Génétique 2 Flashcards
qu’est-ce qu’un caryotype et à quoi sert-il
classement des chromosomes selon un ordre établi par entente internationale
permet d’analyser la structure des chromosomes et de comparer les 2 homologues
combien de paires de chromosomes chez l’humain
lesquels sont autosomes et lesquels sont gonosomes
23 paires (donc 46 chromosomes)
22 paires d’autosomes
1 paire de gonosomes
que détermine la 23e paire de chromosomes
le sexe:
XX = femme
XY = homme
quelles sont les étapes pour établir le caryotype
compter le nombre de chromosomes
ensuite, analyse des chromosomes qui se base sur:
- taille (classés du plus grand 1 au plus petit 22, 23e à part)
- forme des chromosomes
- marquage particulier à chaque chromosome
la forme des chromosomes est déterminée par…
par la position du centromère
est-ce que la forme des chromosomes est constante
oui entre les 2 chromosomes homologues mais non entre les paires de chromosomes
quelles sont les différentes options de forme pour les chromosomes
métacentrique: centromère au centre du chromosome ce qui engendre 2 bras symétriques
submétacentrique: position du centromère entraine 2 bras asymétriques
acrocentrique: centromère à une extrémité qui entraine un très petit bras court
la majorité des chromosomes sont de forme…
submétacentrique
décrit la structure d’un chromosome de haut en bas
télomère (bout du chromosome)
p : bras court, toujours en haut
centromère
q : bras long, tjrs en bas
télomère
est-ce que le marquage chromosomique est constant
oui pour une paire donnée, mais non entre les différentes paires
comment se fait le marquage chromosomique
en bandes GTG ou G
obtenu après traitement à la trypsine et coloration au Giemsa
afin d’obtenir des chromosomes, quelles sont les cellules que nous devons utiliser
cellules qui se divisent parce qu’elles doivent être en métaphase de la mitose (car compaction maximale)
soit spontanément: fibroblastes de la peau ou fascia, amniocytes
soit stimulation: lymphocytes T sanguins suite à stimulation par PHA
l’obtention de chromosomes nécessite…
une culture cellulaire
un arrêt du cycle cellulaire en métaphase en ajoutant un inhibiteur du fuseau mitotique (Colcemid)
récolte des chromosomes après traitement hypotonique de la cellule
qu’est-ce que la formule chromosomique
composition en chromosomes d’une cellule donnée
de quoi est constituée la formule chromosomique
nombre total de chromosomes par cellule (46 normal, 47 anormal, etc.)
gonosomes (XX ou XY)
indication d’une anomalie chromosomique si présente
donne un exemple de formule chromosomique normale chez la femme et chez l’homme
46,XX pour femme ou 46,XY pour homme
décrit ce que l’on peut déduire avec la formule chromosomique suivante: 47,XX,+13
3e chromosome 13 chez une fille
décrit ce que l’on peut déduire avec la formule chromosomique suivante: 45,X
fille avec un seul chromosome X
pour analyser la constitution chromosomique d’un individu, on doit analyser un minimum de ???
10 cellules différentes
qu’est-ce qu’une constitution chromosomique homogène
lorsque toutes les cellules analysées sont normales (46,XX ou 46,XY) ou anormales (ex.: 47,XY,+21)
donc toutes les cellules ont la même formule chromosomique
vrai ou faux, la majorité des gens ont une constitution chromosomique non homogène
faux
décrit ce qu’est une constitution chromosomique mosaïque
on retrouve 2 types ou plus de cellules chez le même individu
anomalie chromosomique lorsque les types cellulaires proviennent d’un même zygote
on parle de lignées cellulaires
elles sont dues à des anomalies dans la ségrégation mitotique des chromosomes (donc survenues après création du zygote)
quel type de chromatine est modifiée dans les anomalies chromosomiques
l’euchromatine des chromosomes
vrai ou faux, les anomalies chromosomiques sont rarement visibles au microscope même si elles touchent plusieurs gènes à la fois
faux, puisqu’elles touchent plusieurs gènes à la fois, elles sont visibles au microscope habituellement
une anomalie chromosomique qui modifie la quantité d’euchromatine dans le génome entraîne…
un effet sur le phénotype
que se passe-t-il si l’anomalie ne touche que l’hétérochromatine
on parle alors de variant chromosomique et il n’y a pas d’effet sur le phénotype
quels sont les 2 grands types d’anomalies chromosomiques
anomalies de nombre
anomalies de structure
il existe 2 types d’anomalies de nombre, quels sont-ils et qu’est-ce qui les différencient
polyploïdie: addition d’un ou plusieurs complément haploïde (n) sur tous les chromosomes d’un génome
aneuploïdie: touche une seule paire d’homologue dont le nombre est augmenté ou diminué
pour chaque type d’anomalie de nombre suivante, indiquez s’il s’agit d’une polyploïdie ou d’une aneuploïdie:
trisomie
tétraploïdie
triploïdie
monosomie
trisomie: aneuploïdie
tétraploïdie: polyploïdie
triploïdie: polyploïdie
monosomie: aneuploïdie
quelle serait la formule chromosomique des différentes anomalies de nombre suivantes:
trisomie
tétraploïdie
triploïdie
monosomie
trisomie: 47,XY,+21
tétraploïdie: 92,XXXX
triploïdie: 69,XXX
monosomie: 45,X
comment peut-on arriver à un zygote souffrant de triploïdie
oeuf de 46 et spermatozoïde de 23 = digynie
oeuf de 23 et spermatozoïde de 46 = diandrie
oeuf de 23 et 2 spermatozoïde de 23 chacun = diandrie
quelles sont les formules chromosomiques possibles pour la triploïdie
quelle formule chromosomique est la plus rare pour la triploïdie
69,XXX ou 69,XXY ou 69,XYY (plus rare)
quelle est la cause de triploïdie la plus fréquente et quel est le phénotype qu’elle engendre
diandrie (84%): fécondation d’un ovule par 2 spermatozoïdes ou dispermie
retard de croissance important RCIU, kystes du placenta (changements molaires), peu viable
quel est le phénotype dans les cas de triploïdie maternelle (digynie)
placenta hypotrophique, syndactylies 2-3, RCIU
l’aneuploïdie résulte de…
une erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire
qu’est-ce qui détermine si une aneuploïdie sera homogène ou mosaïque
le moment où une erreur survient dans la répartition des chromosomes:
- lors de la méiose = homogène
- lors de la mitose = mosaïcisme tissulaire
est-ce que les monosomies d’un chromosome complet sont viables
non, sauf pour le chromosome X
nomme un facteur de risque important de l’aneuploïdie
âge maternel avancé (35 ans et plus)
décrit comment se produit une non-dysjonction des chromosomes en méiose 1
division réductionnelle qui sert à séparer les 2 homologues
si non-dysjonction, les 2 chromosomes homologues (du même parent) demeurent dans le même gamète
décrit comment se produit une non-dysjonction des chromosomes en méiose 2
division équationnelle qui sert à séparer les 2 chromatides soeurs
si non-dysjonction, 2 chromatides soeurs demeurent dans le même gamète (donc 2 chromosomes identiques sauf pour recombinaison subies)
vrai ou faux, les non-dysjonctions sont plus fréquentes en méiose 1 qu’en méiose 2
vrai
quel est le pourcentage des trisomies qui originent de la méiose maternelle
plus de 90%
dans quel type de trisomie est-ce que l’erreur se fait plus souvent dans la méiose 2 de manière exceptionnelle
trisomie 18
est-ce que l’âge maternel a un effet sur les erreurs en méiose 1 et en méiose 2 ou seulement pour l’une des 2
pour les 2
au niveau des recombinaisons méiotiques, quels facteurs de risque de non-dysjonction retrouve-t-on
absence de recombinaison et recombinaisons en position télomériques:
- à tout âge
- erreur de la méiose 1
- bivalent ségrégerait de façon plus ou moins indépendante
recombinaisons péricentromériques:
- femme plus âgée
- erreur de la méiose 2
- interfèrerait avec la cohésion normale des chromatides soeurs
quel est l’effet de l’âge maternel sur le fuseau mitotique
avec âge maternel avancé, combinaison de facteurs qui nuisent au fuseau mitotique:
- patrons des recombinaisons
- vieillissement du fuseau mitotique
à quelle anomalie chromosomique réfère le syndrome de Turner
monosomie du X = 45,X
par rapport au syndrome de Turner:
- ?% des conceptions
- ?% résultent en avortement spontané
- cause majoritaire: non dysjonction des gamètes ??
- 1/?? des nouveaux-nés de sexe ??
2%
90%
paternels
1/2000, féminin
pour le syndrome de Turner, quel est le niveau d’intelligence ainsi que le phénotype le plus courant à la naissance malgré qu’il soit variable
intelligence normale
phénotype variable mais plus courant = courte taille proportionnée et insuffisance ovarienne par dysgénésie gonadique
quelle est la particularité du corpuscule de Barr chez une femme atteinte du syndrome de Turner
absence du corpuscule de Barr
nomme 2 autres signes possibles du syndrome de Turner qui ne sont pas dans le phénotype le plus courant
cou palmé (résultat d’une hygroma kystique en grossesse)
oedème du dorsum des mains et des pieds en néonatal
la formule chromosomique 45,X est homogène dans quel pourcentage des cas? en mosaïque dans quel pourcentage?
homogène = 55%
mosaïque = 20% (avec lignée 46,XX ou 46,XY; origine post-zygomatique)
les anomalies de structure du chromosome X surviennent dans ?% des case homogène ou en mosaïque
donne 2 exemples d’anomalies de structure
25%
isochromosome Xq, délétion
qu’est-ce qu’un isochromosome
chromosome qui possède de façon anormale 2 bras de même longueur: soit 2 bras courts (Xp) ou 2 bras longs (Xq)
par rapport au triple X (47,XXX)
- incidence
- phénotype de quel sexe
- intelligence
- taille
- malformations/dysmorphies
- fertilité
1/1000
féminin
normale mais légèrement diminuée par rapport à la fratrie (difficultés d’apprentissage fréquentes)
grande
aucune
normale
à quelle anomalie chromosomique réfère le syndrome de Klinefelter
47,XXY
par rapport au syndrome de Klinefelter:
- incidence
- phénotype de quel sexe
- intelligence
- taille
- fertilité
1/500
masculin
normale mais légèrement diminuée par rapport à la fratrie
grande
hypogonadisme (petits testicules): infertilité, risque de gynécomastie (seins asymétriques), caractères sexuels secondaires peu développés
par rapport au 47,XYY
- incidence
- type de phénotype
- intelligence
1/900
masculin normal
normale mais légèrement diminuée par rapport à la fratrie: difficultés fréquentes d’apprentissage, impulsivité possible
synonyme de syndrome de Down
trisomie 21 (47,XX,+21 ou 47,XY,+21)
incidence du syndrome de Down
1/660
l’incidence du syndrome de Down augmente avec…
âge maternel (1/1250 à 25 ans VS 1/24 à 45 ans)
95% des syndromes de Down sont causés par…
non-dysjonction méiotique lors de la méiose maternelle
décrit le phénotype du syndrome de Down
retard mental léger à modéré
bon tempérament
hypotonie (tonus diminué)
traits physiques caractéristiques (occiput plat, visage rond, orientation des fentes palpébrales vers le haut, replis épicanthiques, protrusion de la langue, plis palmaires transverses, clinodactylie 5e doigt)
malformations cardiaques 40%, gastro-intestinales 12%
risque de leucémie 1%
synonyme de syndrome de Patau
trisomie 13 (47,XX,+13 ou 47,XY,+13)
incidence du syndrome de Patau
1/5000
phénotype du syndrome de Patau
retard mental sévère
fente labio-palatine
polydactylie
malformation cérébrale sévère
malformations cardiaques, rénales et autres
est-ce que le syndrome de Patau est viable
anomalie le plus souvent létale:
- survie médiane 7 jours
- 91% de décès dans la première année
- survie long-terme de 5-10%
synonyme de syndrome d’Edward
trisomie 18 (47,XX,+18 ou 47,XY,+18)
incidence du syndrome d’Edward
1/6000-8000
phénotype du syndrome d’Edward
retard mental sévère
retard de croissance
mains fermées (2e sur 3e doigt, 5e sur 4e doigt)
pieds en piolets
malformations cardiaques, digestives, rénales fréquentes
est-ce que le syndrome de Edward est viable
anomalie le plus souvent létale
- survie médiane 14,5 jours
- 5-10% survivent plus de 1 an
les anomalies de structure sont des modifications de ??? et sont presque toujours dues à des ??
la forme des chromosomes
cassures
vrai ou faux
- un chromosome peut être le site d’une seule cassure transversale
- plus d’un chromosome peuvent subir des cassures en même temps
- les points de cassure ont tendance à ne pas se recoller entre eux
faux
vrai
faux
que ce passe-t-il avec un fragment chromosomique qui ne s’est pas recollé
il persiste dans les cellules filles au cours des divisions cellulaires seulement s’il contient un centromère
suite à une ou des cassures, quelles sont les options
fragment peut se perdre
se recoller exactement comme il était avant la cassure
se recoller différemment (au même endroit ou ailleurs)
qu’est-ce qu’une délétion
perte de matériel sur un chromosome
qu’est-ce qu’une délétion terminale
une seule cassure
le fragment qui ne contient pas le centromère et qui ne se recolle pas sera perdu lors des divisions cellulaires (fragment acentrique)
les cellules filles conservent le chromosome cassé, soit le segment chromosomique qui contient le centromère
qu’est-ce que le syndrome du Cri-du-Chat
délétion terminale du bras court du chromosome 5
retard de croissance
cri caractéristique à la naissance
retard mental
qu’est-ce qu’une délétion interstitielle
deux cassures dans le même chromosome, à l’intérieur du même bras chromosomique
perte du matériel entre les 2 points de cassure (fragment acentrique)
fusion aux 2 points de cassure
qu’est-ce que l’inversion paracentrique
deux cassures dans le même chromosome
cassures affectent le même bras chromosomique et pas de perte du segment = segment peut se recoller à l’envers ce qui donne une inversion paracentrique
qu’est-ce que l’inversion péricentrique
deux cassures dans le même chromosome
cassures affectent les 2 bras chromosomiques donc de part et d’autre du centromère = segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui donne une inversion péricentrique
laquelle entre l’inversion péricentrique et l’inversion paracentrique change la position du centromère
péricentrique
qu’est-ce que la translocation
deux cassures sur deux chromosomes différents
échange de matériel chromosomique
recollage des segments
quels sont les 2 types de translocation
réciproque ex.: t(9;22)
robertsonienne ex.: rob(13;15) ou der(13;15)
une translocation peut être soit ? ou ?
équilibrée ou déséquilibrée
explique la translocation réciproque équilibrée entre les chromosomes 11 et 22
cassure en a sur le chromosome 11
cassure en b sur le chromosome 22
échange de fragments
formation de 2 nouveaux chromosomes transloqués (der ou dérivés)
les translocations réciproques se font entre des chromosomes ??? et le long des ???
non-homologues
bras chromosomiques
