Fin cours 2 :P Flashcards
Décris les étapes du démantèlement du manteau de clathrine.
- L’auxiline lie la clathrine aux points vertex.
- L’auxiline recrute et active Hsc70, une protéine chaperonne avec une activité ATPase.
- L’hydrolyse de l’ATP provoque le désassemblage du manteau.
L’auxiline a des domaines qui lient …
- La membrane
- La clathrine
- Hsc70
Hsc70 a des domaines qui lient …
et un autre domaine important qui est …
- La clathrine
- L’auxiline
- Domaine ATPase ou NBD
Quel manteau est utilisé pour le transport d’enzymes lysosomales vers les endosomes?
Vésicule à manteau de clathrine, GGA et AP1.
Quelle étiquette permet le transport du TGN aux endosomes et quel récepteur la reconnait?
Mannose-6-phosphate (M6P), reconnu par le récepteur au M6P.
Décris les grandes étapes du transport des enzymes lysosomiales vers les endosomes jusqu’au retour au point de départ.
Dans le TGN :
- Ajout de P-GlcNAc sur des précurseurs d’hydrolase lysosomiales couplés au mannose.
- Exposition du signal M6P et liaison au récepteur au M6P.
Cytosol :
- Vésicule de transport avec un manteau clathrine, GGA, AP1.
Endosome :
- Fusion de la vésicule démantelée à l’endosome précoce.
- Dissociation dûe au pH acide causé par la pompe H+ ATPase, retrait du phophate. Maturation de l’endosome éventuellement.
-Bourgeons avec les récepteurs au M6P.
Cytosol :
- Rétromers rapportent les récepteurs au TGN.
Ou sont fait les précurseurs des enzymes lysosomiales?
RE
Vrai ou Faux : AP2 peut lier ARF
Faux
GGA et AP1 ont des sites de liaison pour …
- PI4P (TGN)
- Récepteurs cargos
- ARF1
- Clathrine
Quelle est la fonction d’ARF1? (Dans vésicules à clathrine)
Petite GTPase qui régule le recrutement et l’activation d’AP1.
Quelles vésicules sont utilisées pour le transport de l’endosome au TGN?
Les rétromers
De quoi est composé un manteau rétromer?
SNX (sorting nexin) et VPS (vacuolar protein sorting).
Quelle est la particularité de la forme des rétromers?
Ça forme des genres de tubules.
SNX peut lier …
- PI3P
- VPS
Dans le rétromer, une protéine est responsable de la courbure grâce à un domaine particulier. Quel est cette protéine et ce domaine?
SNX (sorting nexin) et son domaine BAR.
Le VPS peut lier …
Le cargo et SNX
Les rétromers permettent de recycler …
Les récepteurs au M6P.
Vrai ou Faux : L’endocytose médiée par les récepteurs à la surface cellulaire permet une capture de susbtances précises grâce à des récepteurs spécifiques à la membrane plasmique. Elle permet également l’incorporation de composantes mineures extracellulaires.
Vrai
Quel mécanisme permet d’économiser de l’énergie et d’augmenter l’efficacité de la cellule lors de l’endocytose?
Le mécanisme de triage et de concentration spécifique.
Comment le cargo est-il trié et concentré lors de l’endocytose?
Des signaux d’adressages (motifs) sont présents dans les domaines cytosoliques des récepteurs membranaires, ce qui permet de les diriger dans les puits recouverts d’AP2 et de clathrine.
Ou vont les molécules endocytées? Quel avenir auront-elles?
Les vésicules se fusionnent aux endosomes. Ensuite, les molécules seront triées pour aller soit:
- Vers lysosomes (dégradation)
- Vers la membrane (recyclage)
Quelles sont les 2 fonctions de l’endocytose médiée par les récepteurs à la surface cellulaire?
- Internalisation de composantes essentielles dans la cellule (ex : récepteurs au LDL)
- Internalisation des récepteurs impliqués dans la signalisation (ex : EGFR, GCPR)
Quel est l’effet du blocage de l’internalisation du LDL?
Accumulation de cholestérol dans le sang = athérosclérose = augmentation du risque de crise cardiaque.
Vrai ou Faux : Les récepteurs au LDL sont toujours dégradés, parce que le cholestérol est mauvais pour la santé.
Faux : Les récepteurs au LDL sont toujours recyclés parce que le cholestérol est une composante essentielle des membranes.
À quoi servent les Rab?
Aider la fusion des vésicules aux endosomes, aider la fusion de deux endosomes, aider le triage pour le recyclage ou la dégradation.
Vrai ou Faux : On a besoin de la liaison du ligand et de l’activation de la cascade de signalisation pour internaliser un récepteur.
Vrai
Quelles sont les deux étapes principales pour trier les récepteurs endocytés vers leur dégradation dans le lysosome?
- Ubiquitination du récepteur.
- Cascade de la machinerie ESCRT pour le triage dans le corps multivésiculaire (dans des vésicules intraluminales)
Quel est le point de non-retour pour les récepteurs qui s’enlignent vers leur dégradation dans le lysosome?
Lorsqu’ils sont à l’intérieur des vésicules intraluminales dans le corps multivésiculaire.
Décris les 2 types d’ubiquitination.
- Mono-Ub : 1-4 ubiquitines sur le cargo. Mène à une dégradation par le lysosome (sera reconnu par la machinerie ESCRT)
- Poly-Ub : >4 Ub. Mène à une dégradation par le protéasome.
Décris les étapes pour l’ubiquitination d’un récepteur.
E1 active Ub. E2 lie Ub et le transporte. E3 lie E2 et le substrat à ubiquitiner et transfère l’Ub sur le substrat avec l’aide d’ATP. Ub est liée de façon covalente à un résidu Lys.
Qu’est-ce que l’ubiquitine?
Une protéine (76 aa) ubiquitaire marqueuse de protéines à éliminer. Étiquette de dégradation.
Quels motifs de liaison sont présents sur la machinerie ESCRT pour permettre leur bon fonctionnement?
- Motifs de liaison au PI3P
- Motifs de liaison à l’Ub pour permettre la reconnaissance du cargo.
Décris les étapes en lien avec la machinerie ESCRT.
ESCRT 0 passe le cargo à ESCRT I qui passe à ESCRT II qui passe à ESCRT III. VPS4 désassemble ESCRTIII et le cargo est libéré dans le bourgeon.
Que lient la machinerie ESCRT?
ESCRT-0 : P13P, Ub, ESCRT-I
I : Ub, ESCRT-0 et II
II : PIPn, Ub, ESCRT-1
Je sais pas jcomprends pas cette diapo, ça lie la membrane, le cargo et ils se lient entre eux en gros
Vrai ou Faux : Les vésicules intraluminales nécessitent un manteau.
Faux, c’est la machinerie ESCRT qui déforme la membrane.
Qu’arrive-t-il si un récepteur n’est pas ubiquitiné?
Il peut être internalisé quand même, il ne sera juste pas dégradé.
Comment les produits de digestion sortent-ils du lysosome?
Par des transporteurs.
Décris les étapes de la transformation d’un endosome en lysosome.
- Endosome précoce mature en endosome tardif. Recyclage de membrane et de contenu vers la MP et le TGN (rôle des microtubules).
- pH s’acidifie, ce qui permet la dissociation des ligands et le triage endosomal.
- Les protéines destinées à la dégradation sont internalisées dans les vésicules intraluminales.
- L’endosome tardif mature n’a plus de transport vers la membrane plasmique. Le pH acidifié active les enzymes lysosomiales. Peut fusionner avec un lysosome ou un endolysosome pré-existant.
- Toujours connecté au TGN via un transport vésiculaire ou tubulaire pour fournir des enzymes lysosomiales.
- Endolysosomes maturent en lysosomes une fois leur contenu dégradé, incluant les vésicules intraluminales.
Quelles voies peuvent mener à la dégradation dans le lysosome?
Phagocytose, endocytose, macropinocytose, autophagie.
Décris la voie d’endocytose médiée par les GPCR.
- Après la signalisation, GRK phosphoryle la queue C-ter et la 3e boucle intracellulaire du GPCR avec l’aide d’ATP.
- Ceci augmente l’affinité pour la beta-arrestine, qui vient se lier au site phosphorylé.
- La beta-arrestine recrute AP2, qui recrute la clathrine, qui permet l’internalisation du récepteur.
Vrai ou Faux : Les GPCR sont soit recyclés ou dégradés.
Vrai
Vrai ou Faux : Les GCPR sont recyclé par la voie par défaut.
Faux. Les GCPR ont une voie de recyclage spécifique à ceux-ci.
Comment les GPCR sont-ils recyclés?
Ils ont des séquences de recyclage qui intéragit avec des protéines cytosoliques qui permet un recyclage rapide.
Que se produit-il si une mutation est présente dans la séquence de recyclage d’un GPCR?
Il est transporté au lysosome pour sa dégradation.
Vrai ou Faux : La fusion de la séquence de recyclage d’un GPCR à un autre récepteur est suffisante pour induire son recyclage.
Vrai
Quelles sont les 2 voies de dégradation possibles pour les GPCR?
Voie Ub-ESCRT et Voie GASP et dysbindin (ou voie Ub-indépendante)
Que fait une inhibition de l’ubiquitination pour la majorité des GPCR?
Inhibition de la dégradation
Que fait une mutation des lysines sur les récepteurs?
Une inhibition de l’ubiquitination, donc inhibition de la dégradation.
Que fait une déplétion de la composante ESCRT?
Une inhibition de la dégradation.
Qu’est-ce qui est nécessaire pour la dégradation de la majorité des GPCR?
Ubiquitination et ESCRT.
Pour deux GPCR, l’ubiquitination n’est pas nécessaire pour leur dégradation. Pourquoi?
Ils ont d’autres étiquettes. Ils utilisent la voie GASP et dysbindin (protéines servant d’étiquettes reconnues par ESCRT).
Qu’est-ce que la GRK?
GPCR kinase. Une famille de 6 sérine/thréonine kinases principalement ubiquitaires régulés par le changement de conformation de GPCR ou leur recrutement à la membrane suite à l’activation du GPCR.
Vrai ou Faux :
Arrestine-2 = beta-arrestine/beta-arrestine-1
Arrestine-3 = beta-arrestine-2
Vrai
Vrai ou Faux : la beta-arrestine est seulement présente dans les endosomes.
Faux. Elle est ubiquitaire.
Quels sont les trois rôles de l’arrestine?
- Désensibilisation par découplage des protéines G hétérotrimériques.
- Endocytose pour le recyclage ou la dégradation.
- Signalisation par activation de la voie ERK.
Comment l’arrestine permet-elle la désensibilisation du récepteur?
en lien avec les prots G
En bloquant stériquement la liaison de la protéine G hétérotrimérique. Permet arrêt de la signalisation G-dépendante.
Qu’arrive-t-il s’il n’y a pas d’arrestine?
La signalisation continue. Il n’y a pas de désensibilisation. Pour les récepteurs beta-2 adrénergiques par exemple, il y a une diminution de l’accumulation d’AMPc. Les récepteurs ne seront pas internalisés non plus.
Vrai ou Faux : La signalisation peut aussi se faire à l’endosome, et même au Golgi.
Vrai.
Vrai ou Faux : Peu importe l’emplacement d’un récepteur, sa signalisation est la même.
Faux.
Quels sont les trois types d’agonistes quant à la signalisation biaisée?
- Agoniste non biaisé : active les 2 voies.
- Agoniste biaisé pour la voie des protéines G
- Agoniste biaisé pour la voie beta-arrestine.
Vrai ou Faux : Les protéines G hétérotrimériques peuvent générer un 2e signal une fois dans l’endosome et même au Golgi.
Vrai
Nomme les 4 mécanismes de désensibilisation des GCPR.
- Découplage des GPCR et des protéines de signalisation.
- Internalisation des récepteurs.
- Dégradation des récepteurs.
- Recapture ou dégradation du ligand.
