ENCODE Flashcards
Método adecuado para proteínas que forman el cromatosoma y que se asocian con el ADN en regiones o dominios extensos
ChIP-seq para histonas
Método adecuado para proteínas que se espera se unan en puntos delimitados, como secuencias de ADN definidas o configuraciones de cromatina específicas y sirven como reguladoras de la transcripción
ChIP-seq para fractores de transcripción
Metodología para experimentos diseñados específicamente para recopilar información sobre bibliotecas de ARN mensajero donde el tamaño de inserción promedio es superior a 200 bases
ARN-seq total
Metodología relacionada con transposasas y secuenciación en sitios abiertos de cromatina en todo el genoma
ATAC-seq
Metodología que se utiliza para investigar los patrones de metilación del ADN con detalle para cada base del ADN
WGB-seq
Es utilizada para el análisis y recuento de ARN pequeños
Conteos de miARN
Estudio para caracterizar secuencias de proteínas de unión a ARN (RBP) y sus puntos de unión
ARN Bind-N-Seq
Es un enfoque de secuenciación diseñado para identificar sitios de inicio de transcripción (TSS) con resolución al detalle de pares de bases, cuantificar su expresión y caracterizar sus transcritos
RAMPAGE / CAGE
Metodología utilizada para el estudio relacionado con el empalme alternativo, así como para caracterizar las isoformas en todo el transcriptoma y su cuantificación
Lectura larga de ARN
Es una versión mejorada del ensayo de inmunoprecipitación y se utiliza para identificar los sitios de unión de las proteínas de unión al ARN
e-CLIP