HC3: DNA-schade reparatiemechanismen Flashcards
Bij welke schade BER?
- uracil
- abasische sites
- 8-oxoguanine
- ssDNA breuken
Bij welke schade NER
- pyrimidine dimeren
- bulky adducts
Bij welke schade recombinatie herstel?
- interstreng cross-links
- dsDNA breuken
Bij welke schade MMR
A-G mismatch
T-C mismatch
deletie/insertie
Wanneer zusterchromatide/homoloog chromosoom nodig bij DNA schadeherstel?
- interstrengs DNA-crosslinks
- dsDNA breuken
Verloop van BER
- DNA-glycosylase: scanning DNA –> herkenning vreemd nucleotide door base flipping
- AP endonuclase: enkelstrengige breuk maken
- long patch (polymerase - endonuclease-ligase) of short patch (lyase-ligase)
2 klinische vormen van NER
- xeroderma pigmentosum
- cockayne syndroom
klinische symptomen XP
- zongevoeligheid
- droge, harde huid
- pigmentatie afwijkingen
- cataract
- versnelde neurologische achteruitgang
- huidkanker
oorzaak XP
NER-defect, tenminste 8 genen
klinische symptomen CS
- zongevoeligheid
- groei-achterstand
- neurologische achteruitgang
- versnelde veroudering
- GEEN huidkanker
oorzaak CS
NER-defect, 2 genen
Welke eiwitten betrokken bij NER
XPC-CETN2-RAD23B
TFIIIH-complex
specificatie NER bij kanker
globaal genoom NER: voorkomen van mutaties
specificatie NER bij versnelde veroudering
transcriptie gekoppelde NER: voorkomen celdood
herstel van dsDNA breuken
a) NHEJ
b) HR
verschil NHEJ en HR
NHEJ: direct aan elkaar ligeren van DNA-uiteinden, geen gebruik van template –> onnauwkeurig
HR: uitwisseling van DNA strengen, gebruikt zusterchromatide –> nauwkeurig herstel
Hoe wordt SCID veroorzaakt?
Door een defect in niet-homologe DNA eindverbinding waardoor radiosensitiviteit
waarvoor staat SCE?
Sister chromatids exchange bij HR
Welke eiwitmoleculen spelen een belangrijke rol bij HR?
RAD51: vormen filament op enkelstrengsstaarten en het bevordert de bassparing tussen gebroken en intacte zusterchromatide.
Wordt beïnvloed door BRCA1 en 2
Fout bij HR leidt tot?
LOH
Fout bij NHEJ leidt tot?
LOH binnen homoloog chromosoom of translocatie tussen verschillende chromosomen (vb: t9;22 cml)
