Introduction à la biochimie Flashcards
Donner le spectre d’étude de la biochimie.
La biochimie s’intéresse à ce qui constitue le monde vivant.
Quels sont les éléments chimiques caractéristiques de la matière vivante ?
Les éléments chimiques caractéristiques du monde vivant sont :
- Eau
- Protéines
- Acides nucléiques
- Glucides ou polysaccharides
- Lipides
- Ions inorganiques
Qu’est-ce qu’une macromolécule ?
Une macromolécule est un assemblage de molécules biologiques.
Que représente l’eau en pourcentage au niveau du poids total cellulaire ?
L’eau représente 70 % du poids total cellulaire.
Vrai ou Faux ?
Il n’existe pas de liens entre la morphologie de la molécule et sa fonction.
Faux. En effet, la structure 3D d’une molécule a un lien avec sa fonction. Exemple : l’hémoglobine.
Quels sont les principaux atomes constituant les biomolécules ?
Il s’agit :
- du Carbone
- de l’Hydrogène
- de l’Oxygène
- de l’Azote
- du Phosphore
- du Souffre
Qu’est-ce que les oligo-éléments ?
Les oligo-éléments sont de petits nutriments minéraux nécessaires à l’organisme en quantités infimes formés d’ions minéraux.
Vrai ou Faux ?
Les oligo-éléments sont essentiels dans le fonctionnement de la cellule.
Vrai
Dans quels fonctionnements interviennent les oligo-éléments ?
Les oligo-éléments sont essentiels pour le fonctionnement d’une cellule :
- Site actif d’enzymes,
- vitamines,
- fonctionnement hormonal,
- défense immunitaire.
Qu’est-ce qu’une molécule organique ?
Une molécule organique est composée d’un squelette carboné et d’un ou plusieurs groupements fonctionnels.
Quelle est la principale molécule inorganique ?
L’eau
À quoi correspond le nombre d’Avogadro ? Donner sa valeur.
Le nombre d’Avogadro correspond au nombre d’atomes purs contenu dans 1 mole. Il est égal à NA = 6,022 ×10²³ mol⁻¹.
À quoi correspond 1 Da ?
1 Da correspond à la masse d’un atome d’hydrogène.
Qu’est-ce que la règle de l’octet ?
La règle de l’octet est une règle simple selon laquelle les éléments tendent à se combiner de façon à avoir huit électrons dans leur couche de valence et ainsi devenir plus stable.
Comment est formée une liaison covalente ?
Une liaison covalente est formée lorsque deux atomes mettent en commun un électron de leur couche externe afin de respecter la règle de l’octet.
Qu’est-ce qu’un carbone asymétrique ?
Les carbones asymétriques (C*) sont des carbones avec 4 substituants différents.
La réactivité d’une molécule induit ?
La fonction moléculaire et cellulaire
La composition en atomes d’une molécule conditionne
sa fonction et sa structure
Quelles sont les échelles d’observation du vivant en biochimie ?
Atomes, molecules et cellules
Quels sont les moyens d’observation pour la biochimie (par ordre du moins précis au plus précis) ?
Spectrométrie optique et électronique, RMN et Cristallographie
Catégorie de cation dans la biochimie
Monovalent et bivalent
catégorie d’anion dans la biochimie
halogène
Liste des ions métaux oligo-éléments
Nickel
cuivre
zinc
manganèse
chrome
fer
cobalt
sélénium
def molécule
assemblage covalent d’atomes
Masse molaire MM correspond à
masse d’une mole de la molécule = somme des masses molaires atomiques
masse moléculaire =
MM/NA
Numéro atomique
nombre de protons dans le noyau
-> nombre d’électrons
Les liaisons covalentes influencent
géométrie de la molécule
géométrie majoritaire dans les biomolécules
géométrie tétraèdrique (4 simple liaison)
Autres cas de géométrie du carbone
- 2 simples liaisons et 1 double liaison :
-> carbone trigonal, géométrie plane, cas peu fréquent - 2 doubles liaisons :
-> carbone digonal, géométrie plane, rares - 1 triple liaison et 1 liaison simple :
-> carbone digonal, géométrie plane, très rares cas
molécules possédant un ou plusieurs carbones asymétriques
molécules chirales
la liaison est apolaire si
les deux atomes liés de façon covalente ont une électronégativité similaire ou identique
la liaison est polaire si
les deux atomes liés de façon covalente ont une électronégativité différente
def électronégativité
Capacité d’un atome à attirer vers lui les électrons lors de la formation d’une liaison chimique avec un autre atome
coté du TPDE où les atomes sont plus électronégatifs
haut droit
Atome bio avec électronégativité faible
C
H
P
S
Atome bio avec électronégativité forte
O
N
def dipôle
les électrons ne sont pas répartis uniformément le long de la liaison car ils sont attirés par un atome électronégatif
def moment dipolaire
la grandeur reflétant la polarité d’une molécule
Moment dipolaire µ
Grandeur mesurable : µ = δ(charge) x d
Qu’est ce qui explique la réactivité des molécules bio
La présence de groupements fonctionnels et non fonctionnels
Liste polymères
lipides
polysaccharides
protéines
acide nucléiques
Echelle masse moléculaire d’une macromolécule
10e3 à 10e9
Monomère et atomes d’un polysaccharide
Oses simples (C,H,O)
Monomère et atomes d’une protéine
Acide aminés (C,H,O,N,S)
Monomère et atomes d’un acide nucléique
Nucléotides (C,H,O,N,P)
liaisons non covalentes
Interactions ioniques
Interactions de Van der Waals
Liaisons Hydrogène
Plus les liaisons faibles seront nombreuses
plus la structure tridimensionnelle de la molécules (macro)molécule sera stable
