Flore, pathogenèse et virulence Flashcards
Qu’est ce que la colonisation microbienne?
Présence d’un microorganisme dans/sur un organisme hôte sans nécessairement causer de maladie
Est-ce que la colonisation est préalable à l’infection?
Non, toutefois, la colonisation peut être une étape préalable à une infection.
Un individu colonisé par un microorganisme (sans développer une maladie) peut-il transmettre se dernier?
Oui. Le microorganisme peut être capable de se multiplier dans/sur l’hôte et il peut aussi potentiellement être transmis
Qu’est ce qu’une infection?
Il s’agit de l’envahissement d’un organisme hôte par un agent pathogène biologiquement actif qui est capable de s’y multiplier et de causer des maladies (symptômes, signes cliniques, dysfonctions physiologiques, réponse immunitaire, inflammation, mais peut aussi être en latence sous-clinique ou en phase pré symptomatique) et potentiellement aussi d’être transmis.
Que veut-on dire lorsqu’on parle de contamination?
Il s’agit de la présence d’un microorganisme sur une surface du corps ou d’objets inanimés. Les objets inanimés contaminés dont le contact est susceptible de propager des agents infectieux sont appelés fomites.
En laboratoire, on parle de contamination lorsqu’il y a mise en évidence de microbes (ou de leurs composantes) non présents dans le site prélevé. Ces contaminations sont liées à la charge environnementale au site de prélèvement et au respect des règles de prélèvements, ainsi qu’au mode de fonctionnement du laboratoire (Ex.: 3-10% des hémocultures sont contaminées).
Pour causer une maladie, une microbe doit pouvoir passer par plusieurs étapes. Décrire le processus infectieux.
- Pénétrer dans l’organisme
- Adhérer aux cellules hôtes
- Faire compétition à la flore normale
- Résister aux défenses immunitaires
- Envahir les tissus cibles
- Induire des dysfonctions physiologique
** Il existe d’autre mécanismes d’invasion que les étapes 2 et 3
La présence des pathogènes dans l’environnement qui permettent la transmission et infection par les microorganismes sont généralement contenu dans des “réservoirs”.
Nommez 3 types de réservoirs humains
- Porteurs sains (ex: S.aureus sur la peau)
- Porteurs latents (ex: Herpès, tuberculose, malaria)
- Porteurs malades
Qu’est ce qu’une zoonose?
C’est une maladie infectieuse qui peut passer de l’animal à l’homme
Ex: Toxoplasma (parasite), Antrax (bactérie), Giardia (parasite)
Anecdote: Dans un village au nord de la Russie, à cause de la fonte des pergélisols, un homme à retrouvé un vieux cadavre de cervidé avec lequel il a été en contact. Peu de temps après, il y a une micro-épidémie d’anthax dans ce village. Le microorganisme à l’origine de l’épidémie (Bacillus anthracis) a finalement été retracé jusqu’au cervidé, la bactérie ayant probablement été conservé dans son réservoir congelé.
Moral: Le réchauffement de la planète et la fonte des glaciers pourrait possiblement libérer de vieux pathogènes (même préhistorique). :O
Nommez des réservoirs d’agent pathogènes inanimés ainsi que des exemples de pathogènes que l’on pourrait y retrouver
- Sol (tétanos)
- Eau (choléra, legionellose)
- Aliment (gastroentérite, botulisme)
Fun fact: La fin 6ième épidémie de choléra en Inde fut en partie à cause de l’émergence d’un bactériophage (virus de bactérie) qui s’est mis à trucider la population Vibro cholera dans l’eau.
J’appelle ce chapitre de l’histoire:
Microbe War: La guerre des phages
Nommez 3 manières de transmission des microorganismes:
- Par contact (étroit): relation intime, goulettelette
- Par vecteur vivant: arthropode (Zika, Nil, Malaria, Lyme, Peste, encéphalite)
- Par véhicule inanimé: clou, épine, couteau
Qu’est ce que la différence entre la pathogénicité et la virulence?
Pathogénicité: Capacité d’un microorganisme à causer une infection. Notion qualitative.
Virulence: Le degré de pathogénicité. Notion quantitative. (aptitude des germes à se développer et à sécréter des toxines dans l’organisme). La virulence peut augmenter ou diminuer
La virulence se mesure par:
- Taux de morbidité
- Taux de mortalité (LD50 = Dose léthale à 50%)
Expliquer la différence entre un pathogène primaire VS un pathogène opportuniste
Pathogènes primaires: Initient la maladie chez les sujets sains. Pathogènes opportunistes: Induisent des infections chez les gens immunodéficients/immunosupprimés (peu arrivé chez les patients sains avec un débalancement du système immunitaire)
Quels sont les facteurs qui peuvent augmenter les risques d’infections?
- Génétiques: anatomie homme/femme, déficience
- Âge, malnutrition, habitude de vie
- Maladie chronique
- Prise de médication
- Environnement
Quelles sont les portes d’entrées des microorganismes dans le corps?
- Muqueuses (respiratoires, digestives, génitales (met pas ton pénis n’importe ou))
- Peau (follicule pileux, plaies)
- Voie parentérale (lésions, piqûres, coupures, morsures)
Fun fact: Mon Yorkshire Molly (paix à son âme), est sorti en courant comme une malade et à mordu un livreur de Benny tellement fort que même quand il shakait la jambe le chien restait accroché. Après le livreur m’a dit qu’il allait me poursuivre si mon chien lui avait donnée la rage.
Pensez-vous que mon chien lui a donné la rage?
Comment certaines bactéries sont en mesure d’adhérer aux cellules de l’hôte?
Grâce aux adhésines: Ce sont des composantes ou appendice de la surface microbienne qui permettent l’attachement aux cellules de l’hôte (sur des récepteurs spécifiques) ou à d’autre type de surface.
Exemple d’adhésine:
- Glycoprotéine (glycocalyx, capsule)
- Lipoprotéine
- Fimbriae
- Pili
Donnez des exemples de récepteurs retrouvés sur les cellules hôtes:
- Hydrate de carbone (sucre)
- Acide Sialique
- Fibronectine
Quelles sont les cellules les plus abondantes du corps humain?
Cellule bactérienne (1014 VS 1013 cellules eucaryotes)! Tes une grosse bactérie ambulante
Après les bactéries : Globules rouges (qui elles sont des cellules eucaryotes)
Vrai ou faux
Le bébé naissant est absent de tous microbe
Faux! Le bébé naissant à reçu la flore vaginale de sa mère + contact avec les bactéries ambiante de l’environnement.
Toutefois, le foetus in utero est VIERGE de tout microbe
Qu’est ce que le microbiote?
Ensemble de microorganismes non pathogènes (ou commensaux) qui vivent dans un endroit spécifique (donc microorganisme + son environnement)
Exemple d’endroit: la peau, l’intestin, la bouche, le système respiratoire et génito-urinaire
Quel est le rôle de se magnifique microbiote?
- Protection
- Métabolisme
- Stimulation de l’immunité
- Peut parfois être source d’infection (ex: s’il y a un débalancement de la flore ou une lésion un microorganisme commensal peut devenir opportuniste)
Commensalisme: relation neutre entre 2 entité biologiques (aucune n’apporte bénéfice à l’autre), mais on soupe à la même table.
Quel endroit de la peau est la plus favorable à la croissance des microorganismes?
Les régions humides ;)
Les autres régions sont moins favorable à la croissance
Quels genres de bactéries est-ce possible de retrouver sur la flore de la peau?
- Les Staphylocoques
- Les corynébactéries
- Cutibacterium acnes
**Dit en classe par le prof: S.epidermidis est importante pour la flore normal de la peau car elle sécrètent des peptides qui empêche la croissance de certain pathogène
Vrai ou faux
Il est possible de faire des infections cutanées à Staph?
Vrai
Surtout à S.aureus
2 types de Staphylocoques prédominant sur la flore de la peau: à coagulase positive (S.aureus) ou à coagulase négative (S.epidermidis) = Ça permet de les différencier
- 90% de la flore normale de la peau, originent principalement du nez
- S. epidermidis* prévaut mais S. aureus parfois pathogène
- 90% des S. aureus sont résistants à la pénicilline
- Infections nosocomiales (hôpitaux): SARM (résistants à la méticilline) - causent aussi folliculites, furoncles (clous), impétigo du nouveau-né
Quelle est la maladie de peau la plus fréquente chez les êtres humains?
L’ACNÉ MOTHERFUCKER :O
Il va se produire un déséquilibre au niveau de la flore
- Composante génétique et hormonale qui favorise la production de sébum
- Occlusion du conduit des glandes pilo-cébacées qui produisent le sébum
- Accumulation de sébum et production d’un comédon (point noir)
- Cutibacterium acnes hydrolyse le glycérol et produit des acides gras
- Cellules inflammatoires, apparition de papules et de pustules
Les infections cutanés (juste regarde avec tes kenoeil)
Quelle bactéries est responsable majoritairement de la carie dentaire?
Streptococcus mutans
Elle produit de l’acide qui dissout l’émail des dents.
D’ou l’importance de se brosser les dents (action mécanique), idéalement avec du fluor (action chimique)
Qu’est ce qui module la flore bucale?
- Le système immunitaire
- L’alimentation (par exemple, les sucres libres sont une source très aimé par les bactéries..si y’en a trop dans ta petite bouche, ça va contribuer à la croissance des microorganisme)
Quels genre de microorganismes retrouve-t-on dans la flore de la muqueuse buccale?
- Bactérie anaérobique (logé dans tes gencives)
- Levures (ex: Candida)
- Bactérie aérobique aussi
- Ex: Streptococcus salivarius
Vrai ou faux
Le pH d’un compartiment du corps va déterminer quel genre de bactérie seront en mesure d’y croître
VRAI
Qui sommes-nous?
Nous sommes en mesure de croître dans l’estomac malgré le pH très faible (2)
- Helicobacter pylori (ulcères)
- Lactobacilli
Ces bactéries sont acido-résistante
Qui sommes nous?
Nous sommes capable de croître dans le jéjunum, là ou la main de l’homme n’a jamais mis le pied.
- Streptococci
- Lactobacilli
Le pH de jéjunum est environ 4-5
Vrai ou faux
30% de la flore normal du système digestif est contenu dans l’iléon
Faux!
- 30% de la flore normal du système digestif est contenu dans le colon! à un pH optimal pour une grande partie des bactéries (pH 7)
Quel est le plus gros perturbateur de la flore intestinale?
- L’alimentation
- Antibiotique
Vrai ou faux
Les probiotiques sont suggérés après une prise d’antibiotique, mais il y a peu d’évidence que cela fonctionne cliniquement
Vrai!
Seule évidence sont chez les bébé naissant
Toutefois, c’est certain qu’après une prise d’antibiotique ou d’une gastroentérite, ça peu pas faire de mal ;)
Chez les personnes âgées, la prise d’antibiotique peut toutefois avoir des conséquences plus importante sur les niches écologique libéré de la flore et permettent la croissance de quel organismes?
Clostridium difficile
Peu entrainer des diarrhées à C. difficile chez les patients.
Si le traitement de première intention (avec des antibiotiques spécifiques contre C. difficile) ne suffi pas à résoudre l’infection, il est possible de se tourner vers la transplantation fécale d’un donneur sain.
Quel genre de bactéries peut-on retrouver dans la flore du nez?
- Staphylocoques
- Streptocoques
- Heamophilus
Celle de la gorge et nasopharynx sont semblable à celle de la salive
Celle de la trachée, bronche et poumons est plus ou moins connu puisqu’elles étaient considérés pendant longtemps stérile!
Les perturbations dans le microbiote respiratoire pourrait être à l’origine de certaines infections
Vrai ou faux
La flore des reins et de la vessie est surtout composé de bactérie Gram -
Je te bullshit cher ami(e), c’est faux
Le reins et la vessie sont normalement stériles
Parlez moi de la flore de l’urètre et du vagin
Urètre: Staphylocoques, Streptocoques, Entérocoques, Bacilles anaérobique
Vagin: flore très complexe chez l’adulte
Concernant la vie d’un vagin:
J’avais pas d’idée de question: lis
Expliquez comment il serait possible de contracter une infection à levure suite à la prise d’antibiotique?
Les levures comme Candida albicans font partie de la flore normale du vagin, mais peuvent proliférer suite à l’usage d’antibiotiques qui altèrent la flore bactérienne.
Aussi, d’autre bactéries peuvent proliférer suite à la prise d’antibiotique et causer des infections urinaires.
Nommez quelques manières qu’ont les microbes de résister contre les défenses de l’hôte
- Masquer leurs composantes vulnérables (leur antigène qui permet la reconnaisse par le système immunitaire, ex: les pili)
- Se protéger de la phagocytose
- Survivre à l’intérieur des leucocytes (ou des cellules normales)
- Sécréter des enzymes de destruction des leucocytes
- Interférer avec les anticorps et le complément
Y’en a beaucoup d’autre (pas vue en classe)
Nommez quelques enzymes, ainsi que leur fonction, qui permet à certains microorganismes d’envahir les tissus
- Cytolysine: brisent des composantes cellulaires ex. collagénase, phospholipases
- Hémolysines: détruisent les globules rouges: hémolyses ß et a. Strep ß-hémolytiques Groupe A, B, C…
- Coagulases et fibrinolysines: provoquent la formation de caillot ou empêchent la coagulation
- Leucocidines: détruisent les leucocytes en les perforant
Nommez un exemple classique d’endotoxine bactérienne et expliquez son “fonctionnement”
LPS: lipopolysaccharide
(composante de la membrane externe des bactéries Gram -)
Lorsque libéré dans la circulation (par destruction de la bactérie (antibiothérapie) ou autre), elle reconnait chez l’hôte une panoplie de récepteur qui peuvent déclencher des fièvres carabinés, inflammation jusqu’au choc septique
Le LPS est composé de 3 partie majeure:
- Antigène O (immunogène)
- Centre (core) oligosaccharide
- Lipide A (segment toxique, normalement dans la partie interne de la membrane externe)
Nommez quelques cascades qui mène à des dysfonctions physiologique grave causé par des microorganismes.
Nous savons que les microbes peuvent induire directement ou indirectement (toxine) du dommage cellulaire et donc des dysfonctions physiologique. Quel autre processus important lors de l’infection peut infliger aussi beaucoup de dommage?
Réaction inflammatoire! (réaction de notre propre système immunitaire face à l’infection) et qui peut causer des symptômes de manière similaire aux endotoxines.
Ces réactions ont comme médiateurs: les cytokines
Quelles cytokines peuvent (à eux seuls) reproduire la majorité des effets des endotoxines?
- TNF-alpha
- Interleukine-1 (IL-1)
- Ces cytokines sont très pro-inflammatoire
Mise à part les cytokines, d’autre médiateur participent à l’inflammation.
Nommez des médiateurs lipidiques de l’inflammation
- Thromboxane
- Prostaglandine
- (proviennent initialement des phospholipides membranaires
Qu’est qu’une exotoxine?
Il s’agit d’une toxine produite et sécrété par la bactérie vivante contrairement aux endotoxines (qui sont un produit de lyse cellulaire généralement).
Elle sont généralement facile à inactivées par la chaleur (thermolabile) en anatoxine inoffensives
Il existe différent “types” d’exotoxine, êtes-vous capable d’en nommez? (T’es pas game)
Ici le prof parle seulement d’une catégorie d’exotoxine: type A-B
Toxine de type A-B (protéine à 2 composante donc une lie la composante cellulaire tandis que l’autre possède l’action enzymatique). Se sont des poisons violents, ex: toxine diphtérique, toxine botulique, etc. Il y a différentes catégories de type AB, dépendamment de leur action..
- Cytotoxines
- Neurotoxines
- Entérotoxines
