Définitions Flashcards
Brin codant/sens
Brin d’ADN non transcrit
5’-3’
Brin matrice/antisens
Brin d’ADN transcrit en ARNm et traduit
3’-5’
TATA box
Séquence TATATA à -20 reconnue par la protéine TFIID (cofacteur de l’ARN poly)
Boite CAT/CAAT/GC
Séquence où d’autres protéines de transcription viennent se poser
Sous-unité/facteur σ
- Reconnait spécifiquement les promoteurs bactériens
- Quand se lie à l’ARN polymérase = changement de conformation du core et se lie au promoteur
Holoenzyme
ARN polymérase bactérienne contenant la sous-unité σ
Boite de Pribnow (-10)
Boite dans les promoteurs bactériens, associée à un des éléments suivants:
- Région +35
- Élément UP (gène fortement exprimé)
- Discriminateur
4 domaines du facteur σ
σ4 : reconnait +35
σ2 : reconnait -10
σ3 : reconnait l’extension de -10
σ1 : reconnait le discriminateur
Élément UP
- Région riche en A-T pour une meilleure fixation
- Présent chez les gènes fortement exprimés
- Reconnu par αCTD
Synthèse abortive
Pendant l’initiation, l’ARN polymérase produit des petits ARNs (<9nt) avant de se libérer du promoteur pour commencer l’élongation. L’élongation commence quand la taille des petits ARNs dépassent 9nt, car ça oblige l’ARN à sortir du complexe, et s’insère dans son canal de sortie
Protéine Rho
Hexamère qui se lie à l’ARN à sa sortie de la polymérase
- Utilise son activité ATPase pour induire la terminaison
- Ne se lie pas au ARN en traduction car lié aux ribosomes
Terminaison Rho-Dépendante
Protéine Rho se fixe sur le site rut et induit la terminaison avec son activité ATPase
Terminaison Rho-Indépendante
Formée d’une séquence répétée/inversée de 20 bases, suivie d’une région de 8 A/T. Après leur transcription, il y a formation d’une structure en épingle à cheveux qui provoque la terminaison en:
1. Déplaçant la polymérase vers l’avant
2. Détachant la polymérase du transcrit
3. Induisant un changement de conformation de la polymérase
La terminaison est seulement efficace s’il y a une série de A-U
Promoteur minimal
Promoteur central composé d’éléments de reconnaissance (promoteur de base)
Promoteurs naturels
Séquences régulatrices:
- Activatrices/inhibitrices
- Proches/éloignées du promoteur
- Peuvent avoir des éléments pouvant aider/empêcher la transcription:
–> séquences activatrices en amont
–> enhancers/amplificateurs
–> silencers