ING GEN PARCIAL 2 Flashcards
El porcentaje de eficiencia de transformacion es directamente proporcional al tamaño del vector.
Falso
La región ori
Es reconocida por la maquinaria de replicación del hospedador
Las cepas bacterianas a utilizarse como organismos hospedadores deberían
Ser naturalmente sensible a determinados antibióticos.
Describa la diferencia entre gen marcador y de selección.
Un gen marcador de selección nos permite aislar las colonias de bacterias trasnofrmadas. Tipicamente son de resistencia a ntibióticos o químicos.
Un gen reportero permite evaluar visualmente si la bacteria fue trasnformada. Típicamente relacionados a fluorescencia o emisión de cromóforo.
Un vector mixto o lanzadera
Es vector que tiene la capacidad para replicarse en 2 hospedadores diferentes
La región MCS de un vector de clonación está compuesta por:
Un conjunto de diferentes sitios de restricción
El estado de competencia bacteriana
A y B son correctas
Se logra mediante la incubación de las bacterias en frío durante un corto periodo de tiempo seguido de un corto periodo de calor a 42°C
Requiere de la incubación de las bacterias en una solución con cationes de cultivo.
La fase de denaturación en la PCR consiste en:
La separación de la soble hebra de ADN
El rango de tamaño más usual para los cebadores utilizados para hacer una PCR estre 30 y 50 pares de bases
Falso entre 20 y 30
Durante la preparación de los vectores derivados del fago lambda se eliminaron los genes relacionados a la fase lítica del virus para aumentar la capacidad de carga del ADN pasajero
Falso
Mencione 2 características propias de los cósmidos
Los cósmidos mantienen la región cos que les permite recircularizarse
Son híbridos entre plásmidos y sitios cos de los fagos
Tienen una capacidad de carga mayor de los plásmidos de hasta 45Kb
Cuando decimos que una biblioteca genómica tiene una baja representatividad. Nos referimos a que
La cantidad de fragmentos presentes en la biblioteca es insuficiente para cubrir la totalidad del genoma de interés
La selección de las bacterias trasformadas en un plásmido recombinante pBR322 se realiza en dos pasos consecutivos, al comparar las colonias bacterianas que crecen en placas con ampicilina y Kanamicina
Falso, es tetraciclina
Seleccione la alternativa incorrecta respecto al bacteriofago lambda
Presenta extremos cos que IMPIDEN la circularización de su genoma una vez este ingresa a la célula bacteriana
Respecto a los vectores derivados del fago Lambda
El rango de empaquetamiento de toda la molécula osicila entre 38Kb y 51Kb
Los plásmidos:
Necesitan de una presión selectiva positiva para ser conservados dentro del hospedador
El problema del clonaje direccional del pasajero puede solucionarse
Cortando tanto el plásmidos y el vector como dos enzimas de restricción diferentes
El gen marcador del plásmido pUC18 presenta la característica de inactivación por inserción para la deteección de moléculas recombinantes
Verdadero
¿Qué tipo de enclace se forma entre dos fragmentos de ADN cuando la ligasa cataliza su unión?
Un enlace fosfodiéster
Para que la ligasa puede llevar a cabo la unión de fragmentos de ADN necesita la presencia de:
B y C
ATP y magnesio
La cantidad de colonias bacteriana que conforman una biblioteca genómica es inversamente proporcional a la capacidad de carfa del vector utilizado
Verdadero
Las bibliotecas de expresión:
A, B y C son correctas
Permiten la trasncripción y traducción del ADN pasajero in vivo
Permiten detectar a las colonias de interés mediante análisis Western-blot
Deben incluir una región promotora compatible con el hospedero
Durante la reacción de ligación, una ligasa usa como sustrato:
Un extremo 5’P y un extremo 3’OH de dos fragmentos de ADN
En el secuenciamiento por Nanoporo Todas las anteriores.
Una proteína helicasa es la repsonsable de separar la doble hebra y permitir que la secuencia sea leída en hebra simple
El adaptador de secuenciameinto es el encargado de guiar el fragmento de ADN hacia el nanoporo
Las lecturas resultates del proceso de secuenciamiento en su mayoría son considerados como long reads
Los vectores derivados de fagos, de las serie CHaron también son conocidos como vectores de reemplazameinto
Verdadero
Sobre el sitio cos del fago, marque el incorrecto
Es un sitio de reconocimiento para las enzimas de restricción
La ligación de extremos cohesicos es mucho más eficiente que la ligación de extremos romos debido a que:
La interacción entre los extremos cohesivos promueve el acercameinto entre los fragmentos que se desea ligar aumentando el sustrato disponible para la ligasa
Respecto a los linkers
B y C son correctas
Pueden ser sintetizados en altas cantidades in vitro
Contienen un sitio de reconociiento específico para enzimas de restricción
CUanto creamos extremos cohesivos mediante homopolymer tailing entre el fragmento de interés y el vector de clonación la longitud del homopolímero debe ser exactamente la misma, caso contrario no se puede realizar la reacción de ligación
Falso
El X-Gal es:
Un compuesto que es hidrolilzado por la beta-galactosidasa para producir un color azul
En el método de selección conocido como “blue-white screening” las bacterias que contienen el plásmido recombinante crecerán en el medio selectivo produciendo una coloración
Blanca
El gen lacZ es un componente característico de los vectroes plasmídicos de la serie:
pUC
En el secuenciamiento de Sanger ¿Cual de las siguentes afirmaciones es incorrecta?
Es necesario realizar un proceso conocido como BRIDGE AMPLIFICATION basado en pcr
En la reacción de pirosecuenciamiento
Todas las anteriores
La ATP sulfirasa convierte el pirofosfato en ATP
La luciferasa convierte la luciferina en oxyluciferina usando ATP
La conversión de la luciferasa en oxyluciferina es una reacción que genera fluorescencia
En el secuenciamiento Illumina ¿Cuál de las siguiente opciones no es un paso del proceso?
Detección de los cambio en la corriente eléctrica a medida que la secuencia de ADN es leída por el nanoporo