Intra 2 cours 1 Flashcards
Quelle est l’étape limitante de la synthèse des lipides à partir acétyl-CoA?
2 enzymes qui contrôle la transformation de l’acétyl-CoA en malonyl CoA ce dernier sera pris pour faire de palmitate chaîne à 16 carbones par l’acide gras synthase (FAS) par la suite le palmitate pourra subir des changement commes des élongation de chaîne ou des insaturations
Qu’est que l’acide gras synthase (FAS)?
-Enzyme multifonctionnelle:
Catalyse 6 réactions biochimiques
Domaine Acyl Carrier Protein (ACP)
-Synthétise des acides gras (palmitate, 16C) à partir d’acétyl-CoA et de Malonyl-CoA
Qu’est-ce que la protéine SRP fait ?
C’est une protéine cytosolique qui reconnait la séquence signale hydrophode d’une protéine qui doit aller au RE et arrête la traduction de la protéine
Expliquer les 5 étapes pour synthétiser une protéine qui doit aller au RE.
- Séquence signal n-terminal
- Reconnu par SRP
- Inhibe la traduction de la protéine
- Amène protéine avec ribosome et attache à la surface du RE
- Attaché= libération de SRP
Qu’est-ce que le complexe Sec61
Permet le transfert à travers la membrane du polypetide
La séquence signale cause l’ouverture du pore suivant son relâchement du SRP
Quelles sont les trois étapes suivant la translocation du polypeptide pour qu’il soit replié correctement?
- Glycosylation
- Formation de ponts disulfures(PDI)
- Repliage de la chaîne peptidique
** les protéines qui n’atteignent pas leur conformation native sont retournées dans le cytosol pour dégradation
Quelles sont les deux types de glycosylation?
- Lié à O (sur OH de sérine et thréonine)
Plus rare , se produit dans Golgi, généralement 1-4 résidus - Lié à N ( sur un NH3 de asparagine)
Le plus fréquent, structure complexe, début à partir d’un oligosaccharide préformé, sur séquence Asn-X-Ser
Quels sont les rôles de la glycosylation?
- Protège de l’environnement acide et des protéases
2. Savoir que la protéine est prête à être repliée
Quelles sont les deux sources d’acides gras pour la synthèse de lipides?
Triglycérides importés (dans goutellettes lipidiques)
Synthétisé à partir d’acétyl-CoA (citrate)
Quels sont les deux types de transport endomembranaire?
- Adressage de protéines basé sur une séquence signale
>entrée des protéines du cytosol vers la voie endomembranaire - Transport vésiculaire
>transport des protéines et lipides entre les organites
Quels sont les trois grands rôle du RE?
> Synthèse, glycosylation et contrôle de la qualité des protéines
Rôle majeur dans la régulation du Ca2+
Synthèse de lipides cellulaires
où se trouve les enzymes qui synthétise les lipides?
à la surface du RE
Comment l’acétyl-CoA peut-il sortir de la mitochondrie pour aller faire du cholestérol ou pour allonger des chaînes d’acides gras ?
changement en citrate (va donner un acétyl-CoA et 1 oxaloacétate)
Quels sont les étapes de la synthèse des lipides qui se passe à la surface du RE?
FAS: palmitate
Élongation
Insaturation
Qu’Est-ce que la FAS synthétise et à partir de quoi?
acides gras à 16C (palmitate) à partir d’acétyl-CoA et de Malonyl-CoA
Combien de réactions biochimiques fait la FAS, combien a-t-elle de domaine et lequel sert à l’acide gras de un à l’autre?
catalyse 6 rx biochimiques
ACP
7 domaines au total
Qu’Est-ce que fait le domaine ACP sur FAS?
Transporte l’acide gras d’un domaine à l’autre
Où se trouve FAS?
Surface du RE
Jusqu’à combien de carbone peut-on faire la chaîne d’acides gras avec les autres enzymes que FAS?
24C
Quel est le nom de l’enzyme qui introduit des doubles liaisons sur les chaîne d’acides gras synthétisé par FAS?
Désaturases
Quels sont les deux acides gras que l’on ne peut pas synthétiser chez l’humain?
alpha-linolénique(oméga-3)
acide linoléique(oméga-6)
Les acides gras qui sont essentiels ont leur doucle liaison proche de l’Acide carboxylique ou à l’autre extrémité ?
opposée au COOH (le plus loin)
Comment les acides gras préexistant (dans les gouttelettes lipidiques) sont transporté et modifier pour arriver au mm stade que les acides gras synthétisée sur la face cytosolique du RE?
Doivent être transporté de la gouttelette lipidique dans le cytosol vers le Re sur une protéine de liaison au acides gras (FABP) et doit ensuite être conjugué à un CoA
Quels sont les étapes pour la formation de phospholipides?
- on prend 2 acides gras dans la membrane du RE et on ajoute un glycérol-3-phosphate en échange des 2 CoA
- on enlève le groupement phosphate et on ajoute une tête polaire (ex:choline)
***si c’est un acide gras qui provient d’une gouttelette lipidique, on doit d’abord mettre un CoA sur l’acide gras
Qu’Est-ce qui est différent avec les sphingolipides des autres phospholipides au niveau des étapes de formation?
Début de la synthèse dans le RE et fin de la synthèse dans Golgi
pourquoi a-t-on besoin d’enzyme pour faire translocation à travers le feuillet et quels sont leur nom ?
au départ les phospholipides sont tous synthétisé du mm côté (face cytosolique )
scramblase et flippase
Quelle est l’étape limitante de la synthèse de cholestérol à partir d’acétyl coA et où se passe cette étape (RE ou cytosol)?
HMG-CoA réductase qui fait passer en mevalonic acid mais qui est inhibé par les statines lorsqu’il y en a trop
se passe dans le cytosol
à partir de quoi on fait les hormones stéroïdes?
Cholestérol une partie dans le RE et d’autre fini dans mitochondrie
Quels sont les protéines qui séquestre le calcium dans le RE?
Calnexine et calréticuline
la calréticuline a une faible affinité pour le calcium ce qui fait que aussitôt qu’ il y a stimulus, le calcium sera libéré
Le calcium est aussi nécessaire pour sont activé chaperonne
.
Quels sont les différents signaux qui activent l’entré du calcium dans le cytosol ?
> signaux chimiques: IP3 et autres agonistes des IP3R
>signaux électriques: dépolarisation - muscle, neurone
Quels sont les deux types de récepteur qui activent les canaux dans le RE (RS) qui laisse passer la calcium ?
> récepteurs de l’IP3 (IP3R)
>Récepteurs de la Ryanodine (RyR - tissu excitable)
Quels sont les rôle du calcium?
> Active diff. enzymes cytosoliques(PKC, Calcineurine, CamK, Calpaines…)
Stimule la production d’ATP
Comment se fait la régulation du calcium lorsqu’il sort dans le cytosol (où peut-il aller)? (3 moyens)
> retourné dans le RE (pompe SERCA)
Envoyé au mitochondries (MCU)
Pompé hors de la cellule
Comment les piques de calcium sont traduit par la cellule?
plus la fréquence est grande, plus la réponse physiologique est grande aussi
Quel est le signal qui dit d’envoyer les protéines au RE ?
Signal hydrophobe du côté N-terminal de la protéine
Qu’Est-ce que fait SRP?
> reconnaît la séquence hydrophobe
bloque la traduction
emporte protéine jusqu’au RE sur le port
Quels sont les étapes de la synthèse de protéine ayant une séquence hydrophobe?
- séquence hydrophobe reconnu par SRP
- SRP emporte protéine et ribosome sur RE qui sera reconnu par le récepteur du SRP
- SRP se décroche et le port s’ouvre pour continuer la traduction
Qu’Est-ce que le complexe Sec?
pore aqueux qui permet le transfert a travers la membrane des protéines
Quelles sont les étapes de translocation d’une protéine soluble?
Séquence signal agit comme un signal de début de transfert
Séquence signal est clivée par une peptidase à un site spécifique
La protéine est relâchée dans la lumière du RE
Quelles sont les trois étapes suite à la translocation de la protéine?
> Glycosylation
Formation de ponts disulfure (PDI= enzyme qui catalyse réaction)
Repliage de la chaîne peptidique
Que se passe-t-il avec les protéines qui n’atteignent jamais leur conformation native dans le RE ?
retournées dans le cytosol pour dégradation
Quels sont les deux buts généraux de la glycosylation?
- protection contre l’environnement acide des protéases et lysosomes
- savoir si protéine est bien repliée
où se passe la glycosylation ?
exclusivement dans le Golgi
Sur qu’elle acides aminées se fait la glycosylation liée à N ?
Asparagine
Par quoi est catalysé la réaction de glycosylation liée à N?
oligosaccharyl transférase
Qu’Est-ce que fait la calnexine et calréticuline avec N-glycosylation?
Reconnaisse l’oligosaccharide avec un seul glucose et les aident à se replier (chaperonnes)
Qu’Est-ce qui ajoute un glucose pour dire que la protéine n’est pas encore dans son état natif?
Glycosyl transférase
Qu’Est-ce qui enlève un glucose après l’action des chaperonne sur N-glycosylation ?
glucosidase
Que se passe-t-il précisément avec les protéines mal repliées
> réexporté dans le cytoplasme pour être dégradé (ERAD)
Les protéines qui restent mal repliées ont un oligosaccharides modifié (mannosidase1) reconnu par EDEM et OS-9, nécessite p97(AAA-ATPase)
Protéines déglycosylées dans le cytosol
Protéines ubiquitinées et dégradées par le protéasome
Qu’Est-ce que le protéasome?
> complexe servant à la dégradation des protéines
cylindre creux dans lequel les substrat sont dégradés
substrat marqué par ubiquitination
Qu’Est-ce que l’ubiquitine?
petite protéine de 76 a.a. qui sert à marquer les protéines
Quelles sont les trois étapes de l’ubiquitination?
ubiquitine va sur E1 , E1 s’associe avec E2 et E3 qui sont spécifiques pour chaque substrat, transfère de l’ubiquitine sur E2, association avec substrat et transfère de ubiquitine de E3 à substrat
Quels sont les rôles de l’ubiquitination?
peut servir de signal pour endocytose ou d’autre truc pas seulement dégradation
Quelles sont les réaction de la cellule face à une augmentation de protéines non repliées?
> augmente chaperonne
inhibe synthèse de protéine
peut amener la mort cellulaire si trop
