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Microbiologie > Examen 3 > Flashcards

Examen 3 Flashcards

1
Q

Les groupes taxonomiques sont définis comme des ____________

A

Taxons

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Q

Le but de la taxonomie est d’(a) ___________ des (b) ___________ naturels d’organismes présentant des (c) caractères (c) ______________

A

a) établir
b) groupes naturels
c) communs

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3
Q

Sur quoi est basée la taxonomie ?

A

sur la proportion des caractères communs

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4
Q

Vrai ou faux? Un organisme peut faire partie de deux taxons.

A

Faux, un seul taxon –> taxonomie = non-chevauchante

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Q

Donner les taxons du plus grand au plus petit.

A 
Domaine
règne
sous-embranchement
embranchement
classe
ordre
famille
espéce
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6
Q

Quels sont les utilités de la taxonomie ? (3)

A
  1. identification (description + caractérisation)
  2. nomenclature (noms)
  3. classification (arrangements et relations inter-groupes)
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7
Q

Qu’est-ce qu’une souche (isolat) ? + exemple

A

Tous les descendants d’une culture pure, ex.: culture pure de Legionella pneumophila provenant d’un cas de Légionellose à Québec (2013)

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8
Q

Une espèce est un groupe de souches dont les caractéristiques sont _________ identiques

A

presque

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9
Q

Qu’est-ce qu’un taxon de base?

A

groupe homogène différent des autres groupes

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10
Q

Comment nomme-t-on la 1re souche qui possède toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce?

A

souche-type

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11
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type morphologique? + exemples (4)

A
  • taille, forme, arrangement
  • structure cellulaire
  • membrane (types de lipide, alcools…)
  • paroi cellulaire (polysaccharides, peptidoglycanes)
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12
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type physiologique? + exemples (2)

A
  • éléments nutritifs: exigences nutritionnelles = milieu de culture, source de C, facteur de croissance
  • conditions d’incubation = Température, O2, lumière
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13
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type métabolique? + exemples (2)

A
  • produits finaux de la fermentation (indentification et qté)
  • enzymes extracellulaires (protéases, exotoxines, hémolysines)
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14
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type génétique? (7)

A
  • composition G+C% (G+C% augmente = Tm [température de fusion] augmente)
  • Spectrophotomètre UV (260 nm)
  • Séquences nucléotidiques
  • nombre de chromosomes
  • plasmides
  • taille, nombre, gènes plasmidiques
  • caractéristiques non-essentielles ( ex.: production toxines, résistance antibiotiques)
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15
Q

Donnez deux exemples de composition G+C%

A

plantes et animaux = 30-50%

M-O = 25-80%

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16
Q

La composition G+C% est-elle exclusive à l’espèce?

A

Non, valeur typique mais pas exclusive

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17
Q

Vrai ou faux? Les valeurs intragenre de G+C% peuvent varier beaucoup ?

A

Faux, elles sont très similaires

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18
Q

Qu’est-ce qu’une plasmide?

A

molécule d’ADN extrachromosomique circulaire chez les organismes bactériens et archae

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19
Q

Une plasmide est une molécule ____________

A

autoréplicative

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20
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type “interactions avec l’hôte? + exemples (2)

A
  • pathogénicité (capacité de provoque maladie chez différents hotes, spécificité d’hôte)
  • symbiose (plantes, poissons)
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21
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type écologique? + exemples (2)

A
  • habitat d’où provient l’isolat

- niche écologique

22
Q

(NOMENCLATURE –> IDENTIFICATION) Quels sont les différents caractères de type moléculaire + exemples (5)

A
  • comparaison de séquences protéiques et nucléiques
  • gènes conservés
  • protéines conservées
  • homologie des séquences–> organismes apparentés
  • Hybridation d’acides nucléiques (ADN-ADN) (même espèces, espèces apparentées)
23
Q

Qui s’occupe de l’attribution des noms aux nouveaux organismes?

A

le comité international

24
Q

La nomenclature linnéenne (Carl Von Linnaeus) est dite ___________ car elle utilise 2 mots

A

binominale

25
Q

Quels sont les deux taxons utilisés dans la nomenclature linnéenne ?

A

le genre et l’espèce ex.: Mycobacterium tuberculosis

26
Q

La classification des organismes se fait selon les (a)______________ et permet de voir les (b) _____________

A

a) caractères communs

b) liens évolutifs (déduits)

27
Q

La classification des organismes peut être _______ (4 réponses)

A

1) naturelle
2) phénétique
3) numérique
4) phylogénétique

28
Q

Sur quoi se base la classification “naturelle”?

A

la nature biologique des organismes et l’anatomie

29
Q

Sur quoi se base la classification “phénétique”?

A

Ce qui “parait” = similarité des caractères phénotypiques (morphologiques, métaboliques, génétiques)

30
Q

Sur quoi se base la classification “numérique”?

A
  • comparaison de plusieurs organismes
  • 2 par 2
  • nb de caractères minimum = 50
  • coefficient d’appariement
  • pourcentages de similarité
  • – >nb caract. similaires/nb total de caract. X 100
31
Q

Quelles sont les caractéristiques de la classification numérique? Quelle est sa limite?

A
  • uniforme
  • pertinence biologique
  • non-équivalente
  • présence de capsule vs similarité fonctionnelle de l’ADN polymérase
  • Limite = pondération des caractères
32
Q

Sur quoi se base la classification “phylogénétique”?

A
  • ancêtre commun
  • comparaison d’espèces distantes
  • procaryotes: fossiles utiles rares
  • relations évolutives probables
  • comparaison de séquences de gènes/ protéines conservées
  • chronomètres moléculaires
  • mutations = au hasard
  • ARN ribosomique (régions conservées = essentielles à la fonction) (régions variables = mutations–>n’altérent pas la fonction–> nb de différences proportionnelles au temps depuis la divergence d’un ancêtre commun.
33
Q

Les noeuds dans l’arbre phylogénétique sont des ____________________

A

événements de divergence

34
Q

Les outils bioinformatiques sont en (a) __________ constant et fonctionnent avec la (b) ____________ des séquences génomiques.

A

a) développement

b) disponibilité

35
Q

Classification polyphasique

  • informations __________ et ___________
  • plus complètes
  • remaniements _____________
  • ______________ de la notion d’espèce (ex.: % d’identité des séquences génomiques)
A
  • informations PHÉNÉTIQUES et PHYLOGÉNÉTIQUES
  • plus complètes
  • remaniements CONTINUS
  • RÉ-ÉVALUATION de la notion d’espèce (ex.: % d’identité des séquences génomiques) –> bonobo/chimpanzé/humain = > 99% séquences semblables
36
Q

Linnaeus (1753) = (a) ___ règnes

Haeckel (1865) = (b) ___ règnes

A

a) 2 = animaux, plantes

b) protistes –> bactéries, levures, protozoaires, algues

37
Q 
Whittaker (1969): nutrition + organisation cellulaire
nutrition:
-
-
-
- organisation cellulaire
- 
- 5 \_\_\_\_\_\_ = évolution originelle unidirectionnelle
A 
Whittaker (1969): nutrition + organisation cellulaire
nutrition:
- photosynthèse
- absorption (soluble)
- ingestion (solide)
- organisation cellulaire
- eucaryotes, procaryotes
- 5 RÈGNES = évolution originelle unidirectionnelle
38
Q

Woese = 3 domaines, quels sont-ils?

A

1) Eucarya
[ 2) Bacteria 3) Archaea ] = procaryotes
voies évolutives divergentes

39
Q

Origine des organelles

Donnes les caractéristiques des mitochondries et chloroplastes (4)

A
  • autoréplicatives
  • chromosomes circulaires, uniques
  • Gènes ARNr
  • apparentés aux eubactèries
40
Q

Théorie de l’endosymbiose
Des (a) __________ seraient ancêtres des mitochondries
alors que des (b) __________ seraient ancêtres des chloroplastes

A

a) bactéries (respiration cellulaire)

b) cyanobactéries (photosynthèse)

41
Q

Vrai ou faux ? Les archaes ont une diversité morphologique et physiologique élevée

A

vrai

42
Q

Nommes les types de reproduction des archaes (3)

A

fission binaire, bourgeonnement, fragmentation

43
Q

les archaes vivent dans des environnements __________ et _________ extrêmes

A

aquatiques et terrestres

44
Q

Les archaes sont faciles ou difficiles à cultiver?

A

difficile

45
Q

La paroi cellulaire des archaes

  • fonctions similaires
  • pseudomuréine, autres ________ ou ___________
  • Gr+ : _________ , _________ , ___________
  • Gr- :
  • Couche de protéine ou de ___________
  • présence de __________ externe (sauf exception)
A

La paroi cellulaire des archaes

  • fonctions similaires
  • pseudomuréine, autres POLYSACCHARIDES ou PROTÉINES
  • Gr+ :ÉPAISSE , UNIFORME , RIGIDE
  • Gr- : COUCHE S ATTACHÉE À MEMBRANE CYTO
  • Couche de protéine ou de LIPOPROTÉINES
  • présence de MEMBRANE externe (sauf exception) –> quelques espèces sans paroi
46
Q

Nommez les caractéristiques de la membrane cytoplasmique des archae ? (5)

A
  • fonctions similaires
  • lipides différents
  • alcools
  • monocouche augmente rigidité
  • lipides diff –> ex.: thaumarcéol indicateur de thaumarceota dans le picoplancton
47
Q

Génétique et biologie moléculaire chromosomes

1) unique, _________
2) taille est > ou < que eubactéries ?
3) G+C% = ?
4) gênes _______ des eubactéries ( fonctions ________ )
5) Quelques __________
6) Mécanisme d’ _________ d’ADN

A

Génétique et biologie moléculaire

1) unique, CIRCULAIRE
2) taille est < que eubactéries
3) G+C% = 21-68%
4) gênes DIFFÉRENTS des eubactéries ( fonctions INCONNUES )
5) Quelques PLASMIDES
6) Mécanisme d’ ÉCHANGE d’ADN

48
Q

Génétique et biologie moléculaire ribosomes

1) 70S = __________
2) traduction –> _________
3) Abio s –> ribosomes = _________
4) sensibles : ___________
5) résistants : __________ et __________
6) transcription et ___________ = eucaryotes —> supporte arbre de la vie

A

Génétique et biologie moléculaire ribosomes

1) 70S = EUBACTÉRIES
2) traduction –> EUCARYOTES
3) Abio s –> ribosomes =EUCARYOTES
4) sensibles : ANISOMYCINE
5) résistants : KANAMYCINE et CHLORAMPHÉNICOL
6) transcription et RÉPLICATION = eucaryotes —> supporte arbre de la vie

49
Q

Génétique et biologie moléculaire des archaes

Les acides aminés sont ______ et ________

A

rares et uniques

50
Q 
Archées ---> Crenarchaeota
Thermophiles
- \_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_ (source d'O2)
- Habitats = 
- Sulfolobus
- Pyrodictium: \_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_ = 105-110 degrés
- Geogemma = 121 degrés

Psychropiles

A

Archées —> Crenarchaeota
Thermophiles
- ANAÉROBIES STRICTES(source d’O2)
- Habitats = SOURCES SULFUREUSES, PICOPLANCTONS OU SOLFATARES (VOLCANS)
- Sulfolobus
- Pyrodictium: FOSSE ABYSSALE = 105-110 degrés
- Geogemma = 121 degrés

Psychrophiles

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