Intra Microbiologie Cours 1 à 6 Flashcards
Quelles structures sont obligatoires chez les bactéries?
- ADN (chromosome)
- ribosomes
- membrane cytoplasmique
- paroi
Quelles structures sont optionnelles chez les bactéries?
- capsule
- fimbriae et pili
- flagelle(s)
- plasmides
Qu’est-ce que la microscopie photonique nous permet d’étudier?
formes et arrangements des bactéries
Qu’est-ce que la microscopie à fond noir nous permet d’étudier?
la motilité des bactéries (ce sont des bactéries vivantes qui s’y déplacent)
En quoi consiste la microscopie électronique?
faisceau d’électron balaie le spécimen = image sur écran phosphorescent
En quoi consiste la microscopie électronique (ME) à balayage?
faisceau d’électron balaie le spécimen = image sur écran cathodique
Quelle informations nous donne la coloration?
- composition de la cellule (via colorations Gram)
- présence de structures particulières: capsule, endospore, flagelles
Quelle est la différence entre une préparation séchée à l’air et une préparation à l’air frais?
- préparation séchée à l’air = cellules mortes
- préparation à l’air frais: peu de contraste, MAIS permet d’observer la motilité
Qu’est-ce qu’une coloration simple, un exemple et l’information qu’elle nous donne?
Def: colore uniformément toutes les cellules
Ex: bleu de méthylène
Informations données: forme et arrangement
Comment est-ce qu’on fait une coloration simple?
- étendre le spécimen sur lame
- laisser sécher à l’air
- fixer à la chaleur
- noyer (LOL not mais jsais pas comment dire flood) avec le colorant, rinser et sécher
Qu’est-ce qu’une coloration négative, un exemple et l’information qu’elle nous donne?
Def: coloration qui ne pénètre PAS la cellule ou la capsule
Ex: encre de chine
Informations: visualiser la capsule bactérienne (=zone claire autour de la cellule)
Qu’est-ce qu’une coloration Gram et quelles informations elle nous donne?
Def: coloration DIFFÉRENCIELLE, Gram + ou -
Informations: propriétés de la paroi bactérienne
Comment est-ce qu’on fait une coloration Gram?
- étendre le spécimen sur lame
- laisser sécher à l’air
- fixer à la chaleur
- coloration basique crystal violet
- solution d’iode (mordant)
- rinçage à l’eau
- décoloration à l’alcool (yeah parce que t’es un peu décolorée un lendemain de brosse, sauf à occasions quand on te dessine dans face…)
- contre coloration fuschine
Quelles sont les 3 caractéristiques de l’espèce bactérienne? (disons qu’on nomme une espèce bactérienne, ce sont 3 caractéristiques qui permet de différencier d’un autre espèce bactérienne)
- Gram
- forme et arrangement
- caractéristiques biochimiques et génétiques
Quelle est la définition d’une population bactérienne?
Def: millions de cellules bactériennes après une croissance sur un milieu de culture
Quelle est la définition d’une culture bactérienne pure?
Def: culture qui ne contient qu’une espèce bactérienne
Un milieu de culture contient les éléments nutritifs nécessaires à la croissance, lesquels?
- source de carbone (sucre)
- source d’azote (inorganique, ou dérivé des a.a.)
- ions K, Mg, Fe…
- vitamines
Qu’est-ce qu’une colonie bactérienne? Dans quel type de milieu de culture on la retrouve?
Colonie bactérienne (=clone) : multiplication d’UNE SEULE bactérie qui donne une masse observable à l’oeil nu après plusieurs générations (1 colonie = min 10,000,000 cellules bactériennes)
Milieu de culture: solide
En quoi consiste le milieu de croissance gélifiant Agar?
mélagne agarose + agaropectine (obtenu d’algues rouges)
En quoi consiste le milieu de culture synthétique (ou milieu minimal de Davis)?
- Di-potassium de phosphate
- Mono-potassium de phosphate
- Citrate de sodium
- Sulfate de magnésium
- Sulfate d’ammonium
- Dextrose (sucre)
- Eau
En quoi consiste le milieu de culture complexe (ou bouillon nutritif)?
- extrait de boeuf
- peptones
- eau
En quoi consiste l’autoclave? Son usage?
l’autoclave c’est comme un autocuiseur presto
121℃ pendant 15-20min
Usage: stérilisation
Quelles sont les deux techniques d’ensemencement?
- ensemencement sur boîte: échantillon placé à la surface du milieu gélosé = colonies en surface
- ensemencement en masse: échantillon placé dans la boîte de pétri avant d’y additionner le milieu stérile et de mélanger le tout = colonies en surface + colonies dans la gélose
Pour arriver à bien définir le nombre d’UFC (par mL d’échantillon), on utilise normalement quelle dilution de l’échantillon?
dilutions (en mL) jusqu’à 10 à la -3
Nommer un milieu de croissance, outre Agar, utilisé en TP
Gélose sang (hémolyse)
Qu’est-ce que la galerie API et son usage?
Def: ensemble de petits tubes qui servent à faire des tests biochimiques miniaturisés
Usage: identification de microorganismes
Quelles sont les phases de la courbe de croissance bactérienne?
- phase latente
- croissance log
- plateau ou stationnaire
- décroissance
Comment fonctionne le milieu sélectif & différentiel (MacConkey)?
- via coloration rouge neutre: différencie les bactéries qui utilisent le lactose (rouge = acide donc utilise lactose, jaune-orange = basique donc pas utilisation)
- via crystal violet: croissance de Gram- seulement
- via sels biliaires: croissance des entérobactéries seulement
En quoi consiste l’antibiogramme (ou méthode de Kirby Bauer) et son usage?
Antibiogramme : placer des disques imprégnés d’antibiotiques en surface d’une boîte [milieu nutritif gélosé + culture inoculée ] avant l’incubation
Usage: évalue la susceptibilité des bactéries aux antibiotiques par l’apparition de zones d’inhibition de croissance autour des disques
Quelles sont les conditions du milieu de congélation bactérienne?
Température -70 degrés celcius
+(glycérol) agent qui empêche la formation de cristaux de glace
De quoi est constitué le milieu de transport bactérien et dans quel but?
eau et ions inorganiques seulement
but: empêcher la multiplication
Qu’est-ce que la lyophilisation?
Def: cultures bactériennes congelées dans des ampoules de verres desquelles l’eau est enlevée par sublimation via un lyophilisateur
But: conservation sur plusieurs années
Quelles sont les particularités (3) du nucléoïde bactérien?
- ABSENCE de membrane nucléaire
- ABSENCE d’appareil mitotique
- ADN bactérien = UN chromosome circulaire ou des plasmides
Quels antibiotiques (2) ciblent les ribosomes?
- tétracyclines (sous-unité 30S)
2. aminoglycosides (sous-unité 50S)
Qu’est-ce qui est contenu dans les inclusions (granules) bactériennes et dans quel but?
- lipides (a. poly-hydroxybutyrique)
- glycogène
- phosphate inorganique
but: emmagasiner de l’énergie
Quelle est la différence entre la membrane cytoplasmique des procaryotes et eucaryotes en ce qui concerne les a. gras?
procaryotes: a. gras flexibles
eucaryotes: a. gras plus rigides en raison des stérols
Quels genres de liens unissent les lipides chez les bactéries et chez les archéobactéries?
bactéries: ester
archéobactéries: éther
Quelles sont les fonctions (4) de la membrane cytoplasmique?
- séparer cellule et environnement
- loger les éléments de la chaîne respiratoire
- perméabilité sélective au mvt de molécules
- transport spécifique de molécules hydrophiles = concentre les molécules
Exemple de diffusion passive (transport passif)
transport d’eau, CO2, oxygène…
Exemple de diffusion facilitée (transport passif)
glycérol
Exemple de transport actif
sucres, a.a. ions…
Qu’est-ce que la translocation de groupements et un exemple
Def: lorsqu’une substance est chimiquement modifiée (phosphorylation) pour permettre son transport sans accumulation *demande de l’énergie
Ex: glucose incorporé en glucose-6-P
Quelle est la nécessité d’une paroi cellulaire?
haute pression IC causée par des concentrations élevée
Qu’est-ce que les bactéries acido-alcoolo-résistantes (AAR) ont de particulier par rapport aux Gram+ et donner un exemple de AAR
a. mycoliques (C90)
Exemples:
- M. tuberculosis
- M. paratuberculosis
Qu’est-ce qui fait la différence entre les bactéries Gram+ et Gram- au niveau de la coloration?
Gram+ : le complexe violet crystal-iode (insoluble) est extrait par l’alcool
Gram- : le complexe violet crystal-iode (insoluble) demeure emprisonné
On perçoit les AAR par quel type de coloration?
Coloration Zielh-Neelsen
Qu’est-ce qui fait la différence entre les bactéries Gram+ et Gram- au niveau du peptidoglycane?
Gram+ : 90% peptidoglycane, lien peptidique qui peut être pentapeptidique (5 glycines)
Gram- : 5-20% peptidoglycane, lien peptidique direct DAP -D-alanine
Décrire la structure du peptidoglycane
unités de glycane-tétrapeptide, reliées par ponts peptidiques
[ 2 sucres (acide N-acétyl-glycosamine, acide N-acétyl-muramique) + a.a. (L-alanine, D-alanine, lysine et/ou DAP) ]
Quelle enzyme hydrolyse lien peptidique qui unit les unités glycane-tétrapeptide et ou est-elle retrouvée naturellement?
enzyme: lysozyme
retrouvée dans des liquides biologiques (ex: larmes, salive…)
Quelles antibiotiques s’attaquent à la synthèse de la paroi cellulaire (peptidoglycane plus précisément)?
(vanobacipénicéphal)
- vanomycine
- bacitracine
- pénicilline
- céphalosporine
Qu’est-ce que l’acide théicoïque et définir ses fonctions
Polymère de glycérophosphate ou ribitol phosphate de charge négative retrouvé dans la paroi des Gram+
*acides lipothéoicoïque = [ a. théichoïques + lipides ] lié à memb. cytoplasmique
Fonctions:
- rigidité, structure, porosité
- adhérence aux cellules de l’hôte
- pro-inflammatoire: relâche de cytokines
Quelle protéine de la paroi est caractéristique des streptocoques?
protéine M
*les protéines de la paroi sont souvent associées à la pathogénicité
On dit que la membrane externe de la paroi bactérienne est asymétrique, en décrire la structure
la membrane externe possède 2 feuillet à composition différente (d’ou asymétrie)
- feuillet interne: phospholipides
- feuillet externe: LPS (lipopolysaccharides) à 3 régions
- lipide A (ancré)
- noyau oligosaccharide (heptose + KDO)
- polysaccharadie O (répétition de sucres) = antigène de surface
Quelle composante de la paroi bactérienne est une endotoxine à activité inflammatoire? Quelle autre caractéristique a cette composante?
LPS, qui est aussi une substance pyrogène (donne la fièvre)
Quelle types de bactéries forment des endospores? Nommer une bactérie anaérobie et une aérobie qui forme des endospores
Gram+
- bacillus (aérobie)
- clostridium (anaérobie)