Exam 3 chap 9 et 10 Flashcards
Description signalisation contact dépendant
demande que les cell sont en contact directe. La molécule signal reste fixer à la membranes
ex. réponse immunitaire
Description signalisation paracrine
dépend de médiateur locaux libérer dans espaces extracell agissent sur cell voisines
Régule environnement immédiat
Signalisation autocrines
Type particulière paracrines, cell emet ces propre molécule de signal.
Signalisation endocrine
mode dépend de cell endocrine sécrète hormone dans circulation sanguine, agit sur longue distance
type de complexe de signalisation
- Préformer sur échafaudage ; maintient les composantes du voie a proximité
peut être pré assembler sur le recepteur avant son activation, permet activation rapide et séquentielle des mol. impliquer - Assembler sur un recepteur : complexe qui se forme transitoirement et se dissocie quand le signal disparait
- Assembler sur des sites d’arrimage de phosphoinositides : activation recepteur entraine hyperphosphorylation des phosphoinosides présent sur la membranes crée des sites d’ancrage.
Type de domaine d’interaction proteine-proteine
- Domaine homolgie Src2 (SH2) ; domaine qui fixent aux tyrosine phohsphorylé
- Domaine de fixation aux phosphotyrosine (PTB) ; fixe aux tyrosine phosphorylé
- Domaine d’homologie Src3 (SH3) ; domaine qui fixe courte séquence riche en proline
- Domaine d’homologie à la pleckstrine (PH) ; domaine qui fixe les phosphoinositdes spécialiser dans la membrane plasmique
Adapteur ; proteine composer de deux ou plusieurs domaines d’intéraction agissent comme intermédiaire entre deux molécules de signalisation
Sensibilité est contrôler par ;
- le nombre de recepteur
2. affinité pour le signal
Temps de réponse (2 grands types)
- Réponse lente : si requiert expression de gènes et synthèse de nouvelles mol
- Réponse rapide ; si requiert modification de protéine déja existante
Quel qui dicte l’effet transitoire (le temps que la réponse perciste)
une réponse est souvent transitoire, va dépendre le stabilité des molécules de signalisation
Souvent un signal demande augmentation de la synthèse de molécule instable
Son effet (du mol de signalisation) dépend de sa 1/2 vie
Def de réponse progressive
grand éventaille de concentration de mol de signal, réponse proportionnelle à la concentration
Def de réponse discontinu et deux sous-types
produit seulement un réponse apartir d’un certains seuil de concentration
1. Sigmoïdales : pas de réponse à de faibles concentration, réponse à des concentration intermédaire et augmente progrsseviement
(permet d’exclure signal non spé et permet de réduire le bruit)
2. Abrupte : réponse complet à de haut concentration (tout ou rien)
Méthode de désensibilisation
- Séquestration de recepteur : endocytose
- Régulation négative recepteur : endocytose suivie de dégradation
- Inactivation : pas phosphorylation ou déphophorylation du recepteur
- Inaction de la proteine de signalisation (intracell)
- Production d’une proteine inhibitrice
Mode de désensibilisation des repcepteur coupler à des proteines G
- Séquestration des recepteurs : déplacer temporaiement à l’intérieur de la cell (dans endosome, limite accès à la mol de signal)
- Destruction des recepteur : diriger vers les lysomes
- Inactivation des recepteur : modificer de facons plus intéragir avec les proteines G
dépend de la phosphorylation des recepteur par des kinases (qui sont activer par les recepteur eux-même), une fois phosphoryler recepteur lie arrestine (qui empeche la liaison au proteine G et sert de adapteur à la machinerie d’encytose)
Quel voie cell les proteines Ras sont impliquer
localisation de ras dans la cell
pour transmet les signaux de prolifération cell et de différenciation qui demande expression de gène
Ancrer à la membranes cell, agit comme commutateur
Signaux Ras peut être transformer en signaux de longue durée par la voie des MAPK
Odre des MAPK après activation de RAS
Ras - MAPKKK-MAPKK-MAPK- effecteur
Gènes qui sont activer les MAPK
- gène des cyclines impliquer dans le cycle cell et prolifération
- Phosphatase qui perment de crée des boucles de rétrocontrôle négatif
Rôle des protéines échafaudages dans la voie des MAPK
comme les MAPKS sont impliquer dans plusieurs voie cell, utilisation de proteine échaffaudage permet éviter réaction croiser et assure spécificité
Voie où Rho sont impliquer et 3 principaux membres
transmet les signaux qui organissent le cytosquellette
RAC, RHO et Cdc42
Activité de la proteine P1 3-Kinase
Peut être activer par les proteines G et les RTK
phophosryle les cycles inositol sur les C3 pour produire variée des phosphoinoisitol
Important et inhibiteur de la phophosrylation des P1P2 en PIP3
Important pour crée des sites d’ancrage pour des proteines de signalisation (domaine PH)
PTEN : permet enlever le phophaste en position 3
Muter dans plusieurs cancer = supresseur de tumeur, car quand il est muter il y a prolongement du signal des PI 3-Kinases ce qui favorise croissance cell et survie de la cell
Proteine qui lie les PIP3 crée par PI 3-kinase lors de la liaosn de IGF
ARK : une fois activer va inhibter des signaux pro-apoptotique (donc favorise la survie cell) en activant des inhibiteur pro-apoptose
PDKI ; qui phosphoryle ARK effet de proximiter
Rôle de NOTCH
destiné des cell et contrôle l’organisation spatiales
Une cell qui decider devenir une cell nerveuse (va exprimer delta) et se lie a NOTCH ce qui va bloquer la différenciation des cell autour en un type neurales
TYPE SIGNALISATION ; CONTACT DÉPENDANT
La proteine NOTCH subit trois clivages
- trans-golgis
- extracell par protéase extracell après liaison de delta
- clivage domaines transmembranaire libérant queue cytoplasmique après les deux autres clivages
En quoi les protéines Wnt sont atypique
présent d’une chaine d’acide gras, donc augmente sa liaison au cell et diminue sa diffusion dans le milieu extracel
Qu’est que contrôles la proteines Wnt
divers aspect devellop embryonaire
2 voie de signalisation
1. voie de la polarité planaire : polarité global de tissu (pas seulement un cell individuellement)
2. Voie de Wnt/B-caténine (voie canonique ) ; régule la dégradation de la b-caténine
Endroit où peut se trouver la B-caténine et la conséquence
Dans le cytoplasmes ; pas stables et se fait dégrader
Dans les jonctions cell : stable
Chaine d’action et complexe qui dégrade la B-caténine lorsque dans le cytoplasme (EN ABSENCE DE SIGNAL)
- phopshorylation par CK1
- phosphoryler par GSk3
entraine la dégradation via ubiquitination et dégradation par le protéosome
APC et ANEXIN agissent comme proteine échaffaudage qui permet assurer stabilité du complexe de dégradation
Les gènes sensible à Wnt sont maintenu inactif par ;
co-represseur Groucho qui est lier au régulateur transcriptionnel LEF1/TCF
Conséquence de la mutation de APC
80 % des cancer du colon, muter il ne fixe plus la B-caténine donc elle s’accumule et active transcription en absence de Wnt
un des gènes cibles sont c-Myc (qui augmente la prolifération cell, en activant les gènes de la cycline G1)
Trois voie de mort cell
- apoptose
- Nécroise
- Autophagie
deux étapes important pour la reconnaissances par les phagocyte d’engloutir une cell en apoptose
- détection des cell apoptotique et leur reconnaissances ; se fait via la sécrétion de mol de signaux qui attire les macrophage, dû changement de perméabilité de la membranes apporte la sécrétition de certains composer (ex mol ATP, UTP, sphingosonel phosphate et lypophosphadylchloline)
- Ingestion de la cell cible et son élimation ; via la reconnaissance d’un phosphotidylserine (en conditions normales dans le cytoplasmes, mais en apotose aussi dans la membranes extracell)
Trois technique qui permet d’analyse apoptose
- Test Annexin V ; techinique in vivo
Baser ; Annexin V se lie au phosphatidylsérine qui est à la membranes plasmique externe des cell en apoptose
Annexin couplé avec un fluochrore
POUR TOUT LES TYPES APOPTOSE - Test de Tunnel ; ajout d’une enzyme transférase des déoxynucléotides dUTP marquer aux extrimité 3’ (en gros permet de marquer ADN fragmenter)
SEULEMENT POUR LES APOTOSE QUI APPORTE DÉGRADATION ADN (CAPASES OU NON DÉPENDANTE) - Analyse apoptose WEST Blot ; avec anticorps spécifique qui reconnait les capases cliver ou les subtrat qu’elle clive
SEULEMENT POUR LES VOIES QUI SONT CAPASES DÉPENDANTE
Capase initiatrice et leur domaine particulier
intie la cascade des caspase par leur auto-clivage (qui est provoquer par la proximité)
Caspase 8/10 : domaine DED, impliquer dans la voie extrinséque, et activer (par rapprochement par le complexe DISC)
Caspase 9 ; domaine CARD, impliquer dans la voie intrinséque et activer par le raprochement causer le complexe apoptosome
Coupure de la procaspase et leur structure lorsque activer
coupure sur l’un des deux sites aspartiques, coupe une petite et une grande qui forme un hétérodimère et deux hétérodimière forme un trétamère actif
def de voie extrinsèque et ce l’active
déclencher par la liaison de proteines extracell de signalisation aux recpeteru de mort cell à la surface des cell, implique le complexe DISC et les capases 8/10
recepteur de mort cell
1. recepteur des facteurs de nécrose tumorales (TNF) ; TNF=cytokine
2. Recepteur FAS ; activer par leur ligands FAS qui sont présent au niveua des lymphocytes t tueuse
Def voie intrinséque
déclencger par des conditions de stress qui active un programme à l’intérieur de la cell
Initié par le complexe apoptosome responsable activer caspase 9
Par changement de perméabilité dans la membranes mitochondriales : entre autres relachement du cytochrome C
Voie qui amène à la fragmentation ADN
dépendante des caspase : caspase 3 (qui peut être activer par 8/10 ou 9) peut venir cliver iCAD qui est un inhiteur de CAD (enzymes séquestrer normalement dans le cytoplasmes qui est une nucléases cause fragmentation de ADN)
Indépendante des caspase ; enzymes qui dégrade ADN sont séquestrer au niveau de la mitochondrie, changement de perméabilité de la mito produit lors de l’apoptose permet de libérer des enzymes
Régulation de Apoptose type de Bcl2 et leur rôle
Bcl2 : 4 domaines BH, anti-apoptotique
rôle ; localiser à la surface cytolique de la mitochondire (membranes externe) et du RE, aide a préserver intégrirer de la membranes, empêchant la libération de proteine inaproprié
ex Bcl2 lie BAK (BH123) et l’empêche de s’oligomériser pour former des canaux dans la membranes de la mitochondrie
BH123 : 3 domaine BH, pro-apoptotique, s’oligomérise suite à un stimulu apoptotique dans la membranes de la mitochondire et crées des canales qui permet la libération du cytochrome C et autres proteine
ex : BAK et BAX
Les BH3 seulement; un seule domaine BH, proapoptotique, plus grande famile de Bcl2, car ces proteines fournissent le lien cruciale entre les stimuli apoptose et la voie intrinsèque (donc besoin d’une varié pour réponse à différent signal)
Ex ; inhibe/neutralise activiter de Bcl2, donc permet à BAX et BAK s’oligomériser
Famille des IAPS def
IAPS ; proteine de surveillisance cytoplasmique empeche la production de l’apoptose accidentelle par activation spontanée des caspases
Rôle de anti-IAPS et leur localisation
permet iniber/bloquer les IAPS
quand pas signaux apoptose ; dans la mitochondrie
quand il y a des signaux ; libérer et peut venir inhiber IAPS
Mode action de IAPS
inhibe directement apotose en se liant et inactivant les capsases (autant 9,3,7)
Seuil inhibiteur de l’apoptose
déterminer par IAPS, demande de dépaser une certains concentration pour déclencher apoptose
équilibre IAPS et anti-IAPS ; cruciale
Différence entre petit et grosse Hsp
grosse ; activiter Atpase, catalyse renaturation proteine
petit ; pas activité atpases sert de cofacteur pour les grosse atpase
Comment on peut affecter un cell cancéreuse
en inhibtant l’action du protéasome qui est très actif dans le cas de cancer, quand cancer les cell produisent bcp de proteine donc pour survivre doit avoir un bon mécansimes de dégradation
Deux grand type de molécule de signalisation intracellulaire
- Second messager ; agent chimoque (ex ca+2)
2. Proteine de signalisation ; souvent agit comme des commutateur moléculaires qui alterne état actif et inactif
Mécanisme qui permet un réponse spécifique
- Haute affinité pour le recepteur et la mol de signal et affinité entre les molécules de signalisation (via reconnaisances de motifs particulier)
- Réponse necessite un seuil pour être actif
- Formation de complexe de signalisation
Proteine G grand famille de recepteur important dans quel type de réponse généralement ?
important intermédaire dans les réponse aux signaux provenant de l’extérieur (ex vue) mais aussi interne comme hormone
différent domaine des proteine G
alpha ; contient le domaine ras
beta ; lie alpha et gamma
beta et gamma forme un unité fonctionnnelle unique
Proteine RGS
régule active de alpha-G en jouant le rôle d’une GAP
activation par les RTK des proteine deux facons
- par liaison phospho-tyrosine entraine changement de conformation du à la liaison
- phosphorylation de la proteine de signal par le recepteur
Inhibtion des RTK
- certains proteine peut lier les T-P via domaine sh2 et entrainer son inactivation
ex c-cbl induit ibiquitination des recepteurs causant endocytose du recepteur et sa dégradation
Mutation de Ras et cancer
30 % des cancer il a un mutation de ras qui la rend hyperactive ; donne prolifération incontrôler
Deux modules qui joue la voie des MAPK
- facteur de croissance
2. Facteur de stress (uv) ; 2 module vont terminer par activation de p38 ou JNK
Contrôle migration du cone de croissance axones
- axone rencontre différente cell, qui exprmie ou non la molécule de signal Elphréine A1
- La liasion du recepteur eph4A (couplé à une enzyme RTK) à elphréine A1 (mode de signalisation contact-dépendant) entraine le recrutement d’une kinase intracellulaire s’active en se liant aux recepteur
- apporte phosphorylation de la protéine RhoGef ephexin qui était déja lier au recepteur (recruter avant)
- Rho-GEF ephexin active RhoA
- cause effrondement du cône de croissance dû au remodelage du cytosquellte
Activation voie Wnt canonique (présence de signal)
- proteine Wnt se lie au recepteur Frizzled et son corecepteur LRP
- Recrutement de dishevelled au recepteur qui un proteine d’échffaudage
- LRP est phosphoryler par GSk3 et après Ck1
- Axine vient se lier a LRP-p-p et est inactiver/et/ou dégrader
ce qui aporte pertubation du complexe et l’empêche de dégrader B-caténine - B-caténine pas pris au piège et ni phosphpryler peut se rendre au noyeau et activer les gènes sensible au proteint Wnt
En déplacant Groucho qui était lier à Lef1/tcf
Recepteur FAS
- activer par la liasion de FAS (mol signal insérer dans la membranes des lymphocyte T tueuse)
- active le recepteur permet de recruter via son domaine de mort cell la proteine adaptatrice FADD
- FADD recrute et intéragissent avec le domaine DED des caspases 8 et 10 formant le complexe DISC
- Au niveau de DISC, il va avoir activation des caspases par proximité
activation de la voie intrinsèque
- un signal apoptotique apporte la libération des cytochrome C des mitochonidire
- Les cytochrome C lie la proteine APAf-1 (proteine adaptatrice) forme le complexe apoptosme qui permet de recruter capsase 9 via le domaine card
- Par effet de proximité, permet le clivage de la capases 9
Contrôle de la qualité des proteines sert à
- maintenir les proteines fonctionnelle
- eliminer les veilles proteines ; donne des a.a pour la synthèse de d’autre, les proteine deveins moins fonctionnelle avec le temps
- Maintenir un concentration optimales des proteines selon les besoin (faovirse les rx métabolique)
- Réparer rapidement les proteines endomagger, mal replier ou dénaturer ou les élimner qui réparation ne fonctionne pas
Stress terminque et expression proteine
Les stress termique inhibe la synthèse pluspart des proteines, sauf les Hsps qui font très fonctionnement exprmier mais plus que d’autre proteines état normlaes
Activation de la transcription des gènes condant pour les Hps
- augmentation de la concentration de globule fondu
- Globule fondu recconu par Hsp70 et Hsp90 (proteine chaperone) résidante dans cell non stréser
- Complexe globule fondu/Hsps70 et Hsps90 se lie au facteur de transcription Hsf-1
- activation de Hsf-1 via phoshprylation et se trimérise
- migre vers les noyeau interagir avec les motfis HSE qui sont les promoteur des gènes condant pour les Hsps
- la grande quantité de Hsps va permet de replier les gobule foncu et d’agir négativement sur HSf-1 pour le maintenir inactif dans le cytoplasmes
Famille des Hsps70
ubiquitainre (certains membranes exprimer de facons constitive et d’autre en reponse à un stress)
rôle dans le repliement des proteine, et la solubilisation des agrégat
activité cyclique ; demande plusieurs cycle pour renaturer une proteine fait intervenir Hsps40et NEFS
Rôle de Hsps70 dans la solublisation des agréagt
- Hsps70 retirer subtrat de l’agrégat
s2. ubtrat completement déplier par Hsps70 - Translocation dans le canaux centrale de Hsp100 grâce energie dégager par hydrolyse atp
- Subrrat se replie spontanée et aider par une chaperone à sa sortie
Hps 90
particulirement important dans la régulation de la signalisation cellulaire agissant sur les recepteur des hormones stéroidine et des proteine kinases
trois domaine, la liasion à l’ATP permet un changement de conformation qui passe de ouvert à fermer
cycle implique reconnaisance du recepteur inactif par Hsp40 qui recrute Hsps70 qui après recrute Hsp90 et recruter p23
forme le complexe de maturation pour le recepteur de stéroidien
inhibiteur Hsps90 : comme agent anticancer permet de bloquer le cycle de la chaperone Hsps90 au niveau du complexe interméidaire causant la dégradation du recepteur
Deux grande étapes dans dégrdation des proteine protésome
- liaison de la région c-terminale de ubiqutine au site actif de la cystéine de E1 (ub-E1)
- Transfert de l’ubiquitine de E1 à E2 entraine la formation de ub-E2 (souvent lier a E3)
- E3 assure la ligation entre les complexes Ub-E2 et substrat qui avait un signal de dégradation
E1 peut ajouter d’autre ubiquitine pour former une chaine
Ubiquitine est reversible ?
oui par enzyme deubiquinylation (dubs) permet de fragmenter la chaine de ubiquitne surtout apres la dégradation des proteines par le protésome
faibl affiniét pour les ubs mais forte activité catalytique
Nommez une pathologie charactérisée par une apoptose accrue et une pathologie charcatérisée par une resistance à l’apoptose.
- Résistance : cancer, via la mutation qui apporte perte de fonction des proteines BH3 seulement, donc les signaux apoptique ne font plus reconnu par BH3 seulement, donc il n’a pas plus de lien entre le signaux et la voie intrinsèque
- Augmentation maladie auto-immune; Mutation qui apporte une supression des anticorps anti-FAS qui peut se lier aux recepteur de la famille des TNF apporterai un surstimulation de l’apoptose de la voie extrasèque puisqu’une fois active le recepteur se lie a FADD qui recrutre les capsases 8/10 via le domaine DED et apporte formation du complexe DISC
induit par proximité l,activation des caspases,
alors, plusieurs cell rentrait en apoptose dû à cette suproduction qui ne repond plus à un besoin de tuer certain cell, donc suractivation
Caractéristique commune intrinsèque ou extrinsèque
- autoclivage des capases initiatrice par effet de proximiter
- activation des capsases effectrice via capspases initiatrice
Les agrégat apporte :
- conformation toxique
- séquestration des chaperone
- formation agréagt
gain de fonction toxique des proteines
Quelles sont les protéines cibles des Hsps?
les proteines dénature, inactive, qui ont perdu leur fonction , ceux non utile
