Introduzione

Question 1

Quali sono i limiti dei peptidi in ambito farmacologico?

Answer 1

• Non possono essere somministrati per via orale
• Sono suscettibili alle protasi
• Non riescono ad attraversare la barriera ematoencefalica (troppo polare)
• Non sono resistenti alle alte temperature.

Question 2

Come posso valutare l’idrofobicità di un peptide?

Answer 2

Hydropathy index: Quando si considera un peptide si fa la somma dei valori dell’index di ogni amminoacido: se è negativa allora il peptide è idrofilico, se è positiva è idrofobico.

Question 3

A cosa serve il grafico di Ramachandran?

Answer 3

ci dice quali angoli sono permessi in base alla sequenza amminoacidica che compone il polipeptide.
Nella figura:
- Le aree grigie corrispondono a conformazioni che non sono stericamente consentite per tutti gli amminoacidi, fatta eccezione per la glicina, priva di catena laterale.
- Le regioni rosse corrispondono a conformazioni consentite: α-eliche destrogire e foglietti-β.
- Le aree rosa mostrano le regioni consentite riformulando i calcoli con raggi di van der Waals più corti, ovvero consentendo una prossimità atomica maggiore