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BMGC > génétique > Flashcards

génétique Flashcards

1
Q

gène

A

séquence nucléotidique transcrite

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Q

locus

A

région particulière d’un génome

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Q

locus polymorphe

A

plr allèles

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4
Q

loi d’eqb de Hardy-Weinberg

A

Dans une pop d’effectif infinie, non soumise à la sélection, fermée et sans mutation : les fréq alléliques restent cstes d’une géné à une autre
De plus : si panmixie, alors p², 2pq, q²

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5
Q

sélection directionnelle

A

w hétérozygote est intermédiaire => fixation d’un allèle

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6
Q

sélection équilibrante

A

maintien du polymorphisme

1) surdom de w hétérozygote pe = (w2-w3)/(2w2 -w1 -w3)
2) sélection fréquence dépendante
3) hétérogénéité spatiale

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7
Q

coef de consanguinité

A

proba que les deux gènes qui se trouvent en un locus soient identiques par descendance

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8
Q

coef de parenté de Malécot

A

entre A et B : proba que 2 gènes du même locus tirés au hasard soient identiques par descendance

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9
Q

valeur coef de parenté de Malécot

A 
frères : 1/4
demi-frères : 1/8
cousins germains: 1/16
parent / enfant: 1/4
oncle/ neveu: 1/8
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10
Q

calcul Fx = Phi AB

A

0,5^(n1 + n2 +1)x(1+ Fac)

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11
Q

consanguinité dans pop

A 
p(AA) = p²+Fpq
p(Aa) = 2pq(1-F)
p(aa)= q²+ Fpq
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12
Q

dérive génétique

A

fluctuation aléatoire des fréquences alléliques par effet d’échantillonnage

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13
Q

effectif génétique

A

taille d’une pop idéale présentant une évolution relative de consanguinité par généation de delta F = (1/2Ne)*(1-F(t-1))

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14
Q

pop idéale

A

autant de mâle et de femelle repro et chaque ind participe de façon équitable à la repro

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15
Q

effectif génétique si peu de mâles repro

A

Ne=4Nm

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16
Q

haplotype

A

groupes d’allèles de différents loci d’un même chromosome et habituellement transcris ensemble

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17
Q

établir un objectif de sélection

A

1) critères de sélection selon contexte éco et stratégie de prod
2) hiérarchiser les caractères
3) prendre en compte l’évolution future des caractères

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18
Q

hiérarchisation des caractères

A

1) modéliser les différents caractères par une fonction de revenu
2) calculer le poids relatif (dérivée partielle)
3) comparaison €/écart-type

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19
Q

objectifs de sélection et races

A

espèces à intervalle de gestation long: ts les caractères pour toutes les races
espèces à intervalle de gestation court: spé par lignée

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20
Q

croisement le plus fréquent PC

A

truie : Large White x Landrace F

verrat: Pietrain

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21
Q

différence objectif de sélection et critères de sélection

A

objectif : ce que l’on cherche à améliorer

critères : ce que l’on mesure

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22
Q

contrôle de performance

A

1) phénotypage

2) pointage

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23
Q

identification bovins

A

bouclage des 2 oreilles avant 21j

code pays+ 10 chiffres enregistrés dans BDNI

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24
Q

base de sélection

A

% de femelles de la pop qui sont inscrites aux dispositifs officiels de contrôle de performance

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25
Q

nombre brebis laitière

A

2 millions

26
Q

nombre brebis allaitantes

A

4 millions

27
Q

nombre chèvres

A

800 000

28
Q

origine de la distribution continues des caractères quantitatifs

A

1) influence de l’env

2) intervention de nbx gènes

29
Q

hypothèse polygénétique infinitésimal

A

chaque caractère quantitatif est gouverné par une infinité de gènes, chacun ayant un effet infinitésimal

30
Q

QTL

A

région de génome polymorphe qui selon l’allèle présent provoque une différence importante du caractère

31
Q

premier modèle de décomposition P = G + E

A 
Var(P) = Var(G)+Var(E)  = Var(G) + Var(e)
E= e + F
32
Q

deuxième modèle de décomposition P = G + E

A

G = A + D + I

33
Q

index génétique

A

E(Gdesc) = E(Adesc) = 1/2 (Apère +Amère)

34
Q

stratégie de sélection

A

améliorer A : sélection par variabilité intra-race

améliorer D: croisement entre races

35
Q

ppe sélection

A

indexation

accouplement des meilleurs individus

36
Q

modèle simplifié P= G + E

A

P = A + E

37
Q

héritabilité

A

part de variation phénotypique d’un caractère quantitatif que l’on peut attribuer aux différences de valeurs génétiques additives entre les ind de la pop

38
Q

calcul héritabilité

A

h²=var(A)/var(P)

39
Q

coefficient de régression

A

parents / descendant = 0,5h²

moyenne parent/descendant = h²

40
Q

perf descendants

A

Py = h² x Pxbarre + c

41
Q

progrès génétique

A

trouver une supériorité chez les descendants par rapport aux parents
R=h²xS

42
Q

sélection massale

A

repro des meilleurs reproducteurs selon leurs perf

- si caractère avec h² forte, mesurables sur vivants des 2 sexes

43
Q

sélection par ascendance

A

perf des parents

44
Q

sélection par descendance

A

selection des mâles sur perf des enfants

45
Q

mesurer héritabilité

A

1) quantifier ressemblance entre ind apparentés

2) exp de sélection : montrer que h² forte

46
Q

gène pléniotrope

A

a des effets sur différents caractères

47
Q

index

A

valeur génétique additive estimée

48
Q

progrès génétique moyen entre 2 générations

A

deltaG = i x rho x sigmaA

  • i : intensité de sélection
  • rho : précisions des A estimés
  • sigmaA : écart type des A
49
Q

progrès génétique par an

A

deltaGa= deltaG / t

- t = intervalle de génération

50
Q

intervalle de génération

A

age moyen des repro lors de la naissance de leurs descendants eux mêmes choisis comme repro

51
Q

contribution de la voie des mères à taureaux et des pères à taureaux dans le progrès génétique

A

1/3

52
Q

stratégie historique pour améliorer le schéma de sélection

A

étape 1 du programme : choix uniquement des vaches confirmées (2 lactations)

53
Q

schéma MOET

A

sélection des femelles à 15m sur ascendance + super-ovulation + implantation des embryons dans vaches receveuses

54
Q

schéma OPU-FIV

A

ponction d’ovocyte dans les follicules ov puis maturation IV et transfert sur receveuse

55
Q

couverture

A

nombre de lecture de chaque Nu

56
Q

évaluation génomique

A

estimation de A uniquement par info moléculaire

57
Q

population de réf

A

ensemble d’ind pour lesquels on a une info génomique et phénotypique

58
Q

équation de prédiction

A

équation permettant d’estimer l’effet des SNP

59
Q

déséquilibre de liaison

A

asso préférentielle entre certains allèles d’une première région et ceux d’une deuxième région

60
Q

prix génotypage BV

A

environ 50€

61
Q

mammites

A

40% des V en prod

30€/ 1000 L de lait

62
Q

patho 1 PC, modif ciblée des génomes

A

SDRC (120-300€ / truie / an), inactivation prot CD163

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