Examen 1 partie 2 Flashcards

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1
Q

Qu’est-ce que la microbiologie

A

Étude du devenir et de l’activité des microbes dans l’air , l’eau et le sol et limpacte de c’est derniers sur la santé et le bien-être humain

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2
Q

Louis pasteur

A

Rejet de la théorie de la génération spontanée
Démontre présence de microbe dans l’air

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3
Q

Robert Koch

A

Découvre l’a bacille de Koch
Technique de la culture pure
Fondateur bactériologie

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4
Q

Sergei winogradsky

A

Père de la microbiologie des sols
Identification des genres permettant l’effectuer la nitrification, autotrophie

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5
Q

1928 Griffith

A

Génétique bactérienne
Transformation

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6
Q

1952 Selman Waksman

A

Principes de microbiologie des sols
Découverte de la streptomycine

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7
Q

1953 Watson ans crick

A

Structure de ladn

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8
Q

1985 Kary Mullis

A

Réaction de polymérisation en chaîne

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9
Q

Comment les microbes influencent notre quotidien

A

Santé globale de la planète
Ce qui nous infecte
Ce qui nous guérit
Ce que nous buvons
Ce que nous mangeons

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10
Q

L’importance de l’écologie microbienne (3)

A
  1. Les microbes joue un rôle important dans les grands cycles biogeochimiques
  2. Interactions entre microorganismes: consortium, assemblages, communautés
  3. Interactions des microorganismes avec plantes et animaux
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11
Q

Les buts de l’écologie microbienne

A

Comprendre quels type de microbes sont dans quels environnement
Combien sont-ils
Que font-ils et que sont leurs fonctions
Comment survivent ils
Qu’est-ce qui contrôle leur activité et r leur abondance
Quel rôle jouent ils dans les cycles biogeochimqiues
Comment les microbes changent ou transforment chimiquement et physiquement l’environnement

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12
Q

Les classifications possibles chez les microbes

A

-classification basée sur l’abondance dans l’environnement
-classification basée sur la taille
-classification basée sur leur source d’énergie et de bcarbone

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13
Q

La différence entre phototrophe et chimiotrophe

A

P: oxygènique et anoxygénique utilisent l’énergie solaire (photosynthèse) comme source d’énergie
C: utilisent des composer organique ou inorganique comme source d’énergie

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14
Q

La différence entre autotrophe et hétérotrophe

A

A: obtiention de C par le CO2
H: obtention du C via des composés organiques simple comme le glucose

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15
Q

La différence entre photoautotrophe, chimie autotrophe et chimiohétérotrophes

A

P; obtiennent leur énergie via soleil et fixe le C via CO2 (cyanobacterie er bactéries vertes)
ÇA: obtiennent leur énergie via l’oxydation de composés inorganiques et fixe le C via CO2
CH: utilisent les composés organiques pour leur erreraient et leur C

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16
Q

Les hétérotrophes se divisent en deux catégories…..

A

Organotrophe: utilisent composés organiques dans le processus de décomposition, hydrates de carbones, acides organiques
Mixotrophes: capacité de passer de l’autotrophie à lheterotrophie dépendant des conditions environnementales

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17
Q

Qu’est-ce qu’un virus

A

Organisme pouvant affecter les organisme procaryote et eucaryote.
Sont des parasites obligés

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18
Q

De quoi est fait une composition virale

A
  • génome d’acide nucléique interne
    -Capside protéique externe
    -Enveloppe de membrane supplémentaire
    -N’ont pas de ribosomes et ne métabolisent pas
    -insensible aux antibiotiques
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19
Q

Qu’est-ce qu’une capside

A

-Manteau de protéine
-Sites récepteurs spécifiques pour l’attachement de l’hôte
-Protéger l’acide nucléique de la dégradation
-Les dommages peuvent rendre le virus non infectieux

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20
Q

Les étapes en orde de la croissance des virus

A

Absorption
Pénétration
Réplication
Maturation
Libération

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21
Q

Les différents types d’infection

A

Aiguë ; infection directement liée à la maladie
Chronique: cellule survit pendant une réplication virale prolongée
Latente: présent et peut-être intégré dans le chromosome de l’hôte, mais ne produit une progéniture que lorsqu’il est stimulé
Lente: augmentation progressive de l’effet jusqu’à la mort cellulaire

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22
Q

Rôles des phares

A

Contrôle des populations bactériennes
Contrôle de pathogènes bactériens spécifiques
Contrôle des cyanobacteries aquatiques à
Interactions avec les processus du réseau trophique
Interactions avec les cycles biogeochimiques
Amélioration de la diversité procaryote par transfert horizontal de gènes

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23
Q

Qu’est-ce qu’une bactérie

A

Organisme unicellulaire dépourvus de véritables noyaux (+ simple organismes cellulaire)
Inoffensifs ou bénéfiques
Rôles essentiels dans la décomposition et cycle des nutriments
Formes diverses

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24
Q

Les composantes cellulaire des bactéries

A

Enveloppe: capsule, paroi cellulaire, membrane plasmique
Protoplasme: cytoplasme, nucléoide, plasmides
Organelles: flagelle et pili

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25
Q

De quoi est composé l’enveloppe d’une bactérie

A

Glycocalyx (capsule)
Paroi cellulaire

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26
Q

Qu’est-ce que le glycocalyx (capsule)

A

-manteau membranaire constitue de glucides fixes à la surface de la membrane cellulaire
-lâche ou rigide
-protection contre perte d’eau et de nutriments et contre la toxicité environnementale
-non indispensable pour la survie de la cellule

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27
Q

Nomme les 4 types de paroi cellulaire

A

-Pas de paroi
-Avec paroi, mais sans couche peptidoglycan
-Gram positif : paroi épaisse et riche en peptidoglycane
-Gran négatif: membrane extérieur additionnelle et couche lipopolysaccharide permet interactions avec extérieur

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28
Q

De quoi est composé le protoplasme

A

Ribosomes
Acides nucléique: chromosome + plasmide
Autres

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29
Q

Les différents types d’organelles

A

Fimbria: plusieurs appendices courts qui facilitent la fixation aux surfaces
Pilus: moijns nombreux que fimbira mais plus long et uniquement dans les bactéries gram négatif et implique dans accouplement
Flagelle : simple ou multiple

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30
Q

Les trois différents modes de transfert génétique chez les bactéries

A

Conjugaison: échange de matériel génétique en utilisant un pilus
Transformation : intégration dadn relâche et libre par une cellule receveuse suite à la mort d’un donneur
Transduction : consiste au transfert de ladn dune. Acteur hôte à une receveuse via un bacteriophage

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31
Q

Qu’est-ce qu’une actinomycète

A
  • hétérotrophe
    Aérobie
  • à cheval entre bactérie et champignons
  • forment des filaments comme champignons
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32
Q

Les rôles des actinomycètes

A

Décomposition de la litière végétale
Tolèrent la sécheresse et les pH alcalins
Produisent des enzymes actifs et des antibiotiques utilisés en médecine
Certaines sont pathogénies
Produisent la geosmine

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33
Q

Qu’est-ce qu’un arche

A

Similaire physiquement à une bactérie
Génétiquement et biochimiquement differents
Environnement extrême
Pas cultivables

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34
Q

Qu’est-ce qu’un champignon

A

Eucaryotes
Micro à macroscopique
Filamenteux produisant des spores
Aérobie
Cellules fongiques généralement plus complexes et rigides que cellules procaryote (bactéries)

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35
Q

Qu’est-ce qu’un protozoaire

A

Animaux unicellulaire
Certains parasites
Consomment résidus organiques dans les sols

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36
Q

Rôles des protozoaires

A

Contrôle de la taille et de la composition de la population bactérienne
Cycle des nutriments

37
Q

Qu’est-ce qu’un diatomées

A

Algues
Paroi cellulaire composée de Si

38
Q

Qu’est-ce qu’un chrysophyte

A

Algues jaunes et brune
Mixotrophique ou phagotrophiques

39
Q

Qu’est-ce qu’un cryptophyte

A

Cellule avec flagelles
Pigment accessoires similaires aux algues rouges et cyanobacteries

40
Q

Qu’est-ce qu’une cyanobacteries

A
  • pas une algue
  • gênant lorsque trop de N et P
41
Q

Qu’est-ce que l’aérobiologie

A

étude de l’aérosolisation, de la transmission et de la déposition par voie aérienne de microorganismes et de matériel biologique importants pour l’environnement

42
Q

Qu’est-ce que l’aérosolisation

A

processus quand quelque chose de physique passe a une forme particulaire lui permettant d’être transportée dans l’air

43
Q

Qu’est-ce qu’un aérosol

A

Particules qui sont suspendues dans l’air

44
Q

Qu’est-ce que le Bioaérosol

A

Matériel biologique ou cellulaire qui est retrouvé dans l’air

45
Q

Nomme des types de bioaérosol

A

Bactéries
Virus
Champignons
Protistes
Toxines

46
Q

La différence entre une bactérie gram négative et positive

A

-: paroi cellulaire fragile qui supporte mal les UV solaires et la déshydratation, paroi facilite échanges avec extérieur
+: paroi plus résistante, mois facile les échanges avec l’extérieur et produisent des spores

47
Q

Nomme des toxines pouvant être en aérosol

A

Mycotoxine (métabolite secondaire produite par moisissures)
Neurotoxines (agissent sur s.nerveux)
Entérotoxines (troubles intestinaux)
Endotoxines (toxines dans membrane interne des gram -)

48
Q

Les trois classes de tailles

A

Mode noyaux (virus, mais peuvent s’agglomérer et aller vers mode accumulation)
Mode accumulation ( Stable et ne s’agglomèrent pas pour former plus grosse molécules)
Mode grossier (Déposition rapide vers le sol avec durée de vie dans l’air courte)

49
Q

Qu’est-ce que la Loi de Stoke

A

décrit ls chute des particules d’air, permet de déterminer que les petites particules sont capables de voyager sur une plus grande distance

50
Q

Les trois phases des voies aéromicrobiologiques

A

1.Lancement ou émission
2.Transport
a.Diffusion
b.Dispersion
3. Déposition
a.Gravitationnelle
b.Électrostatisme
c.Précipitation

51
Q

Qu’est-ce que la voie de lancement

A

-Les bioaérosols sont généralement introduits dans l’air via des sources aquatiques ou terrestre

52
Q

Les différentes sources de bioaérosols pendant la phase de lancement

A

-Source ponctuelle: isolée et bien définie dans l’espace
-Source linéaire: suit un vecteur comme le vent
-Source de zone: provient d’un territoire donné de grande taille

53
Q

Qu’est-ce que la dispersion

A

Processus par lequel l’énergie cinétique fournie par le mouvement de l’Air est transférée aux particules en suspension dans l’Air
-> résulte en un déplacement d’un endroit à un autre dans le temps et dans l’espace

54
Q

Qu’est-ce que la diffusion

A

C’est la dissipation de bioaérosols en réponse à un gradient de concentration

55
Q

Nomme les différents mécanismes de déposition

A

-Gravitationnelle
-Diffusion descendante
-Précipitation
-Électrostatisme
-Impact de surface

56
Q

Pourquoi les nuages sont un oasis bactérienne

A

Ils contienne des composés organiques comme des aldéhydes, des acides carboxyliques ou des alcools pouvant être métaboliser par les microorganismes

57
Q

Vrai ou Faux
La formation de spores joue un rôle important dans la possibilité d’être aérosolisé, mais permet aussi aux microorganismes de rester viables de nombreuses années dans les sols

A

Vrai

58
Q

Les facteurs à considéré pour avoir un bâtiment sécuritaire en termes de bioaerosols

A

-Présence de filtres dans appareil de ventilation
-Santé et l’hygiène des occupants
-Quantité d’air propre venant de l’extérieur
-Type d’éclairage
-Température et humidité ambiante
-Présence d’animaux

59
Q

La différence entre une pièce à pression positive et négative

A

-: pression d’air plus basse à l’intérieur de la pièce pour concentrer le pathogène à un seul endroit
+: air est forcé à l’extérieur de la pièce pour protéger l’intérieur de la pièce des contaminant

60
Q

Les différents niveaux de bio sécurité en laboratoire

A

1: aucun pathogène, aucun équipement spécialisé
2: formation spécialisée, accès contrôle, équipement de classe 2
3: confinement physique, ventilation filtrée à haute performance
4: isolement physique, confinement complet, combinaison de bio sécurité

61
Q

La définition d’un environnement extrême

A

-présente des propriétés chimiques et physiques qui rendent la survie difficile et incertaine

62
Q

Pourquoi on s’intéresse aux extrémophiles

A

-A des fins d’application à la société/ services écosystémiques
-Puisqu’ils sont adaptés à de très haut niveaux de stresse, et ils ont développer différents mécanismes, structure de survie.

63
Q

Nomme des services écosystémiques

A

-Service d’approvisionnement (avantages matériels)
-Services de régulations (Avantages tirés régulation processus écosystémiques)
-Services de soutiens (Espace de vie et diversité)
-Services culturels (Avantages non matériels)

64
Q

En quoi les structures de vie des extrêmophiles peuvent être utile à la société dans divers perspectives…

A

-Perspectives technologiques: développement de protéines thermostable et utilisation pour la biorémédiation
-Perspectives écologiques: théorie origine de la terre
-Perspectives astrobiologiques: capacité d’adaptation et limite de la vie sur terre

65
Q

Nomme différents type d’environnement extrême

A

-Alcalins: habitats naturels au dessus d’un ph 9
-Acides: habitat naturel en dessous de ph 3
-Extrêmement froids: en dessous de -17c
-Extrêmement chauds: au-delà de 55c
-Hyper-salés: concentrations en sel supérieur à celle de l’eau de mer > 3,5%
-Sous pression: habitats soumis à une pression hydrostatique extrême
-Rayonnement: exposés à un rayonnement anormalement élevé
-Sans eau: habitat sans eau libre
-Sans oxygène: habitats sans oxygène libre
-Modifié par les humains: habitats anthropiques

66
Q

Qu’est-ce qu’un organisme oligotrophe

A

-Organismes pouvant vivre dans des environnements qui offrent très peu d’éléments nutritifs
-Caractérisés par une croissance et un métabolisme lent
-Faible densité de population

67
Q

Qu’est-ce qu’un organisme copiotrophe

A

-Organisme à croissance rapide dans un environnement riche en nutriments

68
Q

Explique la dynamique de croissance chez les Oligotrophes vs Copiotrophe

A

-Taux de croissance des oligotrophes sera maximal à faibles concentrations de nutriments
-La densité de la population reste élevée chez les oligotrophes même lorsqu’il n’y a plus de nutriments

69
Q

Les habitats dont les oligotrophes seront en dominance dans la communauté microbienne

A

-Sédiment océaniques profonds
-Grottes
-Glace glaciaire et polaire
-Sol souterrain profond
-Aquifères
-Les eaux océaniques
-Sols lessivés

70
Q

Nomme deux groupes représentatifs des oligotrophes

A

-Sphingomonas
-Cycloclasticus Oligotrophicus

71
Q

Nomme des adaptations chez les oligotrophes

A

-Système d’absorption de substrat efficace et rapide (pour nutriments)
-Système d’absorption à haute affinité avec une large variété de substrats
-Grand rapport surface/volume
-Résistance inhérente à d’autres contraintes environnementales

72
Q

Les caractéristiques des thermophiles

A

-Organismes qui prospère à des températures relativement élevées
-Thermophile: croissance entre 50 et 70 c
-Hyperthermophiles: se multiplient de manière optimale de 80-110c

73
Q

Nomme les différents thermophiles en fonction des besoins en température

A

-Psychrophile
-Mesophile
-Thermophile
-Hyperthermophile

74
Q

Nomme l’habitat de thermophile

A

-Sols réchauffés par le soleil
-Sources volcaniques
-Compost
-Cheminées sous marines

75
Q

Nomme les groupes représentatifs des thermophiles

A

-Eucaryotes (champignons, algues et protozoaires)
-Prokaryotes (Streptomyces, cyanobactéries)

76
Q

Nomme un groupe représentatif-Hyperthermophiles

A

-Exclusivement prokaryotes
-Surtout les Archeae

77
Q

Nomme des adaptations au niveau de la membrane cellulaire des thermophiles

A

-Ajustement des lipides membranaires -> contiennent plus d’acides gras saturés et une monocouche membranaire partielle ou complète

78
Q

Nomme des adaptations au niveau du matériel génétique des thermophiles

A

-Barrière protectrice externe crée par une couche superficielle paracristalline (couche S) avec protéines
-Protection et stabilisation de l’ADN
-Stabilisation des protéines par des protéines de choc thermique, les chaperons, replient les protéines lorsqu’elles commencent à se dénaturer

79
Q

Les caractéristiques des Psychrophiles

A

-Psychrophiles sont des organismes qui peuvent compléter leur cycle de vie entier dans les endroits froids
-Se reproduisent généralement 0-10C
-Métabolisent dans la neige
-Souvent bactéries et archées
-Habitats: Désert froids, glace marine, pergélisol, mer profonde
-Prokaryotes, Eukaryotes et Archées

80
Q

Les conséquences du froid sur les Psychrophiles

A

-Toute baisse de température affecte de façon exponentielle le taux des réactions biochimiques
-Diminution de la fluidité des membranes
-Baisse des taux de transcription, de traduction et de réplication de l’adn
-Formation de glace intracellulaire

81
Q

Les adaptations des psychrophiles

A

-Spores ou kystes résistants au stress
-Accumulation de cryoprotecteurs, empêchent la dénaturation et agrégation des protéines
-Capsules ou gaines d’exopolysaccharides: protègent enzymes extracellulaires contre dénaturation par le froid
-Protéines antigel
-Enzymes
-Oritéines d’acclimatation

82
Q

Les caractéristiques des Piézophiles

A

-Vivent en pression hyper élevées
-Mieux adaptées avec une pression de croissance supérieur à 40 Mpa

83
Q

Nomme les classification des piézophiles en fonction des différentes pressions

A

-Piézosensibles
-Piézotolérantes
-Piézophiles
-Piézophiles stricts

84
Q

Nomme l’habitat des piézophiles

A

-Mer profonde
-Cheminées hydrothermales

85
Q

Nomme les groupes représentatifs des Piézophiles

A

-Majorité des prokaryotes
-Eucaryotes
-Archées

86
Q

Les adaptations des Piézophiles

A

-À cause d’une pression élevée, quantité des acides monoinsaturés et polyinsaturés augmente dans la membrane (meilleur fluidité de la membrane)
-Différents types de protéines qui se lient à l’ADN
-Synthèse des pores protéiques particuliers contrôlant les échangent avec le milieu externe
-Extrêmement sensibles à la lumière UV

87
Q

Caractéristiques des Acidophiles

A

-Prospèrent dans conditions acides
-Sources hydrothermales
-Développement de pompes à protons efficaces pour garder le cytoplasme à pH neutre

88
Q

Caractéristiques des tolérantes aux solvants organiques

A

-Prospèrent en présence de fortes concentrations de solvants organiques
-Retrouvées dans les sites contaminés aux hydrocarbures

89
Q

Les adaptations des tolérants aux solvants organiques

A

-Production de vésicules de transport des solvants
-Augmentation de la rigidité membranaire et diminution de sa perméabilité
-Production d’enzymes spécialisés