GMO - Mutations et Diagnostics génotypiques Flashcards
Cours 3 et 4
Dans le cas d’un couple où l’homme et la femme sont tous les deux hétérozygotes pour une mutation, quelle est la proportion de leurs enfants qui seront homozygotes pour cette même mutation ?
25%
Vrai ou Faux : La longueur du génome est proportionnelle à la grosseur de l’espèce.
Faux.
Pas de lien entre la longueur du génome et la grosseur de l’espèce.
Est-ce que la variation génétique est, de manière générale, une bonne chose?
Oui
Elle assure la survie de l’espèce lorsque des cataclysmes surviennent.
Qu’est-ce que le polymorphisme?
C’est la variation entre les individus qui ne cause pas de modification significative/importante
Qu’est-ce qu’une mutation muette?
Mutation sans conséquence biologique
Peut survenir à l’extérieur ou à l’intérieur d’un gène.
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens?
Mutation entraînant un changement d’acide aminé.
Le codon est donc changé pour un correspondant à un autre acide aminé.
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens?
Mutation entraînant la création d’un codon de terminaison précoce.
Un acide aminé est donc remplacé par un codon de terminaison.
Qu’est-ce qu’une mutation somatique?
Mutation survenant dans les cellules somatiques (donc pas dans les cellules germinales)
Ces mutations ne sont jamais transmises aux enfants.
Qu’est-ce qu’une mutation germinale?
Mutation qui survient dans la lignée des cellules germinales et qui sera portée par un ou des gamètes.
Ces mutations sont toujours transmissibles aux enfants.
Qu’est-ce qu’une mutation constitutive?
Mutation héritée de l’un des parents et donc portée par toutes les cellules de l’individu (cellules somatiques et germinales).
Ces mutations sont toujours transmissibles aux enfants.
Vrai ou Faux : Une mutation ponctuelle entraîne un changement de séquence.
Vrai. Mutation d’un seul nucléotide.
Une transition changera une purine par une purine.
Une transversion changera une purine ou pyrimidine ou vice-versa.
Peut entraîner une mutation non-sens, faux-sens ou muette.
Vrai ou Faux : Les délétions sont les mutations les plus fréquentes causant une maladie génétique.
Faux. Ce sont les mutations ponctuelles.
Vrai ou Faux : Les mutations de type inversion engendre un changement de séquence.
Vrai
Vrai ou Faux : Les mutations de type ponctuelle engendre un changement de séquence.
Vrai
Comment appelle-t-on le type de mutation entraînant une perte de matériel génétique?
Délétion
Vrai ou Faux : Une mutation de type délétion entraînera toujours la perte d’au moins 2 bases.
Vrai, car on perd également la base associée à celle mutée.
On perd une paire de bases.
Quel type de mutation entraîne une addition de matériel génétique?
Insertion
Ex: Syndrome de l’X-fragile, chorée de Huntington, Dystrophie myotonique
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région A?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Silencieuse (aucun impact)
- Augmentation ou diminution de la quantité d’ARNm produit et donc de protéines produites.
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région B?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Silencieuse (aucun impact)
- Diminution de la capacité de traduire l’ARNm
- Diminution de la demie-vie de l’ARNm.
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région C?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Absence d’initation de la traduction et donc de production d’ARNm
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région D?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Silencieuse (aucun impact)
- Élimination d’un site d’excision (l’intron est conservé et traduit)
- Création d’un site alternatif d’excision (une partie de l’intron est conservée et traduite)
- Peut mener à une mutation de type non-sens ou insertion (et donc un déphasage de lecture à partir de ce point)
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région E?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Silencieuse (aucun impact)
- Faux-sens
- Non-sens
- Apparition d’un site alternatif d’excision (exon est écourté et/ou épissé)
Quel(s) effet(s) pourrait entraîner une mutation à la région F?
Trait = Intron. Rectangle = Exons. ATG = Initiation. TER = Terminaison
- Silencieuse (aucun impact)
- Absence d’arrêt de la traduction (production d’une protéine plus longue)
Parmi les mutations suivantes qui peuvent survenir dans la séquence codante d’un gène, laquelle est le moins susceptible d’être dommageable pour la fonction de la protéine affectée ?
A. Mutation non-sens
B. Délétion de 2 bases (2 paires de bases)
C. Mutation muette
D. Mutation faux sens
E. Délétion de 1 base (1 paire de bases)
C. Mutation muette
Qui suis-je?
Toute variation de séquence de l’ADN (polymorphisme ou mutation) créant des allèles différents à un même locus.
Marqueur génétique
Qui suis-je?
Variantes d’une séquence d’ADN donnée retrouvées dans la population
Allèles
De quelles façons peut-on identifier les différents allèles d’un locus génétique?
Locus = Endroit
- Marqueurs phénotypiques
- Marqueurs phénotypiques biochimiques
- Marqueurs de l’ADN
Où se situe un marqueur génétique extragénique par rapport au gène?
À l’extérieur du gène
Où se situe un marqueur génétique intragénique par rapport au gène?
À l’intérieur du gène
Où se situe un marqueur génétique juxtagénique par rapport au gène?
Juste à côté du gène
Près du début ou de la fin du gène
Que se passe-t-il lors de la recombinaison méïotique?
Un échange de matériel génétique entre les paires de chromosomes homologues.
Vrai ou Faux : Chaque évènement de recombinaison méïotique est indépendant des autres et est différent dans chaque méïose.
Vrai
Combien de recombinaisons par génome haploïde y a-t-il à chaque méïose?
Environ 30
Donc un peu plus de 1 par chromosome!
Quelles sont les deux causes principales de la variation génétique?
- Mutations germinales
- Recombinaison méïotique
Quelles sont les indications du diagnostic moléculaire?
- Confirmation diagnotiques
- Diagnostic de porteur sain
→ Conseil génétique lorsqu’histoire familiale de maladie héréditiaire
→ Indicateur de pronostic (prédisposition à développer une pathologie) - Diagnostic prénatal
Vrai ou Faux : Le diagnostic génotypique indirect nécessite un cas index.
Vrai
Vrai ou Faux : Le diagnostic génotypique semi-direct nécessite un cas index.
Vrai
Risque de recombinaison presque nul!
Vrai ou Faux : Le diagnostic génotypique semi-direct est plus fiable que l’indirect.
Vrai
Marqueurs très rapprochés du gène. Risque de recombinaison presque nul.
Vrai ou Faux : Le diagnostic génotypique direct nécessite un cas index.
Faux. Pas d’analyse familiale ni de cas index.
Les mutations associées à la maladie sont déjà connues.
Risque de double recombinaison est nul.
Si la distance génétique entre les marqueurs génétiques A et B est de 10% de recombinaison et celle entre les marqueurs génétiques B et C est de 2% de recombinaison et que l’ordre des marqueurs génétiques est A .. B .. C , alors quelle est la probabilité d’une double recombinaison génétique entre les marqueurs génétiques A et C ?
0,2%
10% x 2%
Si la distance génétique entre les marqueurs génétiques A et B est de 5% de recombinaison et celle entre les marqueurs génétiques B et C est de 8% de recombinaison et que l’ordre des marqueurs génétiques est A .. B .. C , alors quelle est la probabilité d’une simple recombinaison génétique entre les marqueurs génétiques A et C ?
13%
5% + 8%
Qu’est-ce qu’une néomutation?
Une nouvelle (néo) mutation/maladie génétique sans histoire familiale
Cela constitue la limite du diagnostic génotypique!
Quelles sont les limites du diagnostic génotypique?
- Néomutations
- Hétérogénéité génétique (coût)
- Nécessité de conseil génétique dans les cas complexes (fréquents)
- Mosaïques somatiques/germinales résultant d’une mutation somatique durant l’embryogénèse (voir note ci-bas)
- Pénétrance incomplète des mutations
- Phénocopies (phénotype compatible avec la maladie, mais qui n’est pas dû à l’hérédité)
Mosaïque somatique = se dit de la situation exceptionnelle où toutes les cellule d’un individu n’ont pas la même constitution génétique.
