Hoorcolleges 2A1 Flashcards
Wat zijn prognotische factoren?
Prognotische factoren = factoren die iets zeggen over het beloop van de ziekte, onafhankelijk van de behandeling
- Kenmerken van/in kanker
- biomarkers: co-morbiditeit
Wat zijn predictive factoren?
Predictive factoren = factoren die iets zeggen over hoe goed de behandeling gaat aanslaan
- Kenmerken van/in kanker
- Biomarkers: preformence
- HOST-factoren
Waarom was de tweedewereld oorlog belangrijk in de onderzoekswereld?
- Concentratiekampexpirimenten leidt tot 1e medisch-etnische code
- Door de oorlog kwam er vanuit organisaties meer geld beschikbaar voor medisch onderzoek
Wat is het centrale ethische dilemma?
Centraal ethisch dilemma:
Beschermen van proefpersonen tegen risico en belasting van het onderzoek VS. vergroten medische kennis en gezondheidswinst
Wat houdt het ‘dubbele consent’ tijdens medisch onderzoek in?
Dubbele consent = moet toestemming krijgen van:
1. Partijen die onderzoek toesten
- CCMO (centraal commissie mens gebonden onderzoek): 1
- METC (medisch ethisch toetsingscommissie): 15
2. Van deelnemer zelf
Wat zijn de hallmarks of cancer?
- Cel moet blijven delen
- Remming blokkeren
- Celdood ontwijken
- Oneindig delen
- Angiogenese
- Deregulatie van energiebehoefte
- Invasief en metastase
- instabiel genoom en mutatie
- Tumorbevorderende ontsteking
- immuunsysteem ontwijken
Wat is invasie?
Invasie = Tumor breekt door basaalmembraan waardoor het in het omliggende weefsel komt
Wat is metastasering?
Metastasering = Tumorcellen over grote afstand verplaatsen en op een andere plek in het lichaam een nieuwe tumor vormen
Stappen van transitie bij metastasering
1e stap: EMT: epitheliale mesenchymale transitie
- Transport via lymfe of bloed
2e stap: MET: mesenchymale - epitheliale transitie
- Nieuwe tumor vormen op andere plek in het lichaam
Hoe zorgt de tumor ervoor dat het zonder zuurstof kan groeien?
Tumor zorgt voor deregulatie van de energievoorziening:
- Glucose omzetten in lactaat: ALLEEN glycolyse waar geen O2 voor nodig is –> levert energie op zonder zuurstof te verbruiken
Waar is kankerregistratie belangrijk voor?
- Trends in prevalentie, incidentie, sterfte, overleving bekijken
- Inzicht in toepassing van therapeutische en preventieve strategie
- Therapeutische meerwaarde van middelen bekijken buiten de studies om
- Kosteneffectiviteit van (dure) middelen bekijken
- Ondersteunen bij beleidszaken/adviezen
- Therapieadhesie in kaart brengen
Kenmerken van een stamcel
Stamcel:
- Hoog delingspotentie
- Weinig delingen
- Relatief ongevoelig voor genotoxische invloeden
Kenmerken van een progenitor cel
Progenitor cel:
- Laag delingspotentie: beperkt tot 1 lijn
- Veel delingen
- Gevoelig voor genotixische invloeden
Wat is een niches en wat zijn de functies van een niches?
Niches = plek waar stamcellen liggen
vaak tegen botcellen aan = osteo niches
Functie:
- beschermen stamcellen tegen toxische stoffen/invloeden
- Reguleren van stamceleigenschappen
Wat is chronische leukemie?
Chronische leukemie = Defect in groeiregulatie waardoor er een ophoping ontstaat van functionerende en/of uitgerijpte leukemiecellen
Wat voor defect leidt tot chronische leukemie?
Chronische leukemie: defect in groeiregulatie
Wat voor defect leidt tot acute leukemie?
Acute leukemie: defect in groeiregulatie en uitrijping
Wat is acute leukemie?
Acute leukemie = acute symptomen veroorzaakt door ophoping van onrijpe cellen waardoor gezonde bloedcellen worden verdrongen/onderdrukt
Verschillende vormen van puntmutaties
Puntmutatie:
- Translatie: pyrimidine –> pyrimidine (C/T) of purine –> purine (A/G)
- Transversie: pyrimidine –> purine of andersom
- Insertie: extra basenpaar
- Deletie: verwijderen basenpaar
Verschillende vormen van chromosomale afwijkingen?
Chromosomale afwijkingen:
- Translocatie
- Amplificatie
- Deletie
- Numerieke afwijking
Wat zijn oorzaken van DNA schade?
- Verkeerde replicatie
- Chemische instabiliteit
- Chemische adducten
- Fysische agentia
- Biologische stoffen
Geef voorbeelden van chemische instabiliteit dat leidt tot DNA schade
- Depurinatie = spontane hydrolyse tussen suiker en base waardoor 1 base verdwijnt ==> deletie
- Deaminatie = hydrolyse van aminogroep waardoor Cytosine wordt omgezet in uracil ==> veranderd complementair
Geef voorbeelden van biologische stoffen die leiden tot DNA schade
- endogeen: ROS (zuurstofradicalen) zorgen voor verandering conformatie waardoor Guanine veranderd naar Tymine ==> veranderd complementair
- Exogeen: benzo[a]pyreen wordt omgezet in actief BPDE wat bindt aan DNA ==> verstoord dubbel helix
Bij welke DNA schade is BER reparatie betrokken?
BER:
- Kleine Adducten
- deaminatie
- SsDNA breuk (single strand)
Hoe werkt excisie reparatie systeem: BER
- DNA Glycosylase herkent fout in DNA en haalt foutieve base weg uit het DNA, ontstaan: Abatische plek (AP)
- AP endonuclease herkent AP en knipt stuk DNA weg wat AP bevat
- DNA polymerase en ligase maken ‘gat’ weer dicht en streng aan elkaar
Hoe werkt excissie repair systeem: NER
- Helixase (XPC/XPD/CSB): herkennen DNA schade
- DNA helix uit elkaar gehaald en ‘3 en ‘5 cap geplaatst
- DNA schade eruit geknipt
- DNA polymerase en ligase maken gat dicht en streng aan elkaar
2 vormen van NER
- Globaal genoom NER: voorkomt mutaties
- Transcriptie gekoppeld NER: voorkomt apoptose
Noem een ziekte die als oorzaak heeft:
- mutatie in globaal genoom NER
- mutatie in transcriptie gekoppeld NER
en wat is het grootste verschil tussen beide ziektebeelden?
- Globaal genoom NER: Xeroderma pigentosum (XP)
- Transcriptie gekoppeld NER: Cockayne syndroom (CS)
Grootste verschil: XP heeft wel huidkanker, CS heeft GEEN huidkanker
Kenmerken van Non-homologe end-joining (NHEJ)
- Snel herstel
- Onnauwkeurig herstel
- Geen template gebruikt
- Uiteinde worden direct aan elkaar gekoppeld: geen nieuwe nucleotide gesynthetiseerd
Hoe werkt Non-homologe end-joining (NHEJ)
- KU70/80: herkent DNA schade en activeert DNA-PKcs
- DNA-PKcs (ligases); knippen defect stuk DNA weg
- Ligase IV pakt uiteinde van 2 DNA strengen en brengt ze tegen elkaar en maakt ze aan elkaar
Kenmerken van Homologe recombinantie (HR)
- Template: zusterchromatide
- Wel nieuwe nucleotide gesynthetiseer
- Nauwkeurig proces
Hoe werkt homologe recombinantie (HR)
- Kapotte streng hekent en door nuclease ‘3 overhang gemaakt
- RAD51 bindt en zorgt dat zusterchromatide van streng de kapotte streng herkent
- Uitwisseling van DNA strengen tussen zusterchromatide en DNA: DNA gesynthetiseerd
- D-loop gevormd en via ‘ontvouwing’ ‘gekruiste’ strengen uit elkaar gehaald
- 2 normale DNA strengen
Door welke mechanisme is DNA replicatie zo nauwkeurig?
- Base selectie
- proofreading: exonuclease activiteit van DNA polymerase
- Mismatch repair:
Wanneer is er sprake van het Lynch syndroom?
Lynch syndroom:
- CRC <50j
- CRC met microsatelliet instabiliteit (MSI) < 60j
- 2x CRC of lynch geassocieerde kanker hebt bij 1 patiënt
- 1/meer 1e of 2e lijns familieleden hebt met CRC of geassocieerde tumoren <50j
- 2/meer 1e of 2e lijns familieleden hebt met CRC of geassocieerde tumoren
Welke kankersoorten zijn geassocieerd met het lynch syndroom?
Lynch syndroom:
- Colonreactaal carcinoom
- Endometriosum carcinoom
- Eierstok kanker
- Hogere urinewegen
- Maag
- Pancreas
- Dunne darm
- Galwegen
- Talgklieren
- Hersenen
Wat is het lifetime risico voor ontwikkelen van volgende tumor soorten bij het Lynch syndroom:
- CRC
- Endometriosum
- Overig
lifetime risico:
CRC: 70%
Endometriosum: 55%
Overig: 1-15%
In welk systeem zit de mutatie en hoe wordt het overgeeft bij Lynch syndroom
Systeem: Mismatch repair
Overerving: autosomaal dominant
Hoe gaat de serveilliance bij Lynch syndroom?
- CRC serveilliance: vanaf 25ste 1x per 2 jr colonscopie
- Endometrium- en ovariumcarcinoom surveillance: vanaf 40-60ste 1x per 1 jr transvaginale echo en endometrium swap
Wat is het werkingsmechanisme van medicatie dat wordt gebruikt bij BRCA geassocieerde tumoren?
BRCA mutatie leidt tot: niet meer goed werkend HR, als ‘gezonde allel uitvalt krijg je L OH waardoor tumor gaat worden gevormd
Werkingsmechanisme:
RARP inhibitor gegeven –> meer enkelstrengs DNA breuken –> HR werkt niet –> veel DNA schade –> celdood
Wat is het probleem bij BRCA geassocieerde borsttumoren en behandeling met RARP 1 inhibitor?
Borstkanker: enzym POLYQ tot uiting –> herkent DNA schade en als er overlap is tussen strengen kan POLYQ DNA schade herstellen ZONDER gebruik te maken van HR
Waarom verhoogd hyperthermie de effectiviteit van radiotherapie?
Radiotherapie zorgt voor: Dubbelstengs DNA breuken
Hyperthermie: remt werking van enzym RAD51 bij HR –> dubbelstreng breuken niet worden gemaakt –> Meer DNA schade –> Celdood
Waar kan next generation sequencing voor gebruikt worden
- DD opstellen
- Therapiekeuze
- Oncolytica
- Clonaliteit analyse
- Weefsel identificatie
Kenmerken van Sanger sequencing?
Sanger Sequencing:
- Eenvoudige methode
- Lage gevoeligheid (20%)
- Meerdere moleculen
- 1 fragment
- Veel DNA nodig
- Output max 1000 base
- Geen barcode gebruiken
Kenmerken van Next generation sequencing (NGS)
NGS:
- Ingewikkelde methode
- Hoge gevoeligheid (1-2%)
- 1 molecuul
- 1000den fragmenten
- Weinig DNA nodig
- output 1-20 x 10^9
- Bioinformatica nodig
- Barcode gebruiken
Wat betekend coverage in NGS?
Coverage = Hoevaak een positie van een base is bepaald
Symtomen passend bij Acute myleoide leukemie (AML)
AML: Snelle achteruitgang van gezondheid
- infecties
- puntbloedingen
- snel moe
- laag bloedplaatjes
Wat is het moleculaire probleem bij Chronische Myeloide leukemie (CML)?
CML: translocatie van chr. 9 en chr. 22 t(9;22) –> ontstaat philadelfia chromosoom met BCR-ABL fusiegen
Gevolg: ontstaat uniek fusie-eiwit met kinase activiteit –> fosforyleren target eiwitten waardoor cellen blijven delen
Welk medicatie wordt geven bij chronische myeloide leukemie en wat is de werking hiervan?
Medicatie: imatinib
Werking: concureert met ATP waardoor fusie enzym kinase niet meer zijn werking kan doen en de gemuteerde cellen doodgaan.
Wat is de functie van telmoeren?
- Celdeling controleren en beperken
- Telomeer verkorting tot Hayflick limiet –> signaal cel niet meer gaat delen
- Zorgen dat chromosomen niet aan elkaar worden gekoppeld
- T-loop gevormd waardoor chromosomen niet aan elkaar kunnen binden EN telomeer niet wordt herkent als kapot DNA of DNA fragment
Welke cycline op welk moment van de celcyclus actief?
Cycline D: G1 fase
Cycline E: overgang G1 naar S fase
Cycline A: progressie S-fase
Cycine B: Overgang G2 naar M fase
Welke cycline vormt een complex met welke CDK?
CDK 4 + Cycline D
CDK 2 + Cycline E/Cycline A
CDK 1 + Cycline B
Welke cycline afhankelijke inhibitoren (CDI) zijn er en welke cycline remmen ze?
P21: remt CDK 2 + Cycline E
p12ink4a: remt cycline D + CDK 4
Welke 5 checkpoints in de celcylus zijn er?
- Restrictie punt
- G1 naar S fase
- Intra-S
- G2 naar M fase
- Anafase
Welk eiwit is belangrijk in het checkpoint: restrictie punt
RB eiwit en transcriptie factor E2F
cel niet delen: RB gebonden aan E2F
Cel wel delen: CDK 4 bindt Cyline D –> Hyperfosforyleren RB –> RB-E2F complex uit elkaar vallen –> E2F actief –> genen afschuiven voor:
- Cycline E: cel over naa S-fase
- P21 (CKI): CDK 2 en Cycline E remmen
Welk eiwit is belangrijk in het checkpoint; G1 naar S-fasae
Eiwit: P53
Veel DNA schade –> [P53] omhoog –> genen voor P21 afgeschreven –> P21 (CKI) remt Cycline E + CDK 2 remmen –> Cel blijft in S-fase
Welk eiwit is belangrijk in het checkpoint: Intra-S
Eiwit: ATM
DNA schade leidt toename [ATM] –> CHK2 actief –> Cycline A + CDK2 remmen –> Cel blijft in S-fase
Welke eiwit is belangrijk in het checkpoint: Anafase
Eiwit: BUB1
BUB1 kijkt of er spanning is tussen de connectie microtubuli en chromosoom
Waar is de plek van de circadiale klok?
Suprachiasmatisch nucleus (SCN)
Hoeveel procent van actieve genen staat onder controle van circadiane klok?
20%
Gevolgen op korte en langstermijn voor werken op momenten dat je lichaam in ‘slaap’ staat
korte termijn:
- slaaptekort
- vermoeidheid
- minder allert
- minder prestatievermogen
lange termijn;
- verhoogde kans cardiovasculaire ziekte
- verhoogde kans metabole ziekte
- vrouwen: verhoogde kans borstkanker
Wat is chronotoxiciteit?
Chronotoxiciteit = toxisch effect afhankelijk van tijdstip van blootstelling