Enzyme 2 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le principe de Régulation métabolique (4)?
Que fait une enzyme régulant une voix métabolique?

A

Adaptation de l’offre métabolique à la demande

  • Ajuster la concentration d’un métabolite au besoin cellulaire
  • Accélérer la production lorsque la demande est insatisfaite
  • Freiner la production lorsque la demande est satisfaite
  • L’enzyme régulant une voix métabolique catalyse la réaction limitante (pour l’ensemble de la chaîne qui va être activée)
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2
Q

Qu’est-ce qu’une réaction limitante (5)?
- Rôle?
- L’enzyme est-elle en excès?
- Où?
- 2 caractéristiques

A
  • Catalyse une étape régulatrice d’une chaîne de réaction
  • Enzyme n’est pas en exès (≠ chaîne de réaction)
  • En début de chaîne de réaction (pas tjrs 1ère)
  • SPÉCIFIQUE de la voie métabolique
  • IRRÉVERSIBLE en conditions cellulaire (∆G très négatif)
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3
Q

Vitesse de la réaction limitante dépend de (3):

A
  • Diponibilité en substrat
  • Activité de l’enzyme
  • Concentration de l’enzyme
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4
Q

Disponibilité en substrat pour une enzyme déterminée par (3):

A
  • Approvisionnement en précurseur (flux métabolique)
  • Compétition avec d’éventuelles autres réactions
  • Approvisionnement en coenzyme (+ sa régénération)
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5
Q

Régulation de l’activité d’une enzyme (2+1)

A
  • Phosphorylation/Déphosphorylation -> COVALENT
  • Contrôle allostérique (Activateurs/Inhibiteur) -> NON-COVALENT

—> Contrôle transcriptionnel (indirectement)

-> Activation par protéolyse (irréversible + Ez digestive)
-> activation par fixation d’une protéine de contrôle (réversible)

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6
Q

Mécanisme de phosphrylation/déphosphorylation:
+ Qu’est-ce qui passe par des réactions de phos/déphos?
+ Que permet la cascade d’activation?

A
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7
Q

Enzyme intervenant dans la Glycolyse (+ formule de la réaction): Phosphofructokinase

A
  • Phosphfruktokinase (sous contrôle allostérique régulé par l’état énergétique) = enzyme irréversible et limitante
  • Fructose-6P + ATP -> Fructose-1,6bisP + ADP
  • Si ATP diminue -> ADP augmente -> Ez plus sensible au substrat -> ATP augmente…= adaptabilité
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8
Q

La concentration de l’enzyme/ contrôle transcription électrique dépend de (2):

A
  • Vitesse de synthèse/dégradation (turnover)
  • Facteurs de transcription (eux-mêmes sous contrôle allostérique)
    => Protéines régulatrices se fixent sur le PROMOTEUR
    -> INDUCTION si synthèse de l’Ez accélérée
    -> RÉPRESSION si synthèse de l’Ez freinée
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9
Q

3 types de contrôle de l’enzyme (activité + concentration)

A
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10
Q

Coenzymes:
- Rôle (3)
- Nature
- Caractéristique
- Mode d’action

A
  • Rôles:
    -> Accompagnement des Ez = COFACTEURS
    -> Participent à la stœchiométrie de la réaction
    -> Indispensables à l’activité de certaines Ez
  • Généralement vitamine (pas protéine!)
  • Retrouvent leur état initial
  • Transfert par prise en charge transitoire d’une molécule à l’autre (électrons/atomes/molécules)
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11
Q

2 mécanismes des coenzyme:

A
  • Cosubstrat:
    -> Cenzyme libre
    -> Liaisons non-covalentes (= faiblement fixées)
    -> Participent à 2 réactions enzymatiques COUPLÉES (Prise en charge + Transfert)
    -> Ex: NAD (pyrimidinique) / CoA
  • Groupe prosthétique:
    -> Coenzyme liée de façon permanente
    -> Liaisons covalentes (= solidement fixées)
    -> Fonctionnent dans une double réaction COUPLÉE EN 1 SEULE (Prise en charge-Transfert)
    -> Ex: FAD (flavinique)
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12
Q

2 fonctions des coenzymes:

A
  • Oxydoréduction (transfert d’e-)
  • Transfert de groupements d’atomes
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13
Q

Coenzymes d’oxred:

  • Rôle
  • 2 types (+ exs)
  • Impliqués dans quelle voie?
A
  • Transfert d’équivalents réducteurs (e-/H/ ion hyodure H-)
    = COFACTEUR des OXYDORÉDUCTIONS
  • 2 types:
    -> Coenzyme pyrimidinique (NAD et NADP)
    -> Coenzyme flavinique (FAD et FMN)
    = impliqués dans les voies cataboliques (sauf NADP)
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14
Q

Coenzymes oxydoréductases types (4):

A
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15
Q

NAD:
- Précurseur
- Type de coenzyme
- Couple redox
- Réaction (formule)
- Action

A
  • Niacine/Vitamine B: désigne l’acide nicotinique et l’amide nicotinique (besoin de ce précurseur pour faire du NAD)
  • Cosubstrat (joue un rôle essentiel pour le transport d’e- dans les voies métaboliques)
    => Pyrimidinique
  • NAD+/NADH + H+
  • AH2 + NAD+ -> A + NADH + H+ (-0,32 V)
    -> NAD+ est l’oxydant qui accepte les équivalents réducteurs extraits de substrat réduit AH2
    -> NADH est réducteur et transfert les équivalents réducteurs à la chaîne respiratoire
  • Extraction d’équivalents réducteurs dans les réactions CATABOLIQUES et transfert sur la chaîne respiratoire (produit de l’ATP)
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16
Q

NADP
- Implication
- Action
- Action sous sa forme réduite

A
  • Impliqué dans les voies de biosynthèse (anabolisme)
  • Agit comme réducteur (NADPH) principalement
  • Sous sa forme réduite: donne ses équivalents réducteurs dans les réactions ANABOLIQUES (synthèse des AG)
17
Q

FAD:
- Précurseur
- Nature
- Type de coenzyme
- Couple redox
- Réaction (formule)
- Action
- Localisation

A
  • Riboflavine (vitamine B2)
  • Dinucléotide formé de FMN et AMP (flavine mononucléotide et adénosine monophosphate)
  • Groupe prosthétique de quelques deshydrogénase (covalente)
  • FAD/FADH2 (-0,1 V -> E° une peu moins négatif que NAD)
  • AH2 + FAD -(E)-> A + FADH2
    -> Transfert d’équivalents réducteurs à la chaîne respiratoire (conséquences sur l’efficience de production d’ATP)
  • => Voie CATABOLIQUE
  • Est localisé dans les mitochondries
18
Q

Que transfèrent les coenzymes de transfert d’atomes (3)?

A
  • CO2
  • Groupes pluricarbonés
  • Autres
19
Q

Coenzyme-A (CoA):
- Rôle
- Type de coenzyme
- Nature
- Permet
- Qu’est-ce que l’acétyl-CoA?

A
  • Transporte les groupes acyles à 2 carbones
  • Cosubstrat
  • Dérivé vitaminique (acide panthotéique)
  • Formation d’acétyl-CoA couplée à des réactions exergoniques
  • Acétyl-CoA = carrefour des voies métaboliques
    -> convergence de voies de dégradation par Ez portée par Acétyl-CoA
20
Q

Coenzyme - Cofacteur - Cosubstrat - Coenzyme-A
Différence?

A
21
Q

Lequel est covalent/non-covalent?

  • Phospho/déphospho
  • Contrôle allostérique
A
  • Covalent
  • Non covalent