Familia Myoviridae (Énfasis T4) - Mariana Angulo Mejía Flashcards

1
Q

Familia Myoviridae - Material Genético

A

Clasificación:
- Familia: Myroviriade
- Clase: Caudovirales (Gracias a su cola contráctil)

Genoma:
- 168 kbp (168.000 bp) dsADN concatémero
- Contiene 289 marcos abiertos de lectura → codifica para 289 proteínas diferentes.

Bibliografía:
Yap, M. L., & Rossmann, M. G. (2014). Structure and function of bacteriophage T4. Future Microbiology, 9(12), 1319–1327. https://doi.org/10.2217/fmb.14.91

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Q

Familia Myoviridae - Morfología

A

Imagen: https://www.google.com/url?sa=i&url=https%3A%2F%2Fictv.global%2Freport_9th%2FdsDNA%2FMyoviridae&psig=AOvVaw3gDOvgFQaNTbzc63ia4WpB&ust=1730900980733000&source=images&cd=vfe&opi=89978449&ved=0CBQQjRxqFwoTCKjH3eGqxYkDFQAAAAAdAAAAABAE

Cabeza prolata:
- 1150 Å de largo y 850 Å de ancho

Cola contráctil:
- 925 Å de largo y 240 Å de diámetro

Placa basal hexagonal:
270 Å de largo y 520 Å de diámetro

Fibra de colas largas (LTF - Long tail fibers):
- 6 fibras de 1450 Å de largo

Fibra de colas cortas (STF - Short tail fiber)
- 6 fibras de STF

Bibliografía:
Häuser, R., Blasche, S., Terje Dokland, Haggård-Ljungquist, E., Brunn, A. von, Salas, M., Casjens, S., Molineux, I., & Uetz, P. (2012). Bacteriophage Protein–Protein Interactions. Advances in Virus Research, 219–298. https://doi.org/10.1016/b978-0-12-394438-2.00006-2

Yap, M. L., & Rossmann, M. G. (2014). Structure and function of bacteriophage T4. Future Microbiology, 9(12), 1319–1327. https://doi.org/10.2217/fmb.14.91

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3
Q

Familia Myoviridae - Nicho ecológico (hospederos)

A

Hospederos primarios:
- E. Coli y especies de Shigella estrechamente relacionadas.
- Infectan estas bacterias al estirar su cola contráctil y perforan la pared celular de la bacteria para inyectar su matarial génetico.

Bibliografía:
F. Tétart, F. Repoila, C. Monod, & Krisch, H. M. (1996). Bacteriophage T4 Host Range is Expanded by Duplications of a Small Domain of the Tail Fiber Adhesin. Journal of Molecular Biology, 258(5), 726–731. https://doi.org/10.1006/jmbi.1996.0281

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4
Q

Familia Myoviridae - Enfermedades asociadas

A
  • Este es un virus que infecta bacterias. Por lo tanto, no son nocivos para los seres humanos.
  • Es un bacteriógafo que puede unirse de manera eficiente a la bacteria E.Coli para inyectar su material genético. Al unirse, es capaz de infectarla y matarla.
  • Se han encontrado concentraciones de bacteriófagos T4 en el cuerpo humano sin ser nocivos:
    - Altas concentraciones en el
    colon.
    - Bajas concentraciones en el
    intestino delgado.
    - No se encontraron en la
    sangre ni en el hígado. (Denou
    et al., 2009)

Bibliografía:
Bryan, D., Ayman El-Shibiny, Hobbs, Z., Porter, J., & Kutter, E. M. (2016). Bacteriophage T4 Infection of Stationary Phase E. coli: Life after Log from a Phage Perspective. Frontiers in Microbiology, 7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.01391

Denou, E., Bruttin, A., Barretto, C., Ngom-Bru, C., Harald Brüssow, & Zuber, S. (2009). T4 phages against Escherichia coli diarrhea: Potential and problems. Virology, 388(1), 21–30. https://doi.org/10.1016/j.virol.2009.03.009

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5
Q

Familia Myoviridae - Datos interesantes!

A

Tratamiento:
- Fago terapia: Al infectar a bacterias, pueden ayudar con la crisis de resistencia antibiótica. (Ryan et al., 2012). Sin embargo, no se cree que podrán reemplazar en su totalidad a los antibióticos. En un futuro se espera que, aquellas cepas resistentes a los antibióticos, sean tratadas con un coctel de fármacos que mezcla antibióticos y fago terapia. (Skurnik, 2022)

  • Terapia genética: Gracias a su gran tamaño a comparación de otros virus, tiene la habilidad de transportar ADN y proteínas a otras células. (Rao & Zhu, 2022).

Bibliografía:
Skurnik., M (2022). Can Bacteriophages Replace Antibiotics? Antibiotics, 11(5), 575–575. https://doi.org/10.3390/antibiotics11050575


Rao, V. B., & Zhu, J. (2022). Bacteriophage T4 as a nanovehicle for delivery of genes and therapeutics into human cells. Current Opinion in Virology, 55, 101255–101255. https://doi.org/10.1016/j.coviro.2022.101255

Ryan, E. M., Alkawareek, M. Y., Donnelly, R. F., & Gilmore, B. F. (2012). Synergistic phage-antibiotic combinations for the control ofEscherichia colibiofilmsin vitro. FEMS Immunology & Medical Microbiology, 65(2), 395–398. https://doi.org/10.1111/j.1574-695x.2012.00977.x

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6
Q

Familia Myoviridae - Conceptos desconocidos

A
  • dsADN/dsDNA (Double stranded DNA)
    Material genético genético de un virus compuesto por ADN de doble cadena. (D. Bastia, 2013)
  • Marcos abiertos de lectura – Open Reading frames:
    Secuencia de codones adyacentes que empieza con un codón de inicio (AUG), seguido por una sección de codones para aminoácidos y un codón que señaliza el final. Esta secuencia tiene el potencial de transformarse en una proteína. (Sieber et al., 2018)
  • Å - Angstrom:
    Unidad de longitud = 10^(−10) o 0,1 nm. Se utiliza para medir magnitudes moleculares y atómicas. (Britannica, 1998)

Bibliografía:

Britannica. (1998). Angstrom (Å) | Definition, Uses, & Facts. Encyclopedia Britannica. https://www.britannica.com/science/angstrom

D. Bastia. (2013). Replication Origin Sequences. Elsevier EBooks, 164–167. https://doi.org/10.1016/b978-0-12-374984-0.01099-8

Sieber, P., Platzer, M., & Schuster, S. (2018). The Definition of Open Reading Frame Revisited. Trends in Genetics, 34(3), 167–170. https://doi.org/10.1016/j.tig.2017.12.009

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7
Q

Aunque infecta únicamente a las bacterias, ¿Es común encontrar a estos virus en la micro biota de los animales? | Julian Villate

A

Encontrar a los Myoviridae en la microbiota de los animales no es muy común. Al infectar únicamente a bacterias, su presencia en la microbiota animal dependería, en su totalidad, si la persona está infectado por los huéspedes bacterianos específicos que ataca Myoviridae, como lo sería E.Coli. (Das et al., 2018)

Bibliografía:
Das, S., Dutta, M., Sen, A., & Ghosh, A. N. (2018). Structural analysis and proteomics studies on the Myoviridae vibriophage M4. Archives of Virology, 164(2), 523–534. https://doi.org/10.1007/s00705-018-4100-7

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8
Q

Podrías explicarnos que es un ADN concatémero? gracias - Karen Atehortua

A

El ADN concatemérico (también conocido como concatameric DNA), es una molécula de ADN que contiene múltiples secuencias de los mismos nucleótidos, una tras otra. (Moxley et al., 2003).

Bibliografía:
Moxley, R. A., Jarrett, H. W., & Mitra, S. (2003). Methods for transcription factor separation. Journal of Chromatography B, 797(1-2), 269–288. https://doi.org/10.1016/s1570-0232(03)00609-3

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9
Q

Laura Sánchez
En cuanto a la morfología se sabe que la función de la cola contráctil se encarga de perforar e introducir su material genético en el hospedero ¿La cabeza prolata posee alguna función fundamental específica?

A

La estructura del T4 se separa en tres vías independientes: la cabeza prolata, la cola contráctil y las fibras de cola largas (LTF). La cabeza prolata transporta y encapsula a las 168 kbp del dsADN. Cuando el virus inyecta su ADN en la bacteria, la cabeza prolata transporta el ADN a través de la cola contráctil para poder introducir su material genético en la bacteria.

Bibliografía:
Yap, M. L., & Rossmann, M. G. (2014). Structure and function of bacteriophage T4. Future Microbiology, 9(12), 1319–1327. https://doi.org/10.2217/fmb.14.91

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