Génétique 3 - Épigénétique

Question 1

Comment est-ce que la configuration de la chromatine peut-elle être changée?

Answer 1

Par des liaisons des facteurs de transcription (à la boite TATA)

Question 2

Qu’est-ce qui détermine la vitesse de transcription de l’ADN en ARN?

Answer 2

La force d’interaction des facteurs de transcription.

Question 3

De quoi est constituée la chromatine?

Answer 3

ADN + échaffaudage de protéines (histones + facteurs de transcription)

Question 4

Qu’est-ce une marque épigénétique?

Answer 4

Une altération au niveau de la chromatine qui ne change pas la séquence d’ADN mais qui controle sa transcription et qui est transmise aux descendants. Par exemple, la méthylation de l’ADN inhibe la transcription. Ces modifications sont pourtant effacées dans la morule.

Question 5

Pourquoi les blastomères de la morule sont-ils totipotents?

Answer 5

Effacement des marques épigénétiques.

Question 6

Dans le cancer, est-ce que les gènes sont inhibés ou réactivés?

Answer 6

Les deux - réactivation de gènes normalement actifs et inhibition de gènes normalement transcrits.

Question 7

Quelles sont les principales marques épigénétiques au niveau de l’ADN, des histones et de la chromatine, respectivement?

Answer 7

ADN = méthylation
histones = acétylation
chromatine = trithorax et polycomb

Question 8

Comment se produit la méthylation de l’ADN?

Answer 8

DNA Méthyle-transférase reconnait une paire CG et insère un groupe méthyle entre les 2.

Plus précisément, des facteurs de transcription inhibiteurs recrutent DMNT pour méthyler les cytosines des dinucléotides CpG.

Question 9

Pourquoi la méthylation de l’ADN est-elle inhibitrice pour la transcription?

Answer 9

Les groupes méthyles bloquent la liaison des facteurs de transcription.

Question 10

Comment-est ce que la méthylation de l’ADN est-elle transmise par mitose?

Answer 10

DNA polymérase fait un nouveau brin, DMNT transférase fait la méthylation en reconnaissant les groupes CG sur le brin complémentaire.

Question 11

Comment est-ce que la méthylation de l’ADN fonctionne sur les plus grosses molécules d’ADN?

Answer 11

Les cytosines méthylés sont liées par les MeCP (cytosine binding protein), qui forme une plus grosse bosse que le groupe méthyle.

Question 12

Quelle maladie affecte le MeCP2 (cytosine binding protein)? Où est-elle localisée? Est-elle dominante ou récessive? Quel(s) sexes affecte-elle?

Answer 12

Syndrome de Rett. Chromosome X. Dominante. Seul les filles parce que les garçons en sont morts.

Question 13

Quelles sont les signes du syndrome de Rett?

Answer 13

Développement normal jusqu’à 6-18 mois. Après, neurodégenerescence progressive, hypotonie qui crée une scoliose (pli) de la colonne vertébrale, microencéphalie progressive (le cerveau et la tête arrêtent de grandir, mais pas le corps), EEG anormal (risque d’épilepsie).

Question 14

Comment peut on guérir le syndrome de Rett?

Answer 14

Réactiver la protéine MeCP2 rétablit un phénotype normal.

Question 15

Quel est le lien entre la méthylation de l’ADN et la modification épigénétique des histones?

Answer 15

MeCP recrute HDAC (histone déacetylase), qui enlève les groupes acétyles des histones - ce qui les rend hypoacétylés et transforme donc la chromatine en hétérochromatine inactive (en plus d’inhiber la formation de nucléosomes)

Question 16

Quel est l’effet de l’acétylation des histones?

Answer 16

Favorisation de la transcription par formation d’euchromatine active -> plus d’intéraction entre ADN et facteurs de transcription.

Question 17

Comment le chromosome X est-il inactivé épigénétiquement chez la femme?

Answer 17

Hypoacétylation des histones, hyperméthylation de l’ADN.

Question 18

Qu’est-ce le code d’histones?

Answer 18

L’ensemble des modifications épigénétiques des histones - acétylation, phosphorylation, ubiquination, etc.

Question 19

De quoi dépend les effets d’une modification épigénétique d’une histone? indice: histone = protéine

Answer 19

De l’acide aminé modifié, du type de molécule ajouté et du nombre de molécule ajoutées.

Question 20

Quels sont les effets de Trithorax (TTX) et Polycomb (PC)?

Answer 20

TTX active la transcription en ouvrant la chromatine en euchromatine. PC l’inhibe en la fermant en hétérochromatine. TTX et PC lient la chromatine en fonction du code d’histones, mais ils peuvent aussi modifier ce même code.

Question 21

Comment est-ce que TTX et PC sont transmis aux cellules filles?

Answer 21

Ils sont transmis lors de la mitose.

Question 22

Quel est le mode d’action de Trithorax?

Answer 22

Trithorax tire sur l’ADN pour que son promoteur et son activateur peuvent tous les deux être lus par le facteur de transcription.

Question 23

Qui recrute DMNT pour la méthylation de l’ADN?

Answer 23

Des facteurs de transcription.

Question 24

Qui recrute HDAC (histone déacétylase)?

Answer 24

DMNT (ADN méthyle transférase)

Question 25

La majorité du génome est transcrit en quelle sorte d’ARN?

Answer 25

ARN non-codant.

Question 26

Quel est le mécanisme de contrôle pré-transcriptionnel de l’ADN?

Answer 26

L’ARN double brin reconnait un brin d’ADN complémentaire. Il active Met1, une enzyme qui méthyle les cystosines de l’ADN et l’inactive.

Question 27

Quel est le mécanisme de contrôle post-transcriptionnel de l’ADN?

Answer 27

Dégradation de l’ARN par siARN.

Question 28

Comment est-ce que l’ARN double brin est formé?

Answer 28

Un ADN complémentaire à lui-même est transcrit en un ARN complémentaire à lui-même qui se referme comme un épingle de cheveux.

Question 29

Comment sont formés et quel est le mode de fonctionnement des siARN?

Answer 29

Les siARN sont formés lorsque l’ADN double brin est reconnu par Dicer. Il est alors coupé en courts segments de 22 nucléotides qui sont inhibiteurs. Cet ARN est transféré à RISC, puis reconnait l’ARN messager et le couper pour empêcher sa transcription en protéines.

Question 30

Quel est le mode de fonctionnement des lncRNA?

Answer 30

Les lncRNA ont une action pré-transcription (modification du code d’histones) et post-transcription (affecte ARNm). Ils jouent aussi un rôle dans la complexification des organes/tissus.

Question 31

Pourquoi une cellule souche est-elle une cellule souche?

Answer 31

Des facteurs de transcription activent des miRNA (ESCC) qui activent des facteurs souches (Lin28, MYC), qui désactivent des miRNS Let-7. Dans la cellule différenciée, Let-7 inhibe les facteurs souches Lin28 et MYC en plus de ESCC et empêche qu’une cellule différenciée redevienne une cellule souche.

Question 32

Comment peut-on former une cellule souche à partir d’une cellule différenciée?

Answer 32

Ajout de miRNA spécifique (miR).