Examen 1 Flashcards
mémoriser infos pour examen 1
Quels sont les avantages d’utiliser des cellules de tissus animal comme matériel?
Les tissus sont faciles à obtenir en grande quantité
Quels sont les inconvénients des cellules de tissus animal?
-Elles sont difficile à manipuler
-Elles sont inefficace pour l’étude de traitements (médicaments)
Quels sont les avantages de cellules en culture?
-Elles sont faciles à manipuler et à visualiser
-Elles se divisent facilement (facile à utiliser)
Quels sont les inconvénients des cellules en culture?
-Elles sont difficiles à obtenir
-Elles sont peu représentatives de ce qui se passe dans l’organisme
Vrai ou faux: les cellules nerveuse en cultures ont une longue durée de vie
Faux
Qu’est-ce qu’une cellule primaire et quelles sont ses caractéristiques?
-C’est une cellule animale de base
-Elle permet d’obtenir des résultats réalistes
-Elle est facile à obtenir
-Elle peut se diviser qu’un nombre limité de fois
Qu’est-ce qu’une cellule immortalisée?
Une cellule semblable à une cellule primaire, mais qui peut se diviser un nombre infini de fois
Quels sont les avantages des cellules immortalisées?
-Permet d’obtenir une grande culture de cellules
Quels sont les inconvénients des cellules immortalisées?
-Elles sont difficiles à obtenir
-Elles n’ont pas les mêmes propriétés que les cellules de souris, ce qui rend les tests moins efficaces
-Les altérations ne sont pas toujours représentatives de la réalité
Qu’est ce qu’une cellule transformée?
Une cellule qui peut se reproduire indéfiniment, mais qui peut former des tumeurs
Qu’est-ce qu’une cellule souche et à quelle étude sert-elle?
Une cellule «normale» qui se divise quand même. Elle sert aux études de maladies neuro-dégénératives
Quels sont les 3 catégories de travaux biochimiques pour étudier et caractériser les cellules
- préparation d’extraits cellulaires et isolation d’organites
- Mesure d’activité biochimique
- Chromatographie
À quoi sert la méthode SDS-PAGE (détergent)?
À isoler les types de protéines à l’intérieur d’une cellule selon leur grosseur à l’aide d’un courant électrique
Quel est l’inconvénient de SDS-PAGE?
Il est impossible d’isoler une seule protéine
Qu’est-ce qu’un Western blot?
Une variante d’SDS-PAGE qui permet d’identifier les différentes structures et interactions entre les protéines, ce qui permet de quantifier la protéine dans la cellule selon la situation donnée
Comment recconait-on lees protéines isolées par SDS-PAGE et Western blot?
On utilise un anticorps spécifique à la protéine pour la reconnaitre et un autre anticorps pour vérifier que le premier est lié à la protéine
Quels sont les incovénients de la microscopie photonique?
Elle est dépendante de la longueur d’onde et a une résolution maximale de 0,2 um
Comment fonctionne le contraste de phase (microscopie photonique) et à quoi sert-il?
-Permet d’observer une cellule sans utiliser de colorant
-À cause du déphasage des ondes, des endroits sombres sont créés dans la lentille du microscope. Les endroits sombres de la lentille sont les endroits où il y a une cellule)
Quelle est l’utilité de l’utilisation de colorants (microscopie photonique)
Permet d’observer des structures distinctes dans une cellule selon le type de colorant (ex: l’éosine qui marque le matériel cytoplasmique)
Quelle est l’utilité de la microscopie à fluorescence (microscopie photonique) et comment fonctionne-t-elle?
-Permet de voir des molécules spécifiques (protéines, ions) et de marquer des organites
-Utilise la propriété de certaines molécules d’absorber une longue d’onde et de la relâcher à une longueur spécifique (plus longue)
Comment fonctionne l’Immunofluorescence (microscopie photonique) et à quoi sert-elle?
-On attache un anticorps spécifique à une protéine cellulaire et on en attache un deuxième au premier qui émet de la lumière
-Permet d’étudier la localisation et la quantité de bactéries
Qu’est-ce qu’un microscope à fluorescence (photonique)?
Un microscope doté d’une lampe à haute énergie qui permet d’illuminer l’échantillon et équipé de filtres qui permettent de sélectionner les longueurs d’ondes d’absorption et d’émission appropriées
Qu’est-ce que la déconvolution (microscopie photonique) et à quoi sert-elle?
-Traitement d’image de microscopie photonique (amélioration d’image)
-Permet de bien visualiser un échantillon trop épais
Qu’est-ce qu’un microscope confocal (photonique) et à quoi sert-il?
-Microscope doté d’un détecteur et de fentes qui permettent de filtrer la lumière qui serait détectées comme «hors focus» par le détecteur
-Permet de produire une image claire lors de la microscopie à fluorescence
Qu’est-ce que la GFP (microscopie photonique) et à quoi sert-elle?
-Protéine fluorescente isolée de aequoria victoria qui peut être fusionnée avec d’autres protéines avant leur entrée dans une cellule
-Permet d’étudier la vitesse à laquelle les protéines bougent et leur rapidité d’adaptation en fonction de différents signaux celullaires
Qu’est-ce que la super résolution (microscopie photonique) et quels sont ses inconvénients?
-Technique qui permet d’obtenir une résolution plus grande que 200 nm à l’aide de procédures optiques particulières et d’analyse d’ordinateur
-On ne peut visualiser plus d’une cellule à a fois
Quel est l’avantage de la microscopie électronique?
-Offre une meilleure résolution que la microscopie photonique (0,1 nm)
Quels sont les inconvénients de la microscopie électronique?
Les tissus doivent obligatoirement être fixés. Il est donc impossible d’étudier des cellules vivantes et le processus de fixation peut créer des artéfacts
À quoi sert la microscopie à transmission (électronique)?
Permet d’observer l’intérieur des structures en 2D ou 3D
À quoi sert la microscopie à balayage (électronique)?
Permet de voir la surface et l’architecture des structures en 3D. Les électrons dispersés sont collectés
Pourquoi ne peut-on pas observer un échantillon épais à la microscopie électronique?
Les électrons ne passeront pas au travers de l’échantillon
quels sont les pré requis d’un échantillon de microscopie électronique à transmission?
- ils doivent être sous-vides
- ils doivent être fixés
- ils doivent être colorés
Qu’est ce que l’immunodéficitaire gold (microscopie électronique à transmission) et à quoi sert-il? Quel est son inconvénient?
-Technique similaire à l’immunofluorescence où une bille d’or est attachée à un anticorps
-Permet de marquer une structure spécifique pour l’étudier
-La bille d’or peut se retrouver loin de la structure
Quels sont les inconvénients de la microscopie électronique à balayage?
La préparation des échantillons est longue
Qu’est-ce que la tomographie (microscopie électronique à transmission)
Méthode qui permet d’obtenir une image 3D et de la visualiser selon des angles différents
Qu’est-ce que le FIB-SEM (microscopie électronique à transmission) et à quoi sert-il? Quel est son inconvénient?
-On prend l’image d’une couche d’un échantillon et on enlève la couche
-Permet d’obtenir une image 3D et d’analyser couche par couche
-Cela prend de nombreuses heures pour un seul échantillon
Quels sont les désavantages de la GFP?
-Elle peut empêcher la protéine à laquelle elle est attachée de fonctionner vu qu’elle est grosse. Attacher la GFP peut échouer et elle peut mener à surexprimer les protéines déjà présentes dans la cellule
Qu’est-ce qu’un artefact?
Résultat faux qui est une conséquence de la manipulation
Nommer les différents organismes utilisés comme modèles de recherche
Souris
C. elegans
drosophile
levures
Nomme les quatre caractéristiques principale d’une cellule eucaryote
-présence de noyau
-ADN linéaire stocké dans le noyau
-Présence d’organistes cytoplasmiques
-Grosse cellule (10-100 um
Nomme les quatre caractéristiques principales d’une cellule procaryote
-Absence de noyau
-ADN circulaire en suspension dans le cytosol
-Absence d’organites cytoplasmiques
-Cellule petite (1-2um)
Nomme les macromolécules présentes dans la cellule
1.protéines
2.lipides
3.glucides
4.acides nucléiques
Nomme les petites molécules présentes dans la cellule
1.eau
2.ions
3.vitamines
4.cofacteurs
Quel est le rôle de l’ATP dans la cellule
Il est sa source d’énergie et sert à réduire l’entropie de la cellule
Quels sont les rôles des protéines dans la cellule?
1.Régulation des activités cellulaires (enzymes)
2.Rôle structural (cytosquelette et fixation de cellule au tissu)
Quel est la liaison covalente autre que la liaison peptidique dans les protéines?
Le pont disulfure (S-S entre deux cystéines)
Quelles sont les liaisons non-covalences lors du repliement des protéines?
1.Pont H ( N/O-H-N/O)
2.Liaison électrostatique (van der Waals, ionique)
Quelles sont les deux structures secondaires des protéines?
- hélice alpha
2.feuillet bêta
Quel est le rôle des glucides dans la cellule?
Réserve d’énergie à court terme
Quel est le rôle des triglycérides dans la cellule?
Source d’énergie à moyen terme
Quel est le rôle de l’eau dans la cellule?
solvant des réactions biochimiques
Quels sont les rôles des ions dans la cellule?
1.Pression osmotique
2.cofacteurs d’enzymes
3.potentiel membranaire
4.signalisation
Quel est le rôle des vitamines dans la cellule?
Cofacteurs (CoA, NAD, FAD)
Qu’est ce qu’une chaperonne?
Protéine qui aide au repliement d’autres protéines, à la prévention d’agrégats et qui corrige les erreurs
Qu’arrive-t-il si on change le radical d’un a.a. dans une protéine?
Elle change de de nature et change de forme, ce qui change les interactions qu’elle peut faire avec d’autres molécules
Qu’est-ce qu’un domaine dans une protéine?
Une partie de la protéine qui se retrouve dans d’autre protéine pour accomplir le même rôle (ex: défaire une liaison particulière) même si la protéine a une fonction différente dans la cellule
De quoi la cellule a-t-elle besoin pour maintenir son organisation?
D’énerige
Autre que générer de l’énergie, que peut-on faire d’une molécule d’ATP/GTP?
- transférer son phosphate sur une protéine pour l’activer ou l’inhiber
Quelles sont les deux conséquences principales de la phosphorylation d’une protéine
- activation ou inhibition
2.création d’un site de liaison avec d’autres protéines
Quelle enzyme ajoute un. phosphate sur une protéine?
Kinase
Quelle enzyme enlève un phosphate sur une protéine?
phosphatase
Quel ion régule l’activité des kinases, phosphatases, protases et autres enzymes?
le calcium (Ca2+)
qu’est ce que la phosphorylation modifie chez une protéine
Un a.a directement
Lorsque la phosphorylation d’une protéine sa fait avec le phosphate d’un ATP, qu’est ce qui se charge de celle-ci
Les enzymes (kinase et phosphatase)
Lorsque la phosphorylation se fait avec un phosphate d’une GTP sur une GTPase, qui s’en occupe
La GTPase elle même avec l’aide de GAP et GEF
Que fait GAP?
Dit à la GTPase de phosphoryler la GTP (désactive le signal)
Que fait GEF?
Active l’échange d’une GDP pour une GTP
Quels sont les 3 rôles d’une membrane biologique?
- Barrière entre l’intérieur et l’extérieur de la cellule
2.Création d’un gradient d’ions
3.Transmission de signaux extra cellulaire (membrane plasmique seulement)
Quelles sont les composantes d’une membrane biologique?
1.Bicouche lipidique (phospholipids et sphingolipides)
2.Protéines (récepteurs, canaux protéiques et pompes)
Comment sont organisés les lipides dans la membrane?
La tête polaire à l’extérieur et les queues non-polaires à l’intérieur
Quels sont les qu’âtres types de lipides membranaires?
- phospholipides
2.sphingolipides
3.glycolipides
4.cholestérol
De quoi sont composés les phospholipides?
1.glycérol
2.phosphate
3. chaines d’acide gras, une comportant une liaison double
De quoi sont composés les sphingolipides?
Tête polaire avec un groupement phosphate et shpingosine
De quoi sont composés les glycolipides et ou sont-ils abondants?
Glucides et sphingosine et dans le cerveau (signalisation)
De quoi est composé le cholestérol?
un noyau stéroïde, un alcool et une tête polaire
Quels sont les types de mouvements dans la membrane?
- déplacement latéraux (diffusion latérale)
2.rotation sur eux même
3.flexion de chaines d’acide gras
4.Flip-flop (lipides du haut deviennent ceux du bas)