Genomisk selektion Flashcards
Hvilken fordel er der ved stor sikkerhed omkring genotypen?
Estimering af fænotypen vil også stige i sikkerhed.
P = G+ E
Hvilke fordlee er der ved molekylære data?
1) Bedre beskrivelse af genetisk varians, man kan forudsige den genetisk udspaltning da man har viden om hvilke alleler afkommet har fået.
2) Det udtrykkes hos begge køn modsat f.eks. mælkeydelse.
3) Udtrykkes tidligt - helt ned til embryo stadie.
Hvilken indflydelse har information om molekylær data på den genetiske fremgang?
Sikkerheden vil øges i høj grad.
Da man får informationer fra avlsdyret tidligt i livet vil generations intervallet mindskes.
(genetisk fremgangsformel)
Hvilke strategier findes der for at undersøge en genetisk(e) egenskab(er)?
1) Undersøgelse af et enkelt gen for en enkel egenskab f.eks. sygdom man skal dog passe på da man ikke har informationer om indflydelse på andre gener.
2) Undersøge hele genomet for alle egenskaber. Dette kan erstatte det traditionelle avlsværdital. Der bruges dog en kombination af dette og det oprindelige avlsværdital.
Nævn et eksempel på udfavorable eliminering af et gen?
Eliminering af RN- gen, da det gav nedgang i avlsfremgang. Da den netop havde indflydelse på andre gener.
Hvad er SNP?
Det er meget tætsiddende gen markører som bruges til at undersøge hele genomer for dyr.
Består af to alleler.
Hvad er forskellen på traditionel EBV og genomisk EBV?
Traditonel:
- Kan kun give estimering for hele genomet
Genomisk:
- Kan give information om hver enkelt kromosom sekvens og samle disse værdier. (mere præcis)
Hvad er prædiktionsformlen og hvornår kan den benyttes?
En formel som udregner effekten for hvert enkelt kromoson stykke ved at gange en faktor på for hver værdi. Denne faktor kan være enten positiv eller negativ.
Bliver brugt for dyr hvor man ikke kender fænotypen, da man kan forudsige hvilke værdier allelerne har.
F.eks. kan bruges til at udvælge elite dyr udfra produktionsdyr genomet - tager højde for miljø forskel.
Hvorfor er det vigtigt at markører ligger tæt?
Hvis der er langt mellem amrkører vil sikkerheden falde drastisk for hver generation. Dette er grundet overkrydsning. Man kan f.eks. gå fra en positiv allel til en negativ allel.
Hvad afhænger sikkerheden på genomisk avlsværdital af?
1) antal fænotypiske registreginger
2) heritabilitet
3) antal genotypning og hvilket dyr
4) tæthed af genmarkører
5) populationssammensætning - indavl (jo mere indavl jo større sikkerhed da der er færre muligheder for variation)
6) statistisk model (korrektion for miljø)
Hvilke fordele er er der ved DNA baseret avl?
1) Større avslmæssig fremgang
2) Mindre indavl
3) Færre udgifter
4) Flere registreringer pr dyr, men færre dyr.
5) Øget centralisering - kerneavl
Hvilke trin er der i Turbo-avl?
1) fostre udvælges baseret på DNA molekyler
2) ubefrugtede æg opsamles fra fostre
3) æggene modnes og befrugtes i laborstoriet.
4) befrugtede æg lægges i rugemødre
Bruges i kvægbesætninger.
Hvilke riscisi er der ved turbo-avl?
1) Når man forkorter generationsintervallet kan tingene hurtig løbe løbsk og derved får man ufavorable egenskaber frem.
2) Ignorerer gener med lav frekvens herunder nye mutationer.
3) Genet kan godt have stor effekt selvom det ikke forekommer så ofte.
4) Der kommer monopoler og mindre samarbejde.
5) Reduceret sikkerhed
Sandt eller falsk:
Genomiske EBV:
1) tager hensyn til en ny mutation som kun findes hos et enkelt dyr med genotype.
2) tager hensyn til en ny mutation som kun findes hos et enkelt dyr uden genotype.
3) tager hensyn til fænotypiske registreringer på dyr med genotyper.
4) Er altid mere sikre end traditionelle EBV.
1) falks - ser bort fra loce som har mindre end 5 % forekomst.
2) falsk
3) sand
4) falsk, kan godt være 100% sikkert men ikke altid
