EXAMEN 2 Flashcards
Quelles sont les composantes du système endomembranaire? (5)
1-RE
2-Golgi
3-Lysosomes
4-Endosomes
5-Vésicules de sécrétion
quelles sont les fonctions du système endomembranaire?(3)
1-production, stockage et export de protéines
2-dégradation de diverses subdstances
3-régulation du Ca2+ (RE)
Nomme les deux types de transports dans le système endomembranaire
1-adressage des protéines basé sur leur séquence signal
2-transport vésiculaire
nomme moi les rôles du RE en général (3)
1-synthèse, glycosylation et contrôle de la qualité des protéines
2-régulation du Ca2+
3-synthèse des lipides cellulaires
Nomme moi les rôles du RER (2)
1-début de la voie sécrétoire
2-synthèse, glycosylation et contrôle de la qualité des protéines
Nomme moi les rôles du REL (4)
1-métabolisme des lipides, synthèse du cholestérol et phospholipides
2-synthèse d’hormones stéroïdes
3-absorption et transport des lipides (intestin)
4-détoxification (foie et reins)
nomme les deux sources des acides gras
1-triglycérides importés (dans les goutelettes lipidiques)
2-synthétisé sà partir d’acétyl-CoA (citrate)
dans le cas de la synthèse des phospholipides, les acides gras préexistants doivent: (2)
1-êtres transportés à travers le cytosol
2- êtres conjugués à un acétyl-CoA
qu’avons nous besoin pour transporter un acide gras à Travers le cytosol?
d’une protéine de liaison aux acides gras
où sont synthétisés les phospholipides? comment?
sur la face cytosolique du RE. les acides gras se font ancrer dans le feuillet cytosolique du RE
quelle est la différence entre la synthèse d’un phospholipide et celle d’un sphingolipide ou d’un glycolipide?
la fin de la synthèse des glycolipides et des sphingolipides est dans le Golgi et non dan le RE
à quoi. est due l’asymétrie des feuillets lipidiques?
au transfert limité entre les feuillets lipidiques (Flip-flop)
quels sont les deux rôles fonctionnels de l’asytmétrie des feuillets lipidiques?
1-singalisation
2-apoptose
vrai ou faux: le début de la synthèse des hormones stéroïdes se fait dans le RE
Faux: la première étape se fait dans la mitochondrie (clivage de la chaine de carbone secondaire du. cholestérol)
lors de la synthèse du cholestérol, la HMG-CoA réductase catalyse la synthèse de quelle molécule?
acide mévalonique
qu’arrive-t-il à la cellule lors d’un excès de calcium?
surexcitation qui mène à la mort cellulaire
vrai ou faux: le cytosol a une concentration élevée en calcium
faux
où le calcium est-il séquestré?
RE et milieu extracellulaire
quelles protéines séquestrent le calcium? (2)
1-calréticuline
2-calnexine
vrai ou faux: la caréticuline a une faible affinité mais une grande capacité pour le calcium
vrai
pourquoi la calréticuline et la calnexine ont-elles besoin de calcium?
il est nécéssaire pour leur activité de chaperonne
quels types de signaux activent l’entré du calcium dans le cytosol? (2)
1-signaux chimiques (IP3 et autres agonistes des IP3)
2-signaux électriques (dépolarisation-muscles, neurones)
quels sont les deux types de canaux à calcium dans le RE (RS)? (2)
1- récepteurs de l’IP3 (IP3R)
2-récepteurs de la ryanodine (RyR-tissus exitables)
qu’est-ce qui active les récepteurs de l’IP3?
les molécules de signalisation des phospholipides
nomme les rôles du calcium (2)
1-active différentes enzymes cytosoliques
2-stimule la production d’ATP
Nomme les 3 mécanismes de régulation du calcium
1- retourné au RE par pompe SERCA
2-envové aux mitochondries par la MCU
3- pompé hors de la cellule
vrai ou faux: la concentration de calclium cytosolique varie selon des pics de concentration
vrai
qu’est-ce qu’un singal de tri? quelles sont ses particularitées? (4)
1-séquence régulant la localisation des protéines
2-importance des charges et des a.a. hydrophobes
3-peut être continu ou discontinu (structure 3D)
4- généralement N-terminal (mitochondrie, RE) mais peut aussi être à l’intérieur de la protéine ou C-terminale
nomme 3 particularités à propos de la synthèse des protéines dans le RER
1-associées à des ribosomes sur la face cytosolique
2-insertion cotraductionnelle de protéines dans la membrane du RE
3-requiert la présence d’une séquence signal hydrophobe
que fait la SRP dans la synthèse des protéines dans le RE? (3)
1- elle s’associe aux ribosomes cytoplasmiques et à son récepteur (RE)
2- reconnait différentes séquences signal à l’aide d’une poche contenant plusieurs méthionines
3-bloque la sysnthèse de la protéine par le ribosome
Que fait la SRP lorsqu’elle arrive au RE avec le ribosome?
elle s’attache à son récepteur laisse le ribosome continuer la synthèse de la protéine à travers un translocon (sec61)
Qu’est ce qui cause l’ouverture du complexe sec 61, qui est un pore aqueux normalement fermé?
la séquence signal après son relâchement du SRP
Que se passerait-il à une protéine ayant une séquence signal pour le RE si il n’y avait pas de translocon?
elle resterait prise dans le cytosol
lorsque la protéine n’a pas de domaine transmembranaire, comment se passe la translocation?
1-la séquence signal agit comme un signal de début de transfert
2-la séquence signal est clivée par une peptidase à un site spécifique
3-la protéine est relâchée dans la lumière du RE
que se passe-t-il aux protéines qui n’atteignent pas leur conformation native?
elles sont retournées dans le cytosol pour leur dégradation
suite à la translocation, les protéines doivent être correctement repliées dans le RE. quelles sont les étapes de ce processus? (3)
1-glycosylation
2-formation de ponts disulfures
3-repliement de la chaine peptidique
Quels sont les deux types de glycosylation?
1-glycosylation liée à. O (plus rare)
2-glycosylation liée à N (plus fréquent)
où se produit la glycosylation liée à O? forme-t-elle des résidus?
- dans ke Golgi
- généralement 1-4 résidus
lors de la glycosylation liée à N, où se situe la synthèse de l’oligosacharide?
sur un lipide à longue chaine, en partie du coté cytosolique et en partie du coté de la lumière du RE
à quoi set la glycosylation liée à N?
marque la protéine pour le repliage
où est transféré l’oligosacharide sur le polypeptide et quelle enzyme catalyse la réaction?
-sur un Asn du polypeptide
-oligosaccharyl tranférase
une fois l’oligosaccharide attaché au polypeptide, que se passe-t-il?
retrait de deux glucoses (singal de transfert?)
qui sont les chaperonne qui reconnaissent les oligosaccharides avec un seul glucose? (2)
1-calnexine
2-calréticuline
quelle enzyme ajoute un glucose à l’oligosaccharide? quelle enzyme lui en enlève un?
-glycosyl tranférase ajoute
-glucosidase enlève
que se passe-t-il si il n’y a pas de Ca2+ lors de la N-glycosylation?
accumulation de protéines mal repliées
qui s’occupe de réexporter les protéines mal repliées dans le cytosol?
ERAD
comment reconnait-on une protéine qui reste mal repliée?
elle possède un oligosaccharide modifié (mannosidase I)
lorsque retournées dans le cytosol, que se passe-t-il avec les protéine qui restent mal repliées (2 étapes)
1- elles sont déglycosylées
2-elles sont ubiquitinées et dégradées par le protéasome
à quoi sert la réaction aux protéines mal repliées?
1-permet d’augmenter la capacité des chaperonnes du RE
2-inhibe la synthèse générale de protéines
vrai ou faux: ERAD régule uniquement les protéines mal repliées
faux
lorsqu’une protéine contenant un domaine transmembranaire subit une translocation, comment se déroule-t-elle? (type 1)
pareil comme lorsqu’aucun domaine, mais celle-ci contient une séquence d’arrêt de transfert qui est relâchée dans la membrane sous forme d’un domaine transmembranaire
lors de la translocation de protéine avec un domaine transmembranaire de type 1 quel côté de la protéine reste dans le cytosol?
le côté C-terminal
qu’est-ce que la translocation de protéine à un domaine transmembraanire de types 2 et 3?
la protéine contient une séquence signal interne qui reste dans la membrane au lieu d’être clivée. l’extrémité (-) entre toujours dans le translocon en premier
quelle est la différence entre les types 2 et 3 de la translocation de protéine à un domaine transmembranaire?
type 2: côté N-terminal dans le cytosol
type 3: côté C-terminal dans le cytosol
comment se déroule la translocation d’un protéine è deux domaines transmembranaires?
commence toujours comme les types 2 et 3, mais la protéine contient aussi un séquence d’arrêt de transfert qui est aussi insérée dans la membrane sous forme d’hélice alpha
que comporte une protéine à plus de deux domaines transmenbranaires?
combinaison de plusieurs signaux de transfert et d’arrêt de transfert insérés à l’aide du même translocon
comment les protéines peuvent-elles être ancrées à la membrane par des lipides?
ancrage par un GPI sur la face non-cytosolque
qu’est-ce qu’une tail anchored protéine?
protéine insérée dans une membrane par son extrémité C-terminale hydrophobe de façon post-trductionnelle
vrai ou faux: les tail anchored protéines peuvent être ingérées de façon spontanée ou à l’aide de chaperonnes les dirigeant vers un organiste spécifique
vrai
Nomme les 4 étapes de formation d’une vésicule
1-association du cargo
2-assemblage du manteau et déformation de la membrane
3-scission de la membrane
4-perte du manteau
nomme les 3 types de manteau et le transport associé
1-COPII: transport antérograde du RE au cis-golgi
2-COPI: transport rétrograde du Golgi vers le RE et entre les membranes du Golgi
3-clathrine: transport antérograde du réseau trans-golgi vers les lysosomes. transport de la membrane plasmique vers les endosmose/lysosomes
vrai ou faux: touts les types de manteau ont les memes protéines adaptatrices et la même régulation
faux
qui permet de reconnaitre le cargo d’une vésicule?
protéines adaptatrices
où se situe la séquence d’adressage dans une protéine adaptatrice qui reconnait un cargo transmembranaire?
dans sa portion cytosolique
comment un cargo soluble trouve-t-il son récepteur lors de la formation d’une vésicule?
un récepteur membranaire reconnait sa séquence d’adressage
que fait une GTPase de recrutement du manteau lorsqu’en forme GTP?
assemble le manteau
que fait une GTPase de recrutememt du manteau lorsqu’en forme GDP?
désassemble le manteau
outre l’assemblage et le désassemblage du manteau, que font les GTPase de recrtuement du manteau?
régulent la courbure de la membrane
une fois la vésicule produite (COPII), que se passe-t-til ensuite? (2)
1-une sous unité du manteau (Sec23) stimule l’activité GTPase de Sar1
2-Hydrolyse du GTP et désassemblage du manteau
vrai ou faux: le désassemblage du manteau est requis pour la fusion de la vésicule avec la membrane cible
vrai
quelles sont les composantes nécessaires pour la fusion entre la membrane cible et une membrane spécifique? (2)
1- présence de protéines Rab
2-SNARES complémentaires dans les deux membranes
décris le processus de fusion entre une vésicule et sa membrane cible (4)
1-la Rab-GTP de la vésicule s’attache au Rab-effecteur de la membrane cible
2-le complexe Rab-GTP/Rab-effecteur guide la vésicule vers les SNARES complémentaires à la vésicule
3-les SNARES complémentaires se lient ensembles
4-les deux membranes fusionnent
à quelle famille appartiennent les protéines Rab?
GTPases
Que régulent les protéines Rab?
spécificité du transport vésiculaire (rab différent sur chaque membrane)
quels sont les rôles des effecteurs de Rab? (4)
1-sélection du cargo/formation de la vésicule
2-transport
3-association de la vésicule avec la membrane cible
4-fusion
définis v-SNARES et t-SNARES
v-SNARES: sur vésicule
t-SNARES: target membrane => membrane cible
vrai ou faux: les SNARES sont spécifiques pour chaque membrane
vrai
complète les phrases suivantes ou choisis le bon mot:
-complexe v-SNARE/t-SNARE ______ (très/peu) stable
-Nécessite de l’_________ pour briser le complexe et recycler les SNARES
-L’énergie provient de l’hydrolyse _________ par NSF
1-très
2-énergie
3- de l’ATP
où doivent aller les protéines destinées au Golgi, lysosomes et membrane plasmique? qu’en est-il des protéines résidant dans le RE?
les protéines destinées au Golgi, lysosomes et membrane plasmique doivent passer du RE au Golgi. les protéines restant dans le RE doivent rester dans le RE
si une protéine n’est pas repliée correctement, passe-t-elle au Golgi?
non
que se passe-t-il avec les vésicules COPII à la sortie du RE? (3)
1-perte du manteau
2-déplacement le long des microtubules
3-fusion des vésicules avec cis-golgi ou formation de réseau cis-golgi
vrai ou faux: des protéines du RE sont parfois incluses dans les vésicules COPII
vrai
comment retourne-t-on les membranes, récepteurs et v-SNARES à recycler au RE?
par des vésicules de COPI à partir du faisceau vésiculaire-tubulaire et de l’appareil de Golgi
où se situe le signal de rétention dans le RE sur les protéines résidants dans le RE
à leur extrémité c-terminale
de quoi est formé l’appareil de Golgi?
empilement de vésicules aplaties
sur quelle face du Golgi arrive les vésicules?
face cis
à partir de quelle face du Golgi partent les vésicules?
face trans
comment décrit-on le réseau cis-golgien et trans-golgien?
réseau des canalicules
comment la structure du Golgi est-elle maintenue?
transport sur les microtubules
comment la nature de chaque citerne du Golgi est-elle maintenue?
par transport rétrograde (vésicules COPI)
nomme les fonctions de l’appareil de Golgi (2)
1-glycosylation et tri des protéines de la voie sécrétoire
2- maturation des protéines (protéolyse, retrait de la séquence signal, maturation/activation)
sur quelle partie d’une protéine se fait la glycosylation en O?
sur le OH d’une sérine ou d’une thréonine
quels sont les 4 rôles de la glycosylation?
1-repliement des protéines
2-tri des protéines
3-altère les propriétés des protéines
4-interactions entre les cellules et la MEC
nomme les 3 modes de transport des vésicules COPIIs vésicules de type COPII font du transport antérograde vers… (3)
1-lysosomes/endosomes
2-membrane plasmique (constitutif => chemin par défaut)
3-membrane plasmque (régulé => protéines qui attendent avant d’être sécrétées)
décris moi la composition d’un manteau de clathrine (5)
1-3 sous unités larges, 3 petites sous unités
2- forme un triskèle
3-assemblé pour former une structure polydrale
4-contient des protéines spécifiques pour le cargo
5-contient des récepteurs pour le cargo
décris moi l’association des protéines et la formation du manteau de clathrine (2)
1- récepteurs reconnaissent les protéines à incorporer dans la vésicule
2-adapteurs reconnaissent les récepteurs et la clatrhine (AP1-3/GAA)
l’adapteur AP1 reconnait les récepteur qui vont de où à où?
Golgi vers endosomes
l’adapteur AP2 reconnait les récepteurs qui vont de où à où?
membrane plasmique vers endosomes
décris moi la dynamine et ses fonctions (3)
1-GTPase contenant un domaine de laison au PI(4,5)P2
2-mécano-enzyme nécéssaire pour la scission de la vésicule
3-interagit avec des protéines affectant la courbure de la membrane
nomme moi les deux types d’exocytose
1-constitutive (par défaut)
2-contrôlée (présent dans les cellules spécialisées - signal de tri)
décris la processus de la voie de sécrétion contrôlée (4)
1-agrégation des protéines
2-retrait d’une partie de la membrane des vésicules (clathrine)
3-maturation (clivage protéolytique)
4- signal nécessaire pour la fusion avec la membrane plasmique (calcium)
qu’est-ce qui active la sécrétion par voie contrôlée?
singal extracellulaire (agit sur des Rab et signalisation du Ca2+)
décris moi le processus de fusion de vésicules synaptiques (4)
1-les vésicules synaptiques s’associent à la membrane plasmique près des canaux calciques
2-l’entrée du Ca2+ cause un changement de conformation dans la Synaptotagmine qui stimule la fusion
3-le Ca2+ est rapidement pompé dans les mitochondries (ATP) et à l’extérieur de la cellule
4- plus la fréquence de potentiel d’action est élevée, plus il y aura de nt relâchés
vrai ou. faux: les cellules polarisées ont des surfaces de fonctionnement distinctes
vrai
définis domaine basolatéral et domaine apical
basolatéral: en contact avec le milieu interstitiel/ circulation sanguine
apical: du côté de la lumière
qu’adresse généralement la présence d’ancrage GPI?
membrane apicale (pas dans la thyroïde)
nomme les vésicules du système endosomal (4)
1-endosome précoce
2-endososme de recyclage
3-endosome tardif
4-lysosome
nomme les 4 processus du système endosomal
1-endocytose
2-autophagie
3-transport vésiculaire
4-exocytose (endosomes/lysosomes)
que contient un endosmose précoce?
matériel en provenance de la membrane plasmique
que contient un endosmose tardif en plus du contenu d’un endosome précoce?
pH6 et présence d’hydrolases acides provenant du Golgi
que contient un endosome de recyclage?
protéines retournant à la membrane plasmique
fais moi une description brève d’un lysosome
vésicule acide (pH4,5-5) permettant la dégradation de diverses molécules intracellulaire et extracelluaires
nomme moi les hydrolases que contient un lysosome (6)
1-protéase
2-phosphatase
3-lipase
4-glycosidases
5-nucléases
6-sulfatases
les hydrolases du lysosomes peuvent-elles être actives dans le cytosol?
non, elles fonctionnent uniquement à pH acide
comment sont les protéines de la membrane des lysosomes? pourquoi sont-elles ainsi?
plusieurs protéines hautement glycosylées. leur glycosylation prévient leur dégradation
que peuvent être les protéines de le membrane des lysosomes? (3)
1-pompes à protons (ATPase vacuolaire)
2-divers transporteurs
3-sites de régulation des voies de signalisation
que se passerait-il si la membrane d’un lysosome se brisait?
mort cellulaire
où se situe la synthèse de nouveaux lysosomes?
au niveau transcriptionnel
qui régule la biogenèse des lysosomes? en réponse à quoi?
-un facteur de transcription (TFEB) activé en réponse à un besoin de dégradation accru
où sont synthétisées les protéines fonctionnelles du lysosome et par où sont-elles envoyées aux lysosomes?
synthétisées dans le RE et envoyées au lysosome par le trans-golgi
comment se déroule la maturation des différentes vésicules dans le système endomembranaire?
ajout et retrait de différentes composantes fonctionnelles et fusion avec des lysosomes primaires
vrai ou faux; les protéines membranaires destinées aux lysosomes ont une séquence spécifique
vrai
qui fusionnent avec u endosome tardif pour former un lysosome?
vésicules AP1-clatrhine et GGA-clathrine
que fait le mannose-6-phosphate dans la biogenèse des lysosomes?
signale tri des protéines lysosomales solubles
décris brièvement comment le mannose-6-phosphate est attaché à une protéine (2)
1-GlcNAc phosphotransférase reconnait u groupe d’a.a. à la surface des hydrolases er ajoute un UDP-GLcNAc sur oligosaccharide
2-GlcNAc enlevé dans le réseau trans golgien par une deuxième enzyme
que permet le récepteur du mannose-6-phosphate et où reconnait-il celui-ci?
transport des hydrolases solubles vers l’endosome tardif par une vésicule à clathrine. reconnait dans le réseau trans-golgi
une fois les hydrolases insérées dans l’endosome tardif, quelle est la dernière étape avent leur activation?
clivage
pourquoi le récepteur du M6P se lie au M6P dans un endosome tardif et défait sa liaison dans un lysosome?
car il se lie au M6P a pH6,5-6,7 et se dissocie à pH plus acide
où peut-on retrouver le récepteur du M6P autre que dans le Golgi? pourquoi?
à la surface de la cellule pour récupérer les enzymes lysosomales qui se sont échappées
comment le M6PR est-il recyclé vers le Golgi?
par transport rétrogradent l’aide de vésicules spécifiques (rétromères)
Vrai ou faux: une rétromère a une structure similaire à COPI, COPII et clathrine
faux: elle a une structure différente
nomme les deux sources de matériel à ingérer dans les lysosomes et ce qu’ils comprennent
1-matériel extracellulaire endocyté:
-récepteurs endocytés suite à leur activation
-endocytose par intermédiaire de récepteur
2-matériel intracellulaire livré aux lysosomes par autophagie (micro, macroautophagie, autophagie médiée par chaperonnes)
quelle est la séquence signal pour une exocytose constitutive?
il n’y en a pas
qu’obtient la cellule par endocytose? (2)
cellule spécialisée (macrophage)
grosses vésicules
qu’est-ce que la pinocytose?
endocytose non-spécifique de milieu extracellulaire
dis moi trois choses sur l’endocytose dépendant d’un récepteur
1-endocytose de molécules spécifiques
2-requiert la présence d’un récepteur pour ces molécules
3-on ne peut endocyter qu’une molécule à la fois
qui reconnait la séquence spécifique dans la portion cytosolique du récepteur lors d’endocytose par intermédiaire de récepteur?
AP2
quel type de manteau est utilisé lors d’endocytose par récetpteurn interposé?
clathrine
que se passe-t-il avec les molécules endocytées? (4)
1-elles se dissocient de leur récepteur à pH acide
2-le récepteur est soit recyclé la membrane plasmique, soit dégradé dans le lysosome
3-le cargo est dégradé dans le lysosome ou recyclé
4-le recyclage se fait dans un endosome de recyclage qui fusionne avec la membrane plasmique
que doit-on faire avec les protéines membranaires à dégrader par le lysosome?
les internaliser: on forme une vésicule intra-endosomale régulée par ubiquitination et qui sera dégradée dans le lysosome
que se passe-t-il avec les composantes des vésicules intra-endosomales qui ne sont pas dégradées?
elles sont exportées du lysosome pour être réutilisées
nomme les 6 rôles de l’autophagie
1-dégradation de molécules et organites endommagées
2-dégradation de protéines à longue durée de vie
3-dégradation de molécules et organites inutiles
4-recyclage des nutriments
5-métabolisme des lipides
5-reconnaissance et dégradation de pathogènes intracellulaires
qu’est-ce que la microautophagie? (2)
1-autophagie la moins connue
2-un genre d’endocytose à partir de la membrane du lysosome
qu’est-ce que la CMA? (3)
1-dégrade spécifiquement certaines protéines à longue durées de vie
2-présence de séquence spécifique reconnue par une chaperonne
3-la chaperonne livre la protéine à un pore protéique à la surface du lysosome
qu’est-ce que la macroautophagie? (3)
1- la plus étudiée
2- activée par un manque d’éléments nutritifs (généralement a.a.)
3-dégraude aussi les composantes cellulaires endommagées ou inutiles
que sont les deux types de macroautophagie?
1-autophagie induite par un manque de nutriments
2-autophagie sélective
qu’est-ce que l’autophagie induite par un manque de nutriments? (4)
1-incorporation de matériel cytoplasmique de façon non sélective
2- permet de maintenir la vialbilité lorsque les nutriments sont présents en quantités limitées
3-nécéssaire pour la survie à la naissance
4-impliquée dans le cancer