Final Flashcards
Définition de métabolite primaire ?
Impliqué dans de nombreux reactions débits élevée
Définition de métabolite secondaire ?
Métabolite qui ne sert plus à des réactions (et qui est souvent excrété ) débit faible
Généralement, que sont ces métabolites secondaires ?
Colorants , toxines , odorants
Comment sont produits les métabolites de luxe et comment sont ils hiérarchisés ?
Produits en petite quantité
Hiérarchisés après les métabolites centraux , primaires
En quelle phase les bactéries produisent elles des métabolites de luxe ?
En phase stationnaire
Quels sont les métabolites de luxe que les bactéries produisent ?
Alcaloïdes, composés phénoliques , huile essentiel, stéroïde
Quand est ce que les antibiotiques sont produits ?
Lorsque les bactéries sont en competition avec d’autres microorganismes
Caractéristiques des anti-biotiques béta- lactame ( groupe chimique , réagit contre quelles bactéries , comment , produites par quel microorganisme)?
Groupe chimique beta lactame
Surtout contre les bactéries gram +
Inhibe la formation de la paroi bactérienne en se fixant aux enzymes de synthèse de la paroi
Produites pas le champignon pénicillium
Caractéristiques des tétracyclines ? ( groupe chimique , réagit sur quelles bactéries , comment , produites par quoi ? )
Groupe chimique polycétides , réagit contre les bactéries gram+ et gram- en inhibant la traduction de fixant à la sous unité 30s du ribosome , produites par les bactéries streptomyces (gram+)
Caractéristiques des macrolides ( groupe chimique , réagit sur quelles bactéries , comment , produites par quoi ? ) quand est ce qu’elle est appliquée ?
Groupe chimique polycetides couplé par glucides , contre les bactéries (gram-, spectre plus large que penicilline), inhibe la traduction en se fixant sur la sous unité 50s , produites par les streptomyces , appliquée en cas d’allergie contre les b- lactame a
C’est quoi FAS?
Fatty acid synthase , acide gras synthase , est une grande enzyme avec de multiples sites actives dans des domaines différentes , dont l’activité comprend plus ou moins toutes les étapes
Le fait que la FAS effectue 7 tours pour du substrat acetyl-CoA/malonyl-CoA d’un acide gras , l’acide palmitique , l’enzyme fait partie de quel type d’enzyme ?
C un enzyme itératif
Quels sont les autres enzymes à multiples domaines , de façon itératives, fonctionnent comme FAS?
Il y a le NRPS (non ribosomal peptide synthase)
PKS( polyketidesynthase)
Quels types de métabolismes synthétisent les NRPS et comment sont ils , s’ils sont synthétisés de façon itérative ?
Des métabolismes secondaires circulaires
Ils sont aussi symétriques
Au lieu de passer plusieurs fois par la même enzyme de façon itérative , qu’est ce qu’on peu faire d’autre ?
On les enchaînes plutôt dans une chaîne de production linéaire modulaire , on obtient plus de possibilité de variations
Le produit peut alors être irrégulier comme la cyclosporine
Quelle enzyme utilise aussi le système de chaine modulaires et qu’est ce qu’elle synthétise?
Le PKS , synthetises les tetracycline et macrolides
Exemple de modules d’enzymes à multiples domaines ?
DEBS qui synthétisent le précurseur de l’erythromycine
Quels sont les antibiotiques que synthétisent les NRPS et les PKS ?
NRPS: vancomycine, actinomycine, cyclosporine, cyclostatique ou Bleomycine, des pigments et des toxines
PKS : tétracycline, macrolides , antifongiques (amphotericine), rapamycine , lovastatines , aflatoxines
Caractéristiques d’aminoglycosides / aminosides ? (Groupe chimique , réagit contre quoi , comment , produit par quoi )
Groupe chimique :2à 5 glucides aminés , réagit contre les bactéries gram - et mycobacterium tuberculosis
Inhibe la traduction en se fixant sur la sous unité 30s , produites par les actinomycètes
Par quoi est favorisé l’apparition des souches résistantes ?
Par l’utilisation inadéquate de l’antibiotique ( sous-dosage)
Par l’utilisation très répandu de l’antibiotique , par exemple dans l’élevage du bétail
Qu’expriment les gènes de résistance et qu’est ce que cela permet ?
Ils expriment des protéines permettant d’extraire l’antibiotique, détruire l’antibiotique ou modifier la cible de l’antibiotique
Dans le cas de destruction de l’antibiotique , de quoi il s’agit ?
Il s’agit d’enzymes Comme or exemple les penicillinases ( beta- lactamase)
Quel inhibiteur choisir pour bloquer l’action des beta-lactamase ?
L’acide clavulanique ( il n’a pas d’activité d’antibiotique directe )
Quel anti biotique est résistant contre les b-lactamase ?
Imipenem
C’est quoi le noyau b-lactame ?
Azetidinone
Quel est l’avantage des pompes pour l’extraction de l’antibiotique ?
Elles transportent tout une classe de métabolites et de xénobiotiques , même principe que celui des transporteurs ABC connu comme MDR
Que fait ABC connu comme MDR ?
Rend les cellules tumorales résistantes à la chimiothérapies
Comme se fait la résistance par modification des cibles ?
Cela peut être une mutation ( par exemple cibles ARN) , une protéine protectrice (bloque l’accès à l’antibiotique) ou l’utilisation d’autres composes dans la paroi bactérienne
C’est quoi un microbiome ?
La totalité des microorganismes associés à un hôte
Que peut être un microbiome ?
Il peut être symbiotique, commensal ou pathogénique
De quoi est composé le microbiome ?
De 10.000 espèces , qui contiennent 100 fois plus de gène que le génome humain
Quel est l’état du microbiome ?
Il est plastique mais retourne à un état de base qui diffère selon les espèces et les individus peut-être
Quelles sont les espèces qui dominent dans le microbiome ?
Les firmicutes et les bacteroidetes
Que sont les firmicutes ?
Souvent gram positive , aerobes , don’t clostridia, bacilli
Que sont les bacteroidetes?
Souvent gram negatives , ne forment pas de spores , anaerobes ou aerobes , présent dans l’environnement, eau , sol , animaux ….
Le microbiome adulte est stable et retourne à l’état de base suite à des modifications passagers? Vrai ou faux
Vrai
Qu’est ce qui joue un rôle dans la stabilité du microbiome?
Cecum/appendix
Que contient l’appendice en cas de diarrhée?
Inoculum pour la reconstitution d’un microbiome sain
Quelles sont les fonctions du microbiome gastro-intestinal?
Fonctions bénéfiques (colonisation , métabolisme , pres digestion, éducation immune , production de vitamines )
Fonctions nuisibles ( pas de colonisations , microbes pathogéniques, modulation immune
Quels sont les principaux aspects métaboliques du microbiome ?
Production de vitamines
Modulation du métabolisme des acides biliaires
Digestion des carbohydrates non digestifs
Production de SCFA
C’est quoi vitamine ?
Metabolite essentiel qui ne peut pas être synthétisé par l’organisme, doit être pris avec la nourriture
Quelles vitamines sont produites par le microbiome ?
Le microbiome produit presque toutes les vitamines hydrosolubles ( vitamine B surtout vitamine B12 , la cobalamine) et la vitamine K
Où se trouvent les vitamines de la nourriture et celles produites par le microbiome ?
Les vitamines de la nourriture sont absorbés dans l’ileum, celles produites par le microbiome sont dans le colon (sauf chez les ruminants