Exam 2 Cours 2 Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine de type 1?
Un domaine transmembranaire
Similaire aux protéines solubles: séquence signal N-terminale
Séquence d’arrête de transfert
Relâchée dans la membrane sous forme d’une hélice alpha
Nterminal lumière, cterminal cytosol
Pour les protéines de types 2 et 3 c’est la charge qui va déterminer le sens. De quel côté est la charge négative et positive?
Négative: lumière
Positive: cytosol
Expliquer comment se fait la translocation d’une protéine de type 2.
Début de la synthèse dans cytosol du côté N-terminal
Signal hydrophobe au milieu de la protéine détecté
Fin de la transcription dans le RE charge négative du côté C-terminal donc lumière et N-terminal charge positive donc cytosolique
Comment se fait la translocation protéine membranaire de type 3 ?
Mm que tyoe deux mais le N-terminal est dans la lumière car il porte la charge négative
Comment peut-on déterminer la topologie d’une protéine membranaire ?
En faisant des mutation on peut enlever une séquence et voir si elle devient soluble, il est aussi possible de savoir les charge sans faire de mutation, on peut aussi prendre une protéase qui coupe seulement d’un côté et voir où elle est rendu
Comment se fait la translocation de protéines à deux domaines transmembranaires?
Type deux si n-terminal cytosol: canaux ioniques, GLUTs
Type trois si n-terminal lumière: GPCR
Ensuite: séquence d’arrêt de transfert
Les deux séquences sont insérées dans la membrane sous forme d’hélices alpha
Comment se fait la translocation de protéines à domaines transmembranaires multiples ?
Combinaison de plusieurs signaux de transfert et d’arrêt de transfert
Insérés dans membrane avec le mm translocon
Charge détermine de quel côté sera le N-terminal et le nombre de domaine va déterminer de quel côté sera le C-terminal
Comment fait-on des protéines avec ancrages GPI?
1 domaine transmembranaire à l’extrémité C-terminal et sera clivé pour que le reste de la protéine puisse s’accrocher à un phosphatidylinositol
Modifié dans le RE
Face non cytosolique (lumière)
Tail-anchored proteins que ce passe-t-il avec eux ?
Ils ont une hélice alpha à l’extrémité c-terminale
Il y aura insertion port-traductionelle dans une membrane (diverse membrane mais spécifique) : mitochondrie, peroxisome, RE
Qu’est-ce qui dicte où la protéine va aller ?
Domaine transmembranaire au C-terminal et les charge que le domaine contient ex: svt positif pour mitochondrie
Quelles sont les deux manières d’insérer une tail-anchored protein ?
Spontanné ou à l’aide de chaperonnes les dirigeant vers un organite spécifique
Quelles sont les deux voies possibles de transport vésiculaire vers la membrane plasmique ?
Constitutive: par défaut si pas d’autre signal
Régulé: prend un signal pour que la vésicule se rende à la membrane, pour qu’il y ai fusion ex: insuline
Quelles sont les vésicules de transport possible ( ici je ne parle pas du manteau mais bien des vésicules) ?
Endocytose Endosome précoce Endosome de recyclage Endosome tardif Lysosome
Qu’est-ce que ça prend pour avoir un transport vésiculaire efficace ?
Spécificité de la membrane et du cargo
Nécessite un mécanisme de reconnaissance du cargo et de la membrane de départ et d’arrivée
Quelles sont les étapes de la formation des vésicules de transport?
Association du cargo
Assemblage du manteau et déformation de la membrane
Scission de la membrane
Perte du manteau
Quel est le rôle du manteau dans la spécificité du cargo ?
Permet l’inclusion sélective du cargo
Modifie la courbure de la membrane
Nécessaire pour l’inclusion des v-SNARES
Les récepteurs pour le cargo et autres protéines adaptatrices couplent la présence de cargo à la formation du manteau
Quels sont les trois tyoes de manteaux connus et que font-ils de spécifique?
COP1: transport rétrograde du golgi vers RE et entre golgi
COP2: antérograde du RE au cis-golgi
Clathrine: antérograde trans-golgi vers lysosome et membrane vers lysosome et endosome
Où se trouve la séquence signal pour être reconnu par le manteau si soluble et si membranaire ?
Soluble: récepteur membranaire qui reconnait la séquence d’adressage
Membranaire: séquence dans la portion cytosolique de la protéine
Par quoi est régulé l’assemblage du manteau ?
Régulé par une petite GTPase:
GTP stimulé par GEF
GDP stimulé par GAP
Comment se nomme la GTPase de COP2 et de COP1 avec clathrine?
COP2: Sar1
COP1 et clathrine: Arf
Comment les GTPase recrute le manteau ?
Tout d’abord, Sar1 ou Arf est inactive sous forme GDP et elle a une hélice hydrophobe qui est caché
Ensuite, GEF (qui est dans la membrane) active GDP–>GTP ce qui deploie l’hélice hydrophobe et ce qui permet son insertion dans la membrane prêt du cargo
Enfin, la GTP recrute le manteau et losrque le vésicule sera totalement formé la GTP sera hydrolysé et il y aura désassemblage du manteau
Pourquoi le désassemblage du manteau est nécessaire?
Pour qu’il y ai fusion avec la membrane cible
Pour permettre au SNARE de fusionner avec la bonne membrane
Qu’est-ce que font RAB ?
Famille de GTPase
Régulent spécificité du transport vésiculaire - Rab diff sur ch. membrane
Ancrage isoprénoïde permettent l’ancrage à une membrane
Liaison au GTP cause l’activation de Rab
Quels sont les rôles des effecteurs de RAb?
- Sélection du cargo/formation de la vésicule
- Transport
- Association de la vésicule avec la membrane cible
- Fusion
Quelles sont les deux composantes essentielles pour qu’il y ai fusion de la vésicule avec la membrane cible ?
- Présence de protéines Rab
2. SNARES complémentaires dans les deux membranes
Comment se fait la dissociation du complexe trans-SNARE?
Très stable donc nécessite de l’énergie pour briser le complexe et pour recycler les SNARE
L’énergie provient de l’ATP par NSF
Comment se déplace les vésicules ?
Sur les microtubules
Pourquoi existe-il du transport rétrograde du golgi au RE ?
- Protéine résidante du RE parfois emballé dans COP2 par erreur
- Nécessité de recycler membrane, récepteurs et v-SNARES
** retournés dans RE par vésicules COP1 à partir du faisceau vésiculaire tubulaire et de l’appareil de golgi
Où est situé le signal de rétention des protéines qui doivent être résidentes du RE et quel est le signal si c’est une protéine soluble ou transmembranaire?
Extrémité c-terminale
Soluble: KDEL récepteur transmembranaire
Transmembranaire: KKXX
Qu’est-ce qui doit être retourné par transport rétrograde au RE ?
- Lipides
- Protéines résidantes du RE (erreur)
- SNARES
Quel est le rôle majeur de l’appareil de Golgi ?
Site de glycosylation et de tri des protéines de la voie sécrétoire
Les diff étapes de glycosylation sont compartimentées
Les enzymes qui font une modification dans une citerne se font transporter par la vésicule mais quand elles ont fini leur travail, elles doivent retourner dans leur citerne de départ donc rétrograde avec quel manteau ?
COP1
Quel est le manteau majeur qui régule l’ endocytose et le transport entre trans-golgi et membrane?
Clatrhine
De quoi est fait la clathrine et quelle est sa forme?
3 sous-unités larges, 3 petites
Forme en triskèle
Assemblé pour former une structure polyédral
Protéines adaptatrice spécifique pour cargo
Récepteur pour le cargo
Quels sont les deux types d’adaptateur que l’on retrouve dans une vésicule de clathrine ?
AP1: golgi vers endosomes
AP2: membrane plasmique vers endosomes
Qu’est-ce qui permet la scission de la vésicule de la membrane ?
Dynamine une mécano-enzyme qui hydrolyse l’atp ce qui fait une constriction
*** seulement pour vésicule de clathrine leur deux autres peuvent se couper toutes seules
