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Cellule Eucaryote > Final > Flashcards

Final Flashcards

1
Q

Noyau

A

Une différence entre Eucaryote et bactérie. Stockage d’informations génétique.

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Q

Structure du noyau (6)

A

Enveloppe nucléaire: cloison, deux couche
Pore nucléaire: transport
Nucléole: fabrication des ribosome
Région dense et clair
Nucleoplasme: partie solube du noyau
Matrice nucléaire: réseau fibrillaire qui supporte la chromatine

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3
Q

Nucléole

A

Production des ribosome, assemblage ARN, protéine, ARN. Le gène qui font lARN sont répétés 200 fois sur 5 chromosome. L’assemblage de ADN se fait dans le nucléole.

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4
Q

Enveloppe nucléaire

A

Deux bicouche lipidique. Continuité avec le RER. Composée de filament intermédiaire de lamine tapissée à l’intérieur: lame nucléaire

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5
Q

Lame nucléaire

A

Treillis rigide, forme de filament intermédiaire, lamine A,B,C. Donne la forme ronde au noyau.

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6
Q

Pore nucléaire

A

Importation de protéines pour la réplication ou transcription. Exportation de ARNm, ribosome et ARNt. Peut exporter 14000 sous-unité de ribosome qui vont maturer à l’extérieur. Composée d’un transporteur centrale et de filament proximaux qui accueil le cargo,

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7
Q

Pore nucléaire, transport

A

Import: cytoplasme au noyau, protéine résident dan sel noyau on besoin d’un signal de localisation nucléaire NLS. Depend de importine qui se lie au NLS et le filament du pore. Les importine se dissocient et demande des protéines G (Rab GTPase) pour revenir dans le cytoplasme.
Export: ARN utilise les exportine, moins d’énergie

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8
Q

Telomere

A

Au extrémités des chromosomes, séquence mini-satellite repete de protéines qui coiffe et protège les chromosome. La répétition peut faire une boucle par la liaison avec le 3, interagit avec les protéines pour ne pas être repéré comme des bris double brin de ADN pour ne pas etre coller ensemble. Fonction d’horloge, se raccourci a chaque division, lorsque trop court elle ne va plus se diviser.

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9
Q

Telomerase

A

Produite par certaine cellule comme les cellule germinale (reproduction). Elle permet de renouveler la telomere des cellule sinon les enfants naissent aussi vieux que nous. Utiliser par les cellule cancéreuse, repro infini.

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10
Q

Superenroulement

A

Observer dans la réplication et transcriptions. Les topoisomerase aide a résoudre le problème. C’est en séparant les deux brin qu’il y a de la tension créer a chaque étirement, forme des cercle dans la partie pas encore répliqué.

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11
Q

Fonctionnement Réplication de ADN

A

ADN se réplique dans les deux direction, se tetache et forme une boule qui va etre répliquer au centre. Famille d’enzyme. ADN polymerase: 5 sorte bactérie 14 humain. 5 a 3. Different par leur vitesse d’action et précision. Chaque type est utilisé pour différentes raison.

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12
Q

Activité ADN polymerase

A

Synthèse du nouveau brin a partir d’un brin matrice. De 5 a 3. La polymerase ajoute un nucleotide au bout d’une chaine double. Une est déjà fait l’autre doit être compléter, polymerase se fie a celle qui est déjà fait et rajoute a l’extrémité 3 le reste. Il a besoin d’une amorce courte et une matrice longue qu’elle va complémenter

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13
Q

ADN helicase

A

Déroule lADN en simple brin. Il y en a deux de chaque côté du loop pour permettre de faire deux synthèse avec chaque brin séparé

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14
Q

Protéines SSB

A

Se lient a ADN simple brin et empêche de se replier en structure secondaire.

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15
Q

Erreur dans la réplication

A

Peu d’erreurs sont fait pas la polymerase. Il sont des mécanismes intrinsèque de réparation des erreur, exonuclease de 3 a 5 * et des pochette de mesappariement

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16
Q

ADN

A

Acide désoxyribonucléique, polymere de phosphate, sucre et 4 base azoté: adénine, thymine, guanine, cytosine et uracile pour ARN. AG sont des purine, CTU sont des pyrimidine.

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17
Q

Structure ADN

A

AT font 2 pont hydrogène GC font 3 pont hydrogène. Des pont non-covalent facile a défaire. Les deux brin sont antiparallèles, complémentaires à l’autre. Forme une double hélice, 10 pair par tour, il y a toujours un sillon majeur plus large.

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18
Q

Rôle ADN

A

Donner l’ordre des résidu acide aminé des protéines et déterminer le moment ou les protéines sont exprimées.

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19
Q

DOGME

A

Transcription de ADN en ARNm et traduction en protéines

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20
Q

Code génétique

A

Lu de 5 a 3, lu en triplet de 3 nucleotide (1 codon) donne un acide aminé. 64 codon, 20 a-a, plusieur codon pour le même a-a. Codon start: ATG ou AUG. Codon stop: TAA TAG TGA. Traduit par le ribosome a partie du ARNm en utilisant les ARNt

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21
Q

Séquence codante

A

Partie de la séquence utilisée pour la protéine du start au stop.

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22
Q

Gène

A

Endroit dans lADN trouve info codant pour l’expression d’une protéine c’est pas juste la séquence c’est tout les séquences non-codante et les régulateur.

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23
Q

génome

A

Ensemble de gène que contient un organisme vivant

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24
Q

Génome procaryote

A

Gène assembler en opérons, bloc prêt a traduire séparé , ADN bactérien est circulaire, 90% sont codante le reste est des régulateur.

25
Q

Gène Eucaryote

A

Séquence codante sont séparés en exonérant et intron (non-codante). Va subir dans modification, intron retirer, exon coller ensemble: épissage. les gêne ne sont pas en opérons mais un promoteur par gène. Seulement 1,5% est encodant protéine (intron, régulateur et séquence répétitive)

26
Q

ADN régulateur

A

Promoteur, élément proximaux, élément distaux (peuvent etre loin en aval ou amont). Moment le gène est actif et intensité d’activation, est reconnu par des facteur de transcription

27
Q

Séquence répétitive en tandem

A

Satellite (autour centromère) minisatellite: telomere. Microsatellite: partout dans le génome.

28
Q

Élément transposable

A

Capacité de se répliquer dans le genome. Couper/coller: retiration du transposon du donneur et donner au récipient qui n’a pas de transposon. Copier/coller: transcription par polymerase, copie inverse et doublement, donner au récipient mais donneur garde le sien.

29
Q

Structure chromatine

A

N’est pas nu, embobiner dans une structure de protéines, histone (boule avec ADN autour). 8 histone forme un nucleosome (unité de base de la chromatine). Compact ion de chromatine donne les chromosome.

30
Q

Histone

A

4 histone: H2A, H2B, H3, H4 deux fois donne 8 ce qui donne un nucleosome. Les extrémités des histone sont non-structurer et permet a ADN de faire le tour. La histone H1 sert de compaction, s’associe au point d’entrée et sortie pour stabiliser le brin ADN

31
Q

Different état de chromatine

A

Euchromatine: moins dense, beaucoup de gène actif. Hétérochromosome: plus dense (voit bien), moins de gène, périphérique du noyau (plus sombre)

32
Q

Chromosome

A

Durant la division cellulaire, la chromatine forme des boucle avec le histone ancré a un échafaudage de protéines. Chromosome facilite la séparation lors de la division. 46 chromosome, 23 pair, 2 sexuel. 2 soeur identique attaché par le centromère, extrémités protégé par le telomere

33
Q

Centromère

A

Point de fixation dés chromatine soeur, contient un site d’attachement pour le complexe kinetochore: tire sur le chromosome pour la séparation. Un seul centromère par chromosome. C’est une séquence ADN répétitive d’alpha satellite en tandem, entourée heterochromatine. Procède un varient de histone H3.

34
Q

Organisation chromatine division

A

Interphase (phase entre mitose et méiose, repos) les chromosome occupé un territoire bien distinct

35
Q

BER, système de réparation

A

Base excision repair, réparation par excision de base. Sert à réparer les base modifier par deamination, oxydation ou alkylation. La détection de réparation est effectuer par des enzyme qui reconnaissent des base modifier comme glycosylase. La réparation est enlevée une seul base.

36
Q

BER et glycosylase

A

Inspecte des base couplée, surtout les G cytosine, torsion de la base mal couplée si la base est modifier donc mal elle va bien rentrer dans le site actif et est remplace par le polymerase , sinon elle est relâcher.

37
Q

Réplication de lADN

A

La réplication dune molecule ADN conduit a la production de deux molécules ADN complète et de même séquence.

38
Q

Réplication semi-conservative

A

LADN parental une duplication donne deux molecule moitié ancien moitié nouvelle car chaque brin peut faire une nouvelle molécule. Deuxième duplication donne 4 molécules deux moitié ancien et nouveau et deux totalement nouveau

39
Q

Réplication ADN bactérien

A

Une origine de réplication les deux fourche font tout le tour de la molécule se qui crée deux cercle qui sont ensuite séparés un vieux un nouveau

40
Q

Fourche de réplication

A

5 a 3 pour la nouvelle mais la vielle est 3 a 5. Mais lautre brin de la fourche qui est de 5 a 3 doit être répliqué vers l’intérieur du cercle donc la fourche ouvre un peu, on réplique cette partie là, elle ouvre un peu plus on réplique lautre partie, c’est une réplication semi-continue, discontinue, brin retardée, fragment Okazaki

41
Q

Fragment Okazaki

A

Les fragment on besoin dune amorce pour partir la synthèse contrairement au brin avancé qui part de l’ancien. L’amorce est la primase qui réplique une petite partie et part quand la polymerase fini sa synthèse. Les fragment discontinu sont liés par une ligase

42
Q

Réparation intrinsèque

A

La polymerase marche à reculons en arrachant les nucleotide mal apparier en sens inverse. De 3 a 5 sur un brin qui est de 5 a 3. Un mauvais assemblage change l’angle des base. Cela cause une courbure dans lADN. Durant la synthèse par polymerase quand elle trouve cette anomalie elle envoie le brin dans son site 3 a 5 vers le bas.

43
Q

Dommage ADN

A

Facteur intrinsèque: erreur de replication, métabolisme (produit métaboliser, dérive de l’oxygène). Facteur extrinsèque: rayon UV, rayon ionisant, produit chimique. Danger: arrêt de la replication (trop grand dommage. sénescence, apoptose, nécrose), mutation: changement permanent dans la séquence, perte de fonction de gène, cancer. Type: mauvais appariement de base, base modifier chimiquement (oxydation, depurination), dimere de pyrimidine (t-t ou C-C), cassure du lien phosphodiester. Les type de mécanisme de réparation étend des dommage. Les dommage sont détectés par la cellule: changement de structure, blocage polymerase, extrémités 5-3 libre, détection ADN dommage.

44
Q

Système impliqué dans la réparation (5)

A

NER: réparation par excision de nucleotide: dimere de pyrimidine, base modifier qui déforment l’hélice. BER: réparation par excision de base: mesappariment avec U ou TG base modifier. MMR: réparation de mauvais appariement: mesappariment apres replication. HR: recombinaison homologue: bris double brin, fourche de replication bloqué. NHEJ: jonction non-homologue: bris double brin.

45
Q

Système de réparation, NER

A

Réparation par excision des nucleotide. Sert à réparer les lésions volumineuse: dimere de pyrimidine. Une section de plusieurs nucleotide est enlever dans le brin autour d’une lésion. Deux voie de détection: voie couplée a la transcription: ou les gêne activement transcrit sont réparer en priorité de façon concomitante a la transcription. Voie globale: moins efficace, s’occupant du reste du génome.

46
Q

Étape du NER

A
  1. Reconnaissance du dommage. 2. Déroulement d’une région englobant le dommage. 3. Clivage par hydrolyse. 4. Excision des nucleotide. 5. Polymérisation. 6. Ligation
47
Q

Système réparation MMR

A

Sert à réparer les erreur de replication laisse par ADNpoly. Mesappariment AC TG. La machinerie détecte le brin mère et modifie le brin fille apres la replication. La reconnaissance s’effectue par des protéines qui détecte la structure ADN. Les mesappariment cause un changement d’angle. Les heterodimere MSH2 et MSH6 ou MSH2 et MSH 3 se lie au mesappariment. Nouveau brin fille dégradée par la nucléase EXO1 5 a 3

48
Q

Système de réparation NHEJ et HR

A

NHEJ fait l’union des extrémités, efficace mais risque d’erreur et HR sert à réparer les cassure double brin, fait une copie d’un brin homologue, difficile mais moins erreur

49
Q

L’expression des gêne

A

Le lien entre le genome et la fonction des protéines. DOGME: ADN ARN protéines. Transcription: action de polymerase de ARN a partir de ADN. Traduction: action de polymérisation acide amine en protéines a partir de ARN. Mécanisme de regulation pas exprimé en meme temps, surtout contrôle de la transcription.

50
Q

ARN

A

Deoxyribose pas ribose, uracine pas thymine. Simple brin, peut prendre différentes forme. ARN bactérien: contient plusieurs structure, boucle, tige. Contient des appariement UG, base modifier.

51
Q

Fonction ARN

A

Plusieurs fonction, activité enzymatique, moins versatile que les protéines. ARNt: traduction, incorporation a-a. ARNm: transporte info ADN vers le cytosol vers traduction, long fil. ARNr: fait la traduction, dans le ribosome positionne ARNm et t.

52
Q

Transcription ADN en ARN

A

Polymerase sont capable de synthétiser de ARN a partir de ADN en utilisant des ribonucleoside tri-phosphate. Synthèse d’un seul brin ARN a la fois. Synthèse peut se faire de lun ou lautre des brin ADN, mais toujours dans la meme direction 5-3. Les ribonucleoside tri phosphate sont les précurseur utiliser dans la polymerase. Ils sont complémentaire a la matrice ADN, le 5P du nucleotide entrant réagit avec le 3OH du nucleotide de ARN en élongation. Libération de pyrophosphate suivie de son hydrolyse en 2 phosphate inorganique.

53
Q

Mécanisme de transcription

A

Initiation:Liaison de la polymerase au promoteur, ouvrir les brin en fusion ADN, forme bulle, ajout deux nucleotide. Élongation: fait la synthèse de ARN a partir de la matrice. Terminaison: rencontre sequence de terminaison et relache ARN

54
Q

Régulation de la transcription

A

Les gêne ont une région promotrice qui permet la liaison de ARNpol. Les polymerase sont incapable de trouver le promoteur toute seule, elle ont besoin de facteur de transcription.

55
Q
  1. Initiation de la transcription. ARN pol 11
A

Promoteur: il existe dés élément dans les promoteur Eucaryote qui aident a positionner la polymerase. Ces élément sont reconnu par des facteur généraux de transcription. TF11D: TBP et TAF reconnaît et lie la boite TATA et certain TAF peuvent lier d’autre région comme l’initiateur.
TF11A: stabilise le contact TBP-ADN
TF11B: sélectionne le site d’initiation de la transcription, oriente ARN pol11
TF11F: se lie directement a la Pol11, facilite l’ouverture de la bulle de transcription
TF11E: aide a maintenir la bulle de transcription ouverte, interagit avec TF11H
TF11H: 9 sous unité, trois activité enzymatique: kinase, helicase, ATPase

56
Q

Régulation de l’initiation de la transcription

A

L’es élément de contrôle sont lie par des activateur de transcription. Chaque activateur possède son site de liaison spécifique dans lADN. Le rôle des activateur est de recruter la machinerie de transcription et la stabiliser au promoteur. Certain élément de contrôle possède plusieurs élément de réponse, on appelle ces site amplificateur. Structure: domaine de liaison (plusieurs famille, reconnaissance dune séquence spécifique), région d’activation ( interaction avec un ou des composant de la machinerie de transcription), domaine de dimerisation (permet l’association de facteur en dimere)

57
Q

Région d’activation, transcription

A

Type de région d’activation: acide, riche en a-a Gln et pro. Forme des interaction protéine-protéines avec les composant de la machinerie et permettent le recrutement de proteine sur ADN recrute des co-activateur pour aide a ouvrir ADN. Mécanisme d’activation: l’activateur sert de pont entre ADN et la machinerie de transcription: recrutement de ARN pol11, facteur généraux de transcription, enzyme de remodelage de la chromatine, enzyme de modification des histone. L’es élément peuvent controler le promoteur par la formation de boucle ADN.

58
Q
  1. Élongation de la transcription
A

Phosphorylation de CTD de ARN pol 11 par TF11H et PTEFb: le CTD est une longue chaine de peptidique répétée. Signale la transition de l’initiation vers l’élongation. CTD phosphoriser est une plateforme d’interaction pour les facteur de maturation de ARN. Plusieurs facteur restent au promoteur, autre suivent la pol en élongation.

59
Q

Maturation ARN

A

La maturation de ARN messager arrive en meme temps que l’élongation. Ajout dune coiffe en 5´, epissage des exon, les intron sont excisées. La terminaison de la transcription arrive en meme temps que l’étape de maturation finale, quand ARN pol11 rencontre le site AATAA: clivage de ARN. Ajout dune queue poly-A en 3´(AAAAA). C’est pas la phosphorylation du CTD que la maturation est couplée à l’élongation. Coiffe: en 5, protège l’extrémité contre la dégradation, permet la traduction de ARNm. Epissage: implique la formation d’un lien phosphodiester non-conventionnel, formation d’un lasso, jonction de l’extrémité 3 de premier exon à l’extrémité 5 du deuxième, lasso est détruit, les deux exon sont ensemble. Epissage alternatif: production de plusieurs sorte de polypeptide a partir d’un meme gène, dans des cellule différente ou en réponse a des signaux distincts. Ajout de la queue: poly-A, accompli par un complexe de protéines comprenant: protéine reconnaissant le site de germination, endonuclease qui coupe ARN, poly-A polymerase. La queue poly-A est ensuite liée par des protéines. Fonction: protège extrémités 3 de ARNm, permet la traduction

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