Examen 2 p.48-71 Flashcards
L’endospore est une organe de ___________ (fonction)
résistance
L’endospore bactérien survient quand les conditions sont
a) propices à la croissance
b) non propices à la croissance
b) non propices à la croissance
Lorsqu’une cellule forme un endospore, y a-t-il duplication de la cellule ?
non, ce n’est pas un mécanisme de duplication ( 1 ⍧ –> 1 endospore –> 1 ⍧)
Quelle structure de l’endospore est responsable de la résistance aux substances toxiques?
La tunique sporale grâce à son imperméabilité
Quels énoncés p/r à la tunique sporale sont vrais?
a) Elle possède plusieurs couches
b) Elle peut constituer de 30 à 60% du poids sec de l’endospore
c) elle est constituée d’un type de peptidoglycane moins ponté (3% de ponts vs 40% PG)
a) et b) sont vrais
c) est faux, c’est un énoncé qui concerne le cortex
Quelles sont les 4 structures de l’endospores en partant de l’extérieur vers l’intérieur ?
L’exosporium, la tunique sporale, le cortex et le protoplaste.
À quoi sert le protoplaste ?
conserver les structures essentielles
Quelles sont les 7 étapes de la sporulation (différenciation)?
- Formation de filament axial
- Formation de septum
- Ingestion de la préspore
- Formation du cortex
- Synth
- Fin de la synthtèse de la tunique (augmentation de réfringence + résistance à la chaleur)
- Lyse du sporange et libération de la spore
Vrai ou faux? La position de l’endospore dans la cellule est typique de l’espèce?
Vrai
Selon les notes, l’endospore permet de résister à 3 choses en particulier, quelles sont-elles?
La température, la pression et les substances toxiques (imperméabilité)
À quoi servent les protéines de l’endospore?
Stabilisation + réparation de l’ADN.
Vrai ou faux? Il y a synthèse de molécule typiques uniques à l’endospore lors de la sporulation?
Vrai
Vrai ou faux ? Le Clostridiumbotulinum (botulisme) peut survivre pendant des heures à 121 degrés, mais seulement 15 minutes à 100 degrés.
Faux, c’est l’inverse (résistance à la chaleur)
La germination des endospores fonctionne par _________ moléculaires.
signaux
Le temps de survie des endospores est-il grand ou petit ?
Énorme –> après 40 M d’années = regermination des endospores d’un intestin d’abeille
Nommez les bactéries formant des endospores (exceptions aussi)
Bâtonnets Gr+, quelques cocci Gr+, quelques Gr- (exceptions)
Changement de section: NUTRITION ET CULTURE DES CELLULES BACTÉRIENNES
On lâche pas ça fait juste commencer ;)
La classification des bactéries peut se faire selon les _______ (a) alimentaires (type trophique), la croissance ou non en présence de _____ (b) et la _________ (c) de croissance
a) exigences
b) O2
c) température
Vrai ou faux? Si la majorité des 12 macroéléments essentiels est présente dans le milieu (éléments majeurs = C, O, H, N, S, P, etc.) , il y aura croissance de la bactérie.
Faux, il est obligatoire d”avoir chacun des 12 macroéléments pour qu’il y ait croissance de la bactérie. 1 seul manquant = Ø de croissance
Est-il nécessaire de s’assurer de la présence des 8 oligoéléments essentiels (éléments mineurs) dans le milieu pour qu’il y ait croissance?
Pas vraiment, les oligoéléments sont nécessaire en très faible qté et on les retrouve déjà en qté suffisante à l’état de traces dans l’eau.
L’assimilation des éléments essentiels se fait en majorité sous forme de ________ (composés)
sels inorganiques (Exceptions = S, N, C, H, O)
Assimilation du souffre (S) se fait sous quelle forme?
Réponse = composé chimique
SO4^2- ou S2O3^2-
exception = archaebactéries méthanogènes (CH4 libéré)–> utilisent le H2S
EXCEPTION les bactéries autres que les archaes méthanogènes assimilent le souffre sous quelle forme ?
acides aminés: cystéine, méthionine.
Sous quelle forme l’azote (N) est-il absorbé ?
NH3
EXECEPTION Sous quelle forme les bactéries fixatrices d’azote (azobacter, Rhizobium) assimilent-elles l’azote?
N2–> NH3
Pour ce qui est du C, H et O, comment sont-ils assimilés?
À partir de matière organique (++Carbone) et de H2O (dégradés par des m-o)
En quoi sont transformé les éléments assimilés? ( deux réponses)
Matière cellulaire + Énergie
Les protéines constituent __ % du poids sec de la cellule bactérienne.
a) 20%
b) 45%
c) 60%
C) 60% du poids sec (protéines très diverses + de 1100 variétés)
Le métabolisme est l’ensemble des réactions chimique cellulaires, soit les réactions de __________ et les réactions de ___________.
catabolisme et anabolisme
À quoi servent les réactions de catabolisme ?
Transformer les nutriments en précurseurs (de nombre restreints et communs à tous les organismes)
Au cours de la réaction catabolique, la cellule utilise ou produit de l’énergie?
Elle produit de l’énergie
Précurseurs + énergie —> _________________ (fonction)
Biosynthèse de macromolécules
Anabolisme:
Intermédiaire +___________ (a) –> biosynthèse de macromolécules –> _____________ (b)
a) Énergie
b) matériel cellulaire
Donnez 4 exemples de fonctions qui utilisent de l’énergie
1) La biosynthèse de macromolécules
2) le transport actif = [nutriments], déchets métaboliques
3) Motilité = déplacement vers nutriments + éloignement des répulsifs
4) maintien de la balance osmotique = [K+] int»_space; [K+] ext
[H+] int. «_space;[H+] ext.
Les types trophiques peuvent être définis selon
1) source d’ ________
2) source de ________
1) énergie
2) carbone
Quelles sont les deux sources d’énergie possibles?
1) énergie chimique (oxydation composés organiques) = chimiotrophes
2) énergie lumineuse = phototrophes
Quelles sont les deux sources de carbone possibles?
1) CO2 = autotrophes
2) molécules organiques (provenant d’autres organismes) = hétérotrophes
Quel nom donne-t-on à un organisme qui utilise le CO2 comme source de carbone et la lumière comme source d’énergie?
Photoautotrophe (ex.: cyanobactéries)
Quel nom donne-t-on à un organisme qui utilise des molécules organiques comme source de carbone et l’oxydation de composés organiques ou inorganiques comme source d’énergie?
chimiohétérotrophe ou chimioorganotrophe
Vrai ou faux? La croissance d’une bactérie aérobie stricte augmente en fonction de la concentration d’O2 du milieu
Faux, une aérobie stricte fonctionne utilise l’oxygène mais lorsque [O2] > 20 %, la croissance diminue (accumulation d’ions peroyde)
Quel est l’accepteur final d’électron pour une aérobie stricte?
L’O2
Qu’est-ce qu’une anaérobie stricte?
Une bactérie qui ne croît pas en présence d’O2 (fait de la fermentation)
a) Quelle est la forme toxique de l’O2 et b) comment est-elle éliminée par la bactérie? **(à l’aide de quel enzyme?)
a) L’ion O2-
b) Grâce à la SOD (superoxydase dismutase), la catalase et la peroxydase
SOD = 2 O2- + 2 H+ --> H2O2 + O2 Catalase = 2 H2O2 --> 2 H2O + O2 Peroxidase = H2O2 + NADH + H+ --> 2 H2O + NAD+
Que se passe-t-il si la peroxydase est absente ou non-fonctionnelle?
accumulation d’ions peroxyde (O2-) –> croissance s’arrête
Comment appelle-t-on une bactérie qui peut croire en présence OU en absence de O2 ?
Une anaérobie facultative
Quel processus métabolique est utilisé par une anaérobie facultative?
La respiration cellulaire ou la fermentation (utilisation du métabolisme le + rentable)
Qu’est-ce qu’un aérotolérant?
bactérie qui peut croître en présence ou en absence d’O2 mais qui fait de la fermentation exclusivement.
Qui suis-je ? Je suis une bactérie qui croît en présence d’une faible [O2] (entre 2 et 10%) et je fais de la respiration aérobie.
une microaérophile
Associez la température de croissance (en degrés celsius) au mot qui lui correspond:
1) Mésophile a) 0-20
2) Psychrotrophe b) 20-30
3) Thermophile extrême c) 20-45
4) Psychrophile d) 45-85
5) Thermophile e) >85
1) c (20-45)
2) b (20-30)
3) e ( >85)
4) a (0-20)
5) d (45-85)
Les pathogènes humains se retrouvent dans quelle catégorie de température de croissance?
Mésophile (Température du corps humain = 37 degrés)
Qu’est-ce qui arrive à un thermophile extrême placé dans un milieu ou T < 80 degrés?
l’organisme meurt
Ou pourrions-nous retrouver des psychrophiles dans l’environnement?
Océans, glace, neige, etc.
Quel est l’objectif d’un milieu de culture?
Augmenter la population
Une culture d’enrichissement permet de_____________?
isoler une espèce
Afin d’isoler un microorganisme, on doit s’assurer que le milieu de culture est ___________
Stérile
Il existe deux types de culture, lesquels ? Quelles sont leurs utilités respectives ?
1) Pure (un seul type de m-o) –> les individus ont tous les mêmes caractéristiques
2) Mixte (plusieurs m-o) –> interactions entre différents m-o = inhibition, compétition, synergisme
Un milieu de culture est composé des éléments nécessaires en quantité suffisante pour permettre la croissance. Quels sont ces éléments?
1) Une source d’énergie et 2) de carbone
3) des facteurs de croissance (précurseurs)–> ex.: vitamines, a.a, purines, etc.
Une culture faite en bouteille, en tube ou en fermenteur est appelée culture en milieu __________
Liquide
Qu’est-ce qui est utilisé pour faire une culture en milieu solide?
un milieu gélosé = plat de Pétri
Quel est l’avantage d’une culture en milieu solide?
On a une grande surface dans un volume restreint et les colonies vont être séparées physiquement
Quel agent gélifiant est le plus souvent utilisé, pour quelle raison ?
L’agar (0,5-1,5%) il est soluble a 100 degrés celsius et se gélifie à 45 degrés. De plus, il n’est pas dégradé par la majorité des m-o.
Quels sont les 4 moyens de stérilisation vus dans le cours + 1 exemple de chaque?
1) par la chaleur (Bec Bunsen = flamme, champs stérile, chaleur sèche = four à l’air chaud, chaleur humide = autoclave)
2) par radiations (rayons gamma, rayons UV)
3) filtration (filtre de nitrocellulose = 0,22um à 0,45um)
4) substances chimiques (gaz stérilisants = oxyde d’éthylène, ozone)
L’efficacité de la stérilisation par la chaleur peut être influencée par la température, la a) ____________, b) l’____________ et le nombre et c) l’________ des m-o.
a) durée d’exposition
b) l’humidité
c) l’état
Quel est l’avantage d’une stérilisation à la chaleur humide vs à la chaleur sèche? Pourquoi est-ce le cas ?
Chaleur humide = plus rapide –> l’humidité rend la chaleur + pénétrante
Vrai ou Faux? La chaleur humide provoque une perte de viabilité des endospores.
Vrai
Donnez un exemple d’utilisation des radiations comme moyen de stérilisation.
Les objets à usage unique (pipettes, pétris) ou encore les plastiques thermosensibles.
Les virus sont-ils retenus par filtration ?
NON –> trop petits
On utilise la stérilisation par filtration pour des liquides a) ____________. b) Pourquoi ?
a) thermosensibles
b) car on ne veut pas les dénaturer
Donnez un exemple de l’utilisation d’ozone comme gaz stérilisant
Pour les instruments chirurgicaux
Nommez deux conséquences possibles d’une mauvaise stérilisation.
1) En laboratoire
2) Dans le milieu médical
1) mauvaise interprétation des résultats
2) Infections
Les deux sont dus à une contamination par des m-o
Dans la nature, la biodiversité des bactéries est-elle
a) peu élevée
b) moyenne
c) élevée
d) extrêmement élevée
d) extrêmement élevée –> ex.1: microflore humaine = 10^5 m-o par éternuement ex.2: microbiote du sol = 10^9 m-o/g
Les méthodes d’enrichissement doivent permettre d’augmenter la proportion du m-o d’intérêt en tenant compte de? (3 réponses)
1) La proportion de l’espèce d’intérêt
2) La vitesse de croissance
3) les caractéristiques spécifiques/discriminantes
Quelles sont les 3 méthodes d’enrichissement vus dans le cours?
chimique, physique, biologique.
MÉTHODE CHIMIQUE –> Sur quoi peut-on jouer afin d’augmenter la proportion du m-o d’intérêt ?
1) Nutriments ou source d’énergie particulière au m-o d’intérêt
2) Source de carbone selon le type trophique du m-o d’intérêt (ex.: cellulose, CO2, azote, etc.)
Le violet de cristal et l’alcool phenyléthilique sont des substances ______________, ce qui veut dire qu’ils diminuent la proportion de certains types de m-o.
Violet de cristal diminue les bactéries Gr + ou -
alcool phenyléthilique diminue les bactéries Gr + ou -
substances inhibitrices
Violet = inhibe Gr+ Alcool = inhibe Gr-
Le milieu macConkey favorise la croissance de bactéries a) ___________ et élimine les b) _________
a) entériques (Gr-)
b) Gr+
Nommez les méthodes d’enrichissement physiques
Dessication: élimine H2O
Température d’incubation: psychrotrophes, thermophiles, etc.
Taille des cellules: filtre 0,22u
Qu’est-ce que la pathogénicité ? Donnez un exemple.
Une méthode biologique qui nécessite un hôte afin de faire une infection expérimentale. ex.: Koch et l’anthrax (charbon)
Qu’est-ce qu’une culture pure ?
une population de microorganismes où tous les individus ont les mêmes caractéristiques.
Vrai ou faux ? Une culture pure provient de la multiplication d’une ou quelques cellules identiques par reproduction sexuée
Faux, reproduction asexuée
Il existe 3 types de technique d’obtention de culture pure. Nommez-les.
Ensemencement en stries (milieu solide), dillution séquentielle en milieu liquide suivie d’un étalement en surface ou en profondeur.
Quel instrument est utilisé pour la striation sur milieu solide?
un fil à boucle
Quelles sont les limites de la striation sur milieu solide?
Une trop faible proportion de l’espèce d’intérêt
Où se trouvent les bactéries dans l’ensemencement en surface vs en profondeur?
Surface = direct à la surface du milieu profondeur = bactéries emprisonnées dans l'agar
L’ensemencement en profondeur est utilisé pour un type de colonies en particulier, lequel?
Les colonies envahissantes
Quelles sont les limites de ces deux types d’ensemencement?
Proportion réduite de l’espèce d’intérêt et bactéries thermosensibles (gélose de surface = 45 degrés)
Quel est l’avantage de ces deux types d’ensemencement ?
La quantification des bactéries
Quelles sont les caractéristiques observables des colonies sur milieu solide? (6 ou 7)
1) taille
2) marge (le bord) : dentelée, filamenteuse, lobée…
3) Élévation: plate, convexe, bombée…
4) texture: mucoïde, sèche, cassante…
5) caractéristiques optiques: opaque, transparent, translucide
6) pigmentation: couleur, pigment hydrophile = halo autour de la colonie
7) fluorescence ou phosphorescence
Quelles sont les caractéristiques observables des colonies sur milieu liquide? (3)
1) La quantité de croissance cellulaire
2) La distribution
3) La texture
(P.78 +) Comment s’effectue la ségrégation des chromosomes dans les cellules filles ? Absence d’(a)_____________________ chez les procaryotes mais présence de (b) ____________.
a) appareil mitotique
b) mésosome (croissance de la membrane plasmique entre les mésosomes)
a) À quoi servent les protéines ParA et ParB (appareils mitotiques procaryotes ? (hint: Par = partage) b) avec quoi interagissent-ils?
a) Pour la migration des pôles cellulaires
b) ParS, près d’oriC- chromosome (origine chromosomique)/
La protéine Mreb (appareil mitotique procaryote) est apparentée au _______________
cytosquelette
La protéine Mreb est assemblée en (a) ____________ (forme) (b) en quoi cette assemblage aide-t-il la fission binaire ?
a) spirale
b) cela permet le déplacement des chromosomes
a) Le septum se forme grâce à quelle protéine? b) Comment?
a) La ftsZ (filaments thermo sensibles)
b) induction de l’invagination de la membrane (échaffaudage au site de formation du septum)
Lorsque la température est non-permissive, qu’est-ce qui est formé par ftsZ?
Longues cellules filamenteuses avec plusieurs chromosomes ( Ø de formation du septum)
À quoi servent les protéines Min ?
Localiser le site de formation du septum
Qu’est-ce qu’une minicell?
Une cellule sans chromosome qui résulte de la formation d’un septum excentrique au mauvais endroit (non viable, Ø de chromosome)
Qu’est-ce que la variable [g] veut dire (temps de génération)
C’est le temps nécéssaire au dédoublement de la population.
g varie-t-il en fonction du milieu ?
milieu riche = g diminue
milieu pauvre = g augmente
quelles sont les unités de g?
min ou heure/génération
Quelle est la variable associée à la constante de vitesse de croissance moyenne ? (1/g) Quelles sont ces unités?
k (génération/h)
Que permet le calcul du taux de croissance ?
Comparaison de milieux
L’évolution d’une population in vitro est prévisible, la croissance est donc _________
limitée
Quelles sont les 4 phases de la courbe de croissance?
1) phase de latence
2) phase exponentielle de croissance
3) phase stationnaire
4) phase de décroissance (déclin ou mortalité)
Vrai ou faux? La phase de latence a une faible activité physiologique.
Faux –> élevé
Que remarque-t-on au début de la phase de latence VS à la fin au sujet de la population?
début = pas d'augmentation fin = augmentation
La durée de cette phase varie en fonction de quoi ? (3)
l’âge, l’état physiologique, le milieu.
Dans quel type de graphique nous trouvons-nous lorsqu’on parle de courbe de croissance ?
Log en fonction du temps (semi-log)
Graphiquement, la phase exponentielle de croissance esr représentée par une ___________________
droite à pente +
a) Quand débute la phase 2 ? b) Cette phase est-elle longue ou courte ?
a) Aussitôt que toutes les cellules sont en fission binaire
b) Courte
Le métabolisme est alors au __________
maximum
Que peut-on dire au sujet des nutriments dans la phase 2?
Il n’y a pas de restriction de nutriments
a) Quand la phase 3 débute-t-elle? b) À quoi ce changement est-il associé?
a) Dès qu’on a un changement de pente
b) Ralentissement de croissance
On a alors une population ____________
constante
Quelle est la densité maximale de la population ?
5 à 15x10^9 cellules/ml
Les éléments nutritifs a) ______________ et on a une accumulation de b) _________________
a) se raréfient (diminuent)
b) substances toxiques (déchets métaboliques)
Y a-t-il formation d’endospores à cette étape ?
oui
Graphiquement, la phase de décroissance est représentée par une ___________________
droite à pente - = chute constante de la population
On a alors une a) ____________ de division cellulaire et une absence d’ b) _______________. De plus, La concentration de c) __________________ est élevée.
a) absence
b) éléments nutritifs
c) déchets métaboliques
La durée de la phase 4 est-elle variable?
oui –> ex.: Neisseria gonorrhoae = 72h
Escherichia Coli = 60 jours et +
Qu’est-ce qu’un chémostat?
une culture en vase clos
Concernant le réacteur (À volume fixe)
On a un (a) ________________ de milieu frais
élimination du (b) ________________ et contrôle de c) (4 choses)
a) ajout constant
b) milieu épuisé
c) pH, température, agitation, gaz.
Quelles sont les unités du taux de dilution?
heure^-1
Comment contrôle-t-on le taux de croissance?
Par le taux de dilution
Quelles sont les 3 situation possibles et leur conséquences (taux de dilution vs taux de croissance)
dilution > croissance = élimination des bactéries (wash-out)
dilution = croissance = conditions optimales
dilution< croissance = conditions limitantes
Quel est le but d’un chémostat?
Avoir des cellules qui sont constamment en phase exponentielle
Quelle est la pertinence biologique de cette méthode ?
On a des conditions de culture qui se rapprochent des conditions in vivo. Ex.: Streptococcus salivarius
g in vitro = 30 min
g in vivo = 11 hrs
a) Qu’utilise-t-on pour faire l’énumération cellulaire?
b) Comment cela fonctionne-t-il ?
c) A-t-on une idée de la viabilité des cellules?
a) Une chambre de Petroff-Hausser
b) On compte les cellules dans un volume prédéterminé
c) non
Quels sont les trois avantages de l’énumération cellulaire avec la chambre de Petroff-Hausser?
Rapide + minimum d’équipement + densité de population
L’énumération électronique est un tri cellulaire basé sur _________________________
La fluorescence de la cellule
Ainsi, en utilisant des fluorochromes ____________ on peut trier les cellules vivantes et mortes.
vitaux
Quelle est la limite de cette méthode?
La taille des bactéries
Témoin interne, l’énumération électronique utilise des billes de a) _________ et de b) _______ connues
a) taille b) [ ]
En ce qui concerne la microbiologie de l’air, à quoi peut-elle servir ? (2)
1) détection de spores dans l’air
2) caractérisation des populations hétérogènes