Exam Flashcards
1
Q
kokiai sistemai priklauso transpozonai, lemiantys dėmių ant kukurūzo grūdų atsiradimą?
A
Ac-Dc
2
Q
kokios dėmės atsiranda ant kukurūzo grūdų dėl transpozonų?
A
aleurono
3
Q
dėl ko atsirado raukšlėtų žirnių požymis?
A
dėl transpozonų transpozicijos į struktūrinį geną, kuris koduoja krakmolo sintezei reikalingą fermentą
4
Q
transpozonų reikšmė (6)
A
- atsparumas antibiotikams;
- genetinė įvairovė;
- genomo evoliucija;
- genų ekspresijos reguliacija;
- genetinis nestabilumas;
- vėžio formavimasis
5
Q
JGE transpozicijos būdai (3)
A
- paprastoji (kerpa+klijuoja)
- replikacinė (kopijuoja+klijuoja)
- retrotranspozicija
6
Q
kur daugiausiai aptinkama paprastoji transpozicija?
A
bakterijose ir eukariotuose
7
Q
kur daugiausiai aptinkama replikacinė transpozicija?
A
bakterijose
8
Q
kur daugiausiai aptinkama retrotranspozicija?
A
eukariotuose
9
Q
kaip skirstomi JGE pagal turimus elementus? (2)
A
į autonominius ir neautonominius
10
Q
kas būdinga autonominiams JGE? (3)
A
- turi visą info transpozicijai
- savyje koduoja traspozazę/ transkriptazę
- juda savarankiškai
11
Q
kodėl autonominiai JGE juda savarankiškai?
A
nes savyje koduoja transpozazę/transkriptazę
12
Q
kas būdinga neautonominiams JGE?
A
- trūksta genų, reikalingų transpozicijai vykti
2. reikia kito JGE, kad galėtų judėti
13
Q
kokius genus savyje koduoja visi autonominiai JGE?
A
baltymo transpozazės genus
14
Q
kas yra transpozazė?
A
fermentas, besijungiantis prie JGE pabaigos ir katalizuojantis jo judėjimą į kitą genomo vietą (kopijuojant/iškerpant ir įklijuojant)
15
Q
atvirkštinės transkriptazės funkcija
A
sintetina DNR grandinę pagal RNR matricą
16
Q
kur dažniausiai aptinkama atvirkštinė transkriptazė?
A
retrovirusuose
17
Q
dėl ko vyksta retrotranspozicija?
A
dėl atvirkštinės transkriptazės
18
Q
ar kukurūzų Ds elementas yra autonominis?
A
ne
19
Q
ko trūksta kukurūzų Ds elementui?
A
transpozazės geno
20
Q
ar Ac lokusas yra autonominis?
A
taip
21
Q
kaip skirstomi JGE pagal klases? (2)
A
- retrotranspozonai
I. LTR
II. ne LTR - DNR transpozonai
22
Q
kas būdinga retrotranspozonams? (6)
A
- juda tarpininkaujant RNR molek.
- nekoduoja transpozazės
- transkriptų perkėlimui nuo RNR naudoja atvirkšt. transkriptazę
- LTR abiejuose galuose turi ilgas nekoduojančias sekas (100bp - 5 kb), neautonominiai
- autonominiai turi ORF seką, neautonominiai - ne
- transpozicijai reikalinga integrazė
23
Q
kas yra atvirkštinė transkripcija?
A
RNR molek. vertimas į DNR.
24
Q
integrazės funkcijos (2)
A
- įsiterpia į integracijos vietą
2. sudaro DNR trūkį
25
į kokias grupes skirstomi LTR retrotranspozonai? (3)
1. Ty1-copia-like
2. Ty3-gypsy-like
3. endogeninius retrovirusus
26
kur aptinkami Ty1 ir Ty3?
gyvūnuose, grybuose ir augaluose
27
kur aptinkami endogeniniai retrovirusai?
gyvūnuose
28
kuo Ty1 ir Ty3 skiriasi nuo retrovirusų?
neturi apvalkalo baltymą koduojančio geno
29
kokius baltymų domenus koduoja Ty1? (4) TIKSLI EILĖS TVARKA
1. proteazę;
2. integrazę;
3. atvirkšt. transkriptazę;
4. ribonukleazę H
30
kur plačiai aptinkami Ty3?
augaluose
31
kokius baltymų domenus koduoja Ty3? (4) TIKSLI EILĖS TVARKA
1. proteazę;
2. atvirkšt. transkriptazę;
3. ribonukleazę H;
4. integrazę
32
į ką skirstomi ne LTR retrotranspozonai? (3)
1. SINE
2. LINE
3. Alu
33
kokio ilgio sekas koduoja LINE JGE?
1-5 kba
34
3 LINE pogrupiai
L1, L2, L3
35
kokios dalys sudaro žmogaus koduojamą L1? (4)
1. netransliuotas regionas
2. ORF1
3. ORF2
4. UTR seka
36
kiek bp sudaro SINE?
iki 500 bp
37
ar SINE koduoja atvirkšt. transkriptazės baltymą?
ne
38
ar SINE priklauso nuo kitų JGE?
taip
39
kur ir kaip daugiausiai integruojasi SINE?
chromosomų trūkiuose naudojant atvirkštinę transkriptazę
40
ar DNR transpozonai naudoja RNR tarpininkus?
ne
41
pagal ką charakterizuojami II kl. transpozonai?
pagal galuose turimus terminalinius invertuotus pasikartojimus (9-40 bp)
42
kam reikalingos DNR transpozonų galuose invertuotos sekos?
kad kurią nors iš jų atpažintų transpozazė
43
Pagr. JGE sekų tipai (6)
1. insercinės sekos
2. sudėtiniai transpozonai
3. replikaciniai transp.
4. retroelementai
5. virusų tipo
6. ne virusų tipo
44
kas būdinga euchromatinui? (4)
1. mažiau kondensuotas
2. jame vyksta aktyvus genų nurašymas ir sintezė
3. ląst. interfazėje
4. dažosi šviesiau
45
kas būdinga heterochromatinui? (3)
1. labai kondensuotas
2. ląst., kuriose aktyvi transkripcija nevyksta
3. dažosi tamsiau
46
2 chromatiną modifikuojančių baltymų klasės
1. polycomb
| 2. trithorax
47
į kokius kompeksus skirstomi polycomb baltymai?
1. PRC1
I. HP1 (heterochromatino baltymai)
2. PRC2
48
į kokius kompeksus skirstomi trithorax baltymai?
1. SWI/SNF
2. CHD
3. ISWI
49
PcG ir trxG svarba (3)
1. keičia transkripcijos aktyvumą
2. embriogenezė
3. ląst. diferenciacija
50
kas yra hox genai?
susijusi genų gr., kuri kontroliuoja embriono kūno planą
51
kaip polycomb baltymai veikia transkripcijos atžvilgiu?
slopinančiai
52
kaip trithorax baltymai veikia transkripcijos atžvilgiu?
aktyvinančiai
53
kaip polycomb ir trithorax baltymai veikia per Hox genų raišką?
koordinuoja ląstelių vystymąsi, atsinaujinimą ir diferenciaciją
54
kokios 2 genų šeimos sudaro Hox genus, kuriuos reguliuoja polycomb ir trithotax?
1. Antennapedia (ANT-C)
| 2. Bithorax (BX-C)
55
ką kontroliuoja BX-C sritis?
embriono užpakalinių dviejų trečdalių segmentų vystymąsi
56
ką kontroliuoja ANT-C sritis?
embriono priekinių segmentų ir galvos vystymąsi
57
kaip PcG baltymai kontroliuoja genų raišką?
katalizuodami H3K27 metilinimą arba H2A K119 ubikvitilinimą
58
kokie represiniai kompleksai sudaro PcG? (3)
1. PRC1
2. PRC2
3. PR-DUB
59
PRC1 komplekso funkcijos (4)
1. ubikvitilina H2A K119
2. nefermentiniu būu tankina chromatiną
3. tiesiogiai sąveikauja su transkripcijos mechanizmais
4. susirišęs su chromatinu blokuoja SWI/SNF priėjimą prie chromatino
60
2 skirtingi mechanizmai, kuriais PRC1 kompleksas sąveikauja su nukleosomomis
1. dėl RING1 radikalų (į H2A įsiterpia argininas ir lizinas, į H2B - glutaminas ir histidinas, taip susidaro van der Valso ryšys. tokiu būdu Polycomb prisijungia prie DNR ir ubikvitilina baltymus)
2. dėl PCGF domenų, kurie jungiasi prie H3 ir H4 histonų
61
kas yra PRC2?
nuo SAM priklausomos histonų metiltransferazės, kurios katalizuoja H3K27 mono, di arba trimetilinimą
62
kokią įtaką embrionui daro Ezh2 geno nutildymas?
yra letalus
63
kaip skirstomi PRC kompleksai žinduoliuose pagal struktūros pokyčius?
į kanoninius ir nekanonius
64
į kokias 3 klases skirstomi trxG grupės baltymai?
1. histoną modifikuojantys
2. chromatiną remodeliuojantys
3. DNR surišantys
65
kokie kompleksai sudaro chromatiną remodeliuojančius trxG baltymus? (4)
1. SWI/SNF
2. CHD
3. ISWI
4. INO80
66
kur aptinkamas SWI/SNF kompleksas?
tiek eukariotuose, tiek prokariotuose
67
SWI/SNF funkcija (3)
1. prisideda pertvarkant kondensuotą DNR;
2. aktyvuoja ATPazę;
3. destabilizuoja histonų-DNR sąveiką nukleosomose nuo ATP priklausomu būdu
68
žmogaus SWI/SNF analogai (2)
1. BAF
| 2. PBAF
69
ISWI funkcijos (3)
1. reguliuoja koduojančių ir nekoduojančių RNR transkripciją;
2. mobilizuoja nukleosomas;
3. kontroliuoja tarp nukleosomų esančio tarpo - jungties ilgį
70
kuo yra ypatingi CHD baltymai?
turi du N-galinius chromodomenus
71
CHD svarba (2)
1. reguliuoja transkripciją
| 2. dalyvauja vystymosi procesuose
72
cinko pirštų (ZF) baltymų funkcijos (2)
1. atpažįsta nemetilintą DNR;
| 2. modifikuoja chromatiną per susitelkusius CpG elementus
73
kurie 2 baltymai metilina citoziną?
1. TET
| 2. TET3 hidroksilatas
74
koks turi būti chromatinas, kad genas būtų aktyvus?
dekondensuotas
75
kuo pasireiškia genominis imprintingas?
kaip vieno iš alelių inaktyvinimu, priklausomai nuo to, ar jis gautas iš motinos, ar iš tėvo
76
ką koduoja Igf2 genas?
IGF2 signalinę molekulę
77
kas yra IGF2 signalinė molekulė?
į insuliną panašus augimo faktorius, skatinantis vaisiaus augimą
78
ar iš tėvo paveldėtas Igf2 genas yra įjungiamas, ar išjungiamas?
įjungiamas
79
ar iš mamos paveldėtas Igf2 genas yra įjungiamas, ar išjungiamas?
išjungiamas
80
jei tėvo Igf2 genas yra mutavęs, o motinos sveikas, kuris iš jų bus išjungiamas?
motinos sveikasis
81
kokį paveldėjimą turi Igf2 molekulęs receptorius Igf2r?
motininį
82
kokį paveldėjimą turi prie Igf2 molekulės linkusi jungtis H19 nekoduojanti RNR molekulė?
motininį
83
kas sukelia geno aktyvumo pokyčius, kurie lemia specifinį pasireiškimą (imprintingą)?
epigenetinės žymės (ne DNR sekos mutacijos)
84
5 genominio imprintingo mechanizmai
1. DNR metilinimas
2. chromatino modifikacijos
3. chromosomų padėties efektas
4. nekoduojančios RNR
5. transpozonai
85
į kokias 3 rūšis skirstomos chromatino modifikacijos?
1. histonų modifikaciijos
2. polycomb ir trithorax gr. baltymai
3. chromatino izoliatoriai
86
kaip DNR metilinimo būdu yra išjungiamas genas?
fermentas metiltransferazė prijungia metilo grupę prie 4,5 C atomo citozino molekulėje
87
DNR metilinimo funkcijos (2)
1. saugoti ląstelę nuo transpozonų
| 2. reguliuoti ląst. šeimininkės genomo raišką
88
kas yra aptinkama DMR (diferencijuotai metilintuose regionuose)?
daug tarpusavy nesusijusių metilintų sekų
89
kur yra genominio imprintingo lokalizacija?
šalia DMR (diferencijuotai metilintų regionų)
90
kokie elementai užtikrina aleliui specifinę genų raišką?
cis ir trans elementai, įjungiami DMR sekose
91
kokios sekos sukelia de novo metilinimą bei embrionui specifinius diferencinius metilinimus?
šalia DMR esančios dažnai pasikartojančios sekos
92
kada visi imprintai būna ištrinti?
prieš tėvams perduodant genus
93
kada vyksta pirminis imprintingas?
po apvaisinimo, formuojantis gemalui
94
kas yra atsakingi už de novo gemalo ląstelių DNR metilinimą?
Dnmt3a metiltransferazė ir jos kofaktorius Dnmt3L
95
3 reiškiniai, turintys įtakos Dnmt3a metiltransferazei atskiriant tėvinius ir motininius DMR
1. skirtinga lokalizacija tėvo/motinos DNR sekose;
2. motinos perduoto geno DNR metilinimas Gnas/Nesp lokuse;
3. skirtinga baltymo Dnmt3L sintezė oocituose ir spermatocituose
96
Gnas/Nesp lokusų funkcija
išjungia genus, atsakingus už imprintingo kontrolę (tai palengvina motininių alelių imprintingą)
97
kada stebima trumpalaikė Dnmt3L raiška oocituose?
kelios dienos prieš ovuliaciją
98
kada stebima Dnmt3L raiška spermatocituose?
nuo prenatalinio laikotarpio vykstant spermatogenezei, gali tęstis iki pilnos brandos
99
kokiu atveju konformacijos pasikeitimai chromatine turi įtakos transkripcijos faktoriams ir kitiems reguliaciniams baltymams?
nustatant genų tinkamumą prieš vykdant transkripciją
100
kas gali lemti aleliui specifinę genų raišką?
skirtingai modifikuota chromatino struktūra
101
ką gali sukelti histonų modifikacijos? (2)
1. genų nutildymą
| 2. transkripcijos aktyvumo pasikeitimą
102
su kuo siejamas histonų acetilinimas?
su transkripcijos aktyvinimu
103
kada dažniausiai vyksta histonų deacetilinimas?
kai reikia sustabdyti transkripciją
104
kaip gali vykti histonų modifikacijos? (3)
1. deacetilinant C ar G
2. metilinant C ar G
3. metilinant lizino likučius ant histonų
105
nuo ko priklauso, ar transkripcija bus slopinama, ar aktyvinama? (2)
1. lizino pozicijos ant histonų
| 2. metilinimo lygio
106
kas inaktyvuoja X chrom. žinduolių patelėse?
H3K9 metilinimas
107
kas lemia Prader-Willi sindromą?
H3K9 ir CpG metilinimas
108
su kuo siejamas H3K4 metilinimas?
su transkripcijos aktyvinimu
109
Dnmt3L (Dnmt3a kofaktoriaus) funkcija
prijungti Dnmt3a prie H3 ir taip neleisti vykti H3K4 metilinimui ir CpG metilinimui
110
ką vykdo KDM1B demetilazė?
H3K4 demetilinimą
111
kur svarbus H3K4 demetilinimas?
vėlyvojoje oogenezėje, kai vyksta de novo metilinimas motininėse DMRs sekose
112
kas yra specifinis faktorius motininėms DMRs sekoms nustatyti?
KDM1B raiškos laikas
113
kur dalyvauja baltymas PcG? (3)
metilinant histonus;
inicijuojant X chrom. inaktyvaciją;
reguliuojant DNR ir histonų metilinimą audiniui specifinėse sekose
114
MBD funkcijos (3)
1. prijungia metilintą CpG;
2. reguliuoja transkripciją;
3. veikia kaip tildantis faktorius metilintose sekose somatinėse ląst.
115
Dnmt1 funkcija
padeda išsaugoti tėvinius imprintus dauginantis somatinėms ląst.
116
kas yra chromatino izoliatoriai?
elementai, blokuojantys sąveiką tarp įvairių DNR reguliacinių elementų (dažn. promotoriaus ir enhancerio)
117
chromatino izoliatorių funkcijos (2)
1. inaktyvuoja transkripciškai aktyvų heterochromatiną;
| 2. apsaugo DNR sekas nuo chrom. padėties efekto ir cis reguliacinių elementų
118
chromatino izoliatorių lokalizacija
šalia H19/IGF2 geno sekų
119
2 priežastys, dėl ko pasireiškia chrom. padėties efektas
1. geno translokacijos prie kitų reguliacinių sričių chromosomoje;
2. geno translokacijos į heterochromatininę chrom. sritį
120
ką lemia drozofilų w[m4] geno translokacija?
raudonų akių fenotipą vietoj baltų
121
kas vyksta, kai baltojo geno raiška vykdoma tik kai kuriose akies ląstelėse?
mutantų akies spalva būna marga (raudonos ir baltos sp. mozaikos)
122
ncRNR Xist funkcija
reguliuoja žinduolių X chrom. inaktyvaciją
123
ką lemia netinkamas imprintingas 15q11-13 regionuose? (2)
1. Prader-Willi sindr. (PWS)
| 2. Angeman sindr. (AS)
124
koks pokytis 15 chrom. stebimas PWS ir AS sergančiuose pacientuose?
dvipusė mikrodelecija
125
kuris (tėvinis ar motininis) UBE3A genas yra išjungiamas įprastomis sąlygomis?
tėvinis, motininis paliekamas veikti
126
kas lemia Angelman sindromą?
dėl tam tikrų pakitimų išjungta ir motininė UBE3A geno kopija
127
kuris (tėvinis ar motininis) SNURF/SNRPN genas yra išjungiamas įprastomis sąlygomis?
motininis, tėvinis lieka veikti
128
kas lemia Prider-Willio sindromą?
dėl tam tikrų pakitimų išjungta ir tėvinė SNURF/SNRPN geno kopija
129
kas yra Angelman sindromas?
genetinis sutrikimas, sukeliantis lėtesnį vystymąsi ir neurologinius sutrikimus
130
kada pasireiškia Angelman sindromo požymiai?
2-3 metų amžiaus
131
Angelman sindr. požymiai (5)
1. hiperaktyvumas;
2. miego sutrikimai;
3. judėjimo ir pusiausvyros sutrikimai;
4. maža galvos apimtis, spec. veido bruožai;
5. šypsosi
132
Prader-Willi sindr. požymiai (12)
1. nuolatinis alkio jausmas
2. sotumo trūkumas
3. silpna odos, plaukų ir rainelės pigmentacija
4. maža burna
5. pailga galvos forma
6. migdolų formos akys
7. plati nosis
8. sumažėjęs kaulų tankis
9. letargioja
10. žvairumas
11. vėlesnis brendimas
12. antsvoris
133
ką sukelia Igf2 geno imprintingo praradimas? (2)
padidėjusią IGF2 sintezę;
| nefroblastomą
134
koks sindromas pasireiškia turint hipermetilintus H19 ir IGF2 genus?
Russell-Silver
135
Russell-Silver sindr. simptomai (7)
1. maitinimo probl.
2. padidėjęs prakaitavimas
3. blyški oda
4. mažas cukraus kiekis kr.
5. mažas trikampis veidas
6. melsvo atspalvio akių baltymai
7. kūno asimerija
136
kokiu atveju pasireiškia pseudohipoparatiroidizmas?
turint motinos perduoto GNAS geno defektą
137
ką lemia DIRAS3 geno supresija?
padidėjusią krūtų ir gimdos vėžio riziką
138
kaip yra išjungiama viena iš X chrom.?
atsitiktiniu ar imprintingo būdu sukoncentruojant į baro kūnelį
139
kada vyksta atsitiktinis X chrom. inaktyvavimas?
ankstyvoje embriogenezėje
140
veiksniai, galintys turėti epigenetinį poveikį (9)
1. sunkieji metalai
2. pesticidai
3. degalų atliekos
4. tabako dūmai
5. hormonai
6. radiacija
7. virusai
8. bakterijos
9. maisto produktai
141
3 epigenominio paveldimumo pasireiškimo būdai
1. prenatalinė ekspozicija
2. multigeneracinis epigenom. paveld.
3. transgeneracinis epigenom. paveld.
142
kas yra prenatalinė ekspozicija?
tiesioginis poveikis būsimam palikuoniui, esančiam įsčiose (tik F1)
143
kas yra multigeneracinis epigenom. paveld.?
tiesiogiai veikiamas vaisius ir jo gametos arba tik jo gametos (F1 ir F2)
144
kas yra transgeneracinis epigenom. paveld.?
epigenominis paveldimumas iš kartos į kartą
145
2 perduodamų epigenetinių žymių rūšys evoliucine prasme
1. stabilios
| 2. nestabilios
146
prenatalinės ekspozicijos įtaka (5)
1. de novo epigenomo formavimasis
2. org. fenotipas
3. gyvenimo trukmė
4. lėtinių ligų atsiradimas
5. vaisiaus epigenetinio kodo pasikeitimas prieš gimstant
147
ką gali nulemti motinos mityba, stresas, trauminė patirtis nėštumo metu? (3)
1. vaisiaus pakitusį gliukozės ir cholesterolio metabolizmą
2. pakitusį širdies darbą
3. pakitusį kraujo spaudimą
148
kokią įtaką darė žiurkių motinų elgesys su palikuonimis?
jei gerai prižiūrėdavo - būdavo ramesni ir geresni tėvai
149
ką aktyvuodavo žiurkės motinos palikuonių organizmuose, juos gerai prižiūrėdamos?
geną, kuris slopindavo streso hormono kortizolio gamybą
150
per kokius 2 mechanizmus atsiranda pokytis, teigiamai lemiantis smegenų veiklą, kuri reguliuoja elgesio ir endokrininę reakciją į stresą?
DNR metilinimo;
| chromatino modifikacijų
151
kas nutinka, kai Agouti genas būna metilinamas?
melaninas sintetinamas, kailis įprastos spalvos
152
kas nutinka, kai Agouti genas būna demetilinamas?
atsiranda polinkis sirgti įvairiomis ligomis, įskaitant vėžį
153
ką lemia motinos prasta mityba ir rūkymas nėštumo metu? (3)
vaisiaus širdies ir kraujagyslių ligų riziką, medž. apykaitos ligas, šizofreniją
154
kur keičiasi chromatino būklė taikant tam tikrą dietą?
tiek somatiniuose audiniuose, tiek gametose
155
kurioms kartoms turi įtakos tėvų dieta?
F1 ir F2
156
kas, epigenetinės žymės ar jų mechanizmai, paveldimi transgeneracinio epigenominio paveldėjimo būdu?
epigenetinių žymių mechanizmai
157
trangenercinio epigenomo paveldėjimo svarba (3)
1. ląst. diferenciacija
2. genominis imprintingas
3. X chrom. inaktyvacija
158
ką lemia Lcyc geno metilinimas?
žiedų skirtumus tarp paprastosios linažolės variantų, kurių epigenomas identiškas
159
už ką atsakingas Lcyc genas?
už žiedų dorsoversalinę asimetriją
160
kas yra epigenetinis perprogramavimas?
procesas, kurio metu epigenetinės žymės yra ištrinamos arba uždedamos iš naujo tam, kad ląstelėse būtų atstatyta arba pakeista pluripotentinė būsena
161
3 kamieninių ląstelių rūšys pagal diferenciacijos potencialą
1. totipotentinės
2. pluripotentinės
3. multipotentinės
162
kas yra totipotentinės kam. ląst.?
tos, kurios gali diferencijuoti į visus ląst. tipus
163
kur aptinkamos totipotentinės kam. ląst.?
zigotoje
164
kas yra pluripotentinės kam. ląst.?
tos, kurios gali virsti multipotentinėmis ir diferencijuotis į visus ląst. tipus
165
kur aptinkamos pluripotentinės kam. ląst.?
embrione
166
kas yra multipotentinės kam. ląst.?
tos, kurios diferencijuojasi į skeleto raumens, širdies raumens, kepenų ląst., visų tipų kraujo ląst.
167
kur aptinkamos multipotentinės kam. ląst.?
šalia tų audinių, į kuriuos diferencijuojasi
168
į kokias 3 rūšis skirstomos multipotentinės ląst.?
1. oligopotentines
2. unopotentines
3. hemapoetines
169
į ką diferencijuoja oligopotentinės ląst.?
į limfoidines ar mieloidines ląst.
170
į ką diferencijuoja unopotentinės ląst.?
į raumenines ląst.
171
į ką diferencijuoja hemapoetinės ląst.?
į kraujo ląst.
172
3 kamieninių ląst. rūšys pagal kilmę
1. prenatalinės (embriono)
2. postnatalinės
3. indukuotosios
173
iš kur gaunamos prenatalinės kam. ląst.?
iš kelių dienų amžiaus vidinio blastocistos sluoksnio ar vaisiaus vandenų
174
iš kur gaunamos postnatalinės kam. ląst.?
iš susiformavusių organizmo audinių
175
iš kur gaunamos indukuotosios kam. ląst.?
iš somatinių ląst.
176
kas vyksta veikiant natūraliam epigenetiniam perprogramavimui? (plačiai)
epi modifikacijos reguliuoja genų raišką specifiškai, žymi genominius regionus, kurie perduoda paveldimus ir stabilius chromatino modifikacijų procesus, o jie diktuoja transkripcijos būklę
177
kada vyksta I epigenetinio perprogramavimo etapas?
iškart po apvaisinimo, gemalo ląst. vystymosi metu
178
epigenetinio perprogramavimo funkcijos I etapo metu (2)
iš naujo nustato genominius imprintus;
| atkuria totipotenciją
179
kur vyksta II epi perprogr. etapas?
pirminėse lytinėse ląst.
180
kaip atsiranda asimetriškumas tarp tėvų genomų?
tėvinė DNR demetilinimama greitai, o motininė - nuosekliai
181
kada atsiranda asimetriškumas tarp tėvų genomų?
I epi perprogr. etapu, zigotai pereinant į blastocistos stadiją
182
ką nustato asimetriškumas tarp tėvų genomų?
epigenetines ląst. charakteristikas (somatinių - vidinė ląst. masė, embriono išorės - ektoderma)
183
kada nukleoproaminai yra pakeičiami į nukleohistonus?
per pirmąją apvaisinimo valandą
184
kas vyksta keičiant vyriškojo chromatino organizaciją? (2)
1. pašalinamos histonų deacetilazių katalizuotos acetilo gr.;
2. specifinių histonų metiltransferazių sąlygoti procesai
185
pagr. baltymai, dalyvaujantys epigenetiniame perprogramavime (5)
1. TET1 hidroksilazė
2. TET2 hidroksilazė
3. TET3 hidroksilazė
4. DNMT3A metiltransferazė
5. DNMT3B metiltransferazė
186
TET funkcija
katalizuoti 5mC demetilinimą
187
3 žingsniai, kaip TET modifikuoja 5mC
1. verčia 5hmC -->
2. verčia 5fC (-formil-) -->
3. verčia 5caC (-karboksil-)
188
kur aptinkami TET1 ir TET2 baltymai?
embrioninėse kamieninėse ląst/
189
kur aptinkami TET3 baltymai?
gametose bei gemalo ląst.
190
kokiu būdu TET baltymai modifikuoja 5mC?
oksiduojant
191
kokiu raiškos lygiu pasižymi TET1 ir TET2 oocituose ir zigotose?
žemu
192
kokiu raiškos lygiu pasižymi TET3 oocituose ir zigotose?
aukštu, bet ląst. dalijantis greitai išnyksta
193
kaip didėjanti DNR replikacija veikia nuo TET3 priklausomą 5mC oksidaciją?
oksidacija mažėja ir išnyksta
194
kokiu laikotarpiu auga TET1 ir TET2 raiškos lygis?
preimplantaciniu laikotarpiu
195
kurių 5mC oksidacija vyksta pirmiausiai: motininių ar tėvinių?
tėvinių
196
3 etapai, kaip vyksta DNR demetilinimas pirminėse gemalo ląstelėse
1. prarandama didžioji dalis DNR metilinimo nepriklausomai nuo TET;
2. 5mC oksidacija iki 5hmC TET1 ir TET2 baltymais;
3. 5hmC prarandama replikacijos metu
197
kas yra DNMT?
DNR metiltransferazių šeima, galinti metilinti pusiau metilintas arba nemetilintas CpG
198
DNMT1 funkcija
metilina pusiau metilintą citoziną CpG sekose tėviniame genome
199
DNMR3A ir DNMT3B funkcijos (2)
metilinti nemetilintas CpG sekas;
| de novo metilinimas
200
kuo svarbus DNMT3L?
atsakingas už motininių imprintų atsiradimą
201
kuo žalingas DNMT3L praradimas?
sąlygoja bialelinę genų raišką, t.y. neteisingą imprintingą
202
DNR demetilinimo funkcija preimplantaciniu laikotarpiu
sukurti pluripotentinį genomą, dėl kurio galėtų vystytis ektoderma, endoderma ir mezoderma
203
nuo ko apsaugo DNR demetilinimas tėviniame genome?
transpozonų
204
dėl ko padidėja DNR metilinimo lygis embrioniniame mezodermos audinyje?
DNMT3A ir DNMT3B raiškos
205
koks baltymas reguliuoja pirminių lytinių ląst. vystymąsi?
BMP
206
kaip migruojančios pirminės lytinės ląst. sustabdomos G2 fazėje ir tampa transkripciškai neaktyvios? (2)
1. sumažinamas H3K9me2 kiekis
| 2. padidinamas H3K27me3 kiekis
207
kokie veiksmai turi būti atliekami perprogramuojant somatines ląst., pertvarkant chromatiną?
1. X chrom. reaktyvacija;
2. retrovirusų promotorių nutildymas;
3. diferenciavimui specifinių genų sekų metilinimas;
4. pluripotenciškumo genų sekų demetilinimas
208
kokie somatinėse ląst. yra pluripotencinių genų promotoriai ir H3K9me3?
metilinti
209
kas nutildo somatinius genus? (2)
1. de novo metilinimas
| 2. PRC2 sąveika
210
kaip DNMT1 ir MeCP2 somatinėse ląst. stabdo genų raišką?
jungdamiesi prie metilintų somatinių genų promotorių
