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Microbiologie > Final Microbiologie > Flashcards

Final Microbiologie Flashcards

1
Q

Système immunitaire inné

a) identifier les intervenants (6 “catégories” si on peut dire)
2) ceux qui forment la première ligne de défense
3) Quel intervenant fait le lien entre ce système et l’immunité adaptative?

A

a) barrières épithéliales; molécules sécrétées (enzymes, peptides antimicrobiens et anticorps); cellules phagocytaires et lymphocytaires spécialisées: neutrophiles, macrophages, NK cells; système du complément; cellules dentritiques
b) la barrière épithéliale et les molécules sécrétées
c) les cellules dendritiques

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2
Q

Quelles (3) cellules sont actives dans la phagocytose?

A
  • monocytes
  • macrophages
  • cellules dendritiques
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3
Q

Nommer les étapes de la phagocytose

A
  1. a) chimiotaxie
  2. b) reconnaissance et adhérance: direct par récepteurs et indirecte par complément ou anticorps
  3. ingestion
  4. formation du phagosome
  5. formation du phagolysosome (phagosome + lysosome)
  6. digestion par enzymes
  7. formation du corps résiduel (matériel indigestible)
  8. exocytose des déchets
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4
Q

Qu’est-ce qui intervient dans le mécanisme d’adhérance et reconnaissance DIRECTE par récepteurs? Donner des exemples vus en classe

A

sur la cellule phagocytaire: PRR = récepteur de reconaissance de motifs moléculaires
*exemple: Toll-like receptor TLR

sur le pathogène: PAMPs = pathogen-associated molecular patterns
*exemple: LPS des gram-

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5
Q

Donner les 3 voies d’activation du système de complément

A
  1. voie classique
  2. voie des lectines
  3. voie alternative
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6
Q

Concernant les voies d’activation du système de complément, une molécule leur est commune dans la cascade permettant le passage en phase terminale, laquelle?

A

C3b

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7
Q

Encore avec le fucking système de complément, une molécule est active dans la lyse cellulaire en phase terminale, laquelle?

A

MAC

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8
Q

Quelles sont les (3) fonctions des NK cells?

A
  1. Cytotoxicité (truc avec les récepteurs inhibiteurs ou activateurs)
  2. ADCC (processus qui mène à la lyse cellulaire par libération de granules)
  3. Production de cytokines
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9
Q

Cytokines

a) Qu’est-ce que les cytokines?
b) Nommer les (6) différentes familles
c) Donner leur (3) types d’actions

A

a) Un messagers chimiques COMMUN entre TOUTES les cellules

b) Familles:
1-IL (interleukines)
2-TNF “tumor necrosis factors”
3-INF (interférons)
4-CSF “colony stimulating factors” = différentiation cellulaire
5-TGF “transforming growth factors” = régulation et inflammation et cicatrisation
6-chimiokines = chimiotaxie et activation cellulaire

3) Actions:
1-autocrine (production et action sur la même cellule)
2-paracrine (action sur cellule adjacente)
3-endocrine (action sur cellule à distance)

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10
Q

Est-ce que les cytokines peuvent faire la phagocytose?

A

NON! Elles sont INCAPABLES de phagocytose, alors font la lyse cellulaire via libération de granules

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11
Q

Quelle est la conséquence des intervenants du système immunitaire inné?

A

Inflammation

Learn only if you’re really crinquée or crazy, fuck those details
Cette réaction inflammatoire générée grâce à…
-vasodilatation (apport de cellules par la voie sanguine)
-chimioattractant (guide les cellules immunitaires par gradient de concentration)
-dégranulation et contraction (augmente les effets de la réponse immunitaire)

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12
Q

Système immunitaire adaptatif

a) l’immunité adaptative se divise en (2) sous-types d’immunité, lesquelles?
b) identifier les intervenants de l’immunité adaptative

A

a) immunité cellulaire et humorale

b) cellules T CD4+ et cellules T CD8+, cellules B, anticorps

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13
Q

Suite à l’activation et la maturation, quels types de cellules forment les cellules T et quelles sont leurs fonctions

A

Cellules T CD4+ = cellules helper : mémoire immunitaire et activation des cellules B (via cytokines) pour la sécrétion d’anticorps
Cellules T CD8+ = cellules cytotoxiques : mémoire immunitaire et élimination des cellules infectées de manières antigène-spécifique (via libération de granules)

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14
Q

Anticorps

a) c’est quoi la défintion d’un criss d’anticorps?
b) quelles sont les portions qui forment l’anticorps?

A

a) Def: substances produites par lymphocytes B SPÉCIFIQUES à l’antigène
b) portion variable (reconnaissance de l’épitope, “antigene binding site”) et portion constante (fonction, définit le type d’anticorps)

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15
Q

Décrire la structure de l’IgA et sa fonction principale

A

structure: monomère OU dimère (liées par une pièce sécrétoire synthétisée par les cellules épithéliales)
fonction: réponse immunitaire locale de neutralisation = empêcher le lien pathogène-cellule de la muqueuse (DONC EMPÊCHE L’ENTRÉE)

MÉMO: quand tu veux pas que quelqu’un entre tu crie NON (n=neutralisation) ARRÊTE (A=IgA)

  • résistantes aux enzymes protéolytiques
  • possède (2) sous-classes
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16
Q

Décrire la structure de l’IgE et sa fonction principale

A

structure: monomère
fonction: défense contre les infections parasitaires, réactions allergiques

MÉMO: elouise est allergique a un paquet d’affaires et est bonne contre les parasites avec ses oignons au fond de son lit

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17
Q

Décrire la structure de l’IgG et sa fonction principale

A

structure: monomère
fonction: fixe le complément et initie la cascade, opsonisation, neutralise les toxines bactériennes

  • possède (4) sous-classes
  • domine le sérum
  • 2 sites actifs
  • HAUTE spécificité
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18
Q

Décrire la structure de l’IgM et sa fonction principale

A

structure: pentamère
fonction: meilleure classe pour l’agglutination, fixation du complément

  • 10 sites actifs
  • PEU spécifique

MÉMO: M = maman or Mouf (my mama): Mouf est la meilleure LOL et est bonne a fixer des choses

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19
Q

Définitions de la pathogénese bactérienne:

  • pathogénèse
  • pathogénécité
  • virulence
  • infection
  • maladie
A

pathogénèse: développement d’une maladie

pathogénécité: capacité d’une bactérie à produire une maladie

virulence: degré de pathogénécité
infection: invasion et multiplication des bactéries ds l’hôte
maladie: manifestation de signes cliniques suite à une infection

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20
Q

Donner des exemples de facteurs de virulence

A

Facteurs de virulence = constituants de la cellule bacérienne qui lui permet de produire une maladie ou un état pathologique

Exemples: toxines, pilis, certains LPS

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21
Q

Quelles sont les grandes étapes de la pathogénèse bactérienne?

A

1-attacher et/ou entrée : via la peau ou surfaces mucosales (tractus génital, tractus urogénital)
2-évasion des défenses de l’hôte
3-multiplication au site d’infection ET dissémination
4-dommage à l’hôte
5-transmission : verticale et/ou horizontale

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22
Q

Quels facteurs bactériens favorisent l’attachement des bactéries à l’hôte?

A

glycocalyx, protéines d’adhérence, acide lipoteichoique, fimbriae (pili)

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23
Q

Quelle est la différence entre un phagocyte professionnel et NON-professionnel?

A

phagocyte professionnel: professionnel de la phagocytose, tel les monocytes et les macrophages

phagocyte NON-professionnel: cellule impliquée accidentellement dans le processus de phagocytose, comme les cellules M et les cellules épithéliales

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24
Q

Quelles sont les (3) étapes majeures de l’invasion des cellules épithéliales par les bactéries?

A
  1. attachement et EFFACEMENT des microvillosités
  2. réarrangement du cytosquelette (actine)
  3. internalisation
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25
Q

Donnez des exemples de défenses de l’hôte, lesquelles seront dépassées par la bactérie pathogène lors de la pathogénèse

A 
protéine de la phase aigue 
lysozyme 
lactoférrine
interféron et autres cytokines
activation du complément
phagocytose
NK cells
Apoptose
Collectines
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26
Q

a) Lorsqu’on parle de besoins en nutriments des bactéries pathogènes, quel nutriment est essentiel par la croissance des bactéries?
b) Qu’est-ce qui rend l’accessibilité à celui-ci plus “challenging” et comment la bactérie surmonte ce défi (eille toute une championne)

A

a) le Fer

b) Le Fer est séquestré ds l’hôte donc nécessite que la bactérie ait différentes stragégies pour l’acquisition
- production de substances qui enlèvent Fe à la transferritine
- production de sidérophores (ex: aérobactine) qui ont une haute affinité pour Fe
- sythèse d’OMP qui interagissent directement avec les protéines de l’hôte qui sont liées au Fe pour le récupérrer

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27
Q

Transferritine est intracellulaire et ferritine est extracellulaire. Vrai ou Faux?

A

FAUX, c’est le contraire

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28
Q

Quelle méthode de colonisation permet aux bactéries pathogènes de coloniser les tissus tout en échappant aux anticorps?

A

colonisation par diffusion de cellule en cellule = la bactérie ne quitte JAMAIS le cytoplasme

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29
Q

Nommer les 4 types de toxines et leurs actions respectives sur l’hôte:

A

toxine I = activation des voies intracellulaires SANS pénétration

toxine II = dommage à la memb. cellulaire

toxine III = pénétration et action, toxine à DEUX composantes (type AB)

endotoxine = pénétration et action

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30
Q

L’hôte peut s’endommager lui même, lors de quels types de réponses?

(oui oui, autant surprenant que ça puisse le paraître, parfois on se blesse par nous même, comme quand on fonce dans une porte… :P )

A
  • réponse inflammatoire = dommage vasculaire, hypotension, dommage organes
  • réponse immunitaire = DON’T know, live with it Lou :P
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31
Q

Je suis un virus
Je suis transmis de vertébré à vertébré
Mon vecteur est un arthropode hématophage (moustique, tique, simulie, puce, taon, etc.)

Qui suis-je?

A

Arbovirus

32
Q

a) Quel système de classification est basé sur 4 critères structuraux?
b) Quels sont ces critères?

A

a) Le système universel de classification

b) Critères structuraux:
1-nature des acides nucléiques
2-symétrie de la nucléocapside : hélicoïdale, icosaédrique ou complexe
3-présence OU absence d’une enveloppe
4-SI virus à nucléocapsides icosaédriques: nombre de capsomères / SI virus à nucléocapside hélicoïdale: diamètre ou longueur et épaisseur

33
Q

a) Quel système de classification classifie les virus en 7 groupes
b) Sur quoi se basent ces groupes?

A

a) Classification de Baltimore

b) particularités du génome

34
Q

Nommer les (3) agents subviraux et brièvement des caractéristiques qui leurs sont particulières

A

1-viroïde: UNE molécule d’ADN SANS capside
2-virusoïde: ne code PAS pour sa propre fixation
3-prions: de nature protéique (avec chaînes repliées incorrectement), ABSENCE de matériel génétique, c’est NI une bactérie NI un virus proprement dit

35
Q

Nommez le prions qui cause la maladie du cerveau

A

Encéphalopathies spongiformes

36
Q

Les agents infectieux peuvent-ils exister SANS génome?

A

OUI… protéines infectieuses

37
Q

Énumérez les étapes au cycle de la réplication virale

A

APDERAML

  • Attachement (tropisme cellulaire et tissulaire
  • Pénétration: via 3 voies possibles, soit l’injection, l’endocytose ou la fusion
  • Décapsidation
  • Expression des gènes viraux et Réplication du génome viral
  • Assemblage et Maturation: ds le noyau SI virus à ADN, ds le cytoplasme SI virus à ARN
  • Libération : 1 cellule infectée = 100 à 1000 particules virales, mais elles ne sont pas nécessairement infectieuses
38
Q

Quelles (4) interactions sont possibles d’avoir lieux entre le virus et la cellule?

A

1-interaction abortive : génome viral ne peut PAS se répliquer
2-interaction persistante ou latente : cellule survit à l’infection et produit des virus SANS être lysée, cas des virus enveloppés capables de bourgeonnement SANS lyse
3-interaction productive ou lytique
4-transformation cellulaire ou maligne

39
Q

a) combien y-a-t’il d’espèces différentes de Fongi?
b) combien d’entre-elles sont décrites?
c) combien sont pathogènes?

A

a) 1.5 millions d’espèces
b) 100 000
c) 300

40
Q

Quelle est la différence majeure entre un Fongus et une plante?

A

ABSENCE de chlorophylle chez le fongus

41
Q

Quelles sont les (4) groupes de Fongus et comment sont-ils regroupés?

A

Pluricellulaires: Champignons (hyphes charnus) & Moisissures (hyphes filamentés)
Pluricellulaires OU unicellulaires: Dimorphiques
Unicellulaires: Levures

42
Q

Qu’est-ce qu’un Hyphe?

A

Def: élément de la formule végétative d’une moisissure

43
Q

a) Qu’est-ce qu’un mycélium?
b) Quels sont les (2) principaux types de mycéliums retrouvés?
c) Quel serait le 3e type de mycélium identifié?

A

a) Def: ensemble d’hyphes
b) Principaux types de mycéliums:
1-végétatif: pénètre le milieu de culture et absorbe les absorbe les nutritifs
2-aérien: demeure au-dessus du milieu de culture
c) Mycéliums fructifère ou reproductif: mycélium aérien avec cellules reproductives ou spores

44
Q

Les Fongi possèdent des pigments photosynthétiques, vrai ou faux?

A

FAUX, il y a ABSENCE de ces pigments

45
Q

Les Fongi sont-ils homotrophes OU hétérotrophes

A

Hétérotrophes: Énergie des composés organiques ds milieu extérieur

digestion de la matière organique => absorbe les éléments nutritifs solubles

*Participe au recyclage des matières organiques

46
Q

Quels sont les (3) principaux types de mycoses? Donnez des exemples vus en classe

A

1-micoses superficielles : teigne et pied d’athlète
2-micoses sous-cutanées
3-micoses systémiques: candidoses

Notes sur la teigne:

  • espèces fréquentes: Microsporum canis et Trychophyton mentagrophytes
  • transition par contact direct OU indirect (ex tissus)
  • dignostique: champignon sous microscope OU mise en culture
  • traitement: voie locales (=pommades) OU générale (=comprimés), traitement de l’environnement
47
Q

Quels (3) facteurs de risques, une fois réunis, permettent à une bactérie pathogène opportuniste de causer une maladie?

A

1-hôte sensible
2-environnement favorable
3-agent pathogène

48
Q

Qu’est-ce qu’une mycotoxicose?

A

Def: intoxication par des mycotoxines

Exemples de mycotoxines: aflatoxine, alcaloïdes de l’ergot …

Attention qu’elles ne se retrouvent pas ds l’alimentation

49
Q

Nommez des cibles des antifongiques

A
  • paroi
  • membrane
  • synthèse des a.n.
  • synthèse des stérols
50
Q

Quel est le SEUL fongi qui affecte la nourriture à long terme?

A

Les levures

  • similarités avec les bactéries
  • formation en colonies sur milieux solides : forme utile en taxinomie
  • anaérobies facultatives
  • pH optimum de croissance: 3.5
  • température optimale de croissance: 20-30 degrés Celcius
  • forme: pléïomorphique en général, souvent ovoïdes
  • diamètre: 1-5 um donc plus petit que les autres fongi, mais plus gros que bactéries
  • longeure: 5-30 um
  • NON motiles
  • formation de pseudohyphes
  • cellule mère allongée donne naissance par bourgeonnement (cicatrices)
  • chez certaines, capsule polysaccharidique
  • généralement haploïdes
51
Q

Quelle différences résident entre les levures et les champignons ?

A

Les champignons

  • aérobies OU quelques-uns anaérobies facultatifs
  • peuvent croitre ds milieux hypertoniques (aérobies avec hautes concentrations en sucres ou en sels)
  • pH optimum: 5.6 plus basique que les levures, mais peut tolérer acide
52
Q

Quel serait l’avantage de la sporulation pour le champignon?

A

=Résistance à la déshydratation

53
Q

Quels sont les (4) modes de reproduction des Fongi?

A
  1. reproduction sexuée (via gamètes OU spores sexuées)
  2. reproduction asexuée (via sporulation)
  3. croissance apicale
  4. croissance par embranchement
54
Q

Formation des spores chez les Fongi

a) Qu’est-ce qu’un spore?
b) Quels sont les (4) modes de formation des spore?

A

a) Def: cellule produite lors de la reproduction asexuée des Fongi, avec noyau déshydraté et memb. cytoplasmique protégée par une enveloppe extérieure, peuvent contenir des pigments = couleur spécifique

b) Production de spores: 
1-bourgeonnement
2-fragmentation (sporulation)
3-formation d’exospores
4-fission binaire
55
Q

Quel est l’objectif d’une reproduction sexuée?

A

Produire de nouveaux individus capables de s’adapter aux nouvelles conditions environnementales

56
Q

Fongi imparfaits

a) Qu’est-ce qu’un Fongi imparfait?
b) La majorité sont-ils pathogènes ou NON pathogènes?

A

a) Def: Fongi qui ne possède pas de cycle sexuel OU cycle sexuel inconnu
b) Fongi pathogènes

57
Q

Microbiome

a) Donnez les 2 définitions de microbiome
b) Combien retrouves-t-on d’espèces différentes ds le microbiome normal?
c) Le génome collectif du microbiome représente combien de gènes?
d) Quel pourcentage est cultivable

A

a) Définitions
1. Collection des gènes de microbes associés à un hôte
2. Collection des microbes qui vivent dans l’habitat animal

b) envrion 1000
c) 8 millions
d) 20-30%

58
Q

Comme quel “genre” d’organe peut-on considérer le microbiote intestinal?

A

un organe symbiote

59
Q

Microbiote intestinal

a) combien d’espèces?
b) combien de microorganismes?
c) dominé par quelle sorte de bactéries? (anaérobie ou aérobie…)
d) fonction principale?
e) nombre de gènes?
d) perte (nombre de microorganismes) par gramme de selle?

A

a) 500 à 1000 espèces
b) entre 1 et 1000 milliards de microorganismes
c) anaérobies
d) digestion des des produits que l’hôte ne peut pas digérer (polysaccharides végétaux)
e) 3 million
f) 100 milliard par gramme de selle

60
Q

Côlon:

a) Combien y-a-t’il de bactéries dans le colon?
b) Celui-ci est dominé par quels deux phylas (à 90%)?
c) Lequel entre ces deux phylas domine sur l’autre?
d) Quels autres phylas y sont présents à 10%

A

a) entre 100 et 1000 milliards de bactéries
b) Firmicutes et Bacteroidetes
c) Firmicutes dominantes
d) Protéobactéries, Cyanobactéries, Actinobactéries

61
Q

Quels sont les 7 phylas bactériens?

A 
FBAFPVC
1-Firmicutes
2-Bacteroidetes
3-Actinobactéries
4-Fusobactéries
5-Protéobactéries
6-Verrucomicrobiae
7-Cyanobactéries
62
Q

Colonisation du tractus intestinal

a) Quel type de bactéries dominent après la naissance?
b) Quels phylas dominent après le sevrage?

A

a) anaérobies facultatives

b) Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobactéries

63
Q

Phases de développement du microbiote intestinal

a) quel type de bactéries dominent les premier 24h? Lesquelles précisément?
b) quel type de bactéries se développe dans les 10 jours qui suivent?
c) quel type de bactérie avec la diversification alimentaire?
d) à quoi ressemble le microbiote à la fin de la première année?

A

a) bactéries germes anaérobies facultatives: streptocoques, staphylocoques, entérobactéries
b) anaérobies strictes
c) aérobies strictes
d) composition semblable à l’adulte, mais note: possède presque la flore adulte à l’âge de 3 ans

64
Q

Si on se fie au diagramme avec les 4 grands cercles de couleur, quels sont les fonctions majeures du microbiote?

A

1-nutrition et dégradation des composés alimentaires indigestibles

2-Protection contre la colonisation du tube par microorganismes pathogènes
(barrière physique +compétition pour les nutriments + stimulation de l’immunité innée + production de composés inhibiteurs (ex: bile))

3-physiologie intestinale et développement du tube digestif

4-éducation du système immunitaire

65
Q

En quoi consiste la fonction métabolique du microbiote?

A
  • hydrolyse et fermentation des POLYOSIDES
  • hydrolyse du mucus endogène
  • biosynthèse de vitamines (K, C, H)
  • production d’a.g.
  • métabolisme des XÉNOBIOTIQUES alimentaires
66
Q 
VOUS ÊTES CE QUE VOUS MANGEZ 
a) gras saturés et protéines animales
b) glucides
c) alcool et gras polyinsaturés
Donnez les entérotypes associés à ces genres d'alimentations
A

a) Bacteroides
b) Prevotella
c) Ruminococcus

67
Q

On peut distinguer parmis les bactéries formant le microbiote des symbiontes, des commensaux et des pathobiontes…

a) Associez: promotion de la santé, pathologie, aucun effet bon ou mauvais
b) Dans quel cas est-ce qu’on a une dysbiose?

A

a) symbiote: promotion de la santé, commensaux = aucun effet bon ou mauvais, pathobiontes = pathologie
b) dysbiose: lorsqu’il y a un désiquilibre de la composition du microbionte (changement non naturel) = inflammation non spécifique

68
Q

Nommez des facteurs qui affectent la composition du microbionte digestif

A
  • alimentation
  • génétique
  • transfert maternel
  • médication
  • infections
  • inflammation
  • stress
  • hygiene
  • age
69
Q

Disons que des facteurs de virulence atteint un hôte qui est en état de dysbiose, quelle conséquence en résulte?

A

inflammation

70
Q

Quand est-ce que la transplantation fécale (FMT) est utilisée?

A

traitement de l’infection C. difficile chez les patients qui n’ont pas réussis à se rétablir avec un thérapie antibiotique (efficacité à 90%)

71
Q

Qu’est-ce que le concept de transplantation du contenu ruminal?

A

collecte du liquide de rumen (cuve à fermentation de milliards de microorganismes => dégradation des matières végétales) d’un animal donneur —> receveur

72
Q

Qu’est-ce qu’un antigène?

A

susbtance (pathogène complet ou partie de pathogène comme le pili, sous-unités, adhésines…: épitopes), reconnue par la système immunitaire, capable de susciter OU NON une réaction immunitaire SPÉCIFIQUE de nature humorale ou cellulaire

73
Q

Qu’est-ce qu’un immunogène et donner un exemple

A

Immunogène: antigène qui produit une réponse immune

Exemple: vaccin

74
Q

Quel est la différence entre des anticorps polyclonaux et monoclonaux

A

polyclonaux: anticorps qui proviennent d’animaux et comportent plusieurs épitopes
- varient selon la source animale
- HAUTE sensibilité
- FAIBLE spécificité

monoclonaux: anticorps dirigé contre UN SEUL type d’épitopes
- toujours les mêmes
- FAIBLE sensibilité
- HAUTE spécificité

75
Q

Quels sont les (3) types de diagnostiques possibles?

A

1-infection aigue: antigène ++
2-infection chronique: antigène +
3-infection sous-clinique: antigène +-

Microbiologie (2 decks)

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