bio mol Flashcards
calcul Tm
Tm = 2 x (AT) + 4 x (GC)
facteurs influençant Tm
compo en bases
concentration en cations
longueur des fragments
mésappariement
mésappariement sur Tm
- 1°C par %
inhibiteur de PCR (2)
héparine, Hb
PCRq
PCR en temps réel, plus il y a de fluorescence, plus il y a de molécules amplifiées
efficacité PCRq
pente de Ct=log(nb de copies/microL)
matériel Taqman
ADN matrice + 2 amorces + 4 dNTP + polym avec activité exonucléase
+ sonde qui s’hybride sur la matrice entre les amorces
sonde Taqman
3’: quencher, bloqué (xOH)
5’: fluorochrome
matériel SyberGreen
comme PCR classique
+ molécule intercalante qui se fixe sur le petit sillon de l’ADN double brin
LAMP
Loop mediated isothermal amplification
matériel LAMP
4 amorces (2 externes simples , 2 internes doubles) reconnaissant 6 régions
méthode de Sanger
ADN polym + 1 amorce + dNTP + ddNTP + ADN à séquencer
agents recherchés en hygiène alim
flore d’altération
bactéries patho
PCR nichée
2 PCR avec 2 couples d’amorces différents:
- 1 pour ext du segment
- 1 pour segment cible
PCR
amplification spécifique in vitro d’un segment d’ADN à partir d’un mélange de séquence