Examen 3 (Biologie moléculaire) Flashcards
Transcription:
Synthèse d’un ARN à partir d’une portion d’ADN appelée gène.
La réaction enzymatique de la synthèse d’ARN est catalysée par:
Une ARN polymérase
Est-ce que la transcription nécessite un amorce:
Non
Élongation se produit où:
A l’extrémité 3’ OH
La condensation se fait à partir:
D’un substrat activé (ATP, UTP, GTP, CTP)
Condensation:
Forme une liaison ester entre la fonction alcool libre du carbone 3’ et la fonction acide de son phosphate. Il y a libération d’une molécule d’eau.
Quelle est la réaction inverse de la condensation:
Hydrolyse de la liaison ester.
Quelle est la vitesse d’incorporation des nucléotides dans l’ARN:
20 fois supérieure à celle de l’ADN
Quel est le site de la transcription et de la traduction:
- procaryotes
- cytoplasme
- eucaryotes
- transcirption dans le noyau
- traduction dans le cytoplasme
ARN polymérase chez les procaryotes:
Le même ARN polymérase synthétise les différents types d’ARN (ARNm, ARNt, ARNr).
ARN polymérases chez les eucaryotes:
- ARN polymérase I: synthétise l’ARN ribosomique
- ARN polymérase II: synthétise les ARNm
- ARN polymérase III: synthétise la plupart des petits ARN
Où se trouve le promoteur:
Situé en amont (du côté 5’) du site ou commence la transcription de l’ARN.
Où est le site de liaison avec l’ARN polymérase:
Le promoteru
Le promoteur détermine:
- lequel des deux brins servira de matrice
- dans quelle direction l’ARN polymérase effectuera la synthèse
Séquences consensus chez les procaryotes:
- TTGACA
- TATAAT (boite de Pribnow)
Les deux séquences consensus chez les procaryotes sont séparés de:
15-19 nucléotides
Où se trouve la premiere séquence chez les procaryotes:
35 paires de nucléotides en amont du site d’initiation de la transcription
Quel est la séquence consensus chez les eucaryotes:
TATA box
Où se trouve la TATA box:
Situé 25 nucléotides en amont du site initiateur.
Comment on détermine le sens de la transcription chez les eucaryotes:
Si la boite CAAT est en amont de la boite TATA, il est le brin sens
Comment se fait la terminaison de la transcription:
- Il y a des facteurs reliés à la polymérase qui reconnaissent sur le brin antisens une certaine séquence
- cette séquence est suivi d’un autre signal qui libère l’ARN polymérase
- la transcription s’arrête peu après le premier signal
- L’ARN polymérase se détache de l’ADN et libère le transcrit primaire et la double hélice se referme
Quels sont les différents modification possible de l’ARN:
- enzyme coiffante
- queue poly A
- édition
- excision-épissage
Enzyme coiffante:
Coiffe cap protège les ARNm des exonucléases et des phosphotases en dissimulant leur extrémité 5’ terminale.
Où se trouve l’enzyme coiffante:
C’est la première modification après environ 30 nucléotides de long.
L’enzyme coiffante est constitué de:
Un minimum d’un GMP.
Où se trouve la queue poly A:
A la fin d’un gène eucaryote.
Rôle de la queue poly A:
- signal la fin de transcription UAUGUUUC
- une endonucléase clive la fin du transcrit dix à quinze nucléotides envrion après un autre signal AAUAAA (boite de polyadénylation ou boite Poly A)
Édition:
Des enzymes peuvent éditer la structure primaire du transcrit en modifiant certaines bases.
Excision-épissage:
Étape de maturation des ARNm au cours de laquelle les introns sont éliminés de la structure et les exons sont liés les uns aux autres.
Qu’est ce qui est la base de la différenciation tissulaire chez les eucaryotes:
L’expression des gènes.
La régulation de l’expression d’un gène se fait lors:
- la transcription (controle transcriptionnel)
- maturation du transcrit
- traduction (controle traductionnel)
- l’activation de la protéine mature (controle post-traductionnel)
Rôles des protéines régulatrices:
- active la transcription
- inhibe la transcription
- se lient à de courtes séquences d’ADN
Quels sont les synonymes de protéines régulatrices:
- ADN: cis-régulateurs
- protéines: trans-régulateurs
Quelle est la grosseur des séquences régulatrices:
Habituellement moins de 20 nucléotides.
Quel est la longueur des palindromes:
Ceux reconnu par les enzymes de restriction sont généralement constitués de séquences de 4-8 bp.
Quel est le plus grand groupe de facteurs de transcription chez les eucaryotes:
Domaine zinc
La __________ est la copie d’une molécule d’____________ en une molécule d’_____________.
Transcription
ADN
ARNm
La transcription qui est en fait une réaction de polymérisation n’est possible que par la présence d’une enzyme: l’_________.
ARN polyméraseq
L’ARN polymérase ne sait pas où amorcer le processus de transcirption. Elle se fixe donc sur une séquence particulière d’ADN appelé un ___________, qui est situé en __________ du gène à transcrire.
Promoteur
amont
La liaison entre l’ADN et l’ARN polymréase permet d’une part d’ouvrire la double hélice et d’autre part de catalyser l’insertion des ___________ triphosphates pour former un brin d’ARN.
Ribonucléosides
Un seul des 2 brins est copié en ARN messager. Par définition, le brin _________ est le brin d’ADN qui a la même séquence que l’ARN messager, on parle également de brin _________, il ne sert pas de brin-matrice de lecture à l’ARN polymérase.
Sens
Non-transcrit
Le brin__________ est le brin opposé, on parle de brin _________, il sert de brin-matrice de lecture à l’ARN polymérase.
Anti-sens
Transcrit
Le mécanisme de la transcription, bien que similaire, est pourtant beaucoup plus complexe chez les ____________.
Eucaryotes
De nombreuses protéines sont nécessaires à l’initiation de la transcription et différentes polymérases assurant la transcription des différentes ___________.
Gènes
L’ARN polymérase ____________ est employée pour synthétiser tous les gènes codants les protéines.
II
On retrouve aussi chez les eucaryotes un phénomène de maturation de l’ARN. Le transcrit primaire contient des séquences codantes appelées _________, interrompues par des séquences non codantes appelées ___________.
Exons
Introns
Les introns sont transcrits mais non _________.
Traduits
Les extrémités de l’ARN sont différentes chez les eucaryotes. On retrouve un ______ à l’extrémité 5’ et une ___________ en 3’.
CAP
queue poly A
La molécule d’ARN directement synthétisée à partir du modèle ADN reste dans le noyau et est traitée par un complexe enzymatique qui enlève tous les introns. C’est ce qu’on appelle l’____________ ou splicing.
excision-épissage
La cellule procaryote est capable de régler le taux de transcription dépendamment de ses besoins. Si besoin est, la cellule déclenche l’activation de la __________ produisant ainsi des ARNm qui seront traduits en protéines.
Transcription