Intro à la physiologie bactérienne Flashcards
Quelles sont les différences des procaryotes par rapport aux eucaryotes?
- Beaucoup plus petit
- Pas d’enveloppe autour de leur nucléïdes (pas de noyau)
- pas d’organelles spécialisés
En lien avec la structure générale bactérienne, qu’est-ce que le plasmide?
ADN extra-chromosomale
Vrai ou faux? La paroi bactérienne est rigide.
Vrai
Quels sont les 4 principaux rôles de la paroi bactérienne?
- protéger contre l’environnement
- Maintenir une pression osmotique élevée intra-cellulaire
- Conférer la rigidité bactérienne
- Maintenir sa forme
Quel est le principal constituant de la paroi bactérienne?
Peptidoglycans (murein): Polymère de disaccharides d’acide N-acetylglucosamine et acide N-acetylmuramique
Quelle est la structure finale de la paroi bactérienne de peptidoglycans?
Chaîne de peptides tissée très serrée où peuvent agir certains antibiotiques.
Que permet la coloration de Gram?
Elle permet une classification dichotomique en fonction des bactéries qui retiennent le colorant (Gram +) et de ceux qui ne la gardent pas (Gram -). En couplant le Gram à la morphologie (Cocci ou bacille), on obtient 4 grandes classes de bactéries qui forment la base de la classification bactérienne
Quelles sont les 6 étapes derrière la coloration de Gram?
1- Étendre un spécimen sur une lame de microscope
2- Fixer à la chaleur ou à l’alcool
3- Colorer avec le cristal violet, laisser agir, rincer
4- Ajouter le mordant (Lugol), laisser agir, rincer
5- Décolorer à l’alcool, rincer
6- Contre colorer (safranine ou fuschine), laisser agir, rincer
Quelles sont les caractéristiques de la paroi bactérienne des Gram +?
- Protéines de la paroi: acide teichoïque, lipoteichoïque, etc.
- Paroi épaisse de peptidoglycans
Quelle est la configuration de la parois bactérienne des Gram -?
En ordre de la couche la plus superficielle à la plus profonde:
- Lipopolysaccharides (LPS)
- Membrane externe perméable
- Espace périplasmatique (permet de concentrer des enzymes contre les antibiotiques)
- Couche mince de peptidoglycans
- Membrane cytoplasmique
Quelles sont les particularités des lipopolysaccharides?
- Présents en grande quantité dans la paroi des bactéries Gram -
- Facteurs de virulence important (endotoxines)
- Déterminant antigénique responsable de l’antigénécité somatique (antigène O des entérobactéries)
Quelles sont les particularités de la membrane externe des bactéries Gram -?
- Composée d’une double couche de phospholipides en interne et de LPS en externe
- Porines permettent à la bactérie de réguler les échanges avec son milieu
- Le blocage de certaines porines est souvent utilisé par des bactéries comme moyen de résistance antibiotiques
Quelles sont les particularités de la membrane cytoplasmique des bactéries?
- Constituée d’une double couche de phospholipides contenant des protéines
- Assure la régulation osmotique et est impliquée dans la réplication cellulaire
Quelles sont les particularités du cytoplasme des bactéries?
- Fluide qui contient 95% d’eau dans lequel se trouve des substances dissoutes
- Contient de nombreux ribosomes et l’appareil nucléaire
- Contient peu d’organelles
Quelles sont les particularités de l’appareil nucléaire des bactéries?
- Constitué d’ADN double-brin sans membrane nucléaire, condensé dans un nucléoïde.
- Parfois, il peut y avoir de l’ADN extra-chromosomal sous forme de plasmide (moyen d’échange efficace entre 2 bactéries comme dans le microbiote)
Quelles sont les particularités des ribosomes des bactéries?
- Complexe de protéines et d’ARN responsable de synthétiser les protéines en décodant l’information de l’ARN messager
- Constitué de 2 sous-unités: Grande sous-unité 50S (23S + 5S + protéines) et petite sous-unité 30S (16S + protéines)
- Total de 70S
Quelles sont les particularités des flagelles des bactéries?
- Assurent la mobilité de la bactérie
- Peut constituer en soi un facteur de virulence
- Déterminant antigénique majeur (antigène H)
Quelles sont les particularités des pili (fimbriae) des bactéries?
- Plus fins et plus rigides que les flagelles
- 2 types: Commun (fixation des bactéries aux tissus, adhésion, facteur de virulence important) et sexuels (interviennent dans la conjugaison bactérienne, soit le transfert de matériel génétique)
Quelle est la définition du métabolisme?
Ensemble des réactions biochimiques mises en jeu par un organisme vivant
Quelle est l’utilité d’étudier le métabolisme des bactéries?
- Comprendre (habitat naturel, interaction avec l’être humain)
- Taxonomie
- Identification selon les caractéristiques phénotypiques
- Définir les conditions optimales pour cultiver les bactéries d’intérêts médical
Quelle est la différence entre un métabolisme autotrophe et hétéroptrophe?
- Autotrophe: Source de carbone est le CO2
- Hétérotrophe: Source de carbone est un substrat organique
Vrai ou faux? Les pathogènes humains sont tous autotrophes.
Faux, hétérotrophes
Quelle est la différence entre catabolisme et anabolisme?
- Catabolisme: Réactions de dégradation qui assurent la production d’énergie
- Anabolisme: Consommation de l’énergie (réactions de biosynthèse, fonctions mécaniques, tel que le déplacement cellulaire ou le transport de métabolite)
Quelles sont les 4 principaux types de molécules catabolisées?
- Glucides
- Alcools
- Acides organiques
- Acides aminés
Vrai ou faux? Le catabolisme se fait via des réactions d’oxydo-réduction, comme le transfert d’électrons.
Vrai
Quel est le processus de transfert des électrons dans l’ordre?
1- Un substrat énergétique organique oxydable est oxydé libérant ainsi 2 électrons et 2 protons pour ainsi devenir un substrat oxydé (production d’ATP)
2- Les électrons et les protons entre dans une boucle de réactions (NAD+/NADH + H+)
3- Ils sont alors transférés à un accepteur final d’électron qui devient ainsi un accepteur réduit (production d’ATP)
Comment se nomme l’étape où un substrat énergétique organique oxydable devient un substrat oxydé?
Oxydation/Phosphorylation oxydative
Quels sont les 3 phénomènes biochimiques interdépendants qu’on retrouve dans le catabolisme?
- Voie enzymatique d’oxydation du substrat
- Voie de transfert des électrons (et protons) vers un accepteur final d’électrons (réduction)
- Production de métabolites phosphorylés riches en énergie
Donne 2 exemple de réaction d’oxydation?
- Glucose en pyruvate
- Tryptophan en Indole par tryptophanase
Quelles sont les 2 méthodes de réduction dans le catabolisme?
Respiration (aérobie/anaérobie) et fermentation
Quelles sont les particularités de la respiration aérobie?
- Cytochrome-dépendante
- Accepteur final = 02
Quelles sont les particularités de la respiration anaérobie?
- Cytochrome-dépendante
- Accepteur final = substrat organique oxygéné ou substrat inorganique réductible
Quelles sont les particularités de la fermentation?
- Cytochrome-indépendante
- Accepteur final = substrat organique oxygéné
Quelle est la voie de respiration préférentielle, car elle produit plus d’énergie?
La voie aérobie
Vrai ou faux? Il est plus avantageux pour une bactérie d’utiliser un seul type de réaction de réduction.
Faux, car plus elle utilise des méthodes différentes, plus elle peut vivre dans des environnements différents. Par contre, ce n’est pas toutes les bactéries qui utilisent plusieurs types.
Comment nomme-t-on les bactéries nécessitant de l’oxygène pour la croissance?
Aérobies obligatoires
Qu’est-ce qu’une bactérie anaérobie obligatoire?
C’est un organisme qui ne croit pas en présence d’oxygène. Cela peut aussi définir des anaérobies stricts qui ne survivent pas à des concentrations d’oxygène supérieures à 0,5%
Quels sont les moyens de réduction utilisés par les bactéries anaérobies facultatives?
Respiration aérobie ou la fermentation
Quelles sont les particularités des bactéries microaérophiles?
- Peuvent croître en présence de petites quantité d’oxygène (4-5%)
- Certains sont aussi capnophiles (requiert du CO2 pour croître)
Comment nomme-t-on les bactéries anaérobiques pouvant survivre en présence de 2 à 8% d’oxygène, mais non se reproduire?
Anaérobies aérotolérants
Quels sont les 5 éléments entrant dans les besoins cellulaires?
- Atmosphère
- Nutriments
- Température
- pH
- Humidité
Quelles sont les 3 classifications de bactéries en fonction de la température?
- Mésophile: croissance aux températures avoisinantes du corps humains
- Thermophiles: Croissance entre 45 et 70°C
- Psychrophiles: Croissance près de 0°C (optimal entre 10 et 15)
Quelles sont les 3 classifications de bactéries en fonction du pH?
- Neutrophiles: pH neutre entre 5,5 et 8,5 avec un optimum à 7,0
- Acidophiles: pH acide (ex: au niveau vaginal)
- Alcalophile: pH alcalin
Comment se déroule la pathogénèse bactérienne et qu’est-ce qui l’impacte?
1- Colonisation d'un (nouveau) site 2- Invasion ou contournement des défenses de l'hôte 3- Multiplication 4- Dommages Impacter par les facteurs de virulence
Quelle est la définition des facteurs de virulence?
Composantes structurelles ou produits synthétisés par une bactérie qui lui permet d’attaquer l’hôte avec une sévérité variable. Il peuvent être au niveau de la structure de la cellule ou extracellulaire
Vrai ou faux? L’adhérence est d’une certaine utilité pour tous les tissus à coloniser et elle est un facteur de virulence quasi universel chez les pathogènes.
Vrai
Quels sont les 4 principaux moyens d’adhérence des bactériques?
- Pili
- Fimbriae (adhésines)
- Protéines d’adhésion
- Biofilm (également moyen de résistance)
Vrai ou faux? Toutes les bactéries possèdent une capsule bactérienne de nature glucidique essentielle à leur survie.
Faux, seulement certaines bactéries et ce n’est pas essentiel à leur survit malgré les avantages procurés
Quels sont les 4 rôles de la capsule bactérienne?
- Mécanisme de protection
- Empêche la formation de complexes de compléments
- Empêche la phagocytose en rendant la bactérie non immunogène
- Interfère également dans la liaison des antibiotiques à leur cible
Quel est le point commun entre la Neisseria meningitidis, la Streptococcus pneumoniae, la Haemophilus influenzae et la Capnocytophaga canimorsus?
Ce sont toutes des bactéries encapsulées
Que sont les siférophores?
Système de chélation et d’emmagasinage du fer permettant de croître en milieu appauvri (ex: entérobactine, aérobactine, …)
Quel est le terme général décrivant les protéines ayant un rôle dans l’invasion par divers mécanismes?
Protéines promotrices d’invasion
Quels sont les 2 types de toxines?
Exotoxines et endotoxines
Vrai ou faux? On retrouve les exotoxines uniquement chez les Gram - et les endotoxines chez les 2 types de Gram.
Faux, c’est le contraire, car les endotoxines proviennent des LPS retrouvés seulement chez les Gram -
De quoi sont responsables les endotoxines?
De beacoup d’effets néfastes lors des chocs septiques
Quel est le test qui a été longtemps utilisé en pharmaceutique pour détecter la présence d’endotoxines dans les préparations stériles?
Test du Limulus
Quels sont les 3 effets principaux des exotoxines représentant la variété d’effets qu’elles peuvent avoir?
- Diarrhée (entérotoxine du E. Coli)
- Toux de la coqueluche
- Spasticité du tétanos
Quelles sont les 3 classes d’exotoxines?
- Type A-B (plus fréquents)
- Cytotoxines (hémolysines, leukocidines, etc.)
- Superantigène (peu fréquent)
Quel est le processus de toxicité des superantigènes que l’on retrouve notamment dans la Streptocoque bêta-hémolytique du groupe A?
1- Stimulation excessive des lymphocytes T
2- Hyperproduction de cytokines
3- Choc toxique induit par le système immunitaire
Quelles sont les 6 différents critères de classification des bactéries et leurs sous-critères?
- Morphologie: Forme, taillem arrangement, coloration Gram
- Biochimique: Composant de la paroi, pigments
- Physiologiques: Température de croissance, pH optimal
- Métabolique: Utilisation de substra, aérobiose, produits
- Génétique: Séquençage d’ADN
- Sérologique: Agglutination avec antisérum
Quelles sont les caractéristiques de la nomenclature des bactéries?
Elles sont classées selon les principes de Linné en une nomenclature binomiale. Les sous-classes taxonomiques utilisées couramment sont le genre et l’espèce exprimés en italique et le genre prend une majuscule
Quelles sont les 3 principales espèces de cocci aérobies à Gram +?
- Staphylococcus
- Streptococcus
- Enterococcus
Quelles sont les 2 principales espèces de cocci aérobies à Gram -?
- Moraxella
- Neisseria
Quelle est la principale espèce de cocci aérobie Gram+ en amas et ses particularités en lien avec la flore cutanée?
Staphylococcus.
- Celles à coagulase positive ne sont pas dans la flore cutanée normale, alors que les coagulases négatives oui
Quelles sont les particularités de la Staphylococcus aureus?
- Pathogène très important et fréquent
- Cause souvent des infections liées à la peau, mais peut causer de nombreuses autres infections divers (vasculaires, cardiaques, os, etc.)
Quelles sont les 2 principales espèces de cocci Gram + aérobies en chaines?
Streptococcus et Enterococcus
Quel groupe de Streptococcus beta-hémolytique est responsable d’une multitude de présentations infectieuses selon les toxines qu’elle produira (ex: fasciite, impétigo, etc.)?
Groupe A (Streptococcus pyogenes)
Quel groupe de Streptococcus beta-hémolytique est responsable d’infections néonatales?
Groupe B (Streptococcus agalactiae)
Quels sont les 2 principaux pathogènes compris dans les Streptococcus alpha-hémolytiques?
- S. pneumoniae
- S. groupe viridans
Quelles sont les principales infections à Streptococcus bêta-hémolytique du groupe A?
- Peau et tissus mous (cellulite, érysipèle, fasciite nécrosante)
- Pharyngite
- Pneumonie
- Post-opératoire
- Choc toxique
Quelles sont les particularités de la Streptococcus pneumoniae?
- Un des pathogènes les plus fréquents dans les infections des voies respiratoires hautes et basses et les otites moyennes aigues
- Aussi fréquent dans les méningites bactériennes
Où retrouve-t-on les enterocoques (Enterococcus)?
Ils font partie de la flore digestive. C’est pourquoi ils sont parfois impliqués dans les infections abdominales. Parfois aussi les infections urinaires
Quels sont les 2 Neisseria d’importance médicale?
- N. gonorrhoeae, agent de la gonorrhée
- N. meningitidis, un des pathogènes impliqué dans les méningites. Nos vaccins couvrent certains sérogroupes
Quelles sont les 3 grandes catégories de bacilles aérobies à Gram -?
- Entérobactéries
- Non-fermenteurs
- Non-enterobacteriaceae
Que sont capable de faire les entérobactéries?
- Fermenter le glucose
- Réduire les nitrates en nitrites
- Oxydase négative
Ex: E. coli, Salmonella, etc.
Quelles sont les particularités de l’Escherichia coli?
- Fait partie de notre flore digestive
- Pathogènr urinaire principal
- Certaines souches toxigéniques sont associées à la diarrhée du voyageur
Quelles sont les particularités des entérobactéries autres que l’E. coli (Klebsiella, Citrobacter, Enterobacter, etc.)?
- Germes fréquents dans les infections urinaires également
- Retrouvés dans les infections respiratoires chez les patients avec MPOC et fibrose kystique du pancréas
Quelles sont les particularités de la Salmonella sp. et la Shigella sp.?
- Pathogènes entériques qui causent des éclosions sporadiques
- La présence dse Shigella multi-résistant dans certains pays en voie de développement est inquiétante
Quelles sont les particularités des bacilles Gram - non fermentaires (BNF)?
- Bactéries qui sont incapables de fermenter le glucose
- On reconnait parmi celles-ci, les Pseudomonas, Acenitobacter, Stenophomonas, Burkholderia, etc.
- Tendance à être assez résistants
Quelles sont les particularités de la Pseudomonas aeruginosa?
- BNF d’importance médicale la plus importante
- Pathogène d’importance aux soins intensifs
- Double couverture d’antibiotique parfois utilisée pour les infections sévères
- Capacité d’induire plusieurs résistances antibiotiques additionnelles
Que sont les bacilles Gram - fastidieux?
Groupe hétéroclite de nombreux BNF qui n’entrent pas dans les autres catégories et ayant des caractéristiques de croissance différentes (plus lente, milieux spéciaux, pas de croissance in vitro)
Quels sont les 3 principaux antibiotiques couvrant les atypiques?
Macrolides, tétracyclines, quinolones
Quelles sont les 3 formes des bacilles Gram + aérobies?
- Corynéformes ou diphtéroïdes
- Bacilles réguliers (sporulés ou non)
- Embranchés (actinomycètes)
Vrai ou faux? Les bacilles Gram + aérobies sont souvent des pathogènes.
Faux, ils font partie de flores normales ou de l’environnement
Quel est le pathogène pouvant causer des infections rares mais sévères chez les personnes immunosupprimées et chez les femmes enceintes en lien avec la consommation de produit laitier à base de lait cru ou de charcutries?
Listeria monocytogenes
Quelle bacille cause l’anthrax par production de toxines?
Bacillu anthracis
Quelle bacille donne parfois des atteintes digestives par production de toxines?
B. cereus
Quelle est la caractéristique commune des Clostridium (C. difficile, C. tetani et C. botulinum)?
Anaérobie ayant le pouvoir de sporuler
Quelles sont les particularités de la C. difficile?
- Bacille Gram + sporulé
- Transmission fécale-orale
- Cause la colite pseudo-membraneuse souvent déclenchée par l’usage d’antibiotque
Quel est le processus de déclenchement d’une infection à la C. difficile?
1- Usage d’antibiotique légitime ou non
2- Séséquilibre de la flore microbienne intestinale
3- Colonisation par le C. difficile
4- Infection
Quelle est l’espèce de bactérie anaérobie intestinal qui représente la majorité de la flore digestive?
Bacteroides sp.
À quel moment le groupe fragilis des Bacteroides devient-il pathogène?
Lors du bris de la muqueuse intestinale
Quels sont les 4 principaux modes de fonctionnement des antibiotiques?
- Inhibition de la synthèse de la paroi bactérienne
- Inhibition de la membrane cytoplasmique
- Inhibition de la synthèse protéique
- Inhibition de la synthèse de l’ADN
