Evolução Molecular Flashcards

1
Q

A evolução molecular envolve …, … e …

A

DNA, RNA e proteínas

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2
Q

Porque é importante a evolução molecular?

A
  • Nem sempre existe evidência fenotípica
  • Reconstrução da história evolutiva dos genes e proteínas
  • construir filogenias entre organismos
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3
Q

O que é considerado como sendo a matéria prima da evolução?

A

As mutações

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4
Q

As transições são mais … e as transversões mais …

A

Transições mais comuns
Transversões mais raras

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5
Q

Transições são trocas entre…
Transversões são trocas entre…

A

… purinas <-> purinas ou pirimidinas <-> pirimidinas
… purinas <-> pirimidinas

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6
Q

Mutações em bases podem ser do tipo:

A
  • missense: mudança no a.a.
  • nonsense: produz-se codão stop
  • silent: mesmo a.a.
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7
Q

O que são mutações in-frame e frameshift?

A
  • In frame: inserção ou deleção de 3 nucleótidos ou seus múltiplos; não alteram a frame de leitura
  • Frameshift: inserção ou deleção de mais de 3 nucleótidos; altera a frame de leitura
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8
Q

A nível dos cromossomas, as mutações podem ser:

A
  • duplicações
  • deleções
  • inversões
  • translocações
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9
Q

O efeito das mutações é completamente …

A

aleatório

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10
Q

A experiência de Luria e Delbrück permitiu demonstrar:

A

Que as mutações são ao acaso e são favorecidas ou não pela seleção natural.

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11
Q

Quais são as duas hipóteses da experiência de Luria e Delbrück?

A
  1. Mutações são aleatórias: antes das cell. serem expostas aos bacteriófagos já existiria mutações que criavam resistência
  2. Resistência hereditáriamente adquirida: a exposição aos fagos induziria resistência; resistência seria hereditária;
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12
Q

A resistência hereditária adquirida é obra do acaso?

A

Não

ppt 10

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13
Q

O que fez concluir que na experiência de Luria Delbrück a resistência a bacteriófagos fora por mutações aleatórias?

A

Haver uma alta variabilidade de culturas resistentes no conjunto de subculturas; se fosse a indução de resistência, não haveria tanta variabilidade pois as mutações surgiriam logo após a infeção.

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14
Q

Os marcadores de variação genética, idealmente são:

A
  • estáveis
  • independentes da fase de crescimento
  • reprodutíveis
  • codominantes
  • não pleiotrópicos
  • polimorfismos facilmente identificáveis
  • fáceis de observar
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15
Q

Os marcadores de variação genética mais usados hoje em dia são:

A
  • SNPs
  • Sequenciamento genético
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16
Q

Quais as vantagens e desvantagens dos SNPs e sequenciamento de DNA?

A

Vantagens SNPs:
* baixa taxa de mutação
* abundantes
Desvantagem SNPs:
* isolamento é caro
Vantagem sequenciamento:
* Maior resolução possível
* Não enviesado
Desvantagem sequenciamento:
* Caro

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17
Q

O que quer dizer SNP?

A

Single nucleotide polymorphism

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18
Q

Segundo Motoo Kimura, como se pode explicar tanta variação a nível molecular?

A

A seleção natural não está a atuar a nível molecular

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19
Q

A teoria neutra da evolução molecular diz que a variação genética de uma pop. está/não está sujeita à…
variações ao longo do tempo são resultado da …

A

não está sujeita à seleção
deriva genética

20
Q

A teoria neutral propõe que a maioria das mutações/substituições são …

A

substituições … neutras

21
Q

A teoria neutral aceita que a maioria das mutações são … e são purgadas da pop. através da …

A

deletérias
seleção natural

22
Q

A teoria neutral nega por completo a seleção natural?

A

Não, mutações deletérias são eliminadas das pop. por seleção natural

23
Q

A teoria neutral propõe que a maioria dos loci são seletivamente irrelevantes?

A

Não! Quando existem alelos alternativos, estes são neutros entre si.

24
Q

Exemplo para aceitar a seletividade neutra é:
Qual o problema?

A

A degeneração do código genético: não altera a proteína -> não altera o fitness -> seleção neutra
Problema: mesmo que a proteína não se altere, pode haver modificações a nível energético em que a seleção natural pode incidir

25
Q

Regiões não codificantes não têm função?

A

Falso, podem ter funções regulatórias apesar de não codificarem para nenhuma proteína

26
Q

Na seleção neutral, substituições que façam ter as mesmas propriedades bioquímicas são mais/menos frequentes que mudanças radicais do funcionamento.

A

mais

27
Q

Na teoria neutral, as substituições/nonsense ocorrem a taxas mais altas que as substituições/nonsense.

A

substituições… nonsense

28
Q

Na teoria neutral, as sequencias não codificantes e os pseudogenes evoluem a uma taxa mais rápida/lenta

A

mais rápida

29
Q

A disputa sobre qual o principal driver evolucionista recai sobre que mecanismos de evolução?

A

Seleção natural ou deriva genética

30
Q

Os selecionistas defendem que a frequencia de mutações … e … são mais elevadas; os neutralistas defendem que a frequencia de mutações … e … são mais elevadas

A

Selecionistas: benéficas e deletérias
Neutralistas: neutras e deletérias

ppt 22

31
Q

Mutações neutras são aquelas que não alteram o …

A

fitness

32
Q

O mecanismos que influencia a frequencia de mutações neutras é:

A

Deriva genética (aleatoridade)

33
Q

Darwin defendia … tipos de variação, enquanto que a prespetiva neo-darwinista apenas defendia …

A

3
* benéfica: mantidas por seleção positiva
* deletéria: eliminadas por seleção negativa
* neutra: mantidas ou eliminadas
2 (benéfica ou deletéria)

34
Q

A hipótese quase neutral difere da neutral no sentido que:

A

Existem alterações intermediárias entre as mutações neutras e deletérias assim como entre as neutras e as benéficas

35
Q

O resultado das mudanças causadas pelas mutações quase neutras é determinado através de que mecanismo(s) de evolução?

A

da seleção natural e do fluxo de genes

36
Q

A teoria quase neutra tem em conta algo que a teoria neutra não. O quê?

A

O tamanho da população

37
Q

Na teoria quase neutra, se a população for grande o mecanismo associado à variação é …; enquanto que em populações pequenas, o mecanismo assiciado é…

A

pequenas: deriva genética
grandes: seleção natural

38
Q

A teoria neutral pode ser usada como … … para testar a ocorrência de … no processo evolutivo

A
  • hipotese nula
  • seleção
39
Q

Usando a teoria neutral como hipótese nula, quando um gene é seletivamente neutro, espera-se que a taxa de substituições seja … e que o racio seja igual a …

A
  • identica em substituições sinónimas e não sinónimas
  • 1
40
Q

O teste de McDonald-Kreitman envolve:

A

Comparação de racios entre mudanças não sinónimas e sinónimas em dois pontos temporais.
(Se for comparação em pouco tempo são polimorfismos entre espécies; longa são divergências entre espécies)

41
Q

NO teste de McDonald-Kreitman, a seleção neutra tem como resultado…

A

racio entre polimorfismo não sinónimo e sinónimo dentro de uma população é igual ao mesmo racio entre populações

42
Q

O conceito de relógio molecular diz que:

A

Evolução molecular funciona como um relógio –> sequencias de a.a. mudam ao longo do tempo a uma taxa constante em diferentes linhagens

A taxa de substituição de a.a. varia entre proteínas mas a sua relação com o tempo é sempre linear

43
Q

A teoria do relógio molecular suporta a teoria neutral?

A

Sim, por causa da relação de linearidade

44
Q

Quais as limitações do relógio molecular?

A
  • não é universal
  • mais complexo do que se pensava originalmente
  • as taxas da evolução podem mudar entre locais da mesma molécula; entre genes; entre regiões do genoma; entre genomas da mesma espécie; ao longo do tempo
45
Q

As limitações ao relógio molecular tornam-no completamente inutil?

A

Não

46
Q

A partir do relógio molecular, podemos prever quando:

A

dois organismos divergiram entre si

https://youtu.be/DpwEf5Ibr5A?si=py055zGFzs7xyhpl