Examen 1 Flashcards
Qu’est-ce qu’un promoteur?
Séquence que l’ARN polymérase II reconnait
Quelle est la différence entre un exon et un intron
Exon: transcrit et traduit
Intron: transcrit et jamais traduit (normalement)
Quelles sont les différences entre le brin codant et le brin matrice?
Brin codant:
- 5’ –> 3’
- brin d’ADN non transcrit en ARNm
Brin matrice:
- 3’ –> 5’
- brin d’ADN transcrit en ARNm
- brin traduit
Quels éléments retrouvent-ont avant le TSS (site d’initiation de la transcription)?
Dans promoteur:
- TATA box (-20-30): séquence TATATA reconnue par la protéine TFIID, cofacteur de l’ARN polymérase II
- Boite CAT/CAAT et boite GC (-80): autres protéines de la transcription qui viennent se fixer
Le transcrit primaire subit quelles modifications?
- Ajout d’une coiffe en 5’: guanine (protège l’extrémité)
- Ajout qu’une queue polyA (protection, stabilité, durée de vie)
- Édition
- Épissage (enlève intron)
Ex.:
Si le brin codant est
5’-ATCGTTA-3’
quel sera le brin matrice et le pré ARNm?
Brin matrice:
3’-TAGCAAT-5’
PréARNm:
5’-AUCGUUA-3’
Comment est ajouté la queue polyA au transcrit primaire?
- Quand des signaux de fin transcription (à la fin des gènes) sont lus, l’ARN poly II arrête de transcrire et quitte l’ADN en libérant le transcrit primaire
- Une endonucléase coupe env. 15 nt après le signal AAUAAA (boite de polyadénylation)
Comment est enlevé la queue polyA?
Une fois l’ARNm actif dans le cytoplasme, des exonucléases vont la digérer. Quand elle sera réduite à 100A, l’ARNm est détruit et remplacé
Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription?
- Liaison de l’ARN polymérase au promoteur
- Changement de conformation du complexe promoteur-ARNpoly
(complexe initial de transcription) - Séparation des 2 brins d’ADN
Quelles sont les étapes de l’élongation de la transcription?
- Séparation des 2 brins d’ADN (ARNpoly rompt interactions avec promoteur)
- Ajout des nucléotides et dissociation du brin d’ARN de sa matrice au fur et à mesure de la synthèse (enzyme ne se décroche jamais du substrat/produit, donc vitesse très rapide)
- Réunion des 2 brins d’ADN derrière ARNpoly
- Correction des erreurs (pas bcp de correction comme pas efficace, mais pg pcq seront dégradés par après)
Quelles sont les étapes de la terminaison de la transcription?
Dissociation de
1. l’ARN (au fur et à mesure)
2. l’ARN polymérase
grâce à des signaux codés dans l’ARN après la région codante
Quelle est la différence entre la transcription in vitro et in vivo chez les bactéries?
In vitro: ARNpoly bactérienne purifiée peut transcrire n’importe quel fragment d’ADN (pas de spécificité)
In vivo: transcription uniquement à partir de régions promotrices, avec le facteur d’initiation σ
En quoi consiste la sous-unité σ?
C’est un facteur d’initiation qui reconnait spécifiquement les promoteurs bactériens
- l’ARNpoly contenant ce facteur est appelée “holoenzyme”
- positionné à l’int. de l’holoenzyme pour différencier les promoteurs
Que ce passe-t-il à la liaison du facteur σ avec l’ARNpoly?
- Changement de conformation du core
- Se lie spécifiquement aux promoteurs
Quelle boite retrouve-t-on spécifiquement dans les promoteurs bactériens? À quoi peut-elle être associée?
Boite de Pribnow (-10)
Associée à:
- Région -35 (+commun)
- Élément UP (upstream promoter element)
- Discriminateur