Intro infectiologie et microbio Flashcards
Qu’est-ce que l’infectiologie?
- Disciplines médicales étude maladies infectieuses
Qu’est-ce que l’épidémiologie?
Branche de l’infectiologie qui étudie les maladies infectieuses et leur…
- Fréquence
- Mode transmission
- Facteur de risque
- Symptômes
- Évolution des infections
- Méthodes diagnostiques
- Traitements curatifs et préventif
- Pharmacologie
- Agents infectieux
Qu’est-ce que la microbiologie?
- Étude micro-organismes vivants, don certains responsables des maladies infectieuses
- Étude des bactéries (bactériologie)
- Des virus (virologie)
- des champignons microscopique/ agents des mycoses (mycologie)
Définir : contamination
Envahissement d’une surface par des micro-organismes
Définir : Infection
Résultat de l’agression d’un organisme vivant par des micro organismes pathogènes (bactéries, virus, champignons, parasites).
Définir : Contagion
Transmission interhumaine d’une maladie d’un sujet atteint à un sujet sain
Définir : Contagiosité
Aptitude d’un agent infectieux à se propager
Définir : Pathogène
Qualifie ce qui provoque une maladie, en particulier un germe capable de déterminer une infection
Nommez 3 éléments de susceptibilité de l’hôte
- Défense de l’organisme (anticorps/mutation) (ex: CCR5 D32 russe et VIH)
- Muqueuse plus réceptives
- Présence de maladie ou infections sous-jacentes (comorbidité)
Définir : période d’incubation
Temps entre le moment de contagion et apparition des 1er signes et symptômes
Contagion —————-> Apparition symptômes
incubation
Définir : période fenêtre
période de temps pendant laquelle, après la contagion, il n’est pas possible de détecter l’infection avec les outils = FAUX NÉGATIF
Pér.fenêtre Contagion -------------------> Test en mesure de détecter l'agent infectieux
De quelles façons/par quels éléments est-il possible de détecter ?
Agent infectieux
Ses antigènes
Son ADN
Ses anticorps
Définir : antigène
Protéine qui couvre le virus : substance (généralement étrangère à l’organisme), susceptible de déclencher une réaction immunitaire en provoquant la formation d’anticorps
Les virus, les bactéries, les parasites et les cellules altérées de l’organisme (infectées par un germe ou tumorales) présentent de multiples antigènes. Les antigènes sont, dans la plupart des cas, des glycoprotéines.
= PROVOQUE IMMUNITÉ ACQUISE
Définir : anticorps?
Protéine du sérum sanguin sécrétée par les lymphocytesB (globules blancs intervenant dans l’immunité) en réaction à l’introduction d’une substance étrangère (antigène) dans l’organisme.
Définir : immunité
Ensemble des mécanismes de défense d’un organisme contre les éléments qui lui sont étrangers, en particulier les agents infectieux (virus, bactéries ou parasites), ou encore des cellules ou des molécules de l’organisme présentant une anomalie.
Aussi certaines mutations génétiques = immunité
Immunité acquise VS Immunité innée
Acquise : en réponse spécifique à l’apparition d’un nouvel agent (ex : antigène)
Innée: cellules macrophages déjà présentes et qui ‘‘bouffent’’ (phagocytose) l’agent
Définir ADN (acide désoxyribonucléique)
1) Macromolécule biologique présente dans toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.
2) Contient toute info. génétique appelée génome, permettant le développement, le conditionnement et la reproduction des êtres vivants
3) ADN des virus altère fonctionnement des cellules saines
Étapes de la défense immunitaire contre un antigène (vidéo diapo 12 cours intro)
1) Vaisseaux sanguins avec globules rouges et blancs structure mauve/noire = virus
2) antigène (point d’attache) : il s’attache sur la cellule saine (pas de réponse immunitaire, donc l’antigène peut envoyer son message pathogène à l’intérieur de la cellule saine)
3) attaque!
4) les anticorps viennent se lier sur le point d’attache de l’antigène (empêcher la réplication)
5) ce qui bloque le point d’attache
6) macrophage vient manger les antigènes bloqués par les anticorps
Quels sont les 2 types de virus
ARN ou ADN
Définir : virus
Petitesse : entre 12 et 300 nanomètre –> peuvent traverser les filtres, voir-même la porcelaine.
Constitué d’un seul acide nucléique : soit ARN soit ADN
Acide nucléique enfermé dans une capside (coque de protéine) = nucléocapside
Certains virus ont une deuxième enveloppe ‘‘péplos’’ de lipoprotéines
Expliquer, en étapes, le fonctionnement d’une infection par un virus
- Attachement
- Fusion (lorsque le virus s’approche de la cellule vient faire dissoudre toute son enveloppe)
- Et venir injecter la capside à l’intérieur du cytoplasme de l’autre cellule
- Le capside se dissout, et libère donc son matériel génétique (ADN ou ARN)
- qui voyage jusqu’au noyau
- Et va s’intégrer à l’ADN de la cellule
- Le lecteur ADN va créer un message aux protéines virales
- Assemblage des protéines virales
- Expulsion des nouveaux virus
- En gros, il rentre chez vous, et vient créer à partir de chez vous d’autres virus, il se multiplie!
Comment expliquer la mutation des virus?
À l’étape où le lecteur ADN lit le message du matériel génétique du virus, il y a des ‘‘erreurs de lecture’’ et cela créer des copies ‘‘infidèles’’. La copie peut être plus efficace, ou moins efficace.
Définir : bactérie
- êtres unicellulaires
- noyau diffus
- reproduction par scissiparité (division en 2)
Définir : champignons microscopiques
- Organismes vivants
- Noyau cellulaire typique
- Dépourvu de chlorophylle
- Vivent aux dépens de matière organique
- Nourissent par absorption à travers leur paroi cellulaire
Définir : protozoaire
- Organisme règne animal à cellule unique
- Microscopique ou visibles à oeil nu
- Les + évolués sont susceptibles de respirer, ingérer des particules nutritives et exécrer
Définir : anthropodes
- Animal constitué d’une suite d’anneaux durs extérieurs
- Souplement articulés entre eux et dont certains portent une paire d’appendices ventraux latéraux (pattes, pinces)
- lui-même divisé en segments articulés
Définir : signe
Manifestation d’une affection ou maladie contribuant au diagnostic : phénomène observé objectivement par un médecin (ex : éruption cutanée)
Définir : symptômes
Manifestation morbide en rapport avec un état pathologique
Perçu par le malade : s’oppose aux signes objectifs découverts par médecin (ex : mal de tête)
Définir : pathognomonique
Symptôme ou signe spécifique à une maladie : qui se rencontre seulement dans une maladie déterminée et suffit à établir le diagnostic
Définir : prodrome
Symptôme survenant au début d’une maladie, ‘‘qui annonce’’, ‘‘symptôme annonciateur’’ (ex : phase de picotement à la lèvre avant apparition lésion herpès buccal)
Dx
Tx, Tr
Rx
Dx : Diagnostic
Tx, Tr : Traitement
Rx : Prescription
Qu’est-ce que l’anamnèse?
Questionnaire d’évaluation des risques
Différence de trajectoire de dépistage entre patient symptomatique et patient symptomatique ?
Patient asymptomatique : on fait les tests de lab avant le traitement, pour savoir si positif ou négatif. On traite seulement si positif.
Patient symptomatique : on traite d’emblée, et ensuite on fait les tests d’analyse à fin statistiques et analyse de génotypes seulement.
Qu’est-ce qu’un TAAN?
Dépistage appelé test d’amplification des acides nucléiques
Les analyses de laboratoires recherchent 3 choses, lesquelles?
- Anticorps : Si présence d’anticorps = présence d’agent infectieux
- Antigène, ADN, ARN : Relever par TAAN le matériel génétique de l’agent infectieux
- Agent infectieux : Observation par microscope et culture de l’agent infectieux
Sensibilité VS Spécificité des tests
Sensibilité : proportion de personnes vraiment atteintes de la maladie, dans la population ciblée. sensibilité indique la probabilité que le test diagnostiquera correctement un cas, ou la probabilité qu’un cas donné sera identifié par le test
= Identification VRAIS POSITIFS
Spécificité : proportion de personnes sans la maladie qui a des résultats peu élevés sur le test de dépistage : la probabilité que le test identifiera correctement une personne n’étant pas atteinte de la maladie
= Identification de VRAIS NÉGATIFS
Faire tableau des résultats possible d’analyse de lab
(dessiner)
Définir : traitement épidémiologique
Traitement administré d’EMBLÉE aux PARTENAIRES SEXUELS EXPOSÉS, AVANT la réception des résultats de leurs tests de dépistage et MÊME S’ILS N’ONT PAS DE SYMPTÔMES. Ce traitement doit être administré même si leurs résultats d’analyse sont négatifs.
Définir Cas-Index/Code K
Personne chez qui une ITSS a été diagnostiquée.
Cas-contact/Code L
Partenaire sexuel du cas-index soumis à un traitement épidémiologique
Quels sont les 3 grandes familles de traitement des ITSS?
1) Antibiotiques
2) Antiviraux
3) Antifongiques
Définir : antibiotiques
Substance, d’origine naturelle ou synthétique, utilisée contre les infections causées par les BACTÉRIES.
Qu’est-ce que le ‘‘spectre d’activité’’ des antibiotiques?
Liste des bactéries sur lesquelles l’antibiotique est actif.
Quelle est la différence entre une antibiotique à large spectre VS à spectre étroit?
Large spectre : agit à la fois sur des bactéries à Gram positif et à Gram négatif
Spectre étroit : actif que sur l’un de ces deux types de bactéries –> Les autres bactéries sont dites «résistantes» (résistance naturelle ou acquise)
D’où vient l’appellation ‘‘Gram’’ ?
Test de la coloration de Gram = une teinture violacée, mauve foncée
Comment identifier un Gram - et en expliquer les raisons
Gram - : Coloration moins intense (rose), car la couche de peptidoglycane de la bactérie est plus petite, et protégée entre 2 autres couches. Puisque la coloration agit sur la couche de peptidoglycane, elle a ainsi plus de difficulté à se rendre et moins de surface de contact.
Comment identifier un Gram + et en expliquer les raisons
Gram + : Coloration foncée, car la couche peptidoglycane de la bactérie est plus grande, et pas ou peu protégée.
Expliquer la différence entre bactérie à Gram - et à Gram +
Les bactéries Gram + : structureunimembranéequi s’organise en trois grandes parties (de l’extérieur vers l’intérieur):
1) La couche de peptidoglycane (très épaisse) =paroi cellulaire
2) L’espace périplasmique
3) La membrane plasmique
Les bactéries à Gram - :
1) Membrane plasmique +
2) Peptidoglycane (très fine) = Paroi
3) Espace périplasmique
4) Membrane plasmique
Comment agissent les antiviraux?
1) Actifs sur les virus en phase réplicative, c’est-à-dire au stade de leur multiplication. Ils n’agissent pas sur les virus latents qui ne se répliquent pas.
2) Doivent agir à l’intérieur des cellules humaines et intervenir sur une ou plusieurs phases de multiplication du virus : (a) attachement cellulaire (b) assemblage (c) synthèse d’acides nucléiques.
Les agents antiviraux agissent en stoppant le processus infectieux. En fonction du virus et du médicament, le blocage du processus peut survenir à plusieurs sites différents. Un agent empêche le virus de fusionner avec la cellule saine en bloquant un récepteur nécessaire à sa liaison. En empêchant cette liaison, le virus ne peut plus pénétrer ni infecter la cellule. Parfois, plusieurs médicaments sont utilisés pour traiter une infection particulière, de manière à perturber plus d’un processus viral et à améliorer les chances de guérison du patient. Alors que certaines infections virales telles que l’hépatite ou le SIDA ne peuvent être complètement guéries, l’état de santé d’un patient peut être ramené à la normale en contrôlant le virus et en l’empêchant d’endommager davantage l’organisme.
Comment agissent les antifongiques (fongicides/fungistatiques)?
Ils agissent tous en ciblant les fonctions clés de la cellule fongique. Un type d’agent antifongique affecte la membrane cellulaire du champignon en se liant à une substance importante située sur la membrane. Cela crée des trous dans la membrane, détruisant son étanchéité et tuant la cellule. Les médicaments antifongiques peuvent être appliqués localement ou pris par voie orale.
Nommez des facteurs pouvant entraîner une croissance incontrôlée des champignons
1) Antibiotiques
2) Système immunitaire affaibli
3) Environnement chaud et humide
Quels sont les 3 types d’infection fongique?
1) Cutanées (peau, cheveux, ongles)
2) Muco-cutanée (muqueuses des voies gastro-intestinale et zones génitales)
3) Systémiques (infections graves débutant dans les poumons et pénétrant la circulation sanguine, se répandant dans tout le corps)
Quelles sont les voies d’administration des traitements?
1) Oral : par la bouche ou sublingual –> comprimés
2) Injection : intramusculaire, intraveineux, sous-cutané
3) Topique : crème et onguent
Quels sont les 3 conseils post-traitement ITSS à suivre?
1) Abstinence ou utilisation du préservatif pendant le traitement ou 7 jours après le traitement si dose unique.
2) Visite de suivi pour s’assurer de l’efficacité et de l’adhérence au traitement.
3) Renforcer la notification aux partenaires pour le traitement épidémiologique.
Qu’est-ce qu’une MADO?
Maladie à déclaration obligatoire :
Le médecin et/ou le laboratoire doit aviser le chef de la Direction de la santé publique (DSP) de son territoire dans les 48 heures suivant le diagnostic sur un formulaire comprenant les informations nominales du patient
Quelles sont les 4 critères d’une MADO?
- susceptible de causer une épidémie si rien n’est fait pour la contrer;
- reconnue comme une menace importante pour la santé;
- nécessitant une vigilance des autorités de santé publique ou la tenue d’une enquête épidémiologique;
- évitable par l’intervention des autorités de santé publique ou d’autres autorités
Programme gratuité RAMQ
Voir diapo 50
Que dit la loi S2-.2 sur la santé publique du Québec à propos du traitement des mineurs?
Permet aux mineurs âgés 14 ans et + de se faire traiter sans autorisation des parents ou tuteurs légaux. Toutefois, si hospitalisation de + 12 heures est nécessaire ou si vie est en danger: parents doivent être avertis
Définir et dresser le portrait d’une épidémie
Nombre anormalement élevé de cas d’une maladie par rapport à ce qui est attendu habituellement. (État aigu accidentel)
- augmentation et propagation inhabituellement rapides, dans une collectivité ou un territoire donné et pendant une période de temps limitée, du nombre de cas d’une maladie transmissible.
- apparition subite d’un nombre plus ou moins élevé de cas d’une maladie qui n’existe normalement pas dans une région ou une collectivité
- limité dans l’espace: sur un territoire donné
- (ex: syphilis: inhabituelle car de 0 cas à 3, à 11, a + de 100 / dans un groupe: homme gai – Chicago: HARSAH puis hétéros latinos, et africaine américaine/)
Définir : endémie
Maladie infectieuse dont l’agent est présent en permanence au sein d’une population ou dans une région. (état constant ou à des époques déterminées/périodique)
Définir et dresser le portrait d’une pandémie
Épidémie touchant le monde entier.
- grandes pandémies de maladies infectieuses qui ont marqué l’histoire de l’humanité: la peste, le choléra, la variole, la grippe, le typhus, la tuberculose, la poliomyélite et le sida.
- Ces pandémies ont frappé indifféremment personnes riches et pauvres à l’époque où pas les acquis de la médecine moderne (vaccins, antibiotiques, antiviraux, antituberculeux, trithérapie anti-VIH, etc.).
- De nos jours, pandémie peut affecter très gravement populations pays en voie de développement, qui ne disposent pas des ressources humaines et matérielles élémentaires pour se prémunir contre la maladie et la combattre. Cependant, populations pays riches pas complètement à l’abri de pandémies causées par un agent pathogène contre lequel pas de vaccin ni traitement curatif. Ex. virus Ebola.
- Avant avènement aviation commerciale: pandémies pouvaient prendre des mois et des années avant de s’étendre à tous les continents connus à l’époque. Pandémies empruntaient grandes routes commerciales terrestres (route de la soie) et maritimes / propagation avec expansion des grands empires de l’histoire ancienne, médiévale, moderne ou contemporaine.
- Invasions et guerres: épidémies (peste, choléra, typhus, syphilis, grippe) qui prenaient parfois des proportions de pandémies (grippe espagnole lors de la Grande Guerre), parce que non contenues à l’intérieur d’une seule frontière internationale. Troupes armées arrivaient de tous les coins du monde, emportant avec elles leurs maladies. Combats faisaient fuir des centaines de milliers de réfugiés civils (8 millions sur les routes de France en juin 1940) qui échappaient à tout contrôle sanitaire.
- De nos jours, un microorganisme pathogène fortement contagieux peut faire le tour de la Terre en 24h, en empruntant les grandes routes commerciales aériennes qui transportent, par vols d’un continent à un autre ou d’un pays à un autre, plus d’un milliard de voyageurs par année.
Définir : tendance séculaire
Évolution d’un phénomène de santé dans le temps
Définir : incidence
- Nombre de nouveaux cas d’une maladie constatés pendant une période déterminée et dans une population donnée.
- préciser si l’incidence a été calculée d’après le nombre de cas de la maladie ou d’après le nombre de personnes atteintes, car une même personne peut être atteinte plusieurs fois de la même maladie au cours d’une période donnée
- généralement exprimée par un taux obtenu par un rapport dans lequel le dénominateur représente le nombre moyen de personnes dans la population considérée pendant la période définie, ou le nombre estimatif de personnes au milieu de cette période.
Définir : prévalence
- Nombre de cas de maladie ou de malades, ou de tout autre événement tel qu’un accident, dans une population déterminée, sans distinction entre les cas nouveaux et les cas anciens.
- La prévalence est un rapport qui s’exprime en nombre de cas pour 100000habitants
- Doit toujours être située dans le temps (prévalence à un moment donné ou prévalence au cours d’une période donnée). Dans les cas où prévalence est utilisé seul, il signifie habituellement « prévalence à un moment donné »