.

23
Q

pembentukan utas DNA baru berdasarkan template DNA dari tiap utas.

A

Ekstension

24
Q

Visualisasi DNA di gel
Fungsi penambahan pewarna (loading dye): sebagai … DNA dan … DNA
pada gel.

DNA akan mengikat pewarna, misalnya … yang menangkap …

A

pemberat, tanda migrasi, Etidium bromida (EtBr), UV

25
Faktor-faktor yang mempengaruhi laju migrasi DNA (3)
Ukuran DNA, Kerapatan gel, Kekuatan arus listrik
26
Ukuran DNA -> semakin ... DNA akan semakin ... bermigrasi
kecil, cepat
27
Kerapatan gel -> semakin ... gel (semakin ... pori-porinya) DNA akan semakin ... bermigrasi (membutuhkan waktu elektroforesis yang lebih ...)
rapat, kecil, lambat, lama
28
Kekuatan arus listrik yang dialirkan -> semakin ... arus, DNA dapat semakin ... bermigrasi (waktu elektroforesis bisa lebih ...)
tinggi, cepat, singkat
29
Bila DNA akan disimpan, maka setelah DNA diambil lalu dikeringanginkan selanjutnya dimasukkan ke dalam ... dan ditambahkan ...
microtube, ddH2O